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[期刊] 西南农业学报
[作者]
蒋彧 何俊蓉 刘菲 王海娥 卓碧萍 唐可玲
为了分析中国兰遗产多样性,利用64对SRAP引物对中国兰24个品种的种质资源进行遗传亲缘关系分析。结果表明,筛选出的51对多态性高引物,共产生1113条扩增带,平均每对引物扩增22条带,多态性条带共1092条,占总数的98.1%。利用ntsys软件分析遗传相似系数,并构建聚类图。因此,结果表明与形态学分类基本一致,SRAP标记适用于分析不同国兰品种之间的遗传基础。
关键词：
中国兰 SRAP 遗传多样性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
唐源江 曹雯静 吴坤林
【目的】探究国兰种质资源遗传多样性水平,并构建分子指纹图谱及分子身份证,为在分子水平上鉴定国兰种质提供技术支撑,也为国兰种质资源开发、保存利用及种质创新奠定基础。【方法】以收集于华南及邻近地区的139份国兰栽培品种和野生种质为材料,采用改良的CTAB法提取基因组DNA,由13条正向引物和16条反向引物随机组成208对SRAP引物,每对引物用品种‘宋梅’和‘大勋’扩增产物进行筛选;PCR扩增产物应用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,电泳胶图进行人工读带,并计算多态性引物的总扩增条带数、多态性条带数和多态性条带比率。按照Botstein公式计算多态信息含量;用POPGENE32软件计算观测等位基因数、...
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
刘明骞 陈丽君 丁美美 欧阳昆唏 惠文凯 李俊成 陈晓阳
采用相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记方法,对收集到的来源于11个国家的19个剑豆种群进行遗传多样性分析。结果表明:1)在扩增出的274条清晰条带中,具有多态性的有144条,占总数的52.6%;2)28对引物的多态性指数(Polymorphism information content,PIC)介于0.16~0.43,平均值为0.28;3)剑豆总遗传多样性指数(Ht)为0.285 6,基因流(Nm)为0.065 6;4)通过分子方差分析(Analysis of molecular variance,AMOVA)...
关键词：
剑豆 相关序列扩增多态性 遗传多样性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李秀 徐坤 巩彪
【目的】生姜为无性繁殖作物,千百年来,在经历气候变迁、自然选择和人工选择过程中,其生物学性状呈现出多方面变异,造就了许多地方品种。因此,研究生姜种质资源的遗传多样性及亲缘关系,对生姜资源进行科学分类,为生姜种质的收集、保护和创新利用提供理论依据。【方法】采用CTAB法提取生姜幼叶基因组DNA,利用SRAP(相关序列扩增多态性,sequence-related amplified polymorphism)分子标记技术,对来源于世界不同地区的51份生姜种质的基因组DNA进行多态性扩增,PCR产物采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,采用银染法显色。根据电泳结果得到"0,1"矩阵,利用POPGENE...
关键词：
生姜 SRAP 遗传多样性分析 起源
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
周鹏 林玮 朱芹 周祥斌 吴林瑛 陈晓阳
采用相关序列扩增多态性分子标记方法，对７个省份２３个种源的刨花润楠进行遗传多样性分析。结果表明：１）１２对引物组合共扩增出１５７条带，其中１１５条为多态性条带，占总条带数的７３．２４％；２）１２对引物的多态性指数介于０．４０６～０．５０２，平均值为０．４７６；３）通过分子方差分析发现，刨花润楠种源内差异占总差异的７２．１９％，种源间差异占总差异的２７．８１％，种源内差异为刨花润楠差异的主要来源；４）基于遗传距离的聚类分析显示，２３个种源的刨花润楠可分为４类：第１类为湖南、广东、广西的所有参试种源和江西多数种源，第２类为浙江参试的３个种源，第３类为江西婺源和安徽黄山２个种源，第４类为福建参试的４．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
房超 李跃建 帅波 刘独臣 刘小俊 梁根云 杨宏
应用SRAP分子标记技术对87份来茄子及其近缘野生种进行了遗传多样性分析。结果显示,从88对SRAP引物中筛选出18对多态性高、稳定性好的引物组合,共检测出309清晰个位点,平均每对引物检测到17.2个扩增位点。.参试茄属植物种质群体位点的平均杂合度为0.6962;平均多态信息含量为0.6441。82份栽培种茄子材料的平均相似系数为0.822,表明茄子栽培种的基因库较小,遗传基础较为狭窄。聚类分析结果表明,87份材料可分成4大类,可以较好地将茄子栽培种与其近缘野生种分开,并且基本可将高级栽培种(S.melongena L.subsp.melongena)和原始栽培种(S.melongena L...
[期刊] 林业科学
[作者]
廖柏勇 王芳 陈丽君 刘明骞 欧阳昆唏 阙青敏 惠文凯 李培 陈晓阳
【目的】利用相关序列扩增多态性（ＳＲＡＰ）分子标记对来自１７个省（区）的３１个苦楝种源进行遗传多样性分析，为苦楝种质资源的保存和育种计划的制订提供依据。【方法】通过ＳＲＡＰ分子标记获得１／０数据矩阵，计算ＳＲＡＰ分子标记各项遗传参数，同时进行分子方差分析（ＡＭＯＶＡ）。随后计算遗传距离矩阵并进行主坐标分析（ＰＣＯ Ａ）、邻接法聚类分析（ＮｅｉｇｈｂＯｕＲ－ＪＯｉＮｉＮｇ）以及遗传距离和地理距离ＭＡＮｔｅｌ相关性分析。【结果】从７８３对ＳＲＡＰ引物中筛选出的２０对引物可扩增出２５７条清晰的条带，其中１４５条具有多态性。引物多态性信息指数（ＰｉＣ）为０．２６２～０．４７８，均值为０．３８５。ＰｉＣ．．．
关键词：
苦楝 SRAP 遗传多样性 亲缘关系
[期刊] 华北农学报
[作者]
史红丽 韩明玉 赵彩平
采用相关序列扩增多态性(SRAP)和简单序列重复多态性(SSR)分子标记,对47份桃(Prunus persica)品种的遗传多样性进行了分析。选用带型清晰的19对SRAP引物和5对SSR引物对47份桃品种的基因组DNA进行扩增,共检测到82个多态性位点。平均每对引物组合产生3.4个多态性位点。应用NTSYS-PC(Version 2.1)软件采用平均距离法(UPGMA)进行聚类分析。结果表明,47份桃品种的相关系数为0.501~0.842,从总体来看,所选取的47个桃品种相关系数相对较低,遗传多样性比较丰富。对聚类结果分析显示,大部分具有亲缘关系的品种及形态学、生物学特征相近的品种聚在一类,...
关键词：
桃 SRAP SSR 遗传多样性
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
蒋开彬 祝文娟 潘文 何紫迪 朱报著 Nguyen Duy Kien 黄少伟
【目的】在我国野生土沉香被大量被采伐,种质资源越来越少,甚至面临消失的情况下,为了利用与保护野生土沉香提供理论依据,采用SRAP分子标记对其种源遗传多样性进行分析。【方法】基于我国11个土沉香种源群体和越南2个土沉香种源群体的SRAP结果,应用POPGEN32软件对遗传多样性参数进行计算。【结果】各群体Nei’s基因多样度指数的变化范围为0.171 5～0.539 4,Shannon多样性指数的变化范围为0.249 1～0.483 7,多态位点百分比的变化范围为42.03%～76.81%。运用GenAlex 6.4软件对土沉香13个群体进行分子方差分析(Analysis of molecular variance, AMOVA),结果显示有30%的遗传变异来自土沉香群体间,70%的遗传变异来自土沉香群体内。【结论】13个土沉香种源有中度的遗传多样性和遗传分化,野生土沉香种质资源正日渐稀少,应该加强资源的保护与利用。
[期刊] 林业科学
[作者]
占明明 杨毅 程子彰 苏光灿 胡伟 陈华萍 黄乾明
【目的】油橄榄作为重要的油料经济作物,其健康价值越来越受到人们的重视,相关产业在我国已初具规模。引种品种混乱和遗传关系不明确影响了我国油橄榄事业的进一步发展,因此我国油橄榄品种的遗传变异有待评估。【方法】采用SRAP技术对32个来自四川西昌市的油橄榄品种进行遗传多样性分析,其中5个油橄榄品种为国内育种品种,27个油橄榄品种为国外引种品种。利用改良的CTAB法提取得到32个油橄榄品种的基因组DNA。【结果】25对SRAP引物共扩增出293条多态性条带,平均每对引物扩增出11.72条多态性条带,平均多态性比率为90.75%;引物组合M5E5扩增出的多态性条带最多(37条);期望杂合度(He)为0....
关键词：
油橄榄 SRAP 遗传多样性
[期刊] 林业科学
[作者]
唐琴 曾秀丽 廖明安 潘光堂 扎西 龚君华 次仁卓嘎
应用SRAP标记对西藏特有植物大花黄牡丹的遗传多样性进行研究。用16对引物从5个自然居群79个单株中共检测到396个有效位点,其中多态性位点357个。在物种水平上,多态位点百分率(Ppl)为90.15%,Shannon表型多样性指数(Ηsp)平均为0.2521;居群水平上的Ppl为31.82%,Shannon表型多样性指数(Ho)为0.0694～0.3428,平均值(Ηpop)为0.1307。上述遗传参数表明,大花黄牡丹具有丰富的物种遗传多样性,5个居群中自然居群C的遗传多样性最高(Ppl=82.32%,Ho=0.3428)。据AMOVA分析结果,总的变异中有41.58%的变异存在于居群间,5...
[期刊] 林业科学
[作者]
黄勇
利用SRAP分子标记,从126对引物组合中筛选出11对引物,对小果油茶全分布区的19个居群514个样品进行遗传多样性分析。结果表明:11对引物组合总共扩增出226条谱带,平均每对引物组合扩增20.55条谱带,其中多态性条带为226,占条带总数的100%。19个居群的遗传距离为0.0216～0.1645,显示了较近的亲缘关系。UPGMA聚类结果表明,除了福建6个居群和江西3个以外,其余地理位置相近的居群未能聚在一起。多态性比率(PPB)、Nei’s基因多样度(H)及Shannon信息指数(I)变化幅度分别为84.96%～95.58%,0.3213～0.3887及0.4732～0.5676;从物种...
关键词：
小果油茶 SRAP标记 遗传多样性
[期刊] 西南农业学报
[作者]
安泽山 严兴初 党占海 李闻娟 郝荣楷 赵利 张建平
用19对SRAP引物对58份来自不同国家和地区的胡麻种质资源进行SRAP分子标记遗传多样性分析。结果显示19对引物共扩增出105条多态性位点,平均多态性含量(PIC)为0.47,具有较好的多态性。通过聚类分析发现国内外品种资源总体多态性不高,但国内资源比外引资源相对更具遗传多样性,且能够各自成簇,表明国内外资源之间存在遗传差异。这为研究者准确评估胡麻遗传资源,挖掘有价值的遗传组分,拓宽胡麻亲本的遗传差异以及加快胡麻育种的选择效率提供了理论依据。
关键词：
胡麻 SRAP 遗传多样性
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
温岚 喻春明 王延周 陈平 陈继康 谭龙涛 熊和平
为分析苎麻多胚苗的遗传多样性,以靖西青麻和中苎1号杂交收获F1代种子,从中筛选出21对双胚苗、3株三胚苗和1株单胚苗,用SRAP标记对这些材料及其亲本进行遗传分析。结果表明:筛选出的24个引物组合共扩增出159个稳定的多态性条带,平均每个组合6.8个;48份材料中成对遗传相似系数为0.360～0.876,在遗传相似系数0.51处可将全部材料划分为A、B、C、D四类群,在遗传相似系数0.586处,A类群又可以分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ3个亚群;多胚苗与亲本没有出现扩增条带完全一致的情况,本研究中苎麻多胚材料与无融合生殖无关。
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