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[期刊] 林业科学
[作者]
王滑 郝俊民 王宝庆 裴东
Eight Juglans populations (4 populations of J. sigillata and 4 of J. regia), which are distributed in Yunnan, Sichuan, Henan, and Shanxi Province, were selected to investigate their genetic structure and diversity using 8 microsatellite loci. A moderate level of genetic diversity was observed at pop...
[期刊] 林业科学研究
[作者]
刁松锋 邵文豪 陈涛 姜景民 段文彬
［目的］通过我国无患子主要分布区的居群样本，研究无患子天然居群的遗传多样性和遗传结构。［方法］采用ＩＳＳＲ分子标记技术，利用１２条ＩＳＳＲ引物分析１８个天然居群的２６５株个体样本。［结果］表明无患子遗传多样性水平较高，物种和居群水平上的多态位点百分率（ＰＰＢ）分别为９５．３７％和５７．８２％，Ｓｈａｎｎｏｎ’Ｓ信息指数（Ｉ）分别为０．２５６ ９和０．１９９ ８，ｎｅＩ’Ｓ遗传多样性指数（ｈ）分别为０．３９０ ９和０．２９８ ０。ａＭｏＶａ分析表明，１８个居群间出现一定程度的遗传分化，且遗传变异主要发生在居群内。ＵＰＧＭａ聚类和Ｍａｎｔｅｌ检验结果表明，１８个天然居群可分为２大组群，且居群间的地．．．
[期刊] 中国林业科学研究院
[作者]
李峰卿
红豆树(Ormosia hosiei)为国家二级重点保护植物,自然分布于陕西南部和江苏、浙江、江西、福建、湖北、四川、重庆、贵州等省(市),呈星散间断或小块状生于溪边、山谷常绿阔叶林中。红豆树材质优良,有光泽,其纹理美观,是制作工艺雕刻、装饰镶嵌等的上等用材。由于红豆树具有较高的经济和人文价值,其原有天然资源被遭到严重的人为破坏。红豆树现有天然居群较小,自然更新困难,已经处于濒危状态,但目前对其遗传背景了解较少。本研究在已有研究基础上,首先,开发适用于红豆树遗传多样性分析的SSR标记,系统研究不同小流域红
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
程建慧 廖荣俊 宋其岩 陈友吾 叶碧欢 柳娟 沈建军 李海波
【目的】科学保护和合理利用香椿天然遗传资源，揭示浙西南香椿天然群体的分子遗传背景。【方法】利用16个多态性SSR标记对浙西南5个香椿天然居群的156份香椿材料进行遗传多样性、遗传分化程度和遗传结构分析。【结果】1)156份香椿材料在16个SSR位点共检测出110个等位基因，每个位点的平均等位基因数(N_a)和平均有效等位基因数(N_e)分别为6.88和2.48，不同等位基因在香椿个体中呈不均匀分布；16个SSR位点的多态性信息含量(PIC)介于0.04～0.79，平均为0.45;2)16个SSR位点的Shannon’s信息指数(I)和Nei’s基因多样性指数(H)平均值分别为0.99和0.49；居群内近交系数(F_(is))和总近交系数(F_(it))平均值分别为-0.02和0.03，遗传分化系数(F_(st))平均值为0.05，仅5%的遗传变异来自不同居群间；基因流(N_m)平均值为4.82；分子方差(AMOVA)分析显示遗传分化的根本原因为总的个体内变异(95%)，极少为居群间变异(5%)，没有来自居群内的个体变异；3)遗传差异和UPGMA聚类分析表明5个居群的Nei’s基因遗传一致度为0.93。浙江开化和浙江常山居群的遗传差异最小，Nei’s基因遗传一致度为0.97；浙江龙游居群与其他4个居群的遗传差异较大；4)群体遗传结构分析表明156份香椿材料无最佳K值；根据ΔK值最大分为3个亚群，各居群材料在3个亚群中皆有一定数量分布。【结论】浙西南天然居群香椿资源在个体水平上的遗传多样性较为丰富；居群内近交程度很低，主要繁殖方式为杂交；香椿居群间的遗传分化程度很小，居群间存在频繁的基因交流，遗传变异主要发生在个体内；浙西南香椿不同居群间的遗传差异总体上较小；居群间未形成相对独立的遗传结构，绝大部分的香椿种质遗传背景比较单一，少量种质拥有复杂的遗传背景。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
马庆国 齐静 裴东
采用FISH-AFLP技术,筛选9对E+3和M+3引物组合,对我国首批16个早实核桃良种进行了基因组DNA水平上的检测,结果表明:共获得1 072条可统计的条带,其中946条呈多态性,平均的多态性带百分率达88.12%;经9对引物检测的16个品种基因型各不相同,均得到数目不等的特征带,并能将16个早实核桃良种完全区分开。研究分析了早实核桃良种的遗传多样性和亲缘关系并建立了它们的指纹图谱。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
何健 马庆国 雪来提·牙生 孙东 孙世国 裴东
采用FISH-AFLP技术,选取8对EcoRⅠ+3和MseⅠ+3引物组合,对新疆维吾尔自治区林木品种审定委员会审(认)定的24个核桃品种(无性系)、2株实生古树及4个农家类型在DNA水平上进行了多态性检测。结果表明:在获得的1 011条谱带中,981条呈多态性,多态性百分率达97.5%;不同引物组合的有效等位基因数为1.188 71.234 7,平均为1.208 5;基因多样度为0.118 3 0.141 2,平均为0.129 7;Shannon信息指数为0.184 6 0.225 8,平均为0.206 6。总体的遗传多样性水平为中等。经8对引物检测的30个品种及类型均得到数目不等的特异带型,...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李超 罗淑萍 曾斌 李疆 李刚
【目的】通过ISSR标记技术,对新疆核桃种质资源的遗传多样性及遗传结构进行分析,为该资源的保护与利用提供理论依据和技术支持。【方法】采用ISSR标记对5个居群和1个栽培类型共163份样品进行遗传多样性分析。【结果】用13条引物对163份样品进行扩增,共检测扩增位点117个,其中多态性位点98个。在物种水平上,多态性位点百分率(PPL)为83.76%,Nei’s基因多样性(H)为0.3010,Shannon信息指数(I)为0.4182;在居群水平上,多态性位点百分率平均为68.36%,Nei’s基因多样性(H)平均为0.1265,Shannon信息指数(I)平均为0.1651。基于Nei’s遗传...
关键词：
核桃 种质资源 遗传多样性 ISSR
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘警 李扬 刘金利 张馨方 白仲奎 于秋香
为研究核桃种质资源涩味的遗传多样性,以4个不同核桃涩味群体共118份种质资源为材料,利用SSR毛细管电泳荧光标记技术进行遗传多样性研究,并构建树状聚类图。结果表明:12对引物共检测到93个等位变异位点,变异范围为2～18,平均每对SSR引物可检测到7.75个等位位点;多态性信息量(PIC)为0.357 9～0.785 2,平均0.541 1。4个群体的多态位点数Np为91、多态位点百分率PPB为97.85%、观测等位基因数Na为1.978 5、有效等位基因数Ne为1.198 5、Shannon′s信息指数I为0.209 7、Nei′s多样性指数H为0.126 3、总遗传多样性指数Ht为0.126 7、群体内遗传多样性指数Hs为0.122 2,说明4个核桃群体的遗传多样性和变异度不高。群体间遗传分化系数Gst为0.035 5,说明群体内遗传变异占总变异的96.45%。其中稍涩群体多态性位点百分率最大,为72.04%,说明稍涩群体在4个群体中遗传多样性最丰富。UPGMA聚类分析表明,4个群体的遗传相似系数在0.989 8～0.997 1,群体的整体相似系数高,说明这4个群体的遗传距离很近。当相似系数为0.993 4时,可将4个群体分成2组。其中,第1组包括不涩、稍涩和较涩3个群体,剩余涩群体单独为一组。通过计算不同群体93个位点的基因频率,发现12对引物的41个位点可将不同涩味等级的资源区分开。利用SSR分子标记技术对4个核桃群体进行与涩味相关的遗传多样性分析,根据转录组测序结果筛选出12对引物用于SSR分析,共扩增出93个SSR位点,多态位点百分率为97.85%,说明引物的多态性高,适用于核桃的遗传多样性分析,为培育轻涩味的优良品种提供技术指导,可用于后续核桃涩味的遗传多样性及育种研究。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
王红霞 赵书岗 高仪 张志华 玄立春
【目的】从分子水平上探讨普通核桃品种的遗传多样性和亲缘关系,为更有效地保护和利用这些品种资源提供科学依据。【方法】采用AFLP-银染分子标记技术,对131份核桃品种进行遗传多样性和亲缘关系分析,应用NTSYSpc2.11a分析软件对统计结果进行聚类分析。【结果】选用20对多态性高、分辨力强的EcoRⅠ/MseⅠ引物组合分别对供试材料的基因组DNA进行扩增,共获得1 643条清晰可辨的条带,其中多态性带1 512条,平均每个引物组合可检测出82.15个多态性位点,多态性位点百分率高达92.03%。得到131份材料间的相似系数范围为0.637—0.928。当相似系数为0.76时,UPGMA分析将1...
关键词：
核桃 AFLP 遗传多样性 亲缘关系
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
何恒流 蔡宇良 高天翔 李彬 宛甜 王玉
【目的】研究陕西野生毛樱桃自然居群的遗传多样性,为科学保存和利用陕西野生毛樱桃资源提供理论依据。【方法】以陕西野生毛樱桃的7个自然居群140份样本为材料,用SSR分子标记技术研究其遗传多样性和遗传结构。【结果】用10对SSR引物从7个毛樱桃自然居群中共检测出92个等位基因,各引物扩增的条带在6~14个。居群多态位点比率(PPL)为100%,Shannon’s信息指数(I)平均值为1.280,Nei’s基因多样性指数(H)平均值为0.655,可观察杂合度(Ho)平均值为0.584,期望杂合度(He)平均值为0.672,表明陕西7个毛樱桃自然居群具有较高的遗传多样性水平。居群的基因分化系数Fst=...
关键词：
野生毛樱桃 SSR 遗传多样性 遗传结构
[期刊] 林业科学
[作者]
刘军 陈益泰 孙宗修 姜景民 何贵平 饶龙兵 吴天林
利用8对微卫星标记对分布于我国的3个毛红椿天然居群的遗传结构进行研究。收集毛红椿3个天然居群209个单株材料并对每个单株的位置进行定位,运用空间自相关分析研究毛红椿居群的空间遗传结构,了解该物种的进化历程和濒危机制,并为制定有效的保护策略和措施提供科学依据。研究结果表明:1)居群等位基因的平均数为5.3,有效等位基因数平均为2.6;2)观察杂合度平均为0.5990,期望杂合度平均为0.5893;3)空间自相关分析结果揭示毛红椿宜丰天然居群在0~240m存在着显著的空间遗传结构;4)宾川和师宗居群内遗传变异在空间上为随机分布,不存在明显的空间遗传结构;5)导致居群内空间遗传结构形成的原因,包括花...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
李雪萍 何正权 陈发菊 梁宏伟 李凤兰
用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对神农架地区4个居群28个珙桐(Davidia involucrataBaill.)个体进行了遗传多样性分析.16个10 bp寡核苷酸引物共检测到87个位点,多态位点49个,多态百分率56.3%,而居群平均多态位点百分率为30.2%.用POPGENE对数据进行了分析,结果显示:居群的平均Nei’s基因多样性为0.111 8,Shannon’s遗传多样性信息指数为0.165 1,总的居群基因多样性为0.169 2,基因分化系数为0.339 2.这表明神农架地区珙桐的遗传多样性较低,其遗传变异以居群内遗传变异为主.
关键词：
珙桐 遗传多样性 RAPD
[期刊] 林业科学
[作者]
徐永杰 韩华柏 王滑 陈凌娜 马庆国 裴东
【目的】大巴山区因其地理和气候原因是我国生物多样性也是核桃资源分布最为重要的地区之一。近年来，由于经济利益驱使，种质资源破坏十分严重。本研究针对该区域核桃实生居群现状开展研究，以期探明其种质多样性特点及居群遗传结构，为科学有效利用和保护提供依据。【方法】选取该区域１２个实生居群３８６个实生单株为试材，单株为１个样本，分别对每个样本坚果（每样本选３０个均匀坚果）１２个表型性状变异和坚果播种苗（每个样本选１株播种苗）１６个等位基因位点遗传多样性进行分析。【结果】１）大巴山区核桃实生居群坚果表型性状变异系数介于２６．７５％～３４．３６％之间，平均为３０．６０％，小果型（单果质量小于６ ｇ）资源占有一．．．
关键词：
核桃 居群 表型性状 遗传性状 多样性
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
付光晟 谭学春 王滑
为有效挖掘湖北神农架核桃(Juglans regia)的种质资源,采用12对多态性高的SSR分子标记引物对3个神农架核桃居群90个单株的遗传多样性及其种群内、种群间的遗传分化进行研究。结果表明:用12对针对核桃属植物基因组设计的SSR引物共检测到108条谱带,其中多态带占比为100%。遗传多样性分析结果显示:居群总期望杂合度为0.604,其遗传多样性水平较高,很可能蕴含了稀有基因资源。遗传分化系数(Fst)显示:有8.22%的变异存在于3个居群间,遗传分化程度中等。这可能与3个居群的地理距离远有关。部分位
[期刊] 林业科学研究
[作者]
瞿印权 杨德明 徐雯 杜溶讫 何天友 施成坤 荣俊冬 陈礼光 郑郁善
[目的]研究花吊丝竹居群遗传多样性和遗传结构,为种质资源有效利用和良种选育提供理论指导。[方法]利用12条ISSR引物对48份种质(共3个居群)花吊丝竹居群进行遗传多样性和遗传距离分析。[结果]共检测到124个位点,其中,多态性位点为102个,种质和居群水平上的多态位点百分比(PPB)分别为82. 26%和50. 27%,Ne’基因多样性指数(He)分别为0. 220 4和0. 206 6,Shannon’s信息指数(I)分别为0. 349 4和0. 300 5,表明花吊丝竹居群间存在中等水平的遗传变异。根据Nei’s遗传多样性计算出不同居群间分化水平(Gst)=0. 163 3,表明16. 33%的遗传变异存在于居群间,居群内的遗传变异为83. 67%。居群间的基因流Nm为2. 562 1,表明花吊丝竹居群间存在较大基因流,很大程度减少居群间遗传差异。基于遗传距离的UPGMA聚类结果表明,48份种质可分为3组,3个居群可分为2组,居群间地理距离与亲缘关系无显著相关性。[结论]虽然花吊丝竹主要靠营养生殖来繁衍后代,其居群遗传多样性较丰富,且居群内遗传多样性大于居群间。此外,福建居群遗传多样性明显高于广西和广东地区居群。
关键词：
花吊丝竹 遗传多样性 ISSR
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