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[期刊] 草业科学
[作者]
张俊超 谢文刚 赵旭红 张宗瑜 赵永强 王彦荣
本研究利用EST-SSR分子标记,对国内的52份老芒麦(Elymus sibiricus)材料进行遗传多样性的研究,并构建了7个老芒麦品种及栽培材料的DNA指纹图谱。20对EST-SSR引物共产生204个条带,平均每对引物扩增出10.2条带,176(86.27%)条带为多态性条带,表明供试材料具有较高水平的多态性。同时,引物Elw404和Elw195构建的指纹图谱较为容易地将品种和栽培材料与其他材料区别开。分子方差分析(AMOVA)表明,老芒麦地理区域内(73.94%)的遗传变异远高于地理区域间(26.0
[期刊] 中国农业科学
[作者]
匡猛 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱
【目的】采用SSR标记构建2008年中国3大棉区8个棉花主产省份32份棉花主栽品种的DNA指纹图谱并进行遗传多样性分析。【方法】从214对候选引物中筛选出36对多态性高、稳定性好且在染色体上分布均匀的引物作为核心引物,构建棉花主栽品种DNA指纹图谱。【结果】36对SSR引物在32份材料中共扩增出142种多态性基因型,每对引物的基因型从2—11种不等,平均每对引物扩增出3.94种基因型。9对引物在10个品种上具有特征带型。最少采用5对引物进行组合鉴定即可将32个棉花品种完全区分开。NTSYS-pc V 2.10软件分析表明,长江流域棉区品种间遗传差异最大,新疆棉区次之,黄河流域棉区最小。常规品种...
[期刊] 华北农学报
[作者]
陈浩东 肖才升 李庠 匡政成 王为 李育强
为解决长江流域缺乏适合短季棉材料分子分析的SSR引物问题及加强对引进短季棉材料遗传信息的了解,以从中国农业科学院棉花研究所引进的15份短季棉品种为材料,利用SSR标记进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。结果表明,从214对候选SSR引物中筛选出稳定性好、多态性高、基本覆盖棉花26条染色体的68对引物,对15份材料的基因组DNA进行了PCR扩增,共检测出178个有效等位位点,平均每对引物检测到2.62个;引物多态性信息含量(PIC)值介于0.244 9~0.906 1,平均0.693 8。品种指纹分析结果显示,在15份材料中,12份材料可采用特征引物进行一次性区分,其他材料需采用引物组合来实...
关键词：
短季棉 SSR 指纹图谱 遗传多样性
[期刊] 西南农业学报
[作者]
赵科 孙淑霞 李靖 涂美艳 王玲利 何成勇 徐子鸿 江国良 宋海岩 陈栋
【目的】丰富枇杷种质资源鉴定方法，为其发掘和利用提供理论依据。【方法】利用277对EST-SSR标记和1对果肉颜色相关InDel标记，对52份国内外枇杷种质资源和本研究团队创制的杂交后代进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。【结果】筛选出扩增带型清晰、稳定性和重复性好的9对引物，每对引物扩增条带为2～5条，平均85条；多态性条带比率为40.00%～100.00%，平均71.55%；多态性信息含量（PIC）为0.250～0.999，平均0.685。遗传多样性分析显示，52份枇杷种质资源和创制的杂交后代的平均相似系数为0.791；果肉颜色一致或地理分布相近的枇杷种质资源被聚类到相近的分类单元，并且可以准确地将西班牙、日本枇杷种质资源与其他种质资源进行区分。此外，本研究还构建了52份枇杷种质资源的DNA指纹图谱和色块矩阵。【结论】丰富了枇杷种质资源鉴定的分子标记，为今后发掘分子标记紧密连锁的功能基因或片段提供了理论依据。
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
董胜君 王新鑫 张皓凯 陈建华 刘权钢 徐豪
东北杏（Armeniaca mandshurica）是东北地区极具经济开发前景的树种，具有重要的生态、经济、社会价值，应用SSR分子标记技术，采用101对扩增条带清晰、多态性高的引物，对61份东北杏野生种质进行PCR扩增，以分析东北杏的遗传多样性，并采用引物组合法构建东北杏的SSR指纹图谱，旨在为东北杏种质资源的鉴定评价、保育研究及合理开发利用提供科学依据。结果表明：101个位点的平均观测等位基因（Na）和有效等位基因的所占比值分别为9.6436和55.13%；平均观测杂合度（Ho）和平均期望杂合度（He）分别为0.2155和0.7711;Shannon’s信息指数（I）和多态性信息含量（PIC）分别为1.7533和0.7316，表明东北杏种质资源具有丰富的遗传多样性。10个种源的遗传多样性差异显著，其中，辽宁省沈阳市的遗传多样性最高，而辽宁省丹东市的遗传多样性最低。聚类结果表明，在遗传相似系数0.842处可以将东北杏种质分为4类(A类、B类、C类、D类)；在遗传距离0.250处可以将东北杏的不同种源分为3类(P1类、P2类、P3类)，均反映了地理种源对东北杏的分类结果占据主导地位。地理距离与遗传距离呈显著相关（p<0.05），表明东北杏种质存在地理隔离现象。采用3对SSR引物（L46、P58H、L28H）构建了东北杏种质的SSR指纹图谱，为东北杏种质资源的分子鉴定提供了重要方法。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘娟 廖康 曼苏尔·那斯尔 孙琪 刘欢 贾杨
【目的】从ISSR分子标记水平分析新疆主栽杏品种(系)的遗传多样性和亲缘关系,构建新疆杏品种(系)的DNA指纹图谱数据库,为杂交育种、品种鉴定和品种分类提供理论依据。【方法】从供试样品中选取表型差异较大的6份材料对100个ISSR引物进行筛选,最终筛选出条带清晰、主带明显、多态性丰富、能够稳定重复且对品种具有较高鉴别力的ISSR特征引物,对48个新疆杏品种(系)进行扩增,采用POPGENE version 1.32软件计算多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),及各材料间的Nei’s遗传相似系数(...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
李怀志 张峻 李翔 陈火英
利用SRAP技术对36份茄子栽培品种进行了分子鉴定。结果表明:选用25对引物组合对其基因组DNA进行PCR扩增,共获得566条扩增带,其中多态性谱带102条,平均每个引物组合扩增出4.08条多态性条带;品种间‘望哈茄’与‘本溪早紫茄’遗传相似系数最大,为0.986,‘辐射1号’与‘沪紫长茄’间遗传相似系数为0.581。同时使用8对引物组合构建了36个品种的指纹图谱,其中引物FC8ME10可以把‘闽长茄’与其他茄子品种完全区分开。引物SA1OD3可以把‘敦和茄’和‘苏大青茄’同其他茄子品种区分开来。表明:SRAP标记技术能较好地从分子水平揭示出茄子品种的遗传多样性,并能有效应用于茄子品种指纹图谱...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
郭娟 樊军锋 梁军
【目的】利用新型分子标记EST-SSR,从分子水平上区分亲缘关系较近、形态上难以区分的5个美洲黑杨品种,并构建其指纹图谱。【方法】采用EST-SSR分子标记,从22对引物中筛选多态性引物,用以鉴别I-69杨、陕林3号、创新杨1号、南抗1号、北抗1号5个美洲黑杨品种,并根据多态性条带计算各品种间的遗传相似系数,构建各自的指纹图谱。【结果】从22对引物中筛选出的17对多态性引物共扩增出86条谱带,其中多态性条带69条,多态性比率为80.23%,有5对引物可以将5个美洲黑杨品种完全区分开;各品种间的遗传相似系数为0.444 4~0.717 2,平均相似系数为0.580 8;构建了各品种的EST-SS...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
郭燕 刘声传 曹雨 赵华富 魏杰 鄢东海 周富裕
为了贵州古茶树资源的有效保护和充分利用提供理论依据，采用ＥＳＴ－ＳＳＲ标记对４０份贵州古茶树资源进行了遗传多样性分析和分子指纹鉴定。结果表明：２０个ＳＳＲ标记在４０份资源中共检测到７６个等位基因，平均每个标记３．８个，ＰＩＣ和Ｓｈａｎｎｏｎ信息指数平均值分别为０．４６２和０．９３６，多态性适中。７６个等位基因在参试古茶树资源中的出现频率差异较大，变异范围为１．３２％～８９．７４％。参试材料的ｎＥＩ＇Ｓ遗传距离（Ｄ）为０．０７５～０．８７５，当Ｄ≈０．１６０时，４０份古茶树资源可聚为６类，包括３个单独聚类和３个复合聚类。利用４个核心标记即可鉴定４０份古茶树资源，并根据等位基因带型，获得１８位数的．．．
[期刊] 林业科学
[作者]
毛秀红 郑勇奇 孙百友 张元帅 韩丛聪 位晓 荀守华
【目的】对山东省刺槐无性系进行遗传多样性分析和指纹图谱构建,为刺槐新品种选育、遗传改良和品种鉴定提供可靠的依据,为中国其他省市刺槐遗传资源保存、评价与利用提供参考。【方法】采用荧光SSR引物进行PCR扩增,产物经毛细管电泳仪进行检测;利用所得结果分析49个无性系遗传多样性并构建其指纹图谱;采用非加权组平均法(UPGMA)进行基于亲缘关系的无性系聚类分析。【结果】8对SSR引物共检测到51个等位基因,每个位点的等位基因为215个,平均每对引物扩增出6.375个多态性等位基因。不同位点的PIC值变化范围很大,
[期刊] 华北农学报
[作者]
韩宗福 赵逢涛 王景会 王宗文 申贵芳 孔凡金 李汝忠 张军
利用28对SSR核心引物构建了25个鲁棉研系列抗虫棉品种的分子指纹图谱并进行遗传多样性分析。28对核心引物的SSR位点分属21条染色体,等位基因数为2~8个,平均4.39个;PIC值为0.63~0.93,平均0.84。数字指纹图谱显示,最少采用BNL1421、BNL1513、BNL1231、NAU2026和BNL2646这5对引物组合可以将25份供试材料区分开。对其中14个常规品种的遗传多样性分析表明,其遗传相似系数介于0.35~0.87,平均为0.57。此结果可为现阶段鲁棉研系列种质资源的杂交选育提供依据。
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘丹丹 逯晓萍 张瑞霞 温莹 薛春雷 杨凯 任锐 王亚男 韩平安
利用SRAP分子标记技术构建了22份高丹草品种的指纹图谱。该指纹图谱可以准确区分供试的所有22个高丹草品种,置信概率达到99.9 999%,为高丹草品种划分提供了基础。利用筛选出的19个多态性较好的SRAP引物组合对22个高丹草品种进行遗传多样性分析鉴定,共扩增出450个位点,其中多态性位点369个;平均每个引物组合产生23.6个位点和19.4个多态性位点,平均多态性水平为82.2%。通过采用UPGMA方法进行聚类分析,遗传相似系数在0.66～0.94之间,以遗传相似系数0.674为阈值,可将供试材料分为2个类群。
关键词：
高丹草 指纹图谱 遗传多样性 SRAP
[期刊] 西南农业学报
[作者]
殷丽琴 彭云强 付绍红 杨进 陈涛 黄敏 余勤 韦献雅 牛应泽
本试验从７０条ＩＳＳＲ引物中筛选出１５条多态性好的ＩＳＳＲ引物，对１０份原产自云南的彩色马铃薯材料进行遗传多样性分析和ＩＳＳＲ指纹图谱构建。结果表明，１５条引物共扩增到１０１条清晰条带，８９个多态性条带，多态性条带百分率为８９．２４％，引物平均多态性位点５．９３，平均多态性信息量０．８２３。聚类分析可将１０份彩色马铃薯划分为４类，其中Ｓ０３－２６７７和Ｓ０３－２６８５的遗传相似系数最大，而紫云１号和Ｓ０６－２７７的遗传相似系数最小。同时筛选到１条核心引物ＡＷ６７７７６，绘制了１０份彩色马铃薯品种的指纹图谱。结果表明ＩＳＳＲ标记能够较准确地按亲缘关系划分彩色马铃薯品种，可为我国彩色马铃薯的品种选．．．
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
段永红 雷海英 张旭 吴玉香 孙毅
为挖掘苦参优异种质资源,利用大宗药材苦参现有的EST资源开发EST-SSR标记,分析不同地理种源苦参的遗传多样性,构建其特有的DNA指纹图谱。通过生物信息学手段对NCBI数据库中苦参EST序列进行SSR查找,利用Primer 5.0软件设计EST-SSR引物,筛选多态性引物检测苦参样本DNA差异,采用UPGMA聚类分析样本的遗传多样性,并构建DNA指纹图谱。经分析得到92条Unigene,从中发掘出126个EST-SSR位点分布于61条Unigene上。SSR检出率为66.30%,平均分布距离为0.512kb;共搜索到61种EST-SSR的重复基元,五核苷酸和六核苷酸重复是主要的重复类型,二者出现频率分别为68.25%和25.40%,没有三核苷酸出现,AAAAT/ATTTT与AAGTGG/CCACTT是五、六核苷酸的优势重复类型;设计出65对苦参的EST-SSR引物,随机合成26对,筛选出18对多态性引物可用于苦参样本遗传多样性分析,共检测出77个等位变异,平均每对引物检测出4.3个基因位点,引物多态性比率为69.2%;聚类分析结果表明:苦参材料首先按照居群聚类,在相似系数为0.73处,供试材料按亲缘关系远近分为5大类,相同或相近产地来源的苦参样本聚为一类,呈现出一定的地域性分布规律;筛选到2对核心引物DYH011与DYH018,构建了苦参样本的DNA指纹图谱,作为对不同产地来源苦参鉴定和溯源的依据。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
邵雪花 刘牛 赖多 肖维强 匡石滋
[目的]利用ISSR分子标记技术对28份余甘子种质资源进行遗传多样性分析,并构建其指纹图谱。[方法]从96条ISSR引物中筛选得到9条核心引物,用作广东省农业科学院收集的华南地区28份余甘子品种分子标记,利用UPGMA聚类分析余甘子种质资源遗传多样性,以核心引物UBC809和UBC886组合构建余甘子DNA指纹图谱。[结果]9条ISSR核心引物对28份余甘子样品扩增共得到686条条带,其中多态性条带667条,多态率为97.23%。通过聚类分析将28份余甘子样品聚为4类,其中大果油甘和甜油甘5号遗传分化较大,各单独聚为一类,珍珠油甘、甜油甘2号和甜油甘4号聚为一类,其余23个品种聚为一类。利用核心引物UBC809和UBC886组合,成功构建了余甘子DNA指纹图谱,供试28份余甘子品种(系)每个都有一套唯一的指纹图谱编码。[结论]成功构建了28份余甘子种质的指纹图谱,可用于余甘子种质资源的分类与鉴定,同时可用于余甘子杂交新品种选育。
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