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[期刊] 西南农业学报
[作者]
孙一丁 李绍平 黄晓东 程在全
对收集自四川阿坝,云南丽江、曲靖、东川等地的6个乌头属药用品种样品提取了基因组DNA,并利用RAPD技术对其遗传多样性进行了分析。从117个引物中筛选出15个多态性引物,共扩增出97条DNA带,其中88条为多态性条带,占总条带数的90.7%。用NTSYS-pc2软件进行UPGMA聚类分析,并算出5个样品间的遗传相似性系数。
关键词：
乌头 RAPD 遗传多样性
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
冉晓华 曹菁菁 毕研平 万谦宏 陈磊
为从分子水平上对中药材质量进行控制,基于磁性微球对中药材核酸进行纯化及后续生物鉴定,采用磁分离技术提取高纯度的核酸模板,以高磁响应性、粒径均一的超顺磁性四氧化三铁微球为固相载体,在聚乙二醇和氯化钠等的协同作用下,对根、茎、叶、花、果实、种子类中药材基因组核酸进行提取;分别提取丹参和柴胡的基因组核酸,并对其进行聚合酶链式反应扩增(PCR)和随机扩增多态性分析(RAPD),用于对丹参的真伪鉴别和对柴胡进行亲缘关系分析。结果表明:经提取,获得了纯度较高(OD260 nm/OD280 nm介于1.6~2.0)的中药材核酸模板;通过扩增叶绿素rpl16基因片段,可有效鉴别丹参及其伪品牛蒡;采用3个有效随...
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘殿林 杨瑞环 哈玉洁
采用SDS法、尿素法、改良SDS法、氯化苄法和CTAB法对黄瓜的基因组DNA进行提取。结果表明,改良SDS法提取的黄瓜叶片DNA具有典型的天然DNA分子的标准紫外吸收光谱特点,其A260/A280在1 7～1 9之间,DNA的产量为450μg/g。用该法提取的黄瓜DNA适合进行RAPD分析。
关键词：
黄瓜 DNA提取方法 RAPD分析
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
吴少华 张大生 潘东明 赖钟雄
提取了木奈基因组 DNA,并以其为模板对影响 RAPD扩增的重要参数进行优化试验 ,以期建立木奈 RAPD反应的优化体系 .结果表明 ,PCR扩增体系最佳条件是 :2 0 μL体积中 ,2 0 0 μmol·L- 1 d NTP、2 .5 mmol· L- 1 Mg Cl2 、0 .2 μmol· L- 1随机引物、2 5 .0 ng·μL- 1 DNA模板、1 -2 U Tag酶
关键词：
木奈 基因组DNA RAPD
[期刊] 西南农业学报
[作者]
胡平 夏燕莉 杨玉霞 周先建 舒光明
探索乌头种质资源的遗传多样性,为乌头新品种选育提供理论基础。本文采用RAMP(ramp amplified microsatellite polymorphism)对来自于四川平武、北川、安县和青川等地的48份栽培乌头居群进行了遗传多样性分析。结果表明,被测材料间RAMP标记多态性较高。73对引物组合共扩增出991条带,其中775条具有多态性,多态性位点百分率(PPB)为78.2%,每个引物可扩增出2~24条多态性带,平均10.6条。材料间遗传相似性系数(GS)变化范围为0.664~0.982,平均达0.933。聚类分析表明,利用RAMP标记可将全部材料区分开,并划分为6类,聚类结果与材料的地...
关键词：
乌头 RAMP标记 遗传多样性 聚类分析
[期刊] 林业科学研究
[作者]
李发根 杨华 尹光天 许煌灿 甘四明
Genomic DNA was successfully extracted from leaf tissues of two rattan species,Calamus simplificifolius and Daemonorops margaritae,using a modified CTAB method.This method could remove phenolic compounds,polysaccharides and proteins,and the quality and quantity of DNA extracted were reliably charact...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
单丽丽 陆瑞菊 王亦菲 孙月芳 陆惠丽 黄剑华
以春兰为研究材料,对春兰基因组DNA的提取以及RAPD-PCR反应体系进行了优化.结果表明,在提取液中加入PVP和β-巯基乙醇去除酚类物质,采用高盐沉淀DNA和多次洗涤去除糖类,可以得到高质量春兰基因组DNA.电泳检测表明,所获得的DNA完整,无降解,完全可以满足RAPD等分子标记分析的需要.同时对春兰RAPD-PCR反应体系中各个影响因素进行了优化,建立了适合春兰RAPD分子标记的最佳反应体系,即20μL反应体系中含1UTaqDNA聚合酶,60μmol/LdNTPs,2.25mmol/LMg2+,1.0μmol/L引物,1.5ng/μL模板DNA.
[期刊] 西南农业学报
[作者]
马艳芝 张玉星
中国梨属植物资源丰富,RAPD技术已广泛用于梨资源遗传多样性研究。通过对不同部位提取的DNA纯度进行测定,并进行RAPD扩增分析,为RAPD技术在梨属种质资源中的应用提供参考。以鸭梨和杜梨为试验材料,利用CTAB法对其幼叶、老叶及韧皮部等不同组织或同一组织的不同时期进行了基因组DNA的提取,并对其进行了RAPD反应的比较。所提取的鸭梨的幼嫩叶片、成熟叶片、韧皮部DNAOD260/OD280的比值分别为2.0、1.8、1.7;杜梨幼嫩叶片、成熟叶片、韧皮部DNAOD260/OD280的比值分别为1.9、1.8、1.6。二者都能成功进行RAPD扩增,且扩增结果基本一致。利用CTAB法从鸭梨和杜梨的...
关键词：
梨属 不同部位 基因组DNA RAPD
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
李建光 李荣生 李发根 尹光天 杨锦昌 邹文涛
以蛇皮果顶梢嫩叶为材料,比较了CTAB法、改良CTAB法、CTAB-free法和SDS法对基因组DNA的提取效果,并对蛇皮果RAPD反应体系进行优化。结果表明,CTAB法、改良CTAB法和CTAB-free法均能提取出蛇皮果基因组DNA,其中NaCl浓度为5 m ol/L的改良CTAB法因可更有效地去除多糖及酚类物质,并能满足PCR扩增的要求而被认为是蛇皮果基因组DNA提取的最适方法;在15μL的PCR扩增体系中,Mg2+、dNTPs和Taq DNA聚合酶的最优浓度分别为1.4 mmol/L、0.12 mmol/L和0.12 U/μL;PC R反应程序的最适退火温度为39℃。
关键词：
蛇皮果 DNA提取 RAPD优化
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
张今今 张莹 李文燕
以桑科榕属植物为研究对象,利用改进的CTAB法提取基因组DNA,并通过单因素多水平梯度试验,筛选了模板、Mg2+、Taq酶、dNTPs和随机引物的浓度及用量,建立了榕属植物RAPD技术分析体系。反应体系总体积为25μL,各组分浓度为:10×Buffer 2．5μL,Mg2+ 2．5 mmol/L,Taq DNA polymerase 0．06 U/μL,dNTPs 0．2 mmol/L,Primer 0．2 μmol/L．Template DNA 1．2 ng/μL。PCR循环程序为:94 C预变性4 min;94 C循环变性 1 min,36 C退火1 min,72 C延伸2 min,40个...
关键词：
榕属植物 DNA提取 RAPD 体系优化
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
曹丽华 康振生 魏国荣
对小麦条锈菌基因组DNA分离的氯化苄法和CTAB/SDS法进行了比较分析,认为后者无降解,质量高,可用于RAPD分析。试验对小麦条锈菌RAPD反应条件进行了优化,建立了标准化的小麦条锈菌RAPD反应体系,即10×ReactionBuffer2.5μL,MgCl22mmol/L,dNTPs0.15mmol/L,模板DNA40ng,引物10ng,Taq1U,ddH2O15.76μL。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
赵凌侠 李景富 唐克轩 许向阳 开国银
对番茄属 9个种的 43份材料进行了 RAPD分析 ,用 2 6条随机引物 (1 0碱基 )共检测到 1 99个位点 ,其中多态位点1 46个 ,占总扩增位点的 73 .3 6% ,依此进行聚类分析将番茄属分为 4个类群 .遗传丰度、遗传离散度、基因杂合度和 Shan-non表型多样性指数分析结果显示 ,遗传多样性均有野生类群大于普通番茄类群的趋势 ,说明野生类群中存在着更为丰富的可用于番茄遗传改良遗传变异类型
关键词：
番茄属 RAPD 遗传多样性
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
杨文欣 贺俊芳 田莉莉 王伟 李敏 张斌
【目的】探究黄缘短头叶蝉(Iassus lateralis)的线粒体基因组结构及叶蝉亚科(Iassinae)的系统发育关系，为叶蝉的分类学、群体遗传学和进化学研究提供参考。【方法】通过高通量测序技术组装、拼接获得黄缘短头叶蝉线粒体基因组全序列，对其进行分析，并基于13个蛋白质编码基因(PCGs)和2个核糖体RNA基因(rRNAs)构建系统发育树。【结果】黄缘短头叶蝉线粒体基因组全长为15 153 bp(GenBank登录号：OQ991898.2),由37个编码基因和1个控制区组成，37个编码基因包括13个PCGs、22个转运RNA基因(tRNAs)和2个rRNAs;碱基组成呈现明显的A+T偏向性；PCGs以ATN或TTG作为起始密码子，以TAA、TAG或T作为终止密码子；13个PCGs编码3 624个氨基酸，其中，脯氨酸(Phe)的含量最多；22个tRNAs中，除trnS1缺失二氢尿嘧啶(DHU)臂外，其余均为典型的三叶草结构。系统发育分析表明，叶蝉亚科内的系统发育关系为：网脉叶蝉族(Krisinimi)单独聚为一支，短头叶蝉族(Iassini)、短板叶蝉族(Hyalojassini)和窄头叶蝉族(Batracomorphini)聚为一支。其中，黄缘短头叶蝉与褐盾短头叶蝉(I.dorsalis)聚为一支。【结论】叶蝉亚科内各族进化关系稳定，黄缘短头叶蝉的分类地位无较大变动，短板叶蝉族的分类地位需要用更多的样本数据进一步确定。
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
吴德东 张国财 杨璟 曾建勇 张国珍
采用系统溶剂法对北乌头甲醇提取物进行分离,用饲料混药法测定4种萃取物对舞毒蛾的胃毒毒力,测定了北乌头乙酸乙酯萃取物对舞毒蛾幼虫体内解毒酶、保护酶、消化酶活力的影响。试验结果表明:北乌头乙酸乙酯萃取物杀虫作用显著,为主要杀虫活性物质;舞毒蛾幼虫经北乌头乙酸乙酯萃取物亚致死浓度(LC_(20))处理后,其体内羧酸酯酶、谷胱甘肽S-转移酶和乙酰胆碱酯酶活性均表现为持续抑制,处理72 h,乙酰胆碱酯酶活力为对照的50.6%,抑制作用极显著(P<0.05)。综上,北乌头乙酸乙酯萃取物可影响舞毒蛾幼虫的解毒酶、保护酶及消化酶,扰乱其正常生理代谢。
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