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[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
潘晓芳 孙雪阳 张振林 马锦林 郭飞 黄寿先 周传明
利用荧光AFLP分子标记技术对八角属部分种类和八角品种(类型)的遗传多样性和亲缘关系进行研究。6对引物组合(PstI/MseI)共得到989条带,其中多态性带988条(99.90%),45个种类或品种(类型)具特征性条带。56个种质资源的遗传相似性系数在0.17～0.71之间,平均相似性系数为0.47。UPGMA聚类结果可将供试样品分为两大类型,来源于广西的八角茴香47个品种(类型)具有较近的亲缘关系,聚于Ⅰ类,大部分品种(类型)聚于C组(44个品种);披针叶八角等7个种类与八角茴香明显被区分,聚于Ⅱ类。AFLP分子标记可区分所有供试样品,是八角属种质资源鉴别的有效手段和方法。
[期刊] 林业科学
[作者]
李善文 张有慧 张志毅 安新民 何承忠 李百炼
利用13对AFLP引物对杨属4个派19个种及杂种的47个无性系进行分析,共检测到858个标记,其中多态性标记为771个,多态性位点的百分率为89.9%,每对引物产生的多态性位点的百分率在80·7%~98·1%之间,表明杨属种间及无性系间在DNA水平上存在广泛变异。根据AFLP标记结果计算杨属派间、派内种间、种内无性系间分子遗传距离,对它们的亲缘关系进行定量描述。聚类分析结果表明,派间聚类与经典形态分类完全一致,派内种间及种内无性系间聚类与形态分类基本相同。最后,探讨根据分子标记结果进行杂交亲本选配及杂种子代早期选择的可行性。
关键词：
杨属 AFLP 遗传变异 亲缘关系
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
潘晓芳 孙雪阳 黄寿先 周传明 陈翠湖 闭冬玲
以八角属部分树种和八角品种共56个样品为试验材料,利用AFLP分子标记技术进行遗传多样性分析。采用改良的CTAB法提取总DNA,通过对酶切-连接反应、预扩增和选择性扩增反应过程中的关键因素进行优化,建立了适合八角属植物的AFLP分子标记体系。该体系应用于八角AFLP研究,能够得到高质量的总DNA和清晰的遗传标记图谱,研究结果为八角种质资源分子生物学研究提供技术支撑。
关键词：
八角属 分子标记 AFLP 反应体系
[期刊] 林业科学
[作者]
宋红竹 张绮纹 周春江
利用10对AFLP引物对杨属5个派20个种及杂种的44份杨树材料进行分析。结果表明:在这些材料中,不同引物组合的多态性均为100%,表明杨属种间及无性系间在DNA水平上存在广泛变异。利用UPGMA法对AFLP数据进行聚类分析,相似系数在0.765~0.971之间,派间聚类与经典形态分类完全一致,派内种间及种内无性系间聚类与形态分类基本相同。构建了44份材料的指纹图谱,在该图谱中,每个材料都具有自身独特的条带。最后,探讨根据分子标记结果进行杂交亲本选配及杂种子代早期选择的可行性。
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
燕丽萍 吴德军 王因花 刘翠兰 王开芳 吴红 任飞 李庆华
为了探讨白蜡属植物种间、品种间亲缘关系以及同品种不同区域间的基因型差异,利用荧光AFLP分子标记技术,采用8对Pst I/Mse I引物组合对90个白蜡种质进行了DNA遗传多样性分析。结果表明:8对引物组合扩增出1 630条带,其中多态性条带1 399条,平均多态位点百分率为85.8%,平均有效等位Ne基因数为1.258 8,Nei’s平均遗传多样性指数为0.171 7;Shannon平均信息指数为0.286 9,表明白蜡属种间具有丰富的遗传多样性。采用NTSYS-PC软件的DICE法计算样本间的相似系数,UPGMA法进行聚类分析,结果表明,白蜡属植物种的聚类结果与传统的分类结果基本一致,绒毛白蜡及新品种(鲁蜡1号-鲁蜡4号)、美国紅梣及新品种(鲁蜡5号、鲁蜡6号)、美国白蜡及新品种(红叶白蜡、秋紫白蜡、秋火白蜡和秋欢白蜡)聚为一类;秦岭梣、庐山白蜡、花曲柳、中国白蜡、和窄叶白蜡聚为一类;不同之处在于花具花萼的象蜡树和对节白蜡与花无花萼的欧洲白蜡、水曲柳、新疆小叶白蜡和狭叶白蜡聚类为一类,象蜡树和水曲柳的亲缘关系较近,对节白蜡和象蜡树的起源与分类学地位有待于进一步的研究。说明AFLP标记技术能较好地揭示白蜡属种质资源的亲缘关系及演化规律,为种的分类及亲缘关系分析提供有力参考依据。
关键词：
白蜡属 优良种质 亲缘关系 AFLP
[期刊] 中国农业科学
[作者]
高源 刘凤之 王昆 王大江 龚欣 刘立军
【目的】以国家果树种质兴城梨、苹果圃保存的131份苹果地方品种、育成品种及其野生近缘种为试材,利用TP-M13-SSR标记构建苹果种质分子身份证。【方法】基于TP-M13-SSR指纹图谱,筛选可以将苹果种质区分的引物组合,并对其等位基因进行编码建立种质分子身份证。【结果】(1)从131份材料中随机选取两份材料,对第一次PCR条件进行优化和引物筛选,从32对合成引物中筛选出16对稳定性高和重复性好的TP-M13-SSR引物用于131份苹果属植物指纹图谱构建。(2)16对SSR引物在供试种质间共检测出等位基因326个,每对引物平均检测到等位基因数为20.3个。CH05d04对种质扩增的等位基因数最...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
肖远辉 区善汉 傅翠娜 梅正敏 甘海峰 刘升球 麦适秋
广西是柑桔原产地之一,蕴藏着丰富的柑桔种质资源。选用8对AFLP引物组合,对42份广西地方柑桔资源和广西柑桔主栽品种进行遗传多样性分析及分类研究。共获得清晰可见标记377条,其中多态性标记245条,占65.0%。在遗传相似系数0.92处,可以将柑桔品种分为柚、橙、柑、桔、金柑5个类群。供试材料两两间遗传相似系数在0.75～1之间。根据遗传相似系数(UPGMA,N-J)得到的分类树状图与传统方法的分类结果相似。研究结果表明广西柑桔种质资源具有较高的遗传多样性,广西柚类品种两两间遗传相似系数在0.93～0.97之间,广西酸桔品种间亲缘关系较近。
关键词：
柑桔 种质资源 AFLP 分类 广西
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
周春玲 戴思兰
利用AFLP技术 ,对菊属植物 1 2个分类群进行分析 .选择EcoRI MseI这一酶切组合 ,5个E +3 M +2引物组合及 1个E +3 M +3引物组合进行选择性扩增 .共得到 2 87条条带 ,其中多态性条带占 85 .7% .利用UPGMA方法对扩增数据进行分析 ,结果表明 :所选的两个栽培品种‘滁菊’和‘亳菊’可归并为一个品种 ,该品种与毛华菊、野菊、甘菊亲缘关系相对较近 ,紫花野菊次之 ,小红菊相对最远 .各野生种间 ,野菊、甘菊和菊花脑间的亲缘关系极近 ,且同一分布区内的不用种间有比较频繁的种质渗入 .研究表明AFLP技术是进行菊属植物亲缘关系研究极为有效的工具
关键词：
AFLP分析 酶切组合 菊属植物
[期刊] 林业科学
[作者]
牟少华 彭镇华 孙启祥 高志民 李雪平
利用AFLP技术,选择EcoRⅠ/MseⅠ这一酶切组合,应用9对(EcoRⅠ+3)/(MseⅠ+3)引物组合进行选择性扩增,检测16种箬竹和5个形态相似的外源竹种的基因组DNA多态性。在21个样品基因组中共获得1367条清晰的谱带,其中共有条带115条,特异性带273条,特异性缺失条带72条。在16个箬竹样品基因组中共获得1193条清晰的谱带,其中共有条带190条,特异性带177条,特异性缺失条带98条。这些特异性带或特异性缺失条带可作为识别不同竹种的分子标记。聚类结果表明:所有的箬竹属植物聚成一类,其他5种外源植物聚成一类。此外,AFLP分析提供的分子证据,支持耿氏分类系统(1996),将天...
关键词：
箬竹属 AFLP 多样性
[期刊] 华北农学报
[作者]
王娟 陶永焕 宋尚伟
借助SSRs软件查找葡萄属含有SSR的EST序列,从葡萄属EST-SSR数据库中开发新型的EST-SSR标记,进行可利用性筛选,并设计引物。共开发出28对引物,从中筛选到16对多态性引物对62份葡萄材料进行PCR扩增。计算相似系数并构建聚类树状图,通过聚类分析研究葡萄属不同品种之间的亲缘关系,进一步验证EST-SSR在葡萄种质分类鉴定中的可行性。结果表明:绝大多数材料间的相似系数大于0.74,62份供试材料在相似系数0.658处可分为4个类群,大多数亲缘关系较近的种质资源都聚集在一起,相似系数种内较种间大,与传统分类情况基本一致。
关键词：
葡萄 EST-SSR 聚类分析
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
刘昔辉 张荣华 张革民 周会 宋焕忠 方位宽 区惠平 杨丽涛 李杨瑞
以广西地区的１５份河八王无性系为材料，采用ＡＦＬＰ标记结合毛细管电泳进行分析，计算多态性引物的总扩增条带数、多态性条带数和多态性条带比率。进行遗传相似系数和ＵＰＧＭＡ聚类分析，并建立分子身份证。２５对ＡＦＬＰ引物组合在１５份河八王种质资源中共扩增出２ ２０８个位点，其中多态性位点１ ９１４个，多态性比率（ＰＰＢ）为８７．１１％。ＵＰＧＭＡ聚类分析表明，供试的１５份河八王种质资源其遗传相似系数变化范围在０．６５６～０．８７８，在相似系数为０．７０６时，可划分为３个类群。结合特征带和不同引物组合方法可有效建立河八王种质资源特异分子身份证，置信概率达到９９．９９％。所供试河八王种质具有较丰富的遗传多．．．
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
张敏 黄苏珍
采用ISSR分子标记技术,从80个随机引物中筛选出多态性强、重复性好且稳定性高的引物15个,对37份鸢尾属材料进行多态性分析,共扩增出328条带,多态性带为327条,多态性比例达99.7%,说明鸢尾属物种间有丰富的遗传多样性。依据15个有效引物所产生的328条ISSR标记建立DNA分子系统聚类图,将供试材料分为6组,其中矮紫苞鸢尾和单苞鸢尾单独划为一组。根据获得物种特有ISSR标记分析表明,利用15个有效引物可以较好地将鸢尾属供试37份材料区分开,其中7个材料具有各自特有的扩增带,单苞鸢尾和黄菖蒲还分别具有2和3条各自特有的扩增带,仅引物ISSR8、ISSR63和ISSR75即可将所有37份供...
关键词：
鸢尾属 ISSR 遗传多样性 亲缘关系
[期刊] 华北农学报
[作者]
张桂华 韩毅科 杨瑞环 杜胜利 王鸣
对23份不同来源的黄瓜材料进行了AFLP分析。18对引物组合共扩增出543条谱带,其中,多态性带为106条,多态率为19.5%。UPGA分类结果将23份黄瓜材料划分为三大类群:第1类群为野生型黄瓜的聚类;第2类群为美国类型黄瓜、荷兰类型黄瓜以及具有荷兰血统的黄瓜的聚类;第3类群中包含所有中国类型黄瓜和2个前苏联类型黄瓜。遗传相似性分析和聚类结果表明:野生黄瓜和栽培黄瓜之间的亲缘关系较远,AFLP标记的分类结果与材料的主要性状特点基本一致。
关键词：
黄瓜 AFLP 遗传多样性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
佟广香 匡友谊 尹家胜
目前哲罗鱼(Hucho taimen)处于濒危状态,野生样品采集较困难,因此对其种群遗传结构了解甚少。本研究应用7对AFLP引物对5个野生哲罗鱼群体(104个体)进行了扩增和遗传结构分析。结果显示7对引物共扩增出193个多态位点,多态位点比率为70.18%;多态性位点数(AP)、多态性位点比率(P)、观测等位基因(Na)、有效等位基因(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)、Shannon's信息指数(I)和遗传距离(D)揭示的规律一致,在5个群体中上述指标从大到小依次均为虎头江段2002、抓吉江段、海青江段、虎头江段2006、呼玛河,H在0.148～0.1953之间,I在0.2215～0.2...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
侯雅君 张宗文 吴斌 李艳琴
【目的】从分子水平研究苦荞种质资源的遗传多样性,为综合评价苦荞种质资源提供依据。【方法】用筛选出的20对AFLP引物,对14个不同地理来源的165份苦荞种质进行遗传多样性分析。【结果】共扩增出938条清晰的条带,其中314(33.48%)条呈多态性,平均每对引物组合的条带数和多态性带数分别为46.9个和15.7个。不同地理来源苦荞种质的Shannon-Weaver多样性指数为0.1093～0.2661,四川资源群最高,青海、云南和甘肃/宁夏等资源群次之,湖南资源群最低。利用Popgen Ver.1.32软件,依不同地理来源苦荞资源群间Nei′s遗传一致度可聚类成5个组,聚类结果与苦荞地理分布相...
关键词：
苦荞 AFLP 种质资源 遗传多样性
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