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[期刊] 渔业科学进展
[作者]
段毓佳 谭建 栾生 罗坤 王宏杰 隋娟 孟宪红 孔杰
在水产养殖中，尤其是高密度养殖情况下，缺氧会短期内造成个体的大量死亡，从而影响生产效益。本研究以凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)高抗和快大2个品系作为研究对象，利用高致死溶解氧(DO)胁迫的方式对2个品系各41个家系共计6 560尾幼虾进行低氧耐受性测试，统计高致死溶解氧水平下幼虾的存活性状，分析不同品系间及同一品系不同家系间耐低氧性状的差异，评估其遗传参数；对耐受性有显著差异的家系个体的鳃、肌肉、肝胰腺组织进行组织学观察，并比较其细胞水平上的差异。结果显示，在0.3 mg/L低氧条件下，高抗品系和快大品系的家系半致死存活率SS_(50)均表现出显著差异(P<0.05)，高抗品系SS_(50)为49.30%，快大品系SS_(50)为42.52%；家系间存活时间的变异系数分别为60%和45%。利用阈值性状动物模型，以半致死时的个体存活状态作为观测值(存活为1，死亡为0)估算的遗传参数为(0.345±0.031)～(0.378±0.029)，经过转换后在连续变化的观测值尺度上的遗传力为(0.219±0.031)～(0.237±0.029)，表现为中等遗传力水平。高抗品系中低氧耐受家系和低氧敏感家系的鳃、肌肉、肝胰腺组织均出现不同程度的损伤，但不同的家系间表现出不同程度的抗逆生理特征差异，这可能与高抗不同家系抗逆耐受力强弱有关。不同家系间在低氧胁迫下的存活时间、生理特性差异以及各品系遗传力估算结果表明，凡纳滨对虾对高致死溶解氧水平的耐受性状存在丰富的遗传变异，具有选育的可行性。
[期刊] 水产学报
[作者]
孔杰 栾生 罗坤 李旭鹏 孟宪红 曹宝祥 刘宁
为揭示不同盐度环境对凡纳滨对虾家系体质量和存活性状的影响,本研究标记来自72个家系的4348尾对虾,在盐度30(HS组)和盐度15(LS组)条件下混养60 d,分析体质量和存活性状的遗传参数以及基因型与环境互作效应。结果显示,HS组的凡纳滨对虾平均体质量和存活率均高于LS组。估算体质量、存活性状遗传参数,结果显示HS和LS组体质量的遗传力估计值分别为0.51±0.08和0.30±0.07,属高遗传力;转换后存活性状遗传力估计值分别为0.22和0.39,也表现为中高遗传力水平。综合HS和LS组的数据,估算的
[期刊] 水产学报
[作者]
徐如卫 钱昭英 刘小林 路正 任晋东 杨福生
采用平衡巢式设计方法和人工授精技术,每个雄体配3个雌体,构建了18个父系半同胞家系和54个母系全同胞家系。分别测定了每个母系生长到5月龄60个全同胞个体的体质量、全长、体长、头胸甲长、头胸甲宽、头胸甲高、第一腹节背高、第三腹节背高和第一腹节背宽9个生长性状,应用数量遗传学原理,采用方差和协方差分析的方法,估算了5月龄凡纳滨对虾生长性状的遗传力及各性状间的遗传相关及表型相关。结果表明,利用父系半同胞组内相关法估计的遗传力是凡纳滨对虾各生长性状遗传力的无偏估计值。其中,体质量、全长、体长、头胸甲长、头胸甲宽、头胸甲高、第一腹节背高、第三腹节背高和第一腹节背宽狭义遗传力的估计值分别为0.460、0....
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
郝登春 栾生 曹宝祥 郭聚涛 罗坤 陈宝龙 孟宪红 许圣钰 孔杰
准确估计育种目标性状的遗传参数,评估其改良潜力,是制定育种方案、进行选择育种工作的重要前提条件。本研究对100个凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)家系15000尾仔虾个体进行淡化和低盐养殖实验,分析了2个阶段家系间存活率的差异,并进一步估计存活性状的遗传力。结果显示,2个阶段存活率范围分别为19.3%100.00%和11.86%99.22%,平均存活率分别为66.7%和67.5%。家系幼虾期总体存活率为6.67%90.67%,平均存活率为46.91%。统计分析显示,2个阶段家系间存活率
关键词：
凡纳滨对虾 淡化实验 存活率 遗传力
[期刊] 水产学报
[作者]
刘均辉 栾生 罗坤 曹宝祥 陈宝龙 孟宪红 刘宁 孔杰
针对凡纳滨对虾生长和存活性状，本实验估算了零换水养殖模式下的遗传参数，分析该模式与大换水量养殖模式的基因型与环境互作效应（ｇｅｎｏｔｙｐｅ ｂｙ ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ ｅｆｆｅｃｔ，ｇ×ｅ），为后续留种、配种方案制定等育种规划工作提供依据。通过人工授精技术，定向交尾建立了５１个凡纳滨对虾全同胞家系。利用荧光标记识别家系，采用零换水养殖模式混养５２ ｄ后，测量并记录２个养殖池中的３８２２尾存活虾的体质量、体长及性别等信息。采用线性（广义线性）混合效应模型和ｒｅｍＬ算法，基于个体动物模型和父母本阈值模型估计生长和存活性状的方差组分和遗传力。结果显示，收获体质量和存活率具有．．．
[期刊] 水产学报
[作者]
金武 栾生 孔杰 罗坤 孟宪红 张天时 王清印
为预测和评估目标性状[收获体质量(BW),存活率(SR)和饲料摄入量(FI)]的遗传进展及经济效益,实验依据凡纳滨对虾多性状复合育种方案进行模拟选择了20个世代。此外,实验还利用选择指数理论,估计目标性状的选择反应、遗传进展以及育种目标;并对影响利润(RP)和效益成本比率(BCR)的生物学参数(遗传力、育种目标是否包括FI),经济学参数(对虾价格、饲料价格、贴现率、初投资、年费用)和运行参数(首次回报年份、扩繁效率)进行了敏感性分析。结果表明,在基础参数值下,BW、SR和FI每个世代的选择反应分别为0.86 g,4.70%和1.54 g;育种方案执行20年产生的RP和BCR分别为862 747...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
和怡婧 李旭鹏 栾生 孔杰 曹宝祥 罗坤 谭建 曹家旺 陈宝龙 代平 邢群 刘绵宇 强光峰 刘杨 隋娟 孟宪红
为开展凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)生长和白斑综合征病毒(white spot syndrome virus， WSSV)抗性复合选育，本研究以凡纳滨对虾59个核心育种群家系1 770尾77～94日龄的个体为实验材料，利用两性状动物模型、公母畜阈值模型评估在WSSV感染情况下，凡纳滨对虾体长、抗WSSV存活时间和家系WSSV半致死存活率的遗传力和遗传相关。研究结果显示，凡纳滨对虾体长、抗WSSV存活时间和家系WSSV半致死存活率遗传力估计值分别为0.17±0.05、0.18±0.05和0.14±0.05，均属于中等遗传力水平，且均与0差异极显著(P<0.01)。凡纳滨对虾体长与抗WSSV存活时间性状的遗传相关系数为0.15±0.20，与家系WSSV半致死存活率性状的遗传相关系数为0.25±0.22，上述遗传相关与0差异不显著(P>0.05)；抗WSSV存活时间性状与家系WSSV半致死存活率性状的遗传相关系数为0.96±0.03，遗传相关与1差异不显著(P>0.05)，为高度正相关。研究结果显示，在该育种群体中，凡纳滨对虾生长与WSSV抗性可根据育种需要，通过赋值制定综合选择指数，进行多性状复合选育。此外，为优化每代育种的操作过程，可选用家系WSSV半致死存活率作为WSSV抗性的指标性状。本研究为开展凡纳滨对虾生长和WSSV抗性优良品种的选育提供了基础数据和理论支撑。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
和怡婧 刘绵宇 栾生 孔杰 李旭鹏 曹宝祥 罗坤 谭建 曹家旺 代平 强光峰 王照欣 隋娟 孟宪红
本研究基于55K SNP液相芯片“黄海芯1号”分型信息估计了凡纳对虾(Penaeus vannamei)生长和白斑综合征病毒(WSSV)抗性的遗传参数，以期为育种芯片在凡纳对虾多性状复合新品种选育中的应用提供数据。对凡纳对虾59个家系，共计1 770尾个体进行WSSV感染测试；根据家系内个体抗WSSV存活时间均匀选取590尾个体，利用55K SNP液相芯片进行分型，复合系谱和基因型信息构建H矩阵及个体动物模型和父母本模型，基于H矩阵估计凡纳对虾感染WSSV后体长、个体抗WSSV存活时间和家系WSSV半致死存活率的遗传力和遗传相关。结果显示，凡纳对虾体长、个体抗WSSV存活时间遗传力分别为0.21±0.06、0.22±0.16，为中等遗传力水平，家系WSSV半致死存活率和0.16±0.06，为低等遗传力水平；经五折交叉验证，基于H矩阵的体长遗传力预测准确性较A矩阵提高18.12%，预测偏差无明显差别；抗WSSV存活时间遗传力预测准确性较A矩阵无明显差别，预测偏差较大；家系半致死存活率遗传力预测准确性较A矩阵降低29.07%，预测偏差较大。基于两性状动物模型，估计凡纳对虾体长与个体抗WSSV存活时间、家系WSSV半致死存活率遗传相关分别为0.13±0.20和0.30±0.22，与0无显著差异(P>0.05)；个体抗WSSV存活时间与家系WSSV半致死存活率的遗传相关为0.95±0.03，与1无显著差异(P>0.05)。研究显示，利用芯片开展凡纳对虾生长的遗传评估可有效提高评估的准确性；WSSV抗性性状的评估可能受分型个体选择等因素影响，预测准确性无明显提升；个体抗WSSV存活时间在准确性和预测偏差等方面均优于家系抗WSSV半致死存活率的评估结果。在抗WSSV存活时间和家系半致死存活率高度相关的情况下，可考虑将抗WSSV存活时间作为基因组选择的目标性状。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
和怡婧 刘绵宇 栾生 孔杰 李旭鹏 曹宝祥 罗坤 谭建 曹家旺 代平 强光峰 王照欣 隋娟 孟宪红
本研究基于55K SNP液相芯片“黄海芯1号”分型信息估计了凡纳对虾(Penaeus vannamei)生长和白斑综合征病毒(WSSV)抗性的遗传参数，以期为育种芯片在凡纳对虾多性状复合新品种选育中的应用提供数据。对凡纳对虾59个家系，共计1 770尾个体进行WSSV感染测试；根据家系内个体抗WSSV存活时间均匀选取590尾个体，利用55K SNP液相芯片进行分型，复合系谱和基因型信息构建H矩阵及个体动物模型和父母本模型，基于H矩阵估计凡纳对虾感染WSSV后体长、个体抗WSSV存活时间和家系WSSV半致死存活率的遗传力和遗传相关。结果显示，凡纳对虾体长、个体抗WSSV存活时间遗传力分别为0.21±0.06、0.22±0.16，为中等遗传力水平，家系WSSV半致死存活率和0.16±0.06，为低等遗传力水平；经五折交叉验证，基于H矩阵的体长遗传力预测准确性较A矩阵提高18.12%，预测偏差无明显差别；抗WSSV存活时间遗传力预测准确性较A矩阵无明显差别，预测偏差较大；家系半致死存活率遗传力预测准确性较A矩阵降低29.07%，预测偏差较大。基于两性状动物模型，估计凡纳对虾体长与个体抗WSSV存活时间、家系WSSV半致死存活率遗传相关分别为0.13±0.20和0.30±0.22，与0无显著差异(P>0.05)；个体抗WSSV存活时间与家系WSSV半致死存活率的遗传相关为0.95±0.03，与1无显著差异(P>0.05)。研究显示，利用芯片开展凡纳对虾生长的遗传评估可有效提高评估的准确性；WSSV抗性性状的评估可能受分型个体选择等因素影响，预测准确性无明显提升；个体抗WSSV存活时间在准确性和预测偏差等方面均优于家系抗WSSV半致死存活率的评估结果。在抗WSSV存活时间和家系半致死存活率高度相关的情况下，可考虑将抗WSSV存活时间作为基因组选择的目标性状。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
朱相燕 孟宪红 代平 孔杰 栾生 曹家旺 谭建 邢群
为探讨选育零鱼粉需求凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)品种的可能性，解决目前鱼粉短缺、饲料成本居高不下的问题，本研究在零鱼粉饲料(蛋白含量占38%)和高鱼粉饲料(鱼粉含量占25%，蛋白含量占42%)饲喂条件下进行凡纳滨对虾饲料利用效率相关性状的遗传评估。选择30个家系进行40 d的单尾饲养实验，发现饲喂高鱼粉饲料的对虾的平均增重率(62.00%)和平均饲料效率比(124.00%)明显高于饲喂零鱼粉饲料(23.50%和49.40%)。对虾摄食量和增重率在零鱼粉饲料和高鱼粉饲料饲喂下的遗传力在0.458±0.140到0.699±0.155之间，饲料效率比在零鱼粉饲料和高鱼粉饲料饲喂下的遗传力分别为0.186±0.098和0.341±0.110。由于没有剖分出共同环境效应，遗传力都存在一定程度高估，因此，零鱼粉饲料饲喂下的饲料效率比的遗传变异并不高。摄食量和增重率在2种饲料间的遗传相关分别为0.580±0.171和0.676±0.155，表示这2个性状存在中等的基因型与饲料互作效应。饲料效率比在2种饲料间的遗传相关仅为0.299±0.304，表示该性状存在严重的基因型与饲料互作效应。综上结果来看，使用零鱼粉饲料不利于凡纳滨对虾的养殖效益及选育工作的开展。
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
田燚 孔杰 栾生 张天时 罗坤 王清印
通过人工授精的方法建立了中国对虾21个半同胞家系(47个全同胞家系)。测量了中国对虾21个半同胞(47个全同胞)家系的体长、头胸甲长、头胸甲宽、第2和第3腹节处宽、第2和第3腹节处高、第1腹节长、第6腹节长和体重,共测量中国对虾1387尾。采用混合家系材料,利用Mtd-freml软件中的动物模型进行分析,平均体重作为协变量,得到的生长性状遗传力在0.04～0.20。体重遗传力为0.14±0.16。体长的遗传力为0.10±0.06,头胸甲长为0.07±0.06,头胸甲宽为0.05±0.04,第2、3腹节宽为0.20±0.16,第2、3腹节高的最低为0.04±0.13,第1腹节长为0.09±0.0...
关键词：
中国对虾 遗传力 遗传相关 生长性状
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
王明珠 孟宪红 孔杰 曹家旺 王军 冯亚萍 强光峰
本研究采用室内人工降温的方式,对69个中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)家系共1327尾成虾进行了耐低温实验,测定其生长和耐低温性状;并利用混合模型方程,通过平均信息约束极大似然法进行遗传力和遗传相关估计。采用2种动物模型对中国明对虾成虾低温下体重、体长的遗传力进行评估,模型1加入了共同环境效应,模型2没有加入共同环境效应。由模型1获得的体重、体长的遗传力分别为(0.206±0.177)、(0.187±0.179),由模型2获得的体重、体长的遗传力分别为(0.317±0.065)、(0.298±0.063),均为中低等遗传力。经似然比检验体重、体长在模型1和模型2间的似然比值均无显著差异(P>0.05),表明模型1和模型2之间无显著差异,模型2为较优遗传模型。以半致死时的存活状态作为耐低温性状指标,遗传力为(0.169±0.078),为低等遗传力。低温下体重、体长之间的表型和遗传相关分别为(0.823±0.010)和(0.969±0.018),为高度正相关;低温下体重、体长与半致死时的存活状态的表型相关分别为(0.187±0.030)和(0.218±0.030),为低度正相关;而遗传相关分别为(0.517±0.205)和(0.538±0.203),为中度正相关。本研究表明,对生长性状进行的选育不会降低其耐低温能力,中国明对虾耐低温性状可与生长性状进行共同复合选育。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
郑静静 刘建勇 蒋湘 谢妙 曹伏君
基于68个日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)全同胞家系,采用混合线性模型和约束极大似然法对日本囊对虾生长性状进行遗传参数的估计。结果表明:1)45日龄、75日龄体长性状的遗传力估计值分别为0.1545±0.0505、0.1933±0.0475,腹节长性状的遗传力估计值分别为0.1672±0.0473、0.1937±0.0468,体重性状的遗传力估计值分别为0.1934±0.0439、0.1992±0.037,均为中等遗传力;2)不同日龄下日本囊对虾生长性状间的表型相关与遗传相关均为
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
黄桂仙 李旭鹏 田吉腾 栾生 孔杰 曹宝祥 刘宁 罗坤 谭建 曹家旺 代平 陈宝龙 强光峰 刘绵宇 刘杨 王宏杰 刘学会 隋娟 孟宪红
为开展凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)生长和急性肝胰腺坏死病(acute hepatopancreatic necrosis disease， AHPND)抗性复合选育，本研究以自主选育的凡纳滨对虾高抗和快大品系为研究对象进行生长和AHPND抗性测试。实验家系共计70个(高抗家系40个，快大家系30个)，实验个体共计1 760尾(高抗个体800尾，快大个体960尾)。2个品系分2批次进行Vp_(AHPND)定量口饲感染。批次内实验个体达半数死亡后停止投喂毒饵。利用个体动物模型和父母本阈值模型评估2个品系3 个性状(体重、感染Vp_(AHPND)后个体存活时间、家系半致死存活率)的遗传力；利用两性状动物模型评估3个性状两两之间的遗传相关。结果显示，高抗系体重遗传力估计值为0.599±0.120，为高遗传力水平；个体存活时间遗传力估计值为0.240±0.072，为中等遗传力水平；家系半致死存活率遗传力估计值为0.173±0.051，为低等遗传力水平。快大系体重、个体存活时间和家系半致死存活率的遗传力估计值分别为0.266±0.082、0.374±0.096、0.257±0.048，均为中等遗传力水平。经Z-score检验，2个品系各性状遗传力估计值与0差异均达到极显著水平(P<0.01)。2个品系内的体重与AHPND抗性性状(个体存活时间、家系半致死存活率)遗传相关均表现为低度正相关(0.061～0.235)，且与0差异不显著(P>0.05)；2个品系内的个体存活时间与家系半致死存活率遗传相关分别为0.997±0.129、0.967±0.044，为高度正相关。结果表明，在实际选育过程中，可将生长和AHPND抗性作为选育指标纳入综合选择指数进行选种制种；为简化抗性测试过程，可将家系半致死存活率作为选育群体的AHPND抗性指标。本研究为开展凡纳滨对虾生长和AHPND抗性优良品种的选育提供了参考。
[期刊] 水产学报
[作者]
刘绵宇 李旭鹏 孔杰 孟宪红 陈美佳 罗坤 隋娟 代平 张雅文 强光峰 谭建 陈宝龙 曹家旺 李波波 赖晓芳 栾生
为评估基因型鉴定芯片在育种群体构建中的应用价值，实验对凡纳滨对虾3个群体(EE、PP和SS)进行急性肝胰腺坏死病(AHPND)副溶血弧菌(Vp_(AHPND))侵染实验，利用自主研发的40K SNP液相芯片“黄海芯1号”获得146尾个体的基因型信息，对群体遗传背景进行了系统调查并估算了AHPND抗性遗传力。Vp_(AHPND)浸染实验结果显示，不同群体间存在抗病差异，PP群体的存活性能比EE和SS群体分别高出12.9%和11.6%。利用质控后的38 148个SNP信息构建系统进化树，结果显示群体内同一个家系的个体首先聚在一起，进而同属一个群体的多个家系聚在一起。主成分和遗传结构分析显示，可以准确地将146尾个体划分为3个组，与系统进化树聚类结果一致。遗传多样性分析显示，3个群体的观测杂合度(H_o)平均值为0.25～0.29，多态信息含量(PIC)平均值为0.20～0.23，上述遗传参数达到极显著水平。3个群体间的遗传分化系数(F_(ST))为0.11～0.21，存在中高度遗传分化。基因组近交分析表明，EE、PP和SS群体的近交系数均值分别为-0.05±0.06、0.20±0.09和0.37±0.07，后2个群体内部分个体表现出较高的近交水平。使用ssGBLUPMF (Single Step Genomic BLUP with Metafounders)模型，复合基因型、表型和系谱信息，获得Vp_(AHPND)侵染后存活状态的遗传力估计值为0.24±0.07，表现为中等水平，表明基础群体具有较好的选育潜力。研究表明，利用液相芯片“黄海芯1号”开展辅助育种，可以进一步提高基础群体构建和评估的效率。
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