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[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
薛磊 侯鑫 曾详健 陈晓雯 王军 王成辉
为探究中华绒螯蟹Kcna基因的结构、表达模式及生长发育中的分子功能，克隆了中华绒螯蟹Kcna（命名为Es-Kcna）基因的全长，并开展了生物信息学分析和时空表达模式研究；观察了干扰Kcna基因后中华绒螯蟹生长表型性状的变化；筛选了Es-Kcna基因的SNP标记并与种群地理分布、生长性状进行了关联分析。结果显示：Kcna基因位于中华绒螯蟹第46号染色体上，全长945 304 bp，含有9个外显子；其中，cDNA全长2 080 bp，开放阅读框1 584 bp，编码527个氨基酸；原子总量为8 433，分子结构式为C_(2719)H_(4210)N_(702)O_(787)S_(15)，预测蛋白等电点（pI）为5.23，相对分子量为59.81 kDa。系统进化树分析显示Es-Kcna基因与三疣梭子蟹Kcna基因的亲缘关系最近。荧光定量PCR结果显示Es-Kcna基因在蜕壳前期、蜕壳间期和蜕壳后期的肌肉、心脏、肠道等六种组织中均有表达，其中以肌肉组织中的表达丰度最高（P< 0.05）。与对照组相比，干扰Kcna基因的表达后，实验组蟹的体重、蜕壳增重率和第二步足长度显著降低（P< 0.05）；肌肉组织切片结果显示实验组步足肌肉肌纤维直径小于对照组（P> 0.05）。此外，在Es-Kcna基因的第8外显子上鉴定出1个SNP位点（A1 461G），该位点在辽河野生群体显著富集GG基因型，而在长江野生群体富集AA基因型。生长性状的关联分析表明，具有AA型个体的步足长度显著长于GG型个体（P< 0.05）。本研究为Kcna基因调控中华绒螯蟹生长的分子功能和遗传育种研究提供了研究基础，并为区分长江、辽河野生中华绒螯蟹提供重要参考。
[期刊] 水产学报
[作者]
姜鹏飞 侯鑫 王军 陈晓雯 王成辉
为研究B类Ⅰ型清道夫受体(SCARB1/SR-BI)在中华绒螯蟹代谢、生长以及免疫等生物学过程中的分子功能，实验对中华绒螯蟹Scarb1的克隆及时空表达进行了分析，观察了RNA干扰该基因后的相关组织结构和类胡萝卜素含量变化，筛选了该基因的SNP标记并与生长相关性状进行关联分析。结果显示，中华绒螯蟹的Scarb1由2个外显子和1个内含子组成，开放阅读框为2 415 bp，编码805个氨基酸；系统进化分析显示中华绒螯蟹与三疣梭子蟹的氨基酸同源性高达80.51%，具有较高的物种间保守性。该基因在不同蜕壳时期的肝胰腺、肠道、血淋巴细胞、心脏、鳃和肌肉组织中均有表达，但在肝胰腺、肠道和血淋巴细胞中的表达量相对较高。RNA干扰Scarb1后，组织切片观察发现肝胰腺的肝小管管腔模糊并产生了部分空泡化结构，肠道内膜的肌肉层和黏膜下层处出现显著空洞现象；肝胰腺的颜色由黄色变成灰白色，其中的类胡萝卜素含量显著下降。在该基因的第一外显子筛选到1个SNP位点(C432T)与蜕壳后体重和壳长增长率存在显著相关性。本研究结果为Scarb1在中华绒螯蟹的遗传研究和育种应用提供参考。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
彭娜 曾丹 王晓清 王佩 罗志嘉 李潇 周先文
采用四引物扩增受阻突变体系PCR法对中华鳖的2个SNP位点进行验证,并统计其基因型频率。采用方差分析法分析2个SNP位点与中华鳖6个生长性状(体质量、背甲长、背甲宽、腹甲长、体高和裙边宽度)的差异。结果显示,只有A–1609G位点上的体高和裙边宽度有显著差异;这2个SNP位点的不同基因型共组成6种双倍型(去掉频率小于3%的双倍型D1、D6和D9),ANOVA分析结果表明这6种双倍型的6个生长性状间均存在显著差异,D4双倍型6个生长性状的均值最大,属于生长优势双倍型。筛选到的IGF2基因上的2个SNP位点具
[期刊] 中国水产科学
[作者]
何杰 吴旭干 赵恒亮 姜晓东 葛永春 王幼鹏 成永旭
于２０１２年５月至２０１３年１１月，对池养中华绒螯蟹（ＥｒｉｏｃｈＥｉｒ ｓｉｎＥｎｓｉｓ）全程投喂配合饲料，观测扣蟹和成蟹阶段的生长规律、成活率、早熟率、性腺发育速度、产量、规格分布和饲料系数等。结果表明：（１）扣蟹阶段雌雄生长差异不显著（Ｐ＞０．０５），增重率（ＷＧ）和特定增长率（ｓＧｒ）为先上升后下降，整个扣蟹培育阶段的平均ｓＧｒ为１．９％／ｄ左右；平均成活率和早熟率分别为１０．０％和４．９％，雌体的早熟率显著高于雄体（Ｐ
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
刘德武 杜颖军 张豪 吴珍芳 张细权 杨关福
根据猪Leptin基因的已知序列设计引物(序列号:U66254、AF026976),PCR扩增产物用变性高效液相色谱技术(DHPLC)和直接测序法进行单核苷酸多态性(SNP)筛查,对其中的4个SNP位点(C3469T、C3952G、C4115T和C4227T)进行基因型与生长性状的关联分析。结果共获得35个多态位点,其中C4115T和C4227T位点在长蓝F2资源群中分别缺少1个基因型,且与各性状相关不显著;C3469T位点与猪的平均日增重存在极显著相关(P<0.01),TT型和CC型显著高于TC型;C3952G位点与猪的体长和眼肌面积等存在一定相关(P<0.1)。
[期刊] 淡水渔业
[作者]
刘金生 王军 岳武成 陈娇 黄姝 慈元吉 王成辉
为了解养殖水体ｐ Ｈ值对中华绒螯蟹（ＥｒｉｏｃＨＥｉｒ ｓｉｎＥｎｓｉｓ）蜕壳生长及其相关基因表达的影响，在试验室水槽条件下，设定ｐ Ｈ＝７、８、９、１０（均无水草）为实验组，以种植适量水草（ｐ Ｈ值为８．２～９．１）为对照组，研究中华绒螯蟹幼蟹（均重０．４３ ｇ±０．０９ ｇ）在不同ｐ Ｈ值水体中饲养一个蜕壳周期（３７ ｄ）的蜕壳生长及其相关基因（蜕皮抑制激素ＭｉＨ，蜕皮激素受体Ｅｃｒ，维甲类Ｘ受体ｒＸｒ，胰岛素样生长因子ｉｇＦ２）表达情况。结果显示，对照组河蟹的成活率和增重率均显著高于实验组，其中，ｐ Ｈ１０的河蟹成活率和增重率最低。荧光定量ｐｃｒ检测显示，ＭｉＨ、Ｅｃｒ和ｒＸｒ基因在不同．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
王晓梅 邢克智 戴伟 王茜 曹维维 李晓东
应用PCR-RFLP技术分析了长江、瓯江和辽河3个水系中华绒螯蟹的线粒体COⅠ的基因片段遗传多样性,应用11种限制性内切酶对COⅠ基因片段进行限制性片段长度多态分析,共检测出6种复合单倍型,其中瓯江群体检测出5种复合单倍型,长江和辽河均有2种复合单倍型。经数理统计分析,3个群体内线粒体DNA的核苷酸多样性指数分别为0.006 7(长江)、0.016 7(瓯江)和0.000 3(辽河),瓯江群体的遗传多态度最高,其次为长江群体,而辽河群体在3个群体中遗传多态度最低。结果说明,中华绒螯蟹具有一定群体内遗传多样性:瓯江群体>长江群体>辽河群体。在群体间,辽河与瓯江群体的净遗传距离最大为0.023 7...
[期刊] 水产学报
[作者]
王瑶 杨志刚 郭子好 姚琴琴 曾奇韬 杨筱珍 成永旭
根据陆地蟹RXR基因保守区序列设计上下游引物,采用逆转录聚合酶链反应(RTPCR)以及cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆中华绒螯蟹RXR基因并进行各组织间的表达分析。序列分析表明,中华绒螯蟹RXR cDNA全长1 517 bp,编码433个氨基酸。经BLASTn和BLASTx分析表明,中华绒螯蟹RXR基因的氨基酸序列与陆地蟹RXR基因的氨基酸序列相似性最高,为96%。系统进化树分析显示,中华绒螯蟹RXR的氨基酸序列与陆地蟹RXR聚为一支。荧光定量PCR结果显示,RXR在所有检测的组织中均有表达,且在中华绒螯蟹Y器官中表达量最高,肝胰腺、鳃和肌肉中少量表达,心脏、胃、肠、胸神经节和脑神经节...
[期刊] 水产学报
[作者]
王瑶 杨志刚 沈城 姚琴琴 曾奇韬 刘启彬 成永旭
为了研究蜕皮激素受体(EcR)在中华绒螯蟹蜕皮和性腺发育过程中的作用,本实验采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)以及cDNA末端快速扩增(RACE)技术,克隆了中华绒螯蟹EcR基因全长cDNA序列。运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法,分析该基因在不同组织、蜕皮过程及卵巢发育阶段的表达特征,并研究了甲基法尼酯(MF)对卵巢中EcR的调控作用。结果显示,中华绒螯蟹EcR cDNA全长2 156 bp,编码422个氨基酸,其序列与招潮蟹相似性最高,为89%。荧光定量PCR结果显示,EcR在Y器官中表达量最高;在卵巢和肌肉中少量表达;在肝胰腺、鳃、心脏、胃、肠、胸神经节和脑神经节中微量表达...
[期刊] 华北农学报
[作者]
宋姗姗 刘宗岳 丛波 刘琳玲 宋兴超 彭英华
为了研究胰岛素样生长因子1受体(IGF-1R)基因外显子2和外显子11的单核苷酸多态性,分析该基因变异与水貂生长性状的关联性,以红眼白水貂、金州黑水貂和咖啡水貂共计235个样本的血液基因组DNA为模板,采用PCR产物克隆和Sanger测序技术,筛查IGF-1R基因SNP位点,将差异位点与不同种群的水貂生长性状进行关联分析。结果表明,红眼白、金州黑水貂的外显子2和外显子11上检测到2个SNPs:c. 207G> A和c. 1782G> A;咖啡水貂在外显子2上检测到2个SNPs:c. 207G> A和c. 218T> A,在外显子11检测到1个SNPs:c. 1782G> A。c. 207G> A和c. 1782G> A都属于无义突变。c. 218T> A位点属于有义突变,氨基酸发生改变,脯氨酸变为精氨酸。关联分析表明:c. 207G> A与金州黑水貂和咖啡水貂体长性状显著相关(P A与咖啡水貂的体长和体质量显著相关(P A位点GG基因型是水貂体长的优势基因型;合并基因型GGGA和GGAA可能是影响金州黑水貂体长体质量的有利基因型,认为IGF-1R基因可能是影响水貂生长性状的候选基因。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
周建强 祁增源 韩银仓 刘秀 孙永刚
[目的]研究牦牛SMAD4基因SNPs与生长性状的关系,探寻与牦牛生长性状相关的分子标记。[方法]采用DNA测序和单倍型分型技术,对青海牦牛SMAD4基因进行SNPs检测及其基因分型、连锁不平衡和单倍型分析,并对多态位点的基因型及组合单倍型与牦牛生长性状的关联性进行分析。[结果]牦牛SMAD4基因在内含子区域存在6个突变位点,其中g.393A>G、g.555A>G、g.6525A>G和g.18360C>T均存在3种基因型,g.582A>T和g.6492C>T均存在2种基因型。连锁不平衡分析发现,6个位点间不存在强连锁不平衡效应。单倍型分析发现,在14种不同的单倍型中,单倍型H_1的发生频率最高。关联性分析表明,g.393A>G位点与体斜长、胸围和管围均显著相关(PG位点与体斜长显著相关(PT位点与体质量和体高均显著相关(PT位点与体高显著相关(PG位点与体质量显著相关(PT位点与胸围显著相关(P<0.05)。基因型组合发现,单倍型H_1H_(14)可能是影响牦牛生长性状的最优组合。[结论]牦牛SMAD4基因内含子区域上的6个位点与生长性状显著关联,可作为牦牛分子标记辅助选择的候选基因。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
李彦宏 胡深强 王杰 贾先波 赖松家
【目的】探究家兔血管生成素样蛋白4(angiopoietin-like protein 4,ANGPTL4)基因第6外显子内的多态性及其与家兔部分生长性状的关联性。【方法】采用PCR产物测序法检测家兔ANGPTL4基因外显子内的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并应用PCRRFLP酶切分型技术对3个家兔品种(天府黑兔、伊拉兔和新西兰兔)共495个群体样本进行酶切分型,分析SNPs与3个家兔品种部分生长性状的关联性。【结果】ANGPTL4基因第6外显子中共检测发现3个遗传变异位点(c.823 G>A为非同义突
[期刊] 西南农业学报
[作者]
陈美 钟金城 武志娟 王吉坤 柴志欣
【目的】本研究旨在探讨SMPX基因在麦洼牦牛中的遗传多态性,并筛选其SNP位点,分析突变位点不同基因型与其生长性状的相关性,为牦牛优良性状定向选育提供依据。【方法】以89头健康成年的麦洼牦牛为试验材料,采用DNA混合池技术辅以直接测序法筛选候选基因的SNPs,同时利用SPSS 19.0软件对不同基因型与牦牛生长性状进行关联分析。【结果】在麦洼牦牛SMPX基因的3个外显子区域未发现突变位点,在启动子区域共检测到2个SNPs,分别为G532A和C1481G,多态信息含量(PIC)均属中度多态(0.25
[期刊] 西南农业学报
[作者]
徐龙鑫 朱丽莉 张麟 刘镜 何光中
为研究阿片黑皮质素前体（ＰＯＭＣ）在动物采食和能量平衡中的作用，采用ＤＮＡ测序技术，对关岭黄牛９２头个体的ＰＯＭＣ基因的多态性进行研究，并分析多态位点与关岭黄牛生长性状的相关性。结果表明：在扩增片段为８７０ ｂＰ的产物中，发现位点１３８，４３０，６４４，６６８ Ｃ→Ｔ突变，位点６９３ Ａ→Ｇ突变。多态性结果显示，除４３０ Ｃ→Ｔ突变位点处于哈代－温伯格不平衡状态（ＨＷＥ）（Ｐ０．０５），５个突变位点的多肽信息含量（ＰＩＣ）均为中度多态。相关性分析结果表明，６４４ Ｃ→Ｔ和６６８ Ｃ→Ｔ突变位点的不同基因型与关岭黄牛体斜长表现出差异性显著。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李思发 蔡完其 邹曙明 李晨虹 赵金良 王成辉 陈桂娟
本文对江苏省阳澄湖产中华绒螯蟹的商业品质，按商业品级和雌、雄，测定了其各部分含量和各项营养成分。该湖所产河蟹符合江南水乡青背、白肚、金爪、黄毛的大闸蟹形态特征。肌肉、肝脏及性腺三大可食部分共占体重的 ３６． ７２％，壳、鳃、胃及心脏四大非可食部分共占体重的 ５３． ２６％。另有 １０． ０２％为血淋巴和组织液。一、二级商品蟹的雌蟹可食部分各高出雄蟹 ５． ２８％和 ６． ５５％，营养成分中，雌蟹的脂肪显著高于雄蟹。在实测的９项微量元素中，雄蟹有７项高于雌蟹，雌蟹仅有磷高于雄蟹；在实测的１７种氨基酸组成中，雄蟹有１３项高于雌蟹，尤其谷氨酸、脯氨酸及丙氨酸，分别高出１６．６Ｏ，２３．３％及２８．５...
关键词：
中华绒螯蟹 营养成分 品质分析 阳澄湖
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