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[期刊] 华北农学报
[作者]
秦艳梅 李向 赵建军 王彦华 轩淑欣
为了研究不结球白菜内部的群体结构,从全国搜集了78份广泛种植的蔬菜用不结球白菜品种,使用SSR标记对其进行多态性分析,并利用Structure 2.1软件统计分析标记数据划分群体结构。结果表明,初筛出的21对多态性SSR标记覆盖了白菜10个连锁群,在78份材料中扩增共产生了56个等位基因变异,平均每个SSR标记产生的等位基因数目为2.7个。Structure分析表明,所选的不结球白菜可分为4个亚类群,S1和S2亚类群主要集中了来自于南北方各省份的49份普通白菜,苗用大白菜主要分布在S3和S4亚类群,乌塌菜主要分布在S1和S4亚类群,菜心的遗传背景比较复杂;材料的类群划分与地理来源的关系在S2亚...
关键词：
不结球白菜 SSR 群体结构 遗传多样性
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
蒋芳玲 侯喜林 史公军 崔秀敏
运用RT-PCR和RACE技术从不结球白菜中克隆到1个抗寒相关基因,命名为BrCBF,基因登陆号为DQ402470。其cDNA全长1 003 bp,含有648 bp的完整开放阅读框,编码216个氨基酸,该基因编码的蛋白序列与拟南芥、荠菜、甘蓝型油菜编码的氨基酸序列有极高的同源性,且具有CBF典型的保守结构域AP2。
关键词：
不结球白菜 CBF基因 克隆
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
郑金双 张蜀宁 孙成振 王建军 侯喜林
以二倍体不结球白菜及其同源四倍体为材料,采用常规染色压片法进行核型分析。结果表明:二倍体不结球白菜核型公式为2n=2x=20=10m+8sm(2SAT)+2st,其中第1、2、3、4、6对为中着丝粒染色体,第5、7、8、9对为近中着丝粒染色体,第10对为近端着丝粒染色体,第5对染色体具有随体,核型类型属于2A型,为基本对称型;四倍体不结球白菜核型公式为2n=4x=20m+16sm(4SAT)+4st,核型特征与二倍体基本一致,仅染色体长度变异范围与二倍体相比略大。表明四倍体不结球白菜是由其二倍体加倍得到的,为同源四倍体。
关键词：
不结球白菜 二倍体 四倍体 核型分析
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
邓晓辉 张蜀宁 侯喜林 陈沁滨
对不结球白菜Pol胞质雄性不育系(CMS)及其保持系基因组DNA进行RAPD分析,共使用了386条随机引物,其中有346条引物在两系之间都得到了扩增产物,64条引物扩增结果在两系之间表现出了遗传多态性。在其不育系中获得了1条稳定扩增的片段OPAY1000,序列测定结果表明,OPAY序列全长为1 053 bp,在GenBank中的登录号为DQ320101。根据序列测定结果设计了1对特异引物,将OPAY1000转化为更稳定的SCAR标记。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
郝慧楠 王倩 侯喜林 张琳 荣子龙 徐卿
利用NJ089×NJ074构建不结球白菜双单倍体群体,应用主基因+多基因联合分离分析方法,研究了不结球白菜株高、开展度、最大叶长、最大叶宽、叶色、抽薹指数和冷害指数7个主要农艺性状的遗传效应。结果表明:7个性状均符合主基因+多基因遗传模型。其中,抽薹指数为3对主基因,其余均为两主基因+多基因遗传模型,主基因遗传率由大到小依次为叶色、开展度、叶宽、叶长、冷害指数和株高。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
刘唱 杨洋 俞静 李燕 刘海龙 张昌伟 侯喜林 李英
[目的]CC-NBS-LRR(卷曲螺旋-核苷酸结合位点-富含亮氨酸重复,CNL)是高度保守的植物抗病蛋白家族。本文旨在克隆和研究CNL基因在不结球白菜抗霜霉病中的作用。[方法]以‘苏州青’c DNA为模板克隆获得BcCNL基因全长,并进行生物信息学分析、实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测、亚细胞定位及病毒诱导基因沉默(VIGS)验证。[结果]BcCNL基因含有2 790 bp开放阅读框,编码929个氨基酸,蛋白质相对分子质量为226.7,等电点为2.7。系统进化树结果显示,不结球白菜BcCNL蛋白与野甘蓝的进化关系最近,含有RX-CC、NB-ARC和LRR-3结构域;亚细胞定位显示其定位于细胞膜上。霜霉菌侵染后,BcCNL基因在抗病品种‘苏州青’中的表达量高于感病品种‘矮脚黄’; BcCNL基因的沉默降低了‘苏州青’对霜霉病的抗性。[结论]BcCNL蛋白在进化过程中保守性较高,定位于细胞膜上,BcCNL基因的沉默降低了‘苏州青’对霜霉病的抗性。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
任海波 刘同坤 袁敬平 吴小婷 王惠玉 侯喜林
[目的]本文旨在分析不结球白菜BcICE1基因的表达模式并探索其在冷胁迫中的功能。[方法]以不结球白菜品种‘NHCC001’为材料,采用同源克隆的方法获得BcICE1基因的全长序列,并进行生物信息学分析;对‘NHCC001’进行4℃低温和PEG-6000模拟干旱处理,检测BcICE1基因对胁迫的响应;构建过表达载体pEarly Gate-BcICE1,利用注射法将载体农杆菌菌液导入烟草细胞进行BcICE1基因的瞬时表达并检测;构建酵母诱饵载体p GBKT7-BcICE1,转化AH109验证其转录激活活性;将pEarly Gate-BcICE1农杆菌菌液利用蘸花法进行BcICE1基因的遗传转化,并用RT-qPCR和Western blot对阳性苗进行鉴定。通过RT-qPCR对BcICE1过表达拟南芥中冷胁迫相关基因的表达水平进行分析。[结果]克隆获得不结球白菜BcICE1基因,其含有1 338 bp的开放阅读框,编码466个氨基酸,相对分子质量为47.40×103,等电点为5.42;氨基酸的多序列比对和系统进化树结果表明,BcICE1蛋白与欧洲油菜、荠菜和拟南芥ICE1蛋白同源关系较近。亚细胞定位表明BcICE1蛋白定位在细胞核中,具有转录激活性且对冷胁迫与干旱胁迫有响应。BcICE1过表达株系能增强植株的抗寒性,同时在低温处理后BcICE1过表达植株中冷胁迫相关基因At CBF3和COR15A的表达量显著高于野生型植株。[结论]克隆并获得BcICE1过表达拟南芥植株,功能分析表明BcICE1基因能增强植株抗寒性。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
文锴 王远 胡蝶 袁敬平 侯喜林 李英
[目的]12-氧-植物二烯酸还原酶(12-oxo-phytodienoic acid reductase,OPR)是茉莉酸生物合成途径的关键酶,催化12-氧-植物二烯(OPDA)还原反应生成茉莉酸化合物,广泛参与植物生长过程中的防御系统。本文旨在克隆和研究不结球白菜Bc OPR3基因,研究其对信号分子和非生物胁迫应答的影响。[方法]对不结球白菜OPR3基因进行克隆、生物信息分析、亚细胞定位,并对其在霜霉病菌、脱落酸(ABA)、茉莉酸(JA)、水杨酸(SA)、机械伤害、低温和热激胁迫下的表达水平进行了分析。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
耿建峰 侯喜林 张晓伟 成妍 李英 原玉香 蒋武生 韩永平 姚秋菊
以不结球白菜品种暑绿的112个双单倍体(double haploid,DH)株系构成的群体作为作图群体,利用SRAP、SSR、RAPD和ISSR 4种分子标记来构建不结球白菜分子遗传连锁图谱。通过Mapmaker 3.0/EXP软件分析,得到1张不结球白菜分子遗传图谱,图谱总长度1 116.9 cM,共包括14个连锁群,186个多态性分子标记,其中包括114个SRAP、33个SSR、24个RAPD和15个ISSR标记,其中偏分离标记44个,占23.7%。每条连锁群上的标记数在4-27个之间,连锁群的长度在30.3-165.8 cM的范围内,平均图距在3.4-11.1 cM之间,总平均距离6.0...
关键词：
不结球白菜 DH群体 分子标记 遗传图谱
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
王建营 侯喜林 张玉明 张正光 郑小波
报道不结球白菜对炭疽病 (Colletotrichumhigginsianum) 抗性的苗期鉴定方法和抗病品种 (株系 )的筛选结果。在 2片真叶期 ,以 1× 10 6个·mL-1孢子浓度喷雾接种 ,2 5℃、RH >10 0 %保湿 2 4h ,2 5℃光照培育 7d ,可快速地将不同抗性的品种 (株系 )鉴别出来。用该方法所获得的品种 (株系 )抗性鉴定结果与田间苗期 (5片真叶期 )和成株期抗性鉴定结果基本一致。将该方法与田间抗性鉴定相结合 ,从 2 6个品种 (株系 )中筛选出 4个高抗材料 ,可供生产上使用或作为抗病育种的抗源材料
关键词：
不结球白菜 炭疽病 抗性鉴定
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
侯喜林 曹寿椿 张蜀宁 张增翠 王建军 孙红霞
通过分子标记辅助选择技术获得矮脚黄自交不亲和系,以其为母本,苏州青自交系为父本,选育出优质、抗病的新品种暑绿。其特点为:(1)优质:叶片与叶柄质量比为0.67,高于对照品种;维生素C含量211.4～219.0mg·kg-1,干物质6.18～6.64g·100g-1(鲜重),可溶性蛋白质0.39～0.41g·100g-1(鲜重),可溶性糖19.95～21.41g·100g-1(干重),均优于对照;粗纤维7.52～8.04g·100g-1(干重),低于对照。(2)抗病:对炭疽病、TuMV、霜霉病和黑斑病进行人工接种鉴定,病情指数分别为5.98(HR)、17.20(R)、16.06(R)和13.96...
关键词：
不结球白菜 优质 杂种
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
蒋芳玲 侯喜林 史公军 崔秀敏
利用RT-PCR和5′/3′RACE方法,从不结球白菜冷诱导12 h的根中,克隆到1个冷适应相关基因BrLOS2,Gen-Bank登录号DQ334724,其cDNA全长1 666 bp,含有1 335 bp的完整开放阅读框,编码444个氨基酸。BrLOS2基因与芜菁、甘蓝型油菜、拟南芥等物种的烯醇酶基因有80%以上的同源性,有1个烯醇酶N端结构域、1个烯醇酶结构域和保守的DNA结合域。二级结构及三维结构分析表明,BrLOS2具有许多其他LOS家族的共同特性。
关键词：
不结球白菜 LOS基因 cDNA 克隆
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
张爱芬 王立 侯喜林 刘同坤 李英
以不结球白菜自交不亲和系03的基因组DNA和柱头cDNA为模板,利用引物SRKF/SRKR扩增获得长度为964 bp和646 bp的SRK基因片段。序列比较分析表明,克隆的基因片段属于SRK基因的激酶域,该序列包含4个外显子和3个内含子,编码215个氨基酸,与芜菁、甘蓝、芥蓝等SRK基因有90%以上的相似性。荧光定量PCR分析结果表明:自交不亲和系03和自交亲和系105不同组织中SRK基因的表达水平存在显著的差异,SRK基因主要在自交不亲和系的柱头中高度表达,自交亲和系中该基因的表达主要分布于叶片、花蕾和柱头组织中。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘秀云 李慧 刘志国 赵锦 刘孟军
【目的】枣原产中国，种质资源丰富。对来自中国２２个省区不同用途的２５５个枣品种进行ＳＳＲ分析，揭示这些不同产地来源的枣种质资源之间的亲缘关系和群体遗传结构，为枣种质资源的科学管理和分子标记辅助育种提供参考。【方法】利用改良ＣＴＡＢ提取供试枣种质的基因组ＤＮＡ，以前期枣基因组测序挖掘出的ＳＳＲ引物为基础，进行高效率引物筛选，并利用ＳＳＲ分子标记技术对２５５份枣种质资源的基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增，然后利用８％聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，银染后显色。根据条带有无统计数据，计算出多态性位点百分率（ＰＩＣ），用ＮＴＳＹＳ软件进行ＵＰＧＭＡ聚类分析；利用ＳＴＲＵＣＴＵＲｅ软件分析群体遗传结构，计算出最适群体．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
卢俊浩 张婷 张鹏 木万福 杨龙 张建华 黄晓蓉 寸婕 管俊娇
【目的】为了解花菜类种质的遗传基础，分析种质群体的亲缘关系，为花菜育种提供参考。【方法】选用22对SSR引物，利用毛细管电泳荧光检测技术对96份花菜类种质材料进行遗传多样性分析，根据Nei’s遗传距离和非加权配对法（UPGMA）进行聚类分析以及以Structure软件的混合模型聚类法推断材料构成群体的遗传结构。【结果】22对引物在96份材料中共扩增出91个等位位点，平均每对引物为4.136个。从22对引物中筛选出了10对条带清晰、稳定性好的多态性引物，可用于花菜类作物种质资源的鉴定和研究。根据花球性状，将材料分为青花菜（24份）以及花椰菜（72份）2个组群，经多态性分析，2个组群的观察等位基因数值（Na）分别为2.727和3.091；有效等位基因数（Ne）分别为1.910和1.841；Shannon′s 指数（I）分别为0.675和0.667，说明这2个组群的遗传多样性均不够丰富。聚类分析也将96份材料分为2个组群，第Ⅰ组为24份青花菜材料，包括1份西兰苔杂交种和23份青花菜杂交种；第Ⅱ组为72份花椰菜材料，包括29份花椰菜自交系、36份花椰菜杂交种和7份花椰菜主栽品种。花椰菜自交系被分到了4个亚群，但在各亚群中材料之间的遗传距离较小，杂交组配时，选用不同亚群的自交系进行组配，以获得更大的杂交优势。群体结构分析中，当K=2时△K出现明显的峰值，最大值为1658.48，为最佳群体组群数，与聚类分析结果基本一致。且96份材料的Q值均大于0.6，说明该花菜资源的遗传结构较为单一。【结论】所参试材料种质群体内遗传多样性不够丰富，遗传背景单一，亟需重视对遗传背景差异大、亲缘关系远的种质资源的发掘利用，加强种质材料共享和交流，促进花菜种业发展。
关键词：
花菜 SSR标记 遗传多样性 群体结构
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