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[期刊] 中国农业科学
[作者]
姜玉锁 赵慧婷 姜俊兵 曹果清 张桂贤 朱文进 郭传甲
【目的】从线粒体水平上探讨中国境内不同地理型东方蜜蜂的系统发育关系,为东方蜜蜂亚种分化的研究及我国境内东方蜜蜂资源的保护与合理开发利用提供基础资料。【方法】采用公开的E2、H2引物对11个不同地理型东方蜜蜂线粒体DNA tRNAleu～COⅡ基因进行了PCR扩增、测序,并利用相关软件和网站进行了序列比较分析。【结果】该序列长度为471bp;序列中共有9个位点发生变异;序列相似性均在99%以上;限制性酶切分析表明:云南保山东方蜜蜂缺少一个SwaⅠ酶切位点;部分编码蛋白序列比对表明,海南海口和吉林安图东方蜜蜂各有一个氨基酸发生变异。与GeneBank上公开登录的国内外有关东方蜜蜂相关序列的比较表明...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
刘意秋 冯毅楠 周丹银 龚雪阳 赵文正 董坤 和绍禹
以线粒体DNA COⅠ区间基因片段为指标,利用生物信息学软件分析了陕甘宁青晋地区5个省15个采样点共443群东方蜜蜂的遗传分化状况.所得序列全长625 bp,共定义了21个线粒体单倍型,总单倍型多样度为0.536±0.029,总核苷酸多样度为:0.001 16±0.000 08.单倍型网络关系图、系统发育树以及分子方差分析数据显示,这些种群总体遗传分化不显著,所采集样本的变异主要存在于组内群体间和群体内,组间变异不显著.
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
周姝婧 朱翔杰 徐新建 吴显达 周冰峰
为了研究福建东方蜜蜂的遗传变异和遗传多样性，在全省采集９个样点，共４２４群东方蜜蜂样本，进行线粒体ＤＮＡ ｔＲＮＡｌｅｕ－ＣＯⅡ序列分析．结果表明，ｔＲＮＡｌｅｕ－ＣＯⅡ片段序列包括９３ ｂｐ的非编码区和２５９ ｂｐ的ＣＯⅡ编码区．在整个３５２ ｂｐ序列中，共检测到２３个多态位点和２７种单倍型，平均单倍型多样度为０．４８４ ３，平均核苷酸差异数为０．６８７，平均核苷酸多样度为０．００１ ９３．福建东方蜜蜂各样点间不存在遗传分化，总体遗传分化系数为０．００３，各样点的基因流参数为４９．７５～２４９．７５．
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
周姝婧 徐新建 朱翔杰 高景林 周冰峰
采用线粒体DNA tRNAleu-COII片段的序列分析方法,对海南16个样点的715群中华蜜蜂(Apis cerana cerana)进行遗传多样性研究,明确了海南中华蜜蜂线粒体DNA tRNAleu-COII片段序列的遗传多样性及单倍型的分布特点.结果共发现48种单倍型,其中新发现43种单倍型.共检测到38个变异位点,包括12个单一多态位点、23个简约信息位点、1个插入位点和3个缺失位点.海南中华蜜蜂单倍型多样度为0.742±0.017,平均核苷酸差异数为1.248,核苷酸多样度为0.00354±0.00013,这表明海南中华蜜蜂线粒体DNA tRNAleu-COII片段具有丰富遗传多样性...
关键词：
海南 中华蜜蜂 线粒体DNA 遗传多样性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
薛运波 李兴安 葛凤晨 蒋滢 历延芳 李志勇 王志
【目的】比较和揭示12个长白山中蜂(长白山地方采样点中华蜜蜂)基因组多态性的分布规律。【方法】采用RAPD-PCR技术选择性扩增基因组RAPD位点分子,以NTsys-PC方法建立基因组分子标记系统树状结构和计算基因组分子标记相似系数。【结果】1104号等6个蜂基因组分子标记多态性图谱同时具有240、400、700、和1 500 bp等4个条带,其系统树状结构在相似系数值为0.568时呈现相对独立的一个分支;1083号等6个蜂基因组分子标记多态性图谱同时具有240、400、600和1 200 bp等4个条带,其系统树状结构在相似系数值为0.586时呈现相对独立的另一个分支;相似系数值二维矩阵与系...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
苏天凤 黄建华 吴进锋 江世贵
对来自粤东和粤西的方斑东风螺(Babylonia areolata(Link))和台湾东风螺(Babylonia formosae(Sowerby))的线粒体16S rRNA和COⅠ基因片段的序列进行分析,并对其遗传变异进行了比较研究。得到的序列总长度分别为506 bp(16S rRNA)和640 bp(COⅠ)。2种东风螺序列的碱基组成均显示较高的A+T比例(16S rRNA基因63.5%,COⅠ基因62.4%)。对位排序比较表明,16S rRNA基因片段变异较小,台湾东风螺和方斑东风螺各存在1个碱基变异位点;方斑东风螺COⅠ片段有12个碱基存在变异,包括3个简约信息位点和9个单一多态位点;...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
贾永红 简承松 朱文适 张亚平 史宪伟 余应淮 廖正录 李通权
采用１５种限制性内切酶对贵州威宁绵羊和六盘水绵羊各５只个体的ｍｔＤ－ＮＡ多态性进行研究。其中只有ＢａｍＨⅠ一种酶的酶切类型表现多态，产生三种酶切类型。共得到１７种限制性态型，可归结为三种ｍｔＤＮＡ单倍型，在威宁绵羊中单倍型Ⅰ所占比较较大（８０％），单倍型Ⅲ只占２０％，而在六盘水绵羊中则单倍型Ⅰ和Ⅱ所占比例相当；根据单倍型在群体中的分布和单倍型间遗传距离，推测贵州绵羊的ｍｔＤＮＡ单倍型Ⅰ和Ⅱ可能代表两个母系祖先的基本单倍型，其分化时间约有１６～３２万年之久，单倍型Ⅲ则可能是由单倍型Ⅰ随机突变而来；两个地方绵羊群体间的分化时间大约为６．３～１２．６万年，群体间的ｍｔＤＮＡ遗传多态度较低，但六盘水绵...
关键词：
贵州绵羊 mtDNA RELP
[期刊] 水产学报
[作者]
姚纪花 楼允东 江涌
本文用一对引物对我国６个地区的银鲫进行ｍｔＤＮＡ－ＮＤ５／６片段的ＰＣＲ扩增，扩增产物（约２．５Ｋｂ）用６种限制性内切酶进行限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）分析。共获得１１种图谱和７种限制性类型（基因型）。根据各群体间的遗传距离构建了ＵＰＧ聚类关系图。结果表明，６个银鲫种群中，云南群体与贵州群体的关系以及黑龙江与安徽群体之间的关系最近，它们分别归为一个群体；河南群体相对独立，它与黑龙江和安徽群体的遗传关系较近；江西群体与各群体间的亲缘关系最远。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘志勇 王子龙 王欢 曾志将
【目的】分析不同地理群体中华蜜蜂(Apis cerana cerana)csd的多态性。【方法】以吉林长白山、海南海口、广西南宁、湖北神农架和江西靖安5个省市的中蜂工蜂为试验材料,提取每个工蜂样品的基因组DNA,对csd 3区进行PCR扩增、克隆和测序,分析csd的多态性。【结果】对中国5个省市的中蜂csd 3区基因组序列进行了克隆测序,获得32条csd基因单倍型,其中吉林长白山和江西靖安群体csd的多态性显著高于其它群体,而吉林长白山群体和江西靖安群体之间,广西南宁群体、海南海口群体和湖北神农架群体之间csd的多态性没有显著差异。利用csd进行群体分析表明江西靖安中蜂与吉林长白山中蜂的核苷酸...
关键词：
中华蜜蜂 csd 多态性 单倍型
[期刊] 水产学报
[作者]
刘红艳 江世贵 苏天凤 龚世园
利用PCR技术扩增海南海口市、福建厦门市和广东珠海市3个地理群体海捕黄鳍鲷线粒体D-loop基因片段,测定了该基因片段580bp序列。结果发现,3个地理群体内和群体间都存在丰富的DNA序列多态性,共检测到33个多态性核苷酸位点(5.7％),24个个体具有22种单倍型(haplotype)。UPGMA法构建的分子系统树中,海南群体内所有的单倍型聚成一支,福建与广东的单倍型混杂在一起,聚成一支。从序列差异的分析中得出,海南群体与福建和广东群体的亲缘关系较远;福建群体和广东群体亲缘关系较近。
[期刊] 水产学报
[作者]
董新培 穆淑梅 周楠 康现江 罗青 白俊杰
为研究乌鳢群体的遗传多样性和控制区结构,实验采用PCR和DNA测序技术对其线粒体DNA控制区序列进行比较。结果显示,用于分析的线粒体DNA控制区全长序列为905~908 bp。104个序列中共发现了37个多态位点,定义了27种单倍型。同时对控制区结构进行分析,识别了其终止序列区(ETAS)、中央保守区(CD)和保守序列区(CSB)的关键序列。3个地理群体的单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(k)分别为0.875、0.003 27和2.939。群体间的平均Kimura双参数遗传距离(Kimura 2-parameter distance,K 2-P)、遗传分化指数(Fs...
关键词：
乌鳢 线粒体DNA控制区 遗传多样性
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
孙玲 王凤成 王秋实 刘彦群 仝振祥 冀万杰 张博 王学英
以22个柞蚕品种(品系)为材料,采用PCR技术分别扩增其线粒体DNA(mtDNA)的细胞色素b基因(Cytb),测定5’端485bp的核苷酸序列,并采用Dnaman软件进行分析,结果表明:供试22个柞蚕品种可分成2组,2组之间只在294bp处有一个差异位点。从GenBank中调取柞蚕豫早1号品种Cytb基因的5’端相应序列(AY242996),与本试验测得的柞蚕青黄1号和青6号对应的核苷酸序列进行了同源性比较,结果表明:青黄1号和青6号的同源性达99.8%,青黄1号和豫早1号的同源性达98.6%,青6号和柞早1号的同源性达98.8%。可见,不同柞蚕品种的表型虽然不同,但在Cytb基因水平上其核...
关键词：
柞蚕 线粒体 细胞色素b基因 序列分析
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘凤丽 刘永斌 王峰 王瑞 田春英 刘美霞 魏建民 荣威恒
为了研究骨形态发生蛋白受体(BMPR-IB)基因对绵羊排卵控制的作用,进一步寻找与多胎绵羊相关的遗传标记,为中国地方绵羊品种繁殖性状的标记辅助选择提供一定的理论基础。以影响Booroola Merino高产性能的BM-PR-IB基因为候选基因,采用PCR-RFLP方法分析内蒙古地方品种,蒙古羊、呼伦贝尔羊、内蒙古细毛羊与中国美利奴多胎品系共206只绵羊个体的基因多态性,以及BMPR-IB基因多态性与绵羊进化的关系。结果表明:高繁殖力的中国美利奴羊多胎品系BMPR-IB基因编码序列第746位碱基处发生了与Booroola Merino绵羊相同的突变(A746G),而低繁殖力的蒙古羊、呼伦贝尔羊、...
[期刊] 华北农学报
[作者]
张翠霞 王洪梅 李建斌 王长法 赖松家 李秋玲 仲跻峰
以297头中国荷斯坦奶牛为研究对象,以TLR2(Toll like receptor 2)基因为目的基因,扩增目的片段,结合测序结果采用PCR-RFLP和CRS-RFLP技术方法来检测TLR2基因第2外显子的遗传多态性。结果发现:exon 2存在10098(T/G),10111(G/A)和11541(C/T)3个单核苷酸突变,其中11541位点的T/C突变为首次报道。分别选择EcoRV、HaeⅢ、DraⅠ等3种限制性内切酶检测其多态性。10098位点有3种基因型(AA,AB,BB),A、B等位基因频率分别为0.784 5,0.215 5;10111位点有2种基因型(CC,CD),C、D等位基因...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
王朝锋 陈宏 雷初朝 孙维斌 党瑞华 张志清
对4头延边牛个体与GenBank中4头朝鲜牛个体的线粒体DNA(mtDNA)D环(D-loop区)910bp全序列进行了比较分析。结果发现,8头黄牛个体mtDNAD-loop序列由8种单倍型组成,单倍型比例为100%,表明2个黄牛品种mtDNA遗传多态性很丰富;在4头延边牛D-loop区序列中,共检测到核苷酸多态位点17个,核苷酸变异率为1.87%;在4头朝鲜牛中共检测到核苷酸多态位点10个,核苷酸变异率为1.10%;延边牛和朝鲜牛mtDNAD-loop全序列突变类型均为转换、颠换和插入/缺失,其中以转换为主;序列分析显示朝鲜牛与延边牛的同源性很高,达98.90%～99.67%,表明朝鲜牛和延...
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