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[期刊] 中国水产科学
[作者]
姚理想 周娜 沈和定 刘宸
基于CO I序列,对中国沿海5个平疣桑椹石磺(Platevindex mortoni)群体的遗传多样性及遗传分化进行了分析,84个样本中共检测出单倍型41个,多态性位点117个。总体来说,平疣桑椹石磺具有高的单倍型多样性(0.835±0.039)和核苷酸多样性(0.0572±0.0060)。分子方差分析(AMOVA)表明,65.98%的变异存在于种群间,34.02%的变异发生在种群内。群体间遗传分化固定指数(Fst)、基因流(Nem)及遗传距离分析表明,平疣桑椹石磺已产生了明显的群体间分化。厦门(XM)、湛江(ZJ)和广西(GX)群体间无明显分化,基因流较大(Nem>5),而海南(HN)、苍南...
[期刊] 水产学报
[作者]
杨智鹏 于红 于瑞海 孔令锋 李琪
我国脉红螺自然资源日趋衰减,为制定相应保护措施,需要对脉红螺遗传多样性及遗传结构进行分析研究。本实验利用9个微卫星标记分析了我国沿海脉红螺9个群体的遗传多样性和遗传分化水平。遗传多样性分析结果显示,群体平均等位基因丰度(AR)为8.6~9.5,期望杂合度(HE)为0.705~0.777,观测杂合度(Ho)为0.498~0.626。遗传分化分析结果显示,群体间遗传分化指数(FST)范围为0.012 2~0.093 6,各群体间没有显著的遗传分化,遗传距离(DC)为0.212~0.349。本研究结果表明,我国沿海脉红螺群体具有较高的遗传多样性,各群体间没有显著分化。
关键词：
脉红螺 微卫星 遗传多样性 遗传结构
[期刊] 水产学报
[作者]
董志国 李晓英 王普力 王文进 张庆起 阎斌伦 孙效文
为探明分布于中国四大海区的天然三疣梭子蟹群体遗传多样性与遗传分化状况,实验以大连(DL)、东营(DY)、连云港(LYG)、舟山(ZS)、湛江(ZJ)和漳州(ZZ)6个三疣梭子蟹地理群体为研究对象,采用线粒体控制区D-loop全基因序列为分子标记,对中国海三疣梭子蟹野生群体的遗传多样性及群体遗传结构进行了分析。结果发现,在用于分析的1 141 bp的D-loop全基因序列中共有185个变异位点,129个简约信息位点。60个个体中共计48个单倍型,单倍性多样性指数和核苷酸多样性指数显示中国沿海三疣梭子蟹群体具有较高的遗传多样性,而且三疣梭子蟹在过去没有出现很强的选择效应,群体大小稳定。6群体三疣梭...
[期刊] 海洋渔业
[作者]
曹艳 章群 宫亚运 吕金磊 杨喜书
为了解中国沿海蓝点马鲛（ＳｃｏｍｂｅｒｏｍｏｒｕＳ ｎｉｐｈｏｎｉｕＳ）的遗传背景以更好地保护和开发利用种质资源，对分布于渤海、黄海、东海和南海海域的６个群体７６ ｉｎｄ蓝点马鲛线粒体ｃｏｉ基因７１２ ｂｐ序列进行了测定，并结合Ｇｅｎ ｂａｎｋ中下载的９条南海蓝点马鲛序列，分析其遗传多样性、种群结构和历史动态。共检测到２１个变异位点，１７个单倍型，总体呈现高单倍型多样性（ｈｄ＝０．７０２±０．０４４）和低核苷酸多样性（π＝０．００２ ８±０．０００ ２）的特点，其中渤海、黄海和东海海域的蓝点马鲛群体遗传多样性指数相对较高（ｈｄ：０．６９５～０．８１６，π：０．００２ ７～０．００３ ３），而南．．．
[期刊] 海洋渔业
[作者]
李玉龙 刘修泽 李轶平 王爱勇 王小林 董婧
细纹子鱼（Ｌｉｐａｒｉｓ ｔａｎａｋａｅ）主要分布于西北太平洋海域的朝鲜半岛、日本和我国渤海、黄海和东海，已成为黄渤海渔业资源的优势种类之一，并在黄渤海生态系统中的扮演着越来越重要的角色。因此，有必要对这一生态优势种的种群状况及遗传背景进行了解。根据线粒体ＣＯⅠ基因序列对辽宁沿海不同体色花纹的细纹子鱼辽东湾群体（ｎ＝２０）和黄海北部群体（ｎ＝３４）的遗传多样性和群体遗传结构进行了分析。结果表明，长度为６２３ ｂｐ的ＣＯⅠ基因片段，其ａ、ｔ、Ｇ、Ｃ碱基的平均含量分别为２２．３％，３２．４％，２６．９％，１８．４％。在２个群体５４ ｉｎｄ个体中共检测得到８个单倍型，其单倍型间遗传差异为０．２％．．．
[期刊] 林业科学
[作者]
高宝嘉 杜娟 高素红 刘军侠
采用微卫星技术对入侵中国的5个美国白蛾种群进行遗传多样性和遗传分化及影响因素的研究。用10对微卫星引物对300个样品DNA进行PCR扩增,并进行聚丙烯酰胺凝胶电泳分析。5个美国白蛾种群的多态位点百分率P=98.36%;多态位点百分率的大小顺序为:沧州种群、烟台种群、秦皇岛种群、丹东种群、石家庄种群;美国白蛾整个群体的遗传分化:34.38%的变异存在于种群间,65.62%的变异存在于种群内,遗传距离变化范围为0.1386～0.3224。用UPGMA法对Nei's遗传距离作聚类分析的结果表明:种群的分化程度与分化时间和入侵来源密切相关。影响美国白蛾种群遗传多样性与遗传分化的主要因素是经度、平原比率...
[期刊] 林业科学
[作者]
王铁娟 李伟琼 张淑艳 孟翔飞
差不嘎蒿(Artemisia halodendron)也称盐蒿,是菊科(Compositae)蒿属(Artemisia)的多年生半灌木,为中旱生沙生植物。可生长于流动沙丘的背风坡、半流动沙丘、半固定沙地、固定沙地和干旱坡地,在半流动、半固定沙地优势作用明显(李进,1991;常
关键词：
差不嘎蒿 ISSR 遗传多样性 遗传分化
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
罗福广 苏翔驹 区小玲 李斌 潘英 郑惠芳 覃志彪
利用RAPD技术对管角螺(Hemifusus tuba Gmelin)4个自然群体(广西北海、广东湛江、浙江温州、江苏连云港)的遗传多样性进行了分析。所选择的19条有效引物在4个自然群体200个个体中总共产生182个扩增片段,片段数量为19 983个,片段大小在250～2 500 bp之间。其中每条引物可产生4～17条带,平均5.28个位点。4个自然群体共检测到149个多态位点,多态位点比例为81.87%,其中北海群体的多态位点比例最高,占66.48%,其次是湛江群体为47.25%,温州群体为44.51%,连云港群体为36.81%。4个群体中均未检测到各群体特有的扩增带。4个自然群体管角螺的N...
关键词：
管角螺 遗传多样性 遗传距离 RAPD
[期刊] 水产学报
[作者]
宋素霞 丁少雄 鄢庆枇 覃映雪
为科学保护和开发我国光裸方格星虫自然资源,本研究以cytb基因全长为分子标记分析了山东烟台、福建古雷、香港、海南儋州、海南陵水、广西东兴6个光裸方格星虫群体的遗传多样性。结果显示,203个个体共检出128个单倍型,299个多态位点,核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0.0488和0.9773,且变异主要来自群体间(88.4%)。6个光裸方格星虫群体间遗传分化指数(F_(st))分析结果显示,南方5个群体间F_(st)0.15,群体间呈高度分化。中性检验(Fu’s Fs、Tajima’s D)结果为负值,北方
[期刊] 水产学报
[作者]
舒妙安 周宇芳 朱晓宇 赵晓枫 郭晓令
利用17对微卫星引物对我国沿海7个拟穴青蟹野生群体(杭州湾、三门湾、闽江口、东山湾、珠江口、北部湾、清澜港)进行了遗传多样性分析。结果表明,17个位点在所有青蟹群体中均为高度多态(PIC>0.5),共检测到253个等位基因;7群体的平均等位基因数(A)为9.41～10.94,平均有效等位基因数(Ne)为5.42～6.87,平均杂合度(H)为0.511～0.563,群体遗传多样性水平较高。分子方差分析(AMOVA)结果显示,94.13%的遗传变异存在于群体内,5.87%的遗传变异存在于群体间,两两群体间FST值为0.035 5～0.081 7(P<0.01),表明群体间遗传分化水平中等偏低。Ha...
关键词：
拟穴青蟹 野生群体 微卫星 遗传多样性
[期刊] 水产学报
[作者]
周娜 沈和定 陈诚
通过对COⅠ序列的分析,研究了中国沿海及泰国普吉岛8个里氏拟石磺群体的种群遗传结构,171个样本中共检测出单倍型101个,117个多态性位点,里氏拟石磺具有高的单倍型多样性(0.974±0.005)和核苷酸多样性(0.032 2±0.001 3)。分子方差分析(AMOVA)表明,50.99%的变异存在于种群间,49.01%的变异发生在种群内。群体间遗传分化固定指数(F st)、基因流(N m)及遗传距离分析表明,里氏拟石磺已明显分化为显著的遗传结构。遗传距离模式(IBD)检测显示,里氏拟石磺群体的遗传距离与地理距离之间不存在明显的线性关系。历史动态检验推断,湛江(ZJ)、苍南(CN)、东寨港(...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
梁宏伟 孟彦 罗相忠 李忠 邹桂伟
为研究我国主要养殖区域黄鳝(Monopterus albus)的遗传多样性,利用线粒体细胞色素c氧化酶亚基I(cytochrome C oxidase subunit I,COI)基因对来源于湖北、江西、安徽、湖南、重庆和山东的6个黄鳝群体共187个样本进行遗传多样性分析。结果表明长度为646 bp的COI基因序列在6个群体的碱基含量基本相同,碱基T、C、A和G的平均含量分别为27.7%,30.7%,24.5%和17.1%,包括61个变异位点,其中单位点突变16个,简约信息位点45个,变异位点以C/T间的转换为主。6个群体中共检测到38种单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.886,核苷酸多样性(π)为0.01094,群体整体遗传多样性高,湖北和山东群体遗传多样性都较高(Hd>0.8),湖南群体和江西群体的遗传多样性次之(Hd>0.5),而安徽和重庆两个群体的遗传多样性都较低(Hd<0.5)。6个群体间有显著的遗传分化,基因交流贫乏(Nm<1)。群体分子变异分析(AMOVA)显示,6个黄鳝地理种群群体内的遗传变异高于群体间的遗传变异,其遗传变异主要发生在群体内部。遗传结构和系统发育树显示湖南群体与其他5个群体的遗传关系较远。重庆群体可能由单一或很少几个群体进化而来的,起源比较单一。就目前而言,黄鳝野生种质资源遗传多样性丰富,苗种频繁流动和人工养殖尚未对其种群结构造成较大影响,仍有较强的环境适应能力和良好的育种潜力。
[期刊] 水产学报
[作者]
赵文 张雷 毕进红
采用ISSR技术,对辽宁沿海5个毛蚶群体的遗传多样性进行了研究。在选择的12个随机引物中共检测到137个扩增片段,长度在200～2 500 bp,每个个体获得的扩增条带在9～15条不等。利用POPGEN 3.2和MEGA 2统计软件,获得实验数据,确立了5个群体间的亲缘关系。结果表明,毛蚶5个地理群体分化不明显,没有形成不同的地理种群;聚类分析显示,丹东和庄河亲缘关系最近,然后依次为金州、营口、锦州;5个群体无论是在多态位点比例还是在平均杂合度上都处于较高水平,说明毛蚶当前种质资源状况良好,遗传多样性水平较高。
关键词：
毛蚶 遗传多样性 ISSR
[期刊] 海洋渔业
[作者]
赵优
多鳞四指马鲅（Eleutheronema rhadinum）是一种名贵经济鱼类，具有较好的养殖开发前景。本文采用fAFLP对多鳞四指马鲅8个地理群体214个样本进行扩增和遗传结构分析。结果显示：9对引物组合共扩增条带493条，多态性条带为443条，多态性比例为89.86%；8个地理群体Nei’s基因多样性指数为0.3028±0.1253，Shannon’s信息指数为0.4378±0.1480。多态性位点数、多态性位点比例、有效等位基因、Nei’s基因多样性指数和Shannon’s信息指数表明，群体遗传多样性大小依次为舟山（ZS）>崇明（CM）>启东（QD）>东山（DS）>广州（GZ）>湛江（ZJ）>琼海（QH）>高雄（GX）。经AMOVA分子方差分析，23.72%遗传变异来自于群体间，基因流Nm为0.8040。8个地理群体UPGMA聚类得出多鳞四指马鲅群体可划分为4分支。研究不同地理群体多鳞四指马鲅的遗传结构，以期为合理地评估和保护其资源、开展遗传育种及开发人工养殖技术等提供基础资料。
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