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[期刊] 林业科学研究
[作者]
袁秀英 白红霞 白玉明
A total of 25 isolates of Alternaria sp.from different localities and host plants were amplified with 6 RAPD primers selected from 50 primers.69 RAPD markers were obtained,62 of them were varied.89.86% of them were polymorphic.The genetic distance and phylogenetic tree were constructed by use of Pop...
关键词:
杨树 内生真菌 链格孢属 RAPD分析
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
张蕊 于琳 李国庆 张静
采用RAPD分子标记对我国15个地区2种寄主植物(铁苋菜和蓖麻)上分离得到的葡萄孢属类似真菌Amphobotrys ricini的81个菌株以及来自美国的1个A.ricini菌株进行了遗传多样性分析。结果显示:筛选出的8条RAPD引物共扩增出63条DNA带,其中有49条DNA条带为多态性条带,多态性条带比率(PPB)为77.8%。多态性信息含量(PIC)值变化范围在0.47~0.84,平均值为0.72,观测等位基因数(Na)的均值为2.000 0、有效等位基因数(Ne)的均值为1.357 7、Nei’s基因多样性指数(H)的均值为0.227 5,Shannon信息指数(I)的均值为0.363 1。UPGMA聚类分析表明,遗传相似系数变化范围在0.55~1.00,以遗传相似系数0.70为阈值时,可分为5个类群(A、B、C、D、E),在遗传相似系数0.74处,B类群又可以分为B1和B2两个亚群。分析结果表明,A.ricini群体内遗传变异与菌株地理来源、寄主植物有一定相关。
[期刊] 华北农学报
[作者]
孙朝霞 王海燕 王玉国 侯思宇 张艳
利用随机引物扩增多态性(RAPD)分子标记技术研究不同枣树品系之间遗传多态性,建立起一个基于PCR技术的分子遗传标记RAPD分析的优化体系。设置不同的浓度梯度,从dNTPs、随机引物、Taq酶、Mg2+、缓冲液Buffer的浓度及模板DNA的质量和用量方面考察,建立了枣树RAPD技术最优体系。结果表明:20μL反应体系组分含量为10×Taq酶Buffer 2μL,Mg2+浓度2.0 mmol/L,dNTPs浓度200μmol/L,引物浓度0.2μmol/L,TaqDNA聚合酶浓度0.06 U/μL,DNA模板浓度1.5 ng/μL。最佳扩增程序为94℃预变性4 min,94℃变性30 s,36...
关键词:
枣树 RAPD 体系优化
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
宛涛 蔡萍 张辰波 伊卫东 李方祯 张洪波
【目的】阐明内蒙古冷蒿居群亲缘关系与地理分布的关系。【方法】采用居群遗传学方法及RAPD技术,对内蒙古不同生态地区具有代表性的14个冷蒿居群的遗传多样性进行了研究。【结果】11个引物对14个冷蒿居群总DNA共扩增出93条带,其中77条表现出多态性,多态性标记所占的比例为82.8%,冷蒿居群表现出丰富的RAPD多态性。构建的14个冷蒿居群的遗传关系聚类图显示,扎尼河冷蒿居群与扎兰屯冷蒿居群的遗传距离最小,其次为卓伦高勒冷蒿居群与蔡木山冷蒿居群,贺兰山和吉兰泰冷蒿居群与其他冷蒿居群间的遗传距离均较大。【结论】RAPD技术适用于冷蒿居群遗传多样性的分析,冷蒿居群的亲缘关系与其地理分布有着密切关系。
关键词:
冷蒿 RAPD 遗传多样性 内蒙古
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
张利 郑有良 魏育明 刘世贵 周永红
采用随机扩增多态性DNA (RAPD)技术 ,对仲彬草属Kengyilia 14个种、1个变种 ,共 32份材料进行了遗传多样性研究 .4 6个引物产生的 341条DNA扩增片段中 ,32 7条 (95 9% )具有多态性 .每个引物可扩增出 1~ 13条多态性带 ,平均 7 1条 .利用 341个RAPD标记 ,计算Jaccard遗传相似系数 ,建立UPGMA聚类图 .结果表明 :①K .melanthera (Y2 70 8)与K .melanthera (Y2 70 9a)的GS值最大 (0 82 9) ,遗传关系最近 ;K .hirsuta(Y2 86 0 )与K .tahelac...
[期刊] 林业科学
[作者]
邓白罗 谭晓风 漆龙霖 贺晶 胡芳名
以山茶属29种红山茶组植物叶片为材料抽提DNA,利用筛选出的23种随机引物对其进行PCR扩增,将扩增出的谱带转化成0-1型数据,用UPGMA法进行相关分析和聚类分析。结果表明:可以将山茶属红山茶组的29个种划分为4大类,第1类为光果红山茶亚组,第2类为毛蕊系,第3类为滇山茶系,第2类和第3类属于滇山茶亚组,短管红山茶单独聚为一类。其结果与张宏达分类系统基本一致。根据各种之间的相容关系系数的大小,发现红山茶组内有3组亲缘关系较为相近的种。
关键词:
山茶属 红山茶组 分类系统 RAPD分析
[期刊] 林业科学
[作者]
夏铭 周晓峰 赵士洞
Genetic diversity and differentiation of four natural populations of \%Quercus mongolica \%in Northeast China were studied with the method of RAPD.Through the amplification with 48 random primers,344 repeatable loci were detected and 245 loci were polymorphic.Percentage of polymorphic loci was 71.22...
[期刊] 浙江林学院学报
[作者]
张立钦 林新春 毛胜凤
采用RAPD PCR技术分析了 4个绿僵菌菌株的DNA遗传多态性。从 1 60条引物中筛选出 2 7条引物 ,对各菌株进行PCR扩增 ,结果 4个绿僵菌菌株共扩增出 334个位点 ,其中多态性位点 2 99个 ,占 89 5 % ,表明各菌株间具有较丰富的遗传多态性。菌株DNA多态性与原寄主和孢子形态表现出明显的相关性 ,但与对松墨天牛幼虫的毒力间未表现出相关性。图2表 4参 7
[期刊] 浙江林学院学报
[作者]
梁月荣 田中淳一 武田善行
探讨了采用RAPD分子标记法进行茶树及其近缘种分类和亲缘关系鉴别的可能性。结果表明 ,RAPD能有效地区分物种间和茶树种内变种间的差异 ,阿萨姆类型茶树和中国类型茶树的特异性RAPD分子标记分别为 1 2 0 0bp的WKA 2 4a和 61 0bp的WKA 2 4b。日本茶树品种与中国茶树品种具有较近的亲缘关系。部分越南茶树品种为中 印杂种。图 1表 1参 4
关键词:
茶树 RAPD 种质资源 分类
[期刊] 林业科学
[作者]
姜静 杨传平 刘桂丰 刘玉喜 任旭琴
RAPD technique was used to detect the genetic relationship among seven Betula species.233 loci in total were amplified by using 14 random primers.The percentage of polymorphic loci varied from 12.02% to 36.91%,in which B.costata had the highest variation level.The dendrogram of genetic relat...
关键词:
RAPD 桦树 种间 亲缘关系 杂交育种
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘学堂 郭金城 张元恩 宋晓轩 孙君灵
在提取我国12个省主产棉区26个菌系gDNA的基础上,采用OPY和OPB两组随机引物,对这些菌系的基因组进行了PCR扩增和聚类分析,40个引物中,12个引物扩增出满意的适合于分析的多态性谱带。聚类分析将26个菌系分为A、B两个群,Va菌系(Verticiliumalboatrum)属于单独的A群,B群则包括了所有的大丽轮枝菌系(Verticiliumdahliae)。B群又分为Ba(Cs、Yc)及Bb两个亚群。Bb亚群下面分3个组,Bb1(AV2、AV3及Ly)、Bb2(Sa、Ji、Ke及Yc)和Bb3。Bb3是最大的一个组,包括供试的3个大丽轮枝菌落叶型的3个菌系(VD-8、T9、V44)和...
[期刊] 林业科学
[作者]
田呈明 康振生 李振岐 赵彦修 张慧
用随机扩增多态性DNA(RandomamplifiedpolymorphicDNA ,RAPD)技术对来自陕西及青海的 7个地区的 1 3个落叶松—杨栅锈菌 (Melampsoralarici populinaKleb.)的分离物进行了基因组DNA多态性分析。 1 3个 1 0 -核苷酸随机引物 (Operon公司 )对 1 3个菌株共扩增出 81条RAPD带 ,其中 69个DNA片断呈现多态性 ,占总扩增片断的 85.2 %。供试菌株的相似系数在 0 .60 8~ 1 .0 0 0之间 ,各菌株之间的差异在 0~3 3 1 %之间 ,并建立了聚类树状图。 1 3个菌株在相似性 76.1 %...
关键词:
杨树 落叶松-杨栅锈菌 RAPD 致病性
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
魏兰芳 杨云亮 姬广海 白学慧
选取云南水稻白叶枯病菌优势小种的代表菌株41个,利用从258个RAPD随机引物中筛选出多态性好的24条引物对其DNA进行多态性分析.指纹图谱和聚类分析结果表明,各优势小种间遗传差异较大,菌株间具有明显的遗传多态性,在不同的相似水平下可分为不同的遗传组群.水稻白叶枯病菌优势小种间在分子水平上存在明显差异,且遗传组群与小种间有对应关系,遗传距离为0.2时可以将41个水稻白叶枯代表菌株分为10个遗传相似组,其中第2、8、10组为主要组群,第2组包括14个菌株,主要为7号小种;第8组有9个菌株,全部为8号小种.
[期刊] 林业科学
[作者]
曾东方 罗信昌
采用DNA指纹比较技术对部分外生菌根蘑菇分离菌株的真伪进行了鉴定 ,结果表明 :不同来源的点柄乳牛肝菌Suillusgranulatus子实体之间的DNA相似系数为 0 93 9,但各菌丝体分离菌株与其来源子实体的DNA相似系数为 1 0 0 0 ,每个供试引物获得的RAPD指纹图谱全部对应相同 ,证实分离物为真正的牛肝菌分离菌株。试验还鉴定与子实体DNA具极高同源性的细裂硬皮马勃Sclerodemaareolatum的组织分离菌丝体是真正的分离菌株。供试大红菇Russularubra分离培养物与供试子实体之间存在很大的DNA异质性 ,因此判定该分离物为杂菌或其它生物体分离物 ,并非大红菇的...
[期刊] 林业科学
[作者]
李涵 殷云龙 徐朗莱 於朝广 陈永辉
利用随机引物扩增多态性DNA(RAPD)技术,对落羽杉属原种及其杂交后代共13个样本进行亲缘关系鉴定。从100个10bp的随机引物中筛选出13个扩增效果较好的引物,共扩增出92条带,其中72条为多态性带。根据扩增结果进行聚类分析,结果表明杂交F1代中山杉302(落羽杉×墨西哥落羽杉)与母本落羽杉更为接近。在回交后代(中山杉302×墨西哥落羽杉)中,BCF1118与BCF1140相似系数最大;BCF11与母本F1302亲缘关系最近;BCF1118与父本墨西哥落羽杉亲缘关系最近。
关键词:
落羽杉属 杂交后代 RAPD 亲缘关系
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