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[期刊] 林业科学研究
[作者]
朱利利 吴疆翀 彭兴民 郑益兴 张燕平
［目的］结合分子数据确定印楝属内３个种及云南省引种栽培过程中发现的变异类型，特别是变异类型的遗传背景及它们之间的遗传关系。［方法］采用方差分析、聚类、主成分分析等方法，对云南省引种栽培的印楝、泰楝、菲楝以及引种栽培过程中发现的一个变异类型的２０个表型性状进行分析。［结果］印楝属植物的形态学特征存在广泛变异，其中，小叶面积变异幅度最大，变异范围为６．０９ ２１．５０ ｃｍ２，变异系数为５１．７０％，其次为种子宽与小叶对数，二者变异幅度分别为０．４７ ０．９５ ｃｍ和７．００ １２．３３，变异系数分别为３０．３４％和３０．３１％；主成分分析显示，印楝属植物的形态变异主要来源于小叶基部偏斜程度、小叶．．．
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
陈文星 杨琳懿 唐军荣 李启少 李建运 宋钰
【目的】为了解新樟属树种间叶片性状的多样性差异，提高新樟树优异种质资源的选育和利用。【方法】采集了新樟属植物7个种10个样本，从微观和宏观两个方面，进行了外部形态、表皮、叶脉以及横切面等性状的定性和定量分研究，对其进行多次测量并记录数据，并对数据进行相关性分析、主成分分析和聚类分析。【结果】相关性分析表明16对性状相关性达到极显著水平（P <0.01）,9对性状达到显著水平（P <0.05），叶片表型性状间关联性强。进一步进行叶片表型性状的主成分分析，发现可将20个叶片性状简化为5个主成分，前5个主成分累计贡献率为87.89%，说明新樟树种叶片关联性状的进化方向存在差异。而后对10个新樟属植物个体的叶片性状进行聚类分析，在欧式遗传距离为10时新樟树种的叶片性状聚为3个类群，第一类群分别为新樟、6068新樟、沧江新樟、7683新樟、大果滇新樟、海南新樟、滇新樟、7751滇新樟；第二类群为川鄂新樟；第三类群为文山新樟，同时发现叶脉密度和气孔数目是区分不同类群的重要性状。【结论】新樟属树种叶片表型性状多样程度较高，叶片性状之间存在关联进化，可初步将10个新樟属植物分成3大类群，研究结果为新樟属进一步确定种间关系及遗传改良提供理论基础。
[期刊] 林业科学
[作者]
李洪果 陈达镇 许靖诗 刘光金 庞晓东 叶金辉 莫小文 谌红辉
【目的】通过对濒危植物格木在我国中心分布区种群的果荚和种子表型性状测量分析,研究其表型多样性及变异规律,结合地理气候信息探讨影响表型变异的关键因子,为格木天然种群的遗传多样性保护恢复和引种栽培提供科学依据。【方法】对8个格木天然种群114个单株的13个果荚及种子表型性状进行测量,利用巢式方差分析、多重比较、相关性分析、主成分分析、聚类分析等分析方法,探讨格木天然种群的表型多样性水平、进化和适应性潜力、表型变异规律、表型分化水平、种群聚类特征及其与地理气候因子的相关性。【结果】格木表型多样性水平中等,13个性状的Shannon-Wiener指数在1. 911 1(种形指数)～2. 103 9(果荚周长)之间,平均2. 027 8;8个种群的Shannon-Wiener指数在0. 920 9(P6)～1. 885 6(P8)之间,均值为1. 474 7。格木表型性状离散程度较轻,13个性状的变异系数在7. 544 6%(种子长)～18. 868 5%(果荚面积)之间,均值为12. 410 9%; 8个种群的变异系数在8. 852 9%(P1)～13. 984 8%(P5)之间,均值为12. 410 9%。13个表型性状的极大值为极小值的1. 395 2(种形指数)～2. 805 6(每荚种子数)倍,均值为1. 791 7。巢式方差分析表明,格木13个表型性状在种群间和种群内均存在极显著差异(P
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
唐惠燕 倪峰 李小涛 陈蓉蓉 袁曦临 朱艳 周济 丁艳锋
[目的]文献计量方法可以用于反映和预测科学技术发展的历史和趋势。本文基于科学大数据的计量方法探讨植物表型组学的研究现状,为植物表型组学的发展提供参考。[方法]基于Scopus数据库,分析2013年—2018年9月数据库中植物表型组学及其相关学术产出的文献数量、引用次数、合作单位、研究方向、学术机构和科研团队等信息,利用Sci Val和Cite Space 5.0等统计分析工具,运用可视化数据方法,分析植物表型组学研究领域的发展特点和趋势。[结果]基于Scopus共检索到与植物表型组学研究和应用相关的文献共20 953篇,总被引数217 105,TOP1%高被引论文为2.0%。相关学术产出总被引量TOP10的国家是美国、中国、德国、英国、法国、日本、澳大利亚、西班牙、加拿大和荷兰。相关论文被引总量TOP10的机构分别是中国科学院、法国国家农业研究院、美国农业部、法国国家科学研究院、中国农业科学院、美国康奈尔大学、西班牙高等科学研究委员会、美国加州大学戴维斯分校、法国巴黎萨克莱大学、荷兰瓦赫宁根大学。学术产出最多的学者是德国克斯·普朗克分子植物生理研究所的Alisdair Robert Fernie,共发表58篇植物细胞表型论文,被引1 246次。目前植物表型组学研究的植物种类较少,主要包括拟南芥、水稻、小麦、玉米、番茄和大豆。[结论]作为一个新兴的研究方向,植物表型组学体现出作物栽培、育种、生物学与计算机科学等多学科交叉发展的特性。高通量图像及相关数据分析是现阶段植物表型组学的重要研究方向,主题显著度指数达到98.8%,受关注度极高。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
彭兴民 吴疆翀 郑益兴 张燕平
采用形态学标记,按照完全随机设计和巢式设计,沿印楝云南分布区的纬度和海拔梯度布点调查和采样,测量9个种群90个单株14个形态性状,运用多元统计分析方法,揭示云南分布区印楝表型的地理变异格局。结果表明:印楝种内表型性状在种群间和种群内个体间均存在着较丰富的差异。营养性状变异与年平均气温(21.7 24.8℃)呈显著正相关,与海拔(197.0 1 277.0 m)和纬度(23°06'N 25°48'N)呈显著负相关,空间分布上呈现纬向的单向变异模式;繁殖性状变异与年平均气温、年降水量(634.0 1 060.0 mm)、经度(101°51'103°11'E)呈显著正相关,与海拔和纬度呈显著负相关,...
[期刊] 林业科学
[作者]
周兰英 王永清 张丽 胡泽明
选择44个在杜鹃分类中的重要性状用SPSS10.0进行分析,其中二元性状18个、多元性状13个、数量性状13个。Q聚类采用平均欧氏距离平方系数,R聚类采用相关系数距离,聚类方法采用类间平均链锁法。Q聚类结果将46种杜鹃花属植物分为特征明显的2大类群,即有鳞类杜鹃和无鳞的常绿类杜鹃,在2大类群下的聚类结果与传统的形态分类基本吻合,但美容杜鹃和汶川星毛杜鹃的亚组归属值得商榷。R聚类结果表明性状被分为明显不同的组,鳞片出现部位、花器构造、外部器官尺寸等性状群内有较强的相关关系。主成分分析中,前3个主成分累积贡献率达60.39%,表明杜鹃分类中存在重要性状,主要是有无鳞片、有无腺体和毛被以及叶、花、果...
关键词：
杜鹃花属 数量分类 主成分分析 聚类分析
[期刊] 林业科学研究
[作者]
李珊 甘小洪 憨宏艳 许宁 侯正扬 陈杨 邓晓娟
［目的］通过对濒危植物水青树叶表型性状的测量分析，研究其表型变异程度和变异规律，并从遗传和环境适应角度探讨其致濒机制，为其天然种群的有效保护及管理提供科学依据。［方法］对来自１４个水青树天然种群的９０个个体的１７个叶形态及其表皮微形态性状进行测量，利用巢式方差分析、多重比较、主成分分析、聚类分析、相关分析等多种分析方法，探讨种群间和种群内的叶表型变异及其与地理、环境因子的相关性。［结果］（１）水青树１７个叶表型性状在种群内和种群间均存在显著差异；（２）１７个性状的平均表型分化系数为４６．６９％，种群内的变异（３１．８３％）大于种群间的变异（２８．８５％），种群内变异是水青树叶表型变异的主要来源．．．
[期刊] 林业科学研究
[作者]
董昕 王磊 鲁仪增 杨海平 韩义 王倩 栗宁宁 解孝满
[目的]研究山东小果白刺的表型变异程度及变异规律。[方法]采用方差分析、相关分析、聚类分析等分析方法,对山东小果白刺5个群体种实和叶片的10个表型性状进行了比较分析。[结果]群体内变异是山东小果白刺表型变异的主要来源;各性状群体间表型分化系数的变幅为20.20%60.70%,平均值为40.71%;所有性状的变异系数平均值为9.34%,各器官的表型变异程度有叶片大小(8.99%)﹥种子大小(7.74%)﹥果实大小(6.77%)和种子形状(10.22%)﹥叶片形状(6.70%)﹥果实形状(4.35%);小果白
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
田美虹 郭孟齐 易自力 黄红梅 陈智勇 肖亮 薛帅
为研究芒草在其重叠分布区内表型性状的遗传多样性,以来自于华东植物区系内的36份芒、五节芒、荻和南荻为材料,对8种表型性状进行多因素方差分析、变异分析和聚类分析。结果表明:8种表型性状种间差异大小依次为分蘖数、基部直径、干物质产量、花序长、株高、最大叶长、最大叶宽、叶长宽比,在种内除最大叶宽与叶长宽比呈显著差异(P<0.05)外,其余6种表型均呈极显著差异(P<0.01),且8种表型性状在种间和种内存在极显著互作效应;该区系内芒属植物表型变异系数为7.94%～76.80%,Shannon’s指数为1.27～1.78,芒草表型变异系数大小依次为芒(26.16%)、南荻(25.46%)、荻(24.49%)、五节芒(17.17%),Shannon’s指数大小依次为芒(1.74)、南荻(1.70)、五节芒(1.68)、荻(1.60);4种芒属植物在欧式距离为20时可分为3类,荻为第Ⅰ类,芒和五节芒为第Ⅱ类,南荻为第Ⅲ类;在华东植物区系内,芒的株高与纬度呈极显著负相关,芒的干物质产量与海拔高度呈显著正相关,荻的干物质产量、分蘖数和基部直径与纬度呈显著或极显著负相关,而南荻与五节芒的产量因子表型与地理因子间则无显著相关性。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
刘新龙 王瑞波 张燕平
以种植在元谋不同年龄的印楝林为研究对象,对林内的植物群落种类组成进行区系分析,结果表明群落内的植物种类以泛热带分布和全世界分布为主。用Gleason丰富度指数、Simpson和Shannon Weiner多样性指数、Pielou均匀度指数对调查样地多样性进行分析,获得如下结果:(1)生物多样性指数随印楝林盖度的提高而逐渐下降,说明盖度是影响林下植物多样性的主要因子;(2)印楝林对林下植物多样性影响主要通过林荫,印楝盖度40%时,影响明显;(3)印楝林下植物生长好于对照,印楝枯枝落叶对林下植物生长没有抑制作用。
关键词：
印楝 多样性指数 盖度
[期刊] 林业科学研究
[作者]
彭兴民 吴疆翀 王有琼 郑益兴 马李一 张燕平
以因子分析和聚类分析作为药用印楝表型选择的分析评价方法,对药用印楝表型选择的分析评价方法进行实证研究,结果表明:性状间呈显著或极显著相关;特征根>1的4个公因子累计方差贡献率为83.53%,第1、第2、第3和第4公因子方差贡献率分别为31.33%、22.98%、15.11%和14.10%,种仁质量(0.995 11)、种子质量(0.956 76)、种子长(0.780 12)、印楝素A+B总含量(0.866 67)、印楝素B含量(0.819 34)、印楝素A含量(0.680 84)、地径(0.939 04)、株产果实数(0.722 82)、印楝素B与印楝素A比(-0.833 60)是表型选择分析...
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
蔡金峰 郁万文 汪贵斌 曹福亮
【目的】通过分析不同产地苦楝果实和种核表型性状，探讨其变异程度和变异规律，为苦楝引种栽培提供科学依据。【方法】采用巢式方差分析、多重比较、相关分析和聚类分析等方法，对15个产地苦楝的果实和种核的8个表型性状变异特征、变异来源、表型分化水平、与地理气候因子的相关性以及种源的聚类特征进行了分析。【结果】苦楝各表型性状在产地内和产地间均达到极显著差异，产地间的遗传分化显著。各表型性状在产地内的变异系数变幅为8.24%～20.78%，平均变异系数为14.47%，其中果形指数的变异系数最小（10.14%），种核体积的变异系数最大（22.67%）。8个表型性状在产地间和产地内的平均方差分量百分比分别为18.00%和53.68%，产地间表型分化系数为6.34%～31.80%，均值为23.89%。相关分析结果表明，果长、果宽、核长、核宽、种核体积和种核百粒重等指标，两两间存在极显著正相关；果形指数与核形指数呈极显著正相关，与其他性状相关性不显著；各表型性状与经度均呈负相关关系，除果形指数和种核百粒重，其余性状指标与纬度也呈负相关关系。主成分分析表明，前两个主成分累计贡献率达90.93%，第一主成分反映了果实、种核的大小，第二主成分反映了果实、种核的形状特征。利用欧式平均距离—类间平均连锁法将15个产地分成3大类，湖南长沙产地单独聚为一类，广东汕头、河南信阳、江西南昌和江西井冈山产地聚为一类，其余产地聚为一类。【结论】15个产地苦楝果实和种核表型性状变异丰富，基于表型性状的种质资源筛选潜力较大；产地内变异是苦楝表型变异的主要来源；苦楝果实和种核性状受经度和纬度的双重影响，整体上表现出果实和种核由北向南、由东向西逐渐增大的趋势；聚类结果与产地的地理分布相关性不明显，产地间的表型性状未形成连续变异，呈随机变异的特点。
关键词：
苦楝 种子产地 表型性状 地理变异
[期刊] 林业科学
[作者]
程诗明 2顾万春
将24个苦楝群体729个家系的5个地理气候因子及与其对应的苦楝18个表型性状因子进行典范相关分析,第一典范变量的特征根为0·9979(0·01水平极显著),占全部特征根的78%;跟进主成分分析将二元坐标降为1维数据轴,即表型性状梯度轴。采用内插法在苦楝自然分布区内按0·2表型性状梯度差值绘出等值线图,揭示出苦楝表型性状东北—西南梯度变异的地理模式。通过通径分析描述各表型性状对表型性状梯度值的直接作用和间接作用,从侧面证实了繁殖器官性状的稳中求变。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
周济 Francois Tardieu Tony Pridmore John Doonan Daniel Reynolds Neil Hall Simon Griffiths 程涛 朱艳 王秀娥 姜东 丁艳锋
随着遥感、机器人技术、计算机视觉和人工智能的发展,植物表型组学研究已经步入了快速成长阶段。本文首先介绍了植物表型组学的发展简史,包括其理论核心、研究方法、在生物研究中的应用以及国际上最新的研究动向。然后,针对各类表型技术载体平台如手持、人载、车载、田间实时监控、大型室内外自动化平台和航空机载等,分析这些技术手段在室内、外植物研究中的应用情况和实际问题。为了对表型研究中产生的巨量图像和传感器数据进行量化分析,把大数据转化为有实际意义的性状信息和生物学知识,本文着重讨论了后期表型数据解析和相应的研发过程。最后,提出表型组学的应用前景与未来展望,以期为中国的表型研究提供指导和建议。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
牟洪香 侯新村 刘巧哲
以文冠果为研究对象,调查了14个分布区文冠果的15个表型性状,利用变异系数和巢式方差分析研究了分布区间和分布区内的变异情况;应用相关分析揭示了表型性状间及其与地理因子间的关系;运用聚类分析进行了分布区分类。结果表明,文冠果分布区内的变异大于分布区间的变异,分布区间的分化相对较小;出种数随经度的增大而减少,果宽随纬度的增大而增大,但随年平均气温的增大而减小,而其它13个性状随地理位置的改变没有特别明显的变化;表型性状的欧式距离与地理距离相关不显著。
关键词：
文冠果 表型多样性 分布区分化
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