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[期刊] 西南农业学报
[作者]
史宪伟 曾凡同 邱祥聘 张亚平
用１８种限制性内切酶对７只云南鹅的线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）进行了限制性片段长度多态（ＲＦＬＰ）分析。１７种酶在所有受试个体表现为一致的限制性态型（ｍｏｒｐｈ），一只灰羽鹅用ＰｖｕＩ消化时出现变异。用１４种限制性内切酶构建了云南鹅ｍｔＤＮＡ的酶切图谱。
关键词：
云南鹅,线粒体DNA,酶切图谱
[期刊] 水产学报
[作者]
戴建华 殷文莉 杨代淑 熊全沫
采用差速离心法及ＤＮａｓｅⅠ、ＲＮａｓｅ消化法制备并纯化了鲇（Ｓｉｌｕｒｕｓａｓｏｔｕｓ）肝脏线粒体ＤＮＡ（ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＤＮＡ，ｍｔＤＮＡ）。用８种限制性内切酶对ｍｔＤＮＡ进行了分析。ＢｇⅡ、ＥｃｏｒⅠ、ＰｓｔⅠ、ＢｇｌⅠ、ＢａｍＨⅠ、ＸｂａⅠ、ＨｉｎｄⅢ、ＸｈｏⅠ在鲇ｍｔＤＮＡ分子上分别具１、１、１、２、２、７、７和０个切点。ｍｔＤＮＡ分子量约１０．８４×１０￣６道尔顿，大小为１７．５４ｋｉｌｏｂａｓｅｐａｉｒｓ。根据单酶和双酶解片段的数目和分子量，建立了鲇ｍｔＤＮＡ的限制性酶切图谱。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
杨少闻 刘楚吾
用识别5、6碱基序列的17种限制性内切酶,即BamHⅠ、BglⅠ、BglⅡ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRⅤ、HindⅢ、KpnⅠ、MluⅠ、PstⅠ、PvuⅡ、SalⅠ、ScaⅠ、SmaⅠ、StyⅠ、XbaⅠ和XhoⅠ,对南海海域石斑鱼属(EpinephelusBloch)野生蜂巢石斑鱼(E.merra)、鲑点石斑鱼(E.fario)、青石斑鱼(E.awoara)、赤点石斑鱼(E.akaara)和七带石斑鱼(E.septem-fasciatus)的线粒体DNA(mtDNA)进行RFLP分析。测算出蜂巢石斑鱼、鲑点石斑鱼、青石斑鱼、赤点石斑鱼和七带石斑鱼的mtDNA分子大小分别为(18.52±...
[期刊] 水产学报
[作者]
宋平 李小迎 熊全沫
以十一种限制性内切酶对鲢鱼ｍｔＤＮＡ进行单酶完全酶解的切点数：ＳａｌＩ和ＢｇｌⅡ为０；ＰｓｔＩ．ＸｈｏＩ．ＫｐｎＩ和ＳａｃＩ为１；ＨｐａＩ和ＸｂａＩ为２；ＢａｍＨＩ为３；ＢｇｌＩ和ＥｃｏＲＩ为４。以九种限制性内切酶对鳙鱼ｍｔＤＮＡ进行单酶完全酶解，其切点数；ＰｓｔＩ．ＸｈｏＩ．ＳａｌＩ．ＫｐｎＩ．ＢｇｌⅡ均为１；ＨＰａＩ和ＸｂａＩ为２；ＳａｃＩ为３；ＢｇｌＩ为４。采用琼脂糖凝胶电泳法测得鲢鱼ｍｔＤＮＡ分子量为１５９３０±２２０碱基对（ｂｐ）；鳙鱼ｍｔＤＮＡ分子量为１６６５０±１５０碱基对（ｂｐ）。用单、双酶解法和部份酶解法构建了鲢鱼九种酶１８个切点和鳙鱼九种酶１６个切点的限制性内切酶酶切图谱。...
关键词：
链鱼,鳙鱼,mtDNA,限制性内切酶图谱
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
汤显春 彭辉银 张小霞 赵淑玲 肖宇宙
将从自然罹死的分月扇舟蛾Closteraanastomosis (L .)幼虫中分离到的一种颗粒体病毒 (简称CaL GV)置于电子显微镜下观察 ,其形态为椭圆形 ,大小为 (30 4 .5 3× 139.0 9)nm ;经碱解病毒粒子为杆状 ,大小为(2 4 6 .2 1× 6 1.36 )nm ;经酚∶氯仿∶异戊醇 (2 5∶2 4∶1)抽提 ,氯仿∶异戊醇 (2 4∶1)洗涤 ,2倍体积无水乙醇沉淀 ,抽提的核酸经EcoRⅠ ,HindⅢ ,NcoⅠ ,PstⅠ限制型内切酶酶解 ,1×TAE缓冲液 ,0 .8%琼脂糖凝胶电泳 ,获得CaLGV核酸酶解图谱。以λDNA HindⅢ酶解片段在...
关键词：
分月扇舟蛾颗粒体病毒 形态 限制性内切酶
[期刊] 淡水渔业
[作者]
晏勇 张兴忠 龙华
本文报道了用ＢａｍＨⅠ，ＢｇｌⅠ，ＢｇｌⅡ，ＣｌａＩ，ＥｃｏＲＩ，ＨｉｎｄⅢ，ＰｖｕⅡ，ＳａｃⅠ，ＸｂａⅠ，ＸｈｏⅠ等十种限制性内切酶酶切草鱼线粒体ＤＮＡ，计算出各酶切片段长度及草鱼ｍｔＤＮＡ大小。其中六种酶有多个切点，在所检测的样品中未发现碱基替换。
关键词：
草鱼线粒体DNA,限制性内切酶
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
周锦萍 李刚 郑明球 蔡宝祥
采用差速离心法纯化鸡源和鸭源减蛋综合征（ＥＤＳ）病毒，酚－氯仿抽提法提取两种毒株的核酸。选取ＥｃｏＲⅠ、ＢａｍＨⅠ、ＢｇｌⅠ、ＢｇｌⅡ、ＫｐｎⅠ、ＰｓｔⅠ和ＨｉｎｄⅢ７种限制性内切酶，对两种毒株进行酶切图谱比较。结果显示，鸡源株酶切片段数分别为４，４，６，８，５，９，１０，共计４６个片段；鸭源株产生的酶切片段数分别为４，４，５，７，９，１０，８，共计４７个片段。两者的酶切结果除ＥｃｏＲⅠ完全相同外，其余均存在不同程度的差异。由此表明，鸡源和鸭源ＥＤＳ病毒虽然血清型相同，但在基因水平上存在较大的差异，属不同基因型。
关键词：
EDS病毒 病毒核酸 酶切图谱
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
王中铎 刘楚吾 郭昱嵩
取星点笛鲷(白星笛鲷LutjanusstellatusAkuzaki)和千年笛鲷(L.sebaeCuvieretValenci-ennes)肝脏组织,分离纯化其线粒体DNA(mtDNA),用限制性内切酶分析构建了两个种mtDNA的物理图谱,进行了限制性片段长度多态性分析,得到两个种的分歧时间大约为5.1Ma(取序列进化率为每百万年1.5%),发现4种内切酶(BglⅠ、MluⅠ、KpnⅠ、SalⅠ)酶切位点在两种间存在明显差异。这些差异为区分两个种提供了遗传标记,同时也为笛鲷类进化遗传学的研究和育种提供了资料。
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
崔彬彬 李云 金晓洁 冯慧
利用PCR-RFLP技术对白杨派毛白杨、毛新杨和银腺杨及其F1代的叶绿体和线粒体遗传进行了分析.以总DNA为模板,扩增了叶绿体trnD-trnT、rps12/7-nadB、trnT-trnF、trnL-trnF3′和trnL-trnF5′基因片段,线粒体coxⅢ、ND5/6、orf25、atp6、nad4/1-2和ND2-COⅢ基因片段,比较了这些扩增片段5种限制性内切酶的酶切片段多态性.结果表明毛新杨×毛白杨、毛新杨×银腺杨F1代的叶绿体DNA为母性遗传;4种杂交组合线粒体基因片段的PCR扩增与酶切图谱完全一致,未发现多态性,表明白杨线粒体基因高度保守.
[期刊] 水产学报
[作者]
张四明 龙华 张兴忠
用 Bam HI、Eco RI、Dra I、Hinf I、Hind III、Hpa II、Msp I、Pst I、Sau 3AI、Sma I、Xba I、Xho I和 Sal I等十三种限制性内切酶对方正银鲫(Carassius aur-atus gibelio)、白鲫(Carassius auratus cuvieri)和鲫(Carassius auratus auratus)的线粒体 DNA(mt DNA)进行单酶酶切以及其中八种识别六碱基对序列的限制性内切酶的双酶酶切,经琼脂糖凝胶电泳后,分析且计算出各酶切片断大小,得出三种鲫鱼的 mt DNA分子大小:方正银鲫为 15990±90碱基对...
[期刊] 水产学报
[作者]
杨丽萍 胡俊仪 秦超彬 张玉茹 卢荣华 孟晓林 杨国坤 闫潇 职韶阳 聂国兴
为揭示麦穗鱼入侵云南后群体的遗传多样性和遗传分化差异现状,实验采集了云南澜沧江、怒江、红河、伊洛瓦底江水系13个样点,及黄河、长江、珠江原产地水系6个样点的麦穗鱼群体共计220尾样本,利用线粒体细胞色素b基因(Cyt b)全序列作为分子标记,初步分析了麦穗鱼群体的遗传多样性、遗传结构和遗传分化情况。结果显示,共检测到72个变异位点,定义25个Cyt b单倍型。云南四大水系麦穗鱼单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.828±0.014和0.005 44±0.001 18。云南四大水系和黄河、长江、珠江水系相比,具有较高的遗传多样性。单倍型系统发育树与单倍型网络图显示,黄河群体单倍型独立,云南各水系单倍型与珠江、长江单倍型混杂,推测云南麦穗鱼主要来源于珠江和长江,这与云南省引种经济鱼类历史一致。分子变异分析(AMOVA)显示,云南四大水系麦穗鱼群体间具有程度较高的遗传分化,其中大多数遗传变异存在于群体内(72.60%),群体间的遗传变异为28.62%,水系间为1.22%。结果发现麦穗鱼遗传分化与当前水系的分布格局不吻合。Fu’s Fs中性检验结果和核苷酸不配对分析结果均表明,云南四大水系麦穗鱼群体未发生扩张。麦穗鱼进入云南各水系后,单倍型多样性较高,可能来源于多个地区。在后续对麦穗鱼的管理过程中,需要注意避免单倍型特殊的群体与其他地区群体的交流,减少水系间相互引种。此外,通过开发麦穗鱼资源利用方式来提高麦穗鱼利用率,以控制其群体数量,从而减小其对当地土著物种和渔业养殖的危害。
[期刊] 水产学报
[作者]
杨丽萍 胡俊仪 秦超彬 张玉茹 卢荣华 孟晓林 杨国坤 闫潇 职韶阳 聂国兴
为揭示麦穗鱼入侵云南后群体的遗传多样性和遗传分化差异现状，本实验采集了云南澜沧江、怒江、红河、伊洛瓦底江水系13个样点，及黄河、长江、珠江原产地水系6个样点的麦穗鱼群体共计220尾标本，利用线粒体细胞色素b基因(Cyt b)全序列作为分子标记，初步分析了麦穗鱼群体的遗传多样性、遗传结构和遗传分化情况。结果显示，共检测到72个变异位点，定义25个Cyt b单倍型。云南四大水系麦穗鱼单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.828±0.014 和0.005 44±0.001 18。云南四大水系和黄河、长江、珠江水系相比，具有较高的遗传多样性。单倍型系统发育树与单倍型网络图显示，黄河群体单倍型独立，云南各水系单倍型与珠江、长江单倍型混杂，推测云南麦穗鱼主要来源于珠江和长江，这与云南省引种经济鱼类历史一致。分子变异分析(AMOVA)显示，云南四大水系麦穗鱼群体间具有程度较高的遗传分化，其中大多数遗传变异存在于群体内(72.60%)，群体间的遗传变异为28.62%，水系间为1.22%。结果发现麦穗鱼遗传分化与当前水系的分布格局不吻合。Fu’s Fs 中性检验结果和核苷酸不配对分析结果均表明，云南四大水系麦穗鱼群体未发生扩张。麦穗鱼进入云南各水系后，单倍型多样性较高，可能来源于多个地区。在后续对麦穗鱼的管理过程中，需要注意避免单倍型特殊的群体与其他地区群体的交流，减少水系间相互引种。此外，通过开发麦穗鱼资源利用方式，来提高麦穗鱼利用率，以控制其群体数量，从而减小其对当地土著物种和渔业养殖的危害。
关键词：
麦穗鱼 遗传多样性 遗传结构 细胞色素b
[期刊] 林业科学研究
[作者]
王瑶 孔祥波 张苏芳 刘福 张真 严善春
[目的]测定和分析了云南松毛虫线粒体基因组特征,从线粒体基因组水平探究鳞翅目蛾类昆虫高级阶元的系统发育关系。[方法]采用Illumina HiSeq测序方法测定了云南松毛虫线粒体全基因组序列,参考鳞翅目昆虫已知线粒体基因组的全序列对其各基因进行定位和注释。采用tRNA Scan-SE 2.0在线预测云南松毛虫线粒体基因组tRNA基因的二级结构。基于线粒体全基因组的蛋白编码序列构建了鳞翅目13个科32种蛾类昆虫的系统发育树和松毛虫属近缘种间的系统发育树。[结果]结果显示云南松毛虫线粒体基因组全长15 443 bp,包括13个蛋白质编码基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因和一段长度为321 bp的A+T富含区,无基因重排,存在较高的A+T含量(80.0%)。13个蛋白编码基因中除了ND2和COX1,其余均以ATN做为起始密码子。9个蛋白编码基因共享相同的终止密码子TAA(ND2、ATP8、ATP6、COX3、ND5、ND4L、ND6、CYTB和ND1),其他4个基因的终止密码子都是残缺的,COX1、COX2、ND4以T为终止密码子,ND3以TA为终止密码子。22个tRNA基因中,除了tRNA~(Ser(AGN))由于缺少DHU臂无法构成三叶草结构,其余T均为典型的三叶草结构。整个线粒体结构与鳞翅目中目前已得到的其他昆虫线粒体基因组结构一致。[结论]系统发育分析结果显示,云南松毛虫与思茅松毛虫是完全不同的近缘种,与其他松毛虫亲缘关系也较远,云南松毛虫与6种近缘种的系统发育关系为:(((((油松毛虫+文山松毛虫)+赤松毛虫)+落叶松毛虫)+(思茅松毛虫+云南松毛虫))+家蚕)。鳞翅目蛾类各科之间的系统发育关系为:((((((((毒蛾科+灯蛾科)+夜蛾科)+舟蛾科)+(尺蛾科+(蚕蛾科+(天蛾科+大蚕蛾科))))+枯叶蛾科)+(螟蛾科+草螟科))+卷蛾科)+蝙蝠蛾科)。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
贾永红 简承松 朱文适 张亚平 史宪伟 余应淮 廖正录 李通权
采用１５种限制性内切酶对贵州威宁绵羊和六盘水绵羊各５只个体的ｍｔＤ－ＮＡ多态性进行研究。其中只有ＢａｍＨⅠ一种酶的酶切类型表现多态，产生三种酶切类型。共得到１７种限制性态型，可归结为三种ｍｔＤＮＡ单倍型，在威宁绵羊中单倍型Ⅰ所占比较较大（８０％），单倍型Ⅲ只占２０％，而在六盘水绵羊中则单倍型Ⅰ和Ⅱ所占比例相当；根据单倍型在群体中的分布和单倍型间遗传距离，推测贵州绵羊的ｍｔＤＮＡ单倍型Ⅰ和Ⅱ可能代表两个母系祖先的基本单倍型，其分化时间约有１６～３２万年之久，单倍型Ⅲ则可能是由单倍型Ⅰ随机突变而来；两个地方绵羊群体间的分化时间大约为６．３～１２．６万年，群体间的ｍｔＤＮＡ遗传多态度较低，但六盘水绵...
关键词：
贵州绵羊 mtDNA RELP
[期刊] 水产学报
[作者]
姚纪花 楼允东 江涌
本文用一对引物对我国６个地区的银鲫进行ｍｔＤＮＡ－ＮＤ５／６片段的ＰＣＲ扩增，扩增产物（约２．５Ｋｂ）用６种限制性内切酶进行限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）分析。共获得１１种图谱和７种限制性类型（基因型）。根据各群体间的遗传距离构建了ＵＰＧ聚类关系图。结果表明，６个银鲫种群中，云南群体与贵州群体的关系以及黑龙江与安徽群体之间的关系最近，它们分别归为一个群体；河南群体相对独立，它与黑龙江和安徽群体的遗传关系较近；江西群体与各群体间的亲缘关系最远。
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