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[期刊] 中国水产科学
[作者]
马骞 冯文荣 柳淑芳 庄志猛 马慧
本研究克隆了半滑舌鳎（Ｃｙｎｏｇｌｏｓｓｕｓ ｓｅｍｉｌａｅｖｉｓ）骨形态发生蛋白４（ＢｍＰ４）基因的Ｃ Ｄｎａ序列，并分析其在半滑舌鳎成鱼的组织表达分布及其在早期发育阶段的定位和表达变化趋势。结果表明，半滑舌鳎ＢｍＰ４基因Ｃ Ｄｎａ全长为１６８０ ＢＰ，包括了４１９ ＢＰ的５′非翻译区（５′ｕＴＲ）、编码４０３个氨基酸的１２１２ ＢＰ的开放阅读框（ｏＲＦ）以及４９ ＢＰ的３′非翻译区（３′ｕＴＲ）。同源性分析和分子进化聚类分析结果显示，半滑舌鳎与已报道慈鲷科（ＣｉＣｈｌｉＤａｅ）各鱼种的同源性最高，并与之共同聚为鱼类ＢｍＰ４分支。ＢｍＰ４ ｍ Ｒｎａ在半滑舌鳎成鱼的１３个组织中具有广泛的分布．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
马鲜平 朱涛 龙安格 毕俊萱 何娇 王瑶 易华山
骨形态发生蛋白１５（Ｂｏｎｅ ｍｏｒｐｈｏｇｅｎｅｔｉｃ ｐｒｏｔｅｉｎ １５，Ｂｍｐ１５）由卵母细胞特异高表达，在卵母细胞发育成熟及动物繁殖性能具有重要的调控作用。通过采集荣昌猪卵泡组织，克隆Ｂｍｐ１５基因并对其ｍｒｎＡ组织表达谱进行分析。研究显示：荣昌猪Ｂｍｐ１５基因片段含有完整开放阅读框，与野猪、长白猪及梅山猪Ｂｍｐ１５基因进化关系最为密切，具有转化生长因子β（ｔｒＡｎｓｆｏｒｍｉｎｇ ｇｒｏｗｔｈ ｆＡｃｔｏｒ－ＢｅｔＡ，ｔｇｆ－β）超家族成员结构特征，具有卵巢组织特异性高表达特征。这些研究结果为进一步探究Ｂｍｐ１５基因的表达调控机制及其在猪卵泡发育中的作用奠定基础。
关键词：
荣昌猪 骨形态发生蛋白 克隆 转录谱
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
王双艳 王磊 陈张帆 崔忠凯 周茜 陈松林
本研究根据半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)基因组数据库中预测的多聚免疫球蛋白受体(Polymeric immunoglobulin receptor, pIgR)序列,通过PCR和RACE技术获得了半滑舌鳎pIgR基因cDNA,全长为1419 bp,开放阅读框(ORF)为1020 bp,编码339个氨基酸,5′UTR区域为109 bp,3′UTR区域为290bp。保守结构域分析显示,半滑舌鳎pIgR蛋白包含1个信号肽,2个免疫球蛋白功能域(Ig-like domain, ILD)和1个跨膜结构域。经蛋白序列同源比对和系统进化树分析,发现半滑舌鳎pIgR与大菱鲆(Scophthalmus maximus)和牙鲆(Paralichthy solivaceus)的pIgR亲缘关系最近。实时荧光定量PCR分析显示,pIgR基因在健康半滑舌鳎的不同组织中均有表达,在鳃中表达较高,在肌肉中表达最低。经哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)病原感染刺激后,pIgR基因在半滑舌鳎的5个组织(肝脏、脾脏、肾脏、肠和鳃)中均呈先上升后下降的趋势,其中,在脾脏和鳃中48 h达到最高值,在肝脏、肾脏和肠中72 h达到峰值。与内脏组织不同的是,pIgR基因在皮肤中呈一直上升的趋势。上述结果表明,pIgR基因在半滑舌鳎抵御哈维氏弧菌的免疫应答中发挥重要作用。
[期刊] 华北农学报
[作者]
吴茵茵 温思怡 韩卓然 孙敬锋
为了分析半滑舌鳎突触体相关蛋白29基因(SNAP29)的分子生物学特征、组织分布特点以及感染海藻希瓦氏菌后的时序表达规律，通过RT-PCR、生物信息学网站、qRT-PCR技术对半滑舌鳎SNAP29基因进行了扩增、生信分析和表达特征研究。结果表明，半滑舌鳎SNAP29基因CDS区长度为789 bp,编码262个氨基酸，理论等电点(pI)为5.39,分子质量为29.717 81 ku,有2个典型的SNARE结构域；二级结构主要由α-螺旋和无规卷曲组成，二级结构和三级结构基本一致；多序列比对结果显示，半滑舌鳎与欧洲鲈鱼SNAP29基因相似性最高；SNAP29基因在健康半滑舌鳎所测的各组织中均有表达，在鳃组织中表达最高，在脑组织中表达量最低；利用海藻希瓦氏菌人工感染半滑舌鳎后，SNAP29基因在肠道组织、心脏组织和脑组织中表达量主要呈现上调趋势，在肝脏、头肾、脾脏组织中主要呈现下调表达，SNAP29基因在健康半滑舌鳎组织中均有表达；海藻希瓦氏菌感染半滑舌鳎的肠道、脑、心脏、肝脏、头肾、脾脏组织中SNAP29基因呈现差异表达。综上，SNAP29可能参与机体免疫应答过程或病理生理过程。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
扶晓琴 王娜 王佳林 陈松林 赵法箴
颗粒酶(granzyme， Gzm) B是免疫炎症反应必不可少的介质，可激活半胱天冬酶3，进而诱导靶细胞的凋亡。本研究通过PCR扩增和RACE技术获得了半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)颗粒酶B基因(CsGzmBl)的全长cDNA序列，并对其序列特征和表达水平进行了分析。结果显示，CsGzmBl cDNA全长为923 bp，开放阅读框长度为780 bp，编码259个氨基酸(前19个氨基酸残基为信号肽序列)，5′非编码区为49 bp，3′非编码区为94 bp。CsGzmBl的基因组结构比较保守，由5个外显子和4个内含子组成。CsGzmBl蛋白包含2个N端糖基化位点、1个催化三联体“His63Asp112Ser207”、1个“PHSRPYMA”结构域及6个保守的半胱氨酸。荧光定量PCR结果显示，CsGzmBl在半滑舌鳎健康成鱼不同组织中均有表达，其中，在脾脏中表达量最高，头肾、中肾、肝脏和鳃中次之，在肌肉中表达量最低。与对照组0 h相比，CsGzmBl在哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)感染后的不同时间点的脾脏、肠、肝脏、皮肤、鳃和肾脏中的表达水平均有不同程度的上调。这些结果表明，CsGzmBl基因在半滑舌鳎抵御哈维氏弧菌感染过程中发挥重要作用。
[期刊] 华北农学报
[作者]
田蕾 王峰 班旭空 那顺温都乐 齐贵春 何小龙 田春英 刘永斌 荣威恒
蒙古牛是在蒙古高原的大陆性严寒气候条件下形成的一个古老的地方品种,它具有遗传性稳定、抗病耐粗饲、宜牧、抓膘能力强,适应性强等生物学特性。为了阐明BMP4基因对蒙古牛繁殖性能的影响,试验根据GenBank中报道的人、小鼠、绵羊和牛BMP4基因序列设计引物,从蒙古牛卵巢、输卵管、子宫、肾脏中提取RNA,以β-actin为内参照物,采用RT-PCR技术分析BMP4基因在蒙古牛卵巢、子宫、输卵管和肾脏组织中的表达情况。结果表明,BMP4基因在蒙古牛这4种组织中均有表达,只是在不同组织中的表达丰度不同。蒙古牛BMP4基因在卵巢的mRNA水平极显著高于在输卵管、子宫和肾脏(P<0.01);在子宫中的mRN...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
王倩 张雪 陈亚东 沙珍霞
甘露糖结合凝集素相关丝氨酸蛋白酶1 (Mannan-binding lectin associated serine protease 1,MASP1)是补体凝集素途径中起重要作用的激活蛋白。本研究以半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)为研究对象,应用RACE技术和实时荧光定量qRT-PCR技术对半滑舌鳎MASP1基因(Cynoglossus semilaevis MASP1, CsMASP1)进行了克隆和表达模式分析。结果显示,CsMASP1基因c DNA序列全长为2507 bp,5′非编码区长82 bp,3′非编码区长142 bp,开放阅读框长2283 bp,共编码760个氨基酸;CsMASP1基因包含13个外显子和12个内含子,与多数已知鱼类的MASP1基因结构一致;SMART分析显示,CsMASP1包含6个结构域,与哺乳动物、鸟类、其他鱼类的结构域一致;同源比对发现,CsMASP1和鱼类的相似度较高,与金目鲈(Latescalcarifer)的相似性最高,为76%。CsMASP1基因在11种健康组织(血液、脑、鳃、性腺、心脏、头肾、肠、肝、皮肤、脾和后肾)中均有表达,其中,在肝、脾和头肾中表达量较高;鳗弧菌(Vibro anguillarum)感染后,CsMASP1基因在6种免疫组织(血液、鳃、头肾、肠、肝和脾)中呈现不同的表达模式,在6种免疫组织中呈现明显的上调表达,肝的表达峰值出现在感染后24 h;脾和鳃的表达峰值出现在感染后6 h;肠、头肾和血液的表达峰值均出现在感染后12h;随着病原菌感染时间增加,基因表达量逐渐降低并恢复至正常水平。研究表明,CsMASP1基因参与了半滑舌鳎的免疫应答过程,本结果为半滑舌鳎的免疫机理研究奠定了基础。
[期刊] 水产学报
[作者]
朱颖 孟亮 胡乔木 王晓夏 常亚青 陈松林
利用半滑舌鳎性腺转录组测序获得的StAR基因部分序列,设计RACE引物,克隆了半滑舌鳎StAR基因的cDNA序列,全长为1 294 bp,5'端UTR为132 bp,3'端UTR为310 bp,开放阅读框(ORF)为852 bp,共编码283个氨基酸。将半滑舌鳎StAR基因与其他物种StAR基因进行氨基酸同源性分析,结果显示,半滑舌鳎StAR与塞内加尔鳎、大口黑鲈、花鲈、金头鲷的同源性都达到了85%,与虹鳟、斜带石斑鱼及日本鳗鲡的同源性分别为81%、83%和76%。雌、雄鱼不同组织StAR基因的表达分析表明,StAR基因在雄鱼性腺中高表达,在雄鱼的肝脏、脑及心脏中表达量较低,而在雄鱼的其他组织...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
刘万军 张丽燕 邵长伟 王凯琳 齐茜 陈松林 温海深
生长阻滞和DNA损伤诱生蛋白45(growth arrest and DNA damage inducible protein 45,Gadd45)基因在胚胎发育和性别决定中起重要作用。本研究通过RACE方法在半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)中克隆得到了1个Gadd45g同源基因,命名为Gadd45g3。该基因全长1 147 bp,编码155个氨基酸残基。氨基酸序列分析表明,半滑舌鳎Gadd45g3与其他鱼类Gadd45g-like的同源性为79%~88%,与硬骨鱼和高等脊椎动物的Gadd45g同源性为58%~67%。对多个物种的Gadd45g同源基因的CDS区进行Ka...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
刘万建 史成银 宋展 耿伟光 李赟 黄倢
本研究克隆了半滑舌鳎干扰素调节因子7(CsIRF-7)cDNA的全长序列,并对该基因进行了结构特征分析,同时还完成了该基因在半滑舌鳎各组织中表达水平的定量分析。结果表明,CsIRF-7基因cDNA全长为1957bp,其中包含48bp的5′-UTR、1302bp的ORF和607bp的3′-UTR。CsIRF-7 cDNA编码一个由433个氨基酸残基组成的多肽。氨基酸序列比对结果表明,CsIRF-7多肽与脊椎动物IRF-7相似,存在高度保守的3个结构域:DNA结合域(DNA binding domain,DBD)、干扰素相关区(IRF associated domain,IAD)和丝氨酸富含区(S...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
刘姗姗 张静 陈松林
为研究HIRA基因在半滑舌鳎胚胎发育中的作用及其组织差异表达,以半滑舌鳎为研究对象,采用同源克隆策略从其精巢中分离了长度为764bp的HIRA部分cDNA序列,该片段编码254个氨基酸,具有5个WD结构域。对氨基酸进行比较发现,半滑舌鳎HIRA与比较物种的氨基酸序列具有很高的同源性,与红鳍东方鲀亲缘关系最近。实时定量PCR分析发现,HIRA mRNA在多细胞期到原肠胚期的表达量较高,表明HIRA对胚胎发育起重要作用;HIRA在不同组织中表达差异显著,其中在性腺中表达最高,推测HIRA在维持性腺的功能方面有一定作用。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
齐茜 董忠典 张宁 邵长伟 贾晓东 温海深 陈松林
通过ＲＡＣＥ方法获得半滑舌鳎（Ｃｙｎｏｇｌｏｓｓｕｓ ｓＥｍｉｌＡＥｖｉｓ）ＨＨ基因家族的ｓＨＨ基因，该基因全长１ ９２２ ｂｐ，其中５′ｕＴＲ ２６６ ｂｐ，３′ｕＴＲ ３６０ ｂｐ，ｏＲＦ１ ２９６ ｂｐ，编码４３１个氨基酸，经预测该多肽的相对分子质量为４７．２８ ｋ Ｄ，理论等电点６．９５，具有ＨＨ基因家族特有的保守结构域。氨基酸序列分析表明，半滑舌鳎ｓＨＨ与牙鲆的同源性最高，为８２％，与其他鱼类同源性为７４％～８１％，与非洲爪蟾的同源性为６１％，与人和鼠的同源性为６３％～６４％。甲基化结果显示，ｓＨＨ基因在１龄卵巢中的甲基化程度普遍低于雄鱼与伪雄鱼精巢。基因表达分析显示，ｓＨＨ基因在胚．．．
[期刊] 水产学报
[作者]
董晓丽 陈松林 季相山
同源克隆了半滑舌鳎Dmrt3基因的部分cDNA片段,片段长度为228bp,NJ系统发育树显示,半滑舌鳎Dmrt3基因cDNA片段与红鳍东方鲀、青鳉以及斑马鱼的Dmrt3基因cDNA片段同源性最高,首先聚为一支。实时定量分析了Dmrt3基因在半滑舌鳎雌性和雄性个体的各组织中的表达情况,以及在高温处理和甲基睾酮处理组的雌性、雄性和伪雄鱼的性腺组织中的表达。Dmrt3基因在雌性和雄性的脑、垂体、性腺、肝脏、脾脏、心脏、肾脏7个组织中都有表达,但是表达量有差异,在精巢中的相对表达量高,Dmrt3基因在精巢的表达与其它组织中的表达差异极显著(P<0.01),而在卵巢中的表达很微弱,结果预示Dmrt3基因...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
邢贺飞 高峰涛 张永珍 董忠典 陈松林
天然抗性相关巨噬细胞蛋白（Ｎａｔｕｒａｌ ｒｅｓｉｓｔａＮｃｅ－ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ｍａｃｒｏｐｈａｇｅ ｐｒｏｔｅｉＮ，Ｎｒａｍｐ）属于膜整合转运蛋白，具有抑制胞内寄生菌侵染、调节巨噬细胞的抗菌活性等作用。本研究对半滑舌鳎（ｃｙＮｏｇｌｏｓｓｕｓ ｓｅｍｉｌａｅｖｉｓ）Ｎｒａｍｐ基因进行了克隆和表达分析，并对其与抗鳗弧菌感染相关的单核苷酸多态性（ｓｉＮｇｌｅ Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ，ｓＮｐ）位点进行了筛选。该基因ｃ ｄＮａ序列全长３７１７ ｂｐ，其中开放阅读框（ｏｐｅＮ ｒｅａｄｉＮｇ ｆｒａｍｅ，ｏｒｆ）１６７７ ｂｐ，所编码蛋白含有５５８个氨基酸，该蛋白具有Ｎｒ．．．
[期刊] 中国水产科学
[作者]
董晓丽 陈松林
克隆了半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Dmrt4基因DNA全序列,得到的序列长度为2 271 bp,包含1个内含子,2个外显子,与其他鱼类的同源性在90%以上。Dmrt4基因在雌性和雄性半滑舌鳎的7个组织中都有表达,有差异表达的组织是脑、垂体和性腺,雄性的表达显著高于雌性(P0.05),但是甲基睾酮处理组的雄鱼和伪雄鱼的表达显著高于对照组的雌鱼和雄鱼(P<0.05)。Dmrt4基因的表达在胚胎发育过程中呈现先升高后降低的趋势,在原肠期表达量最高,显著高于其他几个时期(P<0.05),从...
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