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[期刊] 海洋渔业
[作者]
孙真 刘一萌 高鹏程 周凯 么宗利 来琦芳
为了解凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)可能的微生物致病原因，通过对养殖水体环境细菌16S rRNA基因进行高通量测序和生物信息学分析，研究比较了健康虾塘(HSP)、少量死虾塘(MinUH)和大量死虾塘(MajUH)水体细菌群落组成。结果表明，MajUH氨氮、亚硝酸盐、细菌总数均显著高于其他组(P<0.05),HSP细菌群落香农指数显著高于MajUH(P<0.05)。养殖水体中优势菌门为变形菌门、蓝藻门、放线菌门、拟杆菌门、绿菌门，其丰度在3类虾塘中有很大差异，其中，蓝藻门在HSP、MinUH、MajUH的丰度分别为6.17%、5.94%、46.85%。对虾的大量死亡伴随着细菌群落的变化，RDA分析表明，细菌群落的分布主要由亚硝酸盐氮和氧化还原电位决定。通过文献检索和方差分析对HSP与MajUH进行比较后发现，当微生物群落多样性下降时，其对高pH的抑制和调控作用将会减弱，从而影响对虾健康状况。此外，研究还确定了24个可区分健康和大量死亡虾塘主要细菌指示物，明确了水体细菌群落结构作为虾类健康状态指示指标的可行性。研究结果可为凡纳滨对虾养殖过程中的病害防治及新微生物资源开发提供基础数据。
[期刊] 水产学报
[作者]
何润端 宁为民 温崇庆 闵冠杰 朱锋 王成桂 薛明
为探索糖蜜对凡纳滨对虾生长及其水体菌群的影响，本研究利用16S rDNA扩增子高通量测序技术，比较了添加糖蜜调节水体碳氮比的处理组(C/N = 16.0)与无添加的对照组(C/N = 8.5) 2种模式下第4、13和34天时水体菌群结构差异，并通过PICRUSt2对菌群功能进行预测。结果显示，糖蜜添加尽管对对虾体长和体质量无显著性影响，但可显著提高对虾存活率；第4天时水体菌群Shannon多样性与均匀度均显著上升，但第13与34天时均显著下降。添加糖蜜后，处理组α-变形菌纲和放线菌门丰度均极显著高于对照组，蓝细菌门和γ-变形菌纲丰度则显著低于对照组，β-变形菌纲丰度在第4和34天时也显著低于对照组，拟杆菌门丰度在第4和13天时分别显著高于和低于对照组。科水平上，处理组第4、13和34天时微杆菌科相对丰度均显著高于对照组，第4天时红杆菌科、黄杆菌科和海仙菌科丰度均极显著高于对照组，而德沃斯氏菌科、产碱菌科和束缚杆菌科丰度均极显著低于对照组，第13天时海仙菌科和环杆菌科丰度分别极显著高于和低于对照组，脱醌菌科丰度在第34天时显著高于对照组。添加糖蜜后处理组芽殖杆菌属和脱醌菌属等优势属的丰度显著高于对照组，而海仙菌属等丰度则显著下降。菌群功能预测结果显示，第34天时，丰度前20的代谢功能项在处理组的富集程度均明显优于对照组，尤其糖酵解/糖异生等8项属于碳水化合物代谢或能量代谢的功能均高度富集。以上结果表明，糖蜜添加可显著影响凡纳滨对虾养殖水体优势菌群相对丰度，优化水体菌群结构，并增强其碳水化合物和能量代谢通路功能，从而提高对虾存活率。本研究为糖蜜作为有机碳源应用于对虾生物絮团养殖提供了理论依据。
[期刊] 水产学报
[作者]
郁维娜 戴文芳 陶震 熊金波
为探究病害发生后健康与患病凡纳滨对虾肠道菌群结构和功能的差异,并筛选肠道指示菌群来评估宿主健康状况,评价凡纳滨对虾肠道菌落的功能冗余性。实验采集健康和患病凡纳滨对虾样品,通过Illumina高通量测序技术测定肠道菌群组成,并利用PICRUSt进行功能预测,以此比较健康与患病凡纳滨对虾肠道微生物的群落结构和功能差异,并预测功能与群落组成的相关性。结果显示,病害的发生伴随着肠道菌群结构的显著变化,而多样性无显著差异。与健康凡纳滨对虾肠道细菌组成相比,患病凡纳滨对虾肠道中放线菌门(Actinobacteria)
[期刊] 中国水产科学
[作者]
陈琛 闫茂仓 张翔 於俊琦 柴雪良 曾国权
通过对养殖水体环境基因组ＤＮＡ中细菌１６Ｓ ｒｒＮＡ基因Ｖ４–Ｖ５区的高通量测序和生物信息学分析，研究了两种养殖密度的凡纳滨对虾（ＬｉｔｏｐｅＮＡｅｕＳ ＶＡＮＮＡｍｅｉ）高位池水体中细菌群落在养殖过程中的动态。结果显示，养殖过程中各菌群相对丰度变化明显，细菌多样性随时间逐渐提高，优势菌群为变形菌门（ｐｒｏｔｅｏｂＡｃｔｅｒｉＡ）、蓝藻门（ｃｙＡＮｏｂＡｃｔｅｒｉＡ）、拟杆菌门（ｂＡｃｔｅｒｏｉＤｅｔｅＳ）、放线菌门（ＡｃｔｉＮｏｂＡｃｔｅｒｉＡ）和浮霉菌门（ｐＬＡＮｃｔｏｍｙｃｅｔｅＳ）。随着养殖时间增长，蓝藻丰度所占比例逐渐减少，而变形菌、拟杆菌和浮霉菌丰度逐渐增大，同时养殖前期高密度池浮．．．
[期刊] 水产学报
[作者]
杨坤杰 王欣 熊金波 裘钱玲琳 黄雷 张化俊 郭安南 李来国 张德民
凡纳滨对虾养殖过程中，早期阶段是病害易感阶段，而消化道菌群结构与对虾健康关系密切。因此，探讨幼虾的消化道菌群尤其是弧菌类细菌与对虾发病的关系对病害有效防治具有重要意义。本实验采用ＩｌｌｕｍＩｎａ测序研究了凡纳滨对虾健康和患病幼虾的消化道细菌群落结构，并基于纯培养和１６Ｓ ｒ Ｄｎａ，ｒｅｃ ａ和ｐｙｒ Ｈ基因序列比对，分析了幼虾消化道中弧菌的主要种类组成。结果发现，健康幼虾消化道中α－变形菌纲和厚壁菌门丰度较高，而患病幼虾中γ－变形菌纲、拟杆菌门、放线菌门和β－变形菌纲较高，其中放线菌门丰度差异显著。基于科水平的响应比分析，发现患病幼虾消化道中动性球菌科和噬菌弧菌科的丰度显著降低，而弧菌科的丰．．．
[期刊] 中国水产科学
[作者]
罗鹏 胡超群 张吕平 任春华
采用PCR-DGGE(PCR-denaturing gradient gel electrophoresis)技术对一个典型的凡纳滨对虾(Litopeneaus vannamei)海水养殖系统细菌群落进行分子分析。结果表明,沿岸水、蓄水池、养殖池水具有较高的细菌种类多样性,而蓄水池进水、对虾粪样、肠壁定植细菌样以及排水渠污水的细菌多样性程度低。每种环境群落的优势种明显。3个养殖池水样(Y1、Y2、Y3)、2个沿岸水样(W1、W2)、2个粪样(F1、F2)、蓄水池水样(B1、B2)及2个肠壁定植细菌样(G1、G2)各自具有高度群落相似性。BLAST结果表明,12个条带克隆序列所代表优势种很可能来...
[期刊] 水产学报
[作者]
汤上上 韩凤禄 周利 刘世誉 徐畅 陈立侨 李二超
为研究低盐胁迫(盐度3)下,饲料添加不同含量的甘露寡糖(mannan oligosaccharide, MOS)对凡纳滨对虾生长性能、抗氧化能力、免疫力和肠道微生物的影响。低盐条件下,给实验组对虾(0.68±0.01)g分别饲喂含有2、4和8 g/kg MOS的实验饲料,并将在盐度25和3条件下饲喂0 g/kg MOS饲料的对虾作为海水对照组和低盐对照组,养殖周期42 d。结果显示:(1)相比于低盐对照组,海水对照组、4和8 g/kg MOS组对虾生长性能显著升高。(2)与海水对照组相比,低盐条件下各处理组对虾肝胰腺总超氧化物歧化酶、谷胱甘肽硫基转移酶活力显著降低(P
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
宫晗 陈萍 秦桢 刘洋 高焕 李吉涛 李健 朱建新
为探究凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)工厂化循环水养殖系统的养殖水体水质情况以及微生物菌群的组成结构，本研究利用高通量测序技术和生物信息学分析手段，测定凡纳滨对虾工厂化循环水养殖过程一级移动床生物净化、二级固定床生物净化、养殖水体的水质指标、水体和生物净化载体以及对虾肠道微生物菌群的组成。结果显示，水体的氨氮(NH_(4)~(+)-N)和亚硝酸盐氮(NO_(2)~(–)-N)质量浓度显著降低，分别为0.85和0.21 mg/L。养殖系统水体、生物净化载体和虾肠道样品中共有的优势菌为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)，此外，一级、二级生物净化系统水体中的放线菌门(Actinobacteria)为优势菌，生物净化载体中浮霉菌门(Planctomycetes)和硝化螺旋菌门(Nitrospirae)为优势菌；对虾肠道中的厚壁菌门(Firmicutes)为优势菌。另外，对虾养殖循环水系统中生物净化载体上的细菌物种含量比水样中的细菌物种少，但微生物多样性高于养殖水体，生物净化载体中微生物具有低丰度和高多样性的特点。综上所述，生物净化系统可有效地增加水体中促进氮、磷代谢的微生物菌群，调控养殖水体的水质指标，研究结果为凡纳滨对虾工厂化循环水养殖系统构建及水质调控提供理论依据。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
王元 周俊芳 韦信贤 马荣荣 赵姝 李新苍 房文红
运用Miseq高通量测序技术,分析凡纳滨对虾虾苗及其在海水和淡水2种养殖条件下生长到体长9~10 cm时的肠道和鳃的菌群结构。结果显示:虾苗、肠道和鳃样品在门水平上菌群均以厚壁菌门和变形菌门为主,但丰度差异较大;在属水平上,虾苗菌群以乳球菌属(36.1%)、未成功分属的γ–变形菌纲的菌株(25.5%)、芽孢杆菌属(13.5%)、Solibacillus(7.9%)、假单胞菌属(5.0%)和节杆菌属(2.5%)为主,鳃的菌群以乳球菌属、芽孢杆菌属、Solibacillus、假单胞菌属和节杆菌属为主,肠道菌群在海水养殖中的以发光杆菌属(22.9%)、弧菌属(18.2%)、乳球菌属(13.3%)、纤维弧菌属(8.0%)、希瓦氏菌属(5.5%)和芽孢杆菌属(5.4%)为主,而在淡水养殖中的以希瓦氏菌属(57.4%)、乳球菌属(18.8%)和芽孢杆菌属(6.3%)为主,弧菌丰度小于0.1%。养殖条件对凡纳滨对虾鳃中菌群结构影响较小,但对肠道菌群结构影响较大。
[期刊] 水产学报
[作者]
薛明 何瑶瑶 邱孟德 梁华芳 陈第省 王立群 刘杨锋 温崇庆
为了解凡纳滨对虾育苗期正常苗池水体菌群结构和多样性变化,实验采用Illumina MiSeq高通量测序水体细菌16S rDNA V4区,比较幼体在无节V期(N5)、溞状Ⅱ期(Z2)、糠虾Ⅰ期(M1)与仔虾Ⅰ期(P1)时的水体菌群特征。结果显示,水体菌群Shannon多样性指数随幼体发育先降后升,而Pielou均匀度指数除在N5时稍高外,在其余阶段都很接近。育苗期间,变形菌门为水体绝对优势菌群(50.0%88.0%),尤其红杆菌科从N5到P1阶段分别占24.2%、61.6%、43.3%和51.8%;拟杆菌门
[期刊] 海洋渔业
[作者]
谢剑 戴习林 臧维玲 王家伟 丁福江
试验设计6个凡纳滨对虾幼虾养殖密度:10、20、30、40、50、60 ind/m2,通过比较60 d养殖周期内的水环境因子、幼虾生长状况与消化酶活性,分析研究凡纳滨对虾幼虾低盐度粗养水体的养殖容量。结果表明:各试验组水质均符合凡纳滨对虾幼虾生长要求,单位水体载虾量主要影响pH、非离子氨氮(NH3-Nm)、溶解氧(DO)等水化指标;不同试验组水体pH、NH3-Nm含量、DO含量、总氮(TN)含量差异极显著(P<0.01),浊度、总磷(TP)含量差异显著(P<0.05);不同试验组对虾中肠腺蛋白酶活性差异显著(P<0.05),表现出单位水体载虾量越高,对虾体内蛋白消化酶活性和氮利用率越低的规律,...
[期刊] 水产学报
[作者]
张庆华 戴习林 李怡 赵勇 曾胡龙 张军玉 潘迎捷
So far studies have focused on bacteria isolation aimed at establishing causes of fish diseases and medication methods.Now,more and more attention has been given to the composition of the microflora,its variations in time,and effect on whiteleg shrimp(Litopenaeus vannamei).This is why the problem of...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
王春迪 宋晓玲 张晓静 张盛静 孙新颖 刘宝彬 高文辉 黄倢
将蜡样芽胞杆菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｅｒｅｕｓ）Ｐｃ４６５添加到凡纳滨对虾（ｌｉｔｏＰｅｎａｅｕｓ ｖａｎｎａｍｅｉ）养殖水体中至终浓度分别为１０～４、１０～５和１０～６ ｃＦｕ／ｍｌ，以无益生菌添加的养殖组为对照组，定期检测实验对虾肠道和养殖水体中的细菌总数、弧菌总数以及水体中氨氮含量和亚硝酸氮含量。实验结果表明，水体中添加益生菌能降低凡纳滨对虾肠道内细菌数量，且与对照组相比差异显著（Ｐ＜０．０５）；高浓度的益生菌处理组可以明显降低养殖水体内弧菌数量（Ｐ＜０．０５），但是益生菌并没有显著影响水体中的氨氮含量和亚硝酸氮含量。养殖４周后进行Ｗｓｓｖ投喂感染实验，感染实验表明，实验组Ｈ组（益生菌浓．．．
[期刊] 水产学报
[作者]
张哲 杨章武 葛辉 陈辉辉 卓吓晃
为研究凡纳滨对虾育苗标粗阶段生物絮团形成所需要的适合碳源,设计3种不同碳源添加组(葡萄糖组、淀粉组和蔗糖组),每个处理组设置3个重复,实验期20 d,以分析不同碳源添加后对水体生物絮团的形成、营养成分、细菌群落结构及水质指标的影响。结果显示,在碳源添加量均为投喂量的80%时,形成的生物絮团可有效调节水质,降低水体中的氨氮和亚硝酸盐氮水平。3个碳源添加组水样中氨氮、亚硝酸盐氮和硝酸盐氮浓度显著低于对照组,淀粉组水样中氨氮、亚硝酸盐氮和硝酸盐氮浓度显著高于葡萄糖组和蔗糖组;最终对虾存活率统计结果显示,葡萄糖组、淀粉组、蔗糖组和对照组分别为72.9%、54.2%、69.8%和44.3%;淀粉组的生物絮团沉降体积(BFV)显著低于葡萄糖组,蔗糖组BFV最高,在13～15 d后3组均趋于稳定;葡萄糖组和蔗糖组的粗蛋白含量均显著高于淀粉组,葡萄糖组和蔗糖组则差异不显著;葡萄糖组和蔗糖组生物絮团中组氨酸、精氨酸、蛋氨酸等必需氨基酸和天冬氨酸、谷氨酸、丙氨酸等非必需氨基酸含量都显著高于淀粉组;葡萄糖组、淀粉组和蔗糖组的必需氨基酸指数(EAAI)值分别为0.93、0.89和0.92。3种类型生物絮团在门级水平的细菌群落共有18余种,其中变形菌门和拟杆菌门在各组占有比例均最高,淀粉组拟杆菌门含量显著高于其他2组,蔗糖组浮霉菌门和放线菌门含量显著高于葡萄糖组和淀粉组。研究表明,添加不同碳源可影响水体生物絮团的形成、营养成分、细菌群落结构和多样性,不同程度地改善水质。以必须氨基酸指数及存活率为评价指标,则葡萄糖和蔗糖都是凡纳滨对虾育苗标粗水体中适宜的碳源选择。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
章跃陵 林伯坤 陈俊 胡忠 黄通旺 严芳
以凡纳滨对虾(Litopenaeaus vannamei)为研究对象,运用亲和层析、PAGE、SDS-PAGE、Western-blotting和细菌凝集实验等方法探索凡纳滨对虾血蓝蛋白的细菌凝集活性。结果发现,血蓝蛋白对副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)、溶藻酸弧菌(Vibrio alginolyticus)、河弧菌(Vibrio fluvialis)、哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)、嗜水气单胞菌(Aeromona hy-drophila)和金黄色葡萄球菌(Stphylococcus aureus)等6种虾类致病菌具有凝集活性,其凝集活性大小为0.27~...
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