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[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
范付华 杨勇胜 李庆宏 邓勇 文晓鹏
为探索枇杷新种质的鉴定方法,利用ISSR标记,构建了贵州18个枇杷栽培品种及课题组选育的7个优良新种质的DNA指纹图谱,并分析其相互间的亲缘关系。结果表明:以筛选出的15条引物进行PCR扩增,获得清晰、重复性好的谱带172条,其中多态性谱带157条,多态性比例为91.3%;应用3个引物825、834和848的组合,构建了25份枇杷品种(系)的ISSR指纹图谱,可以有效区分所有供试材料;聚类分析显示,在相似性系数为0.60时,可将供试种质分成2大类:一类主要为原产于浙江的品种(系),另一类主要为原产于四川的品种及选育的新种质;因此,ISSR标记能有效地用于枇杷栽培种及新种质的分子鉴定及其亲缘关系...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
关萍 马丹炜 王贵侠 石建明 陈放
该文利用ISSR分子标记技术,对分布于贵州的药用植物天麻的9个种群的遗传多样性水平和遗传结构进行分析,为传统的中药材天麻的遗传、育种及种质资源的保护和合理利用提供依据.该研究用12条ISSR引物共扩增出120条大小在200~1 600 bp清晰的谱带,其中97条具有多态性,总的多态位点百分率为80.83%,表明在物种水平上有较高的遗传变异;种群水平的多态性相对较低,多态百分率在17.5%~40.83%,平均25.56%.用POPGENE软件计算各种群间和种群内的遗传参数,结果表明:物种水平上的Nei’s遗传多样性(He)为0.042~0.153,平均0.073;Shannon信息指数为0.33...
关键词：
天麻 ISSR 遗传多样性 遗传结构
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
宋常美 文晓鹏
为探讨玛瑙红的起源原因,利用ISSR标记对贵州省纳雍县地方樱桃种质玛瑙红、酸樱桃、黑珍珠和4种欧洲甜樱桃等种质的亲缘关系进行分析。结果表明:用15条稳定性强、条带清晰及多态性丰富的引物进行PCR扩增,共获得286个标记位点,其中多态性位点为249个,多态性比例为87.06%;采用NTSYS2.01软件计算,7种樱桃相似性系数为0.41～0.94,玛瑙红与酸樱桃的相似系数为0.57。玛瑙红和酸樱桃在分子水平上的遗传差异很大,该种质可能为酸樱桃的实生变异种质。
关键词：
樱桃 种质 玛瑙红 贵州 ISSR
[期刊] 西南农业学报
[作者]
谭君 张彪 唐海涛 陈洁 何文铸 康继伟 叶国成 杨俊品
在SSR分子标记的基础上,以3个玉米自交系、4个玉米杂交种和7对玉米SSR引物为材料,确定了较为适宜的多重PCR扩增体系和程序,获得了适宜琼脂糖凝胶电泳的、扩增效果较好的2～5重引物组合,并能有效应用于玉米杂交种和自交系的种子鉴定,不仅比单个引物鉴定更准确可靠,而且省时省工,成倍地降低了检测成本,将有利于推动多重PCR技术在玉米品种鉴定中的广泛应用。
关键词：
玉米 SSR 多重PCR 琼脂糖凝胶电泳
[期刊] 中国农业科学
[作者]
胡冬梅 江东 李永平 彭磊 李冬云 朱延松 杨云光
【目的】柑橘芽极易发生变异,用形态学的方法鉴定这些芽变材料,易受环境、栽培条件等因素影响,而利用深度测序技术开展柑橘芽变材料鉴定,能够获得变异位点的基因型;同时,建立的技术体系也有利于柑橘资源的精准鉴定、种质资源的遗传多样性研究和植物性品种权保护。【方法】本研究通过靶位点SSR测序技术对柑橘芽变材料开展鉴定。首先利用柑橘全基因组序列扫描发掘SSR,采用多态性较高的SSR位点用于柑橘芽变材料的区分,进一步利用多路复用PCR扩增构建SSR靶位点文库,并通过MiSeq深度测序方法对2份温州蜜柑芽变材料的SSR靶位点进行测序验证。再利用开发的SSR标记对22份优质柑橘种质资源进行遗传多样性分析。【结果】利用GMATA软件在克里曼丁红橘(Citrus clementina Hort. ex. Tanaka)参考基因组和温州蜜柑(Citrus unshiu Macf.)基因组中分别获得69 101个和80 193个SSR,其中以AT/TA为主的2基序SSR最多,3基序中以AAT最多,通过序列比对发掘出变异热点区域的高多态性SSR用于温州蜜柑芽变材料的检测,4对SSR引物能对22份柑橘材料进行准确区分。77对SSR靶位点的深度测序一次性对多个SSR位点进行基因分型,能准确鉴定出2份温州蜜柑芽变材料的SSR基因型,以及SSR在基因组上的准确位置。结合SSR以及SNP基因型,能够对2份温州蜜柑芽变材料进行有效区分。【结论】本研究开发了用于柑橘芽变材料区分的高效SSR位点发掘方法,结合靶位点多路扩增和Target SSR-seq的深度测序实现了柑橘芽变材料的高效区分。
[期刊] 华北农学报
[作者]
宋顺华 郑晓鹰
采用随机引物扩增多态DNA(RAPD)技术分析了 2 1个大白菜主栽品种。用 13个引物共扩增出 87个清晰可重复的DNA片段 ,其中 39条带具有多态性 ,多态性条带的频率为 4 4 8%。OPE0 1是多态性频率最高的引物 ,它可区分 15个大白菜品种 ,再与引物OPH0 3和OPH12配合 ,即可将 2 1个大白菜品种区别开。
关键词：
大白菜 主栽品种 RAPD标记
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
郑光明 朱新平 张跃 罗建仁 夏仕玲
以池塘养殖的鲮（Ｃｉｒｒｈｉｎａ ｍｏｌｉｔｏｒｅｌｌａ） 、麦鲮（ Ｃ． ｍｒｉｇｏｌａ） 和野鲮（Ｌａｂｅｏ ｒｏｈｉｔａ） 各１２ 尾为材料，提取血液基因组ＤＮＡ，利用１０ ｂｐ 随机引物进行ＰＣＲ扩增，通过缩短扩增反映时间和电泳时间，快速鉴定３ 种不同的鲮鱼，建立了一套ＤＮＡ 分子水平上的快速鉴定鱼种的方法。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
曾黎辉 洪自同 林文忠 郑金水 吴少华
采用ISSR分子标记技术对51份龙眼种质资源进行遗传多样性和聚类分析.从100条内部简单重复序列(ISSR)引物中筛选出12条多态性好的引物,共扩增出110个可重复多态性位点,多态性条带比例为64.1%.聚类结果将51份样品分为中国龙眼和泰国龙眼两大品种群,其中的中国龙眼品种群分为7组.结果表明,龙眼种质资源具有遗传多样性.
[期刊] 西南农业学报
[作者]
王彬 郑伟 范建新 李兴忠 邓仁菊 蔡永强
为评价早熟枇杷种质资源的遗传多样性,用RAPD标记对贵州省内收集的16份和省外引进的3份早熟枇杷种质资源进行了遗传多样性分析。结果表明:从60条引物中筛选出6条稳定扩增的引物,共扩增出85条带,其中多态性带67条,多态性比例为78.82%。聚类分析,结果为19份早熟枇杷种质资源遗传多样性丰富,遗传距离在0.10～0.54;当GD=0.32时,19份早熟枇杷种质资源可以分为5类。结论:聚类结果与形态特征有一定的对应关系,这为早熟枇杷种质资源的保存、利用和新品种选育提供了依据。
关键词：
枇杷 早熟 RAPD 遗传多样性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
白占兵 粟建光 陈基权 戴志刚 王凤敏 龚友才
【目的】利用分子标记分析来自中国11个省(市)的48份青麻种质资源的遗传多样性,为青麻资源利用和育种提供分子生物学依据。【方法】利用内部简单重复序列多态性(ISSR)分子标记检测青麻种质资源的遗传多样性。【结果】在48份青麻种质资源中,9条ISSR引物扩增出82条带,多态条带比率(PPB)为88.89%,扩增产物片段大小在0.1～3.0kb。基于UPGMA聚类,将青麻分为3大类。【结论】中国青麻的遗传多样性水平较高,实验结果支持青麻起源于中国。
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
宋莎 吴亚维 季祥彪 宋来庆 文晓鹏
利用ISSR标记,对原产于贵州的10份苹果砧木种质及5份外来资源进行亲缘关系分析。结果表明:采用筛选出的10条引物,共扩增出75条重复性好的谱带,其中67条(占89.3%)具有多态性;应用引物827、M05、M08可以有效区分出15份种质资源,构建其DNA的ISSR指纹图谱;聚类分析表明,供试种质间的遗传相似系数在0.49～0.93之间,贵州威宁苹果砧木资源遗传多样性较为丰富,ISSR分析结果与已知苹果砧木间的谱系较为一致。
[期刊] 林业科学
[作者]
邹天才
贵州植物区系起源古老 ,特有和孑遗种类较多。贵州特有种子植物约有 2 80余种 ,分属 6 6科、144属 ,占全省种子植物科属种的比例分别为 33.8%、10 .3%和 5 .3% ,而且分布 31个中国特有单型属和黔苣苔属(Tengia)、辐花苣苔属 (Thamnocharis)、假胡麻属 (Centrantheropsis)和歧柱蟹甲草属 (Dicercodados) 4个贵州特有属。这些贵州特有植物是贵州森林资源组成的不可替代成分 ,并都具有多种生物学和重大经济价值。本文从重要用材林和园林观赏树种中遴选出如梵净山冷杉 (Abiesfanjingshanensis)等 6 0余种 ,对其...
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘永财 孟林 张国芳 毛培春 张德罡
利用ISSR标记对15份新麦草(Psathyrostachys juncea)种质资源进行遗传多样性检测。为获得稳定的新麦草ISSR反应体系,对反应条件中的dNTP、Taq酶浓度、引物浓度、Mg2+浓度等因子进行了优化,建立起的最佳反应体系为:25μL的反应体系中含有dNTP 2.5μL、Taq酶0.2μL、Primers 1μL、Mg2+1.5μL、2.5μL 10×Buffer、2μL模板DNA和ddH2O 15.3μL。ISSR标记结果显示,筛选出的重复性好、谱带清晰的ISSR引物8条,共获得84个扩增位点,其中多态性位点72个,多态性比率(PPB)为85.7%。通过遗传相似系数(GS)...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
盛慧 秦智伟 周秀艳 武涛
【目的】寻找黄瓜胚胎发育早期和胚胎发育晚期优势表达基因,研究其胚胎发育的分子机制。【方法】利用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建胚胎发育早期和晚期差异表达cDNA文库。【结果】经反向Northernblot杂交检测,共得到97个阳性克隆。利用分子生物学软件对测序后的序列进行质量检测和聚类、拼接,共得到93个UniESTs,其中包括86个singletons和7个contigs。将上述EST序列在GenBank上进行BLAST比对,有83个EST片段找到了与之匹配的同源序列,有10个EST片段未找到同源序列,推测可能是新基...
关键词：
黄瓜 SSH 胚胎发育 cDNA文库
[期刊] 林业科学
[作者]
王永清 付燕 杨芩 罗楠 邓群仙 严娟 曾建国 阮光伦
采用ISSR技术对41份枇杷属植物材料进行分类和遗传多样性研究。从100条引物中筛选出20条引物共产生436条带,其中多态性带392条,占89.9%。平均有效等位基因数为1.3,平均Nei’s基因多样性指数为0.2085,平均Shannon信息指数为0.3323,表明枇杷属植物中具有较丰富的遗传多样性。发现特异性条带33个,但并未发现春季开花或秋冬开花的特异标记,所用ISSR标记分析枇杷属植物的亲缘关系所得聚类结果表明,开花时期不能作为枇杷属植物的分类依据。相似系数0.722可将41份枇杷属植物分为野生类群和栽培类群,而栽培品种却不能按单一性状进行聚类。对枇杷属植物的分类方法进行讨论。
关键词：
枇杷属 ISSR 分类 遗传多样性
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