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[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
高浩然 滕守连 罗玉秀
[目的]鉴别不同花色甘蓝型油菜花瓣花青素合成相关差异表达基因(DEGs),为油菜花色形成机理研究奠定基础。[方法]以甘蓝型红花油菜与黄花油菜杂交和回交获得的B_1C_1群体为材料,分别用Na(NO_2)_2-Al(NO_3)_3-NaOH显色法和pH示差法测定红花和黄花总黄酮和总花青素含量。取7月份油菜初花期花瓣,分别构建黄花和红花cDNA文库,利用高通量测序技术获得其转录组数据,筛选DEGs,随后利用生物信息学方法对DEGs进行GO和KEGG分析;用MapMan注释和鉴别出花瓣花青素合成相关基因;并用qRT-PCR技术进行验证。[结果]甘蓝型黄花油菜花瓣中的总黄酮和总花青素含量明显低于红花油菜。经转录组分析,从黄花油菜和红花油菜初花期花瓣中共获得2 824个DEGs,其中红花油菜花瓣中多数基因负调控表达。KEGG富集分析显示,2 368个DEGs显著富集到124个KEGG代谢通路,其中代谢途径的差异基因最多(461个),次生代谢的生物合成差异基因次之(266个);GO富集分析显示,2 824个DEGs注释到分子功能、细胞组分和生物过程3种功能类型,其中生物过程中的细胞过程、代谢过程、刺激反应和生物调节的DEGs分别有1 546,1 198,983和704个基因。MapMan分析结果显示,花青素生物合成途径差异表达的结构基因有34个,其中7个上调表达,27个下调表达,表达倍数均达极显著水平。相关转录因子鉴定结果显示,参与花青素合成的转录因子有56个,其中MYB家族转录因子34个,bHLH家族转录因子22个,未找到WD40。对鉴定出的花青素合成相关的5个基因(3个结构基因和2个转录因子)进行qRT-PCR验证,结果与转录组分析结果一致。[结论]甘蓝型油菜花瓣的黄色与红色是由其内总黄酮和总花青素含量不同所致;甘蓝型油菜黄色花瓣和红色花瓣中鉴别出的差异表达结构基因和转录因子是导致不同花色花瓣总黄酮和总花青素含量差异的关键基因;甘蓝型红花油菜的花青素合成途径中仅有MYB和bHLH转录因子发挥作用。
[期刊] 华北农学报
[作者]
郎丽娜 赵娜 马兵 刘亚萍 田正书 刘璐 卢虹 刘霞 王阳 徐爱遐 黄镇
为明确甘蓝型油菜花叶性状的遗传特点，开发与花叶性状连锁的分子标记。以甘蓝型油菜品系２２０５（圆叶）、１４２３（花叶）为亲本，构建了３个世代群体：Ｆ１、ＢＣ１和Ｆ２，探讨花叶性状的遗传规律；利用分子标记技术对花叶基因进行定位。结果表明，Ｆ１植株叶形表现为花叶，ＢＣ１（Ｆ１×２２０５）和Ｆ２中花叶与圆叶的植株分离比分别符合１∶１和３∶１，说明甘蓝型油菜的花叶性状受１对不完全显性基因控制。利用集团分离法（ＢＳＡ）筛选６３７对ＳＳＲ引物，共筛选到了３个与花叶基因紧密连锁的ＳＳＲ标记：ＣＢ１００７９、ＢＮＧＭＳ１１４和ＢＮＧＭＳ３８５。连锁分析发现，这３个连锁标记均位于花叶基因的一侧，其中ＢＮＧＭＳ１１．．．
关键词：
甘蓝型油菜 花叶 遗传 SSR
[期刊] 华北农学报
[作者]
张秋平 文李 张振乾 王峰 官春云
为了研究甘蓝型油菜与菌核病病原核盘菌互作的分子机制,挖掘分别与甘蓝型油菜抗、感病相关的基因,以高抗菌核病品种湘油15(Xiangyou 15)及其感病的近等基因系98C40NL为材料,利用转录组测序技术(RNA-Seq)对2个品种盛花期叶片接种核盘菌前及接种后12,24 h差异表达基因进行了分析,并采用实时荧光定量PCR技术对部分基因表达进行验证。测序得到34.16 G Clean bases,6个样本中共鉴定出78 582个基因。相对于高感品种,湘油15在3个时间点共有1 296个基因下调表达,1 495个基因上调表达; 54个基因在3个时间点都表现显著差异,其中18个基因在3个时间点都下调,27个基因在3个时间点都上调。差异基因主要富集在氧化还原、植物激素信号转导、钙信号通路、苯丙烷类代谢、次生代谢产物合成等途径。通过荧光定量PCR验证,BnaA03g09060D、BnaA01g26640D、BnaA03g09090D、BnaA04g12120D、BnaA01g26920D 5个基因在高抗品种的表达显著高于高感品种,可能与寄主植物防御核盘菌的侵染有关;BnaA06g10010D、BnaA09g16180D、BnaAnng19580D、BnaC01g40400D、和BnaC06g05340D 5个基因则在高感品种中表达显著高于高抗品种,可能与核盘菌感病受体相关。研究结果为解析油菜与核盘菌互作机理及挖掘菌核病抗性和受体基因提供参考依据。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
田志涛 赵永国 LENKA Havlickova HE Zhesi REA L Harper IAN Bancroft 邹锡玲 张学昆 陆光远
【目的】探索甘蓝型油菜不同发育时期种子和角果皮硫苷含量的动态变化规律,通过转录组关联分析解析控制硫苷含量变异的遗传机制。【方法】在由113个油菜品种构成的自然群体中,利用高效液相色谱法检测不同发育时期油菜种子及角果皮中的硫苷含量。提取油菜幼嫩叶片m RNA并进行m RNA-Seq测序,开发了355 536个单核苷酸多态性标记(SNP)和116 098个基因表达量标记(GEM)。将开发的SNPs和GEMs分别导入到混合线性模型(MLM)和回归分析模型中进行关联分析,获得与油菜硫苷表型变异显著相关的遗传位点,
[期刊] 中国农业科学
[作者]
郑本川 张锦芳 李浩杰 柴靓 崔成 蒋俊 蒲晓斌 牛应泽 蒋梁材
【目的】研究开花调控转录因子CONSTANS(CO)同源基因在甘蓝型油菜中的表达特征。【方法】以早熟甘蓝型油菜品系D626-6和晚熟甘蓝型油菜品系D125-5为材料,依据甘蓝型油菜CONSTANS同源基因Bn1CON19设计特异性引物扩增CO基因全长编码区,并根据获得的cDNA序列设计实时荧光定量特异性引物,采用SYBR GreenI染料法进行实时荧光定量PCR研究CO基因表达差异。【结果】在整个生育期内,早熟和晚熟甘蓝型油菜品系的CO基因以叶片中的表达量最高,花蕾和茎中表达量次之,且早晚表达量高于中午时分;在不同生育时期内,抽薹期表达量最大,且早熟甘蓝型油菜品系CO基因在叶片和花蕾中的表达明...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李培武 赵永国 张文 丁小霞 杨湄 汪雪芳 谢从华 傅廷栋
采用高效液相色谱法测定了中国499份甘蓝型油菜籽硫苷组份与含量,用统计学方法分析了不同硫苷含量水平下各硫苷组份标准差、变异系数及硫苷分量对总量的影响。结果表明,高硫苷、中硫苷甘蓝型油菜籽中主要组份是脂肪族2-羟基-3-丁烯基硫苷和3-丁烯基硫苷,其含量在2种类型中分别为60.33、31.42和30.38μmol·g-1、20.18μmol·g-1,比例为81.16%和73.92%;低硫苷甘蓝型油菜籽中主要组份是吲哚族4-羟基-3-吲哚甲基硫苷和芳香族苯乙基硫苷,含量为7.36μmol·g-1和4.38μmol·g-1,占硫苷总量的51.52%。2-羟基-3-丁烯基硫苷和3-丁烯基硫苷在高硫苷油...
关键词：
甘蓝型油菜 硫苷 组份 分析
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
陈聪 刘忠松
采用近红外方法,分析104份甘蓝型油菜种子中的芥酸、油酸与硫代葡萄糖苷含量;运用简化基因组技术(ddRADseq)对全部材料进行基因分型;结合性状与基因型的数据,利用Tassel混合线性模型进行全基因组关联分析。结果表明:芥酸含量与硫代葡萄糖苷呈极显著正相关,油酸含量与芥酸、硫代葡萄糖苷呈极显著负相关;群体结构分析将104份材料划分为4个亚群;通过全基因组关联分析发现,与芥酸、油酸含量显著关联的SNP标记主要分布在A08与C03染色体上,与硫代葡萄糖苷含量显著关联的标记分布在A05、A02与C09染色体上。
[期刊] 华北农学报
[作者]
张书芬 傅廷栋 李媛媛 朱家成 王建平 马朝芝
采用SRAP标记对甘蓝型油菜品种1141B、垦C1、32B和32C的多态性进行了分析。每对引物组合产生13~36对比较清晰的扩增带,20对引物组合共产生419条扩增带,平均每对引物组合产生20.95条。20对引物组合共产生多态性带116条,每对引物组合产生3~10条,平均5.8条。每对引物组合产生的多态性带的比例为18.75%~38.89%,平均为28.23%。用24对引物组合对组合1141B×垦C1构建的F2群体各单株多态性进行了分析,F2群体多态性标记75条,平均为3.12条。用卡平方测验检测F2群体各单株标记基因型频率是否偏离了期望比例1∶2∶1(共显性标记)和3∶1(显性标记)的分离规...
关键词：
甘蓝型油菜 多态性 SRAP标记
[期刊] 中国农业科学
[作者]
张书芬 傅廷栋 朱家成 王建平 文雁成 马朝芝
【目的】芥酸含量是油菜非常重要的品质性状,研究芥酸含量的遗传模式为低芥酸和高芥酸育种提供指导。【方法】应用多世代联合分析数量性状主基因和多基因混合遗传的统计方法,分析了甘蓝型油菜组合1141B×垦C1的5个世代——亲本P1,P2,F1,F2和F2﹕3家系材料芥酸含量的遗传效应。【结果】分离世代F2及F2﹕3家系芥酸含量次数分布均呈混合的正态分布,符合主基因+多基因的遗传特征;E-1模型为芥酸含量的最适合性模型,即芥酸含量遗传是由2对加-显-上位性主基因+加-显多基因控制的。2对主基因加性效应值da、db分别为-16.26和-2.83,表明亲本1141B中主基因位点上的等位基因降低芥酸含量,而亲...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
王文静 杨小川 丁永强 尹国英 马浩然 张洁 石小于 张鼎宇 李加纳 张洪博
【目的】研究甘蓝型油菜中茉莉素受体复合体核心成员CORONATINE INSENSITIVE 1(COI1)蛋白的基因表达特性及生理调控功能。【方法】利用基因组数据分析甘蓝型油菜及其亲本种白菜和甘蓝基因组的COI1构成情况;使用定量和半定量RT-PCR扩增方法检测油菜COI1的组织特异性表达;克隆油菜COI1保守区片段,构建病毒诱导的基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)载体,以农杆菌侵染方法培育VIGS诱导COI1沉默的油菜植株,然后,用鉴定出的COI1沉默植株研究油菜COI1在育性调控及虫害抗性等方面的调控功能。【结果】基因组数据分析表明,甘蓝型油菜...
[期刊] 华北农学报
[作者]
赵娜 郎丽娜 卢虹 刘璐 刘亚萍 刘霞 田正书 王阳 黄镇 徐爱遐
低温是影响油菜生产和产量最重要的非生物逆境胁迫因子。为了阐明油菜抗寒性的遗传基础并定位相关的数量性状位点，利用甘蓝型油菜强抗寒ＧＺ恢和弱抗寒１０Ｂ杂交获得的１４７个Ｆ＿２单株为定位群体、以双亲及Ｆ２∶３家系为辅助研究材料，利用ＳＳＲ分子标记结合生理学指标及自然条件下抗寒性调查对抗寒基因ＱＴＬ进行初步定位。结果表明：６３０对ＳＳＲ引物中有１６０对在双亲间具有多态性，多态率２５．４０％；１６０对多态性引物中有１０２对在Ｆ＿２群体中有多态性，多态率６３．７５％，１０２对多态性引物共检测出多态性位点２２９个。１０２个ＳＳＲ标记构建连锁图，图谱总长９７４．７０ ｃ Ｍ，平均距离为５．７０ ｃ Ｍ。在自然．．．
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
杨光圣 傅廷栋
甘蓝型油菜天然孤雄生殖现象的初步研究杨光圣，傅廷栋（华中农业大学农学系，武汉４３００７０）关键词甘蓝型油菜,孤雄生殖,遗传中图法分类号Ｓ５６５．４０３．５１ＳＰＯＮＴＡＮＥＯＵＳＡＮＤＲＯＧＥＮＥＳＩＳＩＮＢＲＡＳＳＩＣＡＮＡＰＵＳＬ．￥ＹａｎｇＧｕａ...
关键词：
甘蓝型油菜,孤雄生殖,遗传
[期刊] 华北农学报
[作者]
丁云花 Holger Budahn 简元才 Herbert Peterka
应用RAPD与dpRAPD方法鉴定萝卜-甘蓝型油菜中萝卜基因组,筛选了140条随机引物。结果表明,平均每条引物(组合)能产生的萝卜基因组特异标记数dpRAPD高于RAPD,分别为1.69和1.33;在dpRAPD扩增产物中有77.6％谱带清晰易辨,略高于RAPD(75.4％)。两者所检测到的萝卜基因组标记大部分为各自特异的扩增产物。由于结合了荧光标记引物,dpRAPD反应产物可在Genetic Analyzer上分离检测,因此能检测到100 bp以下的小片段DNA。
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
徐芳森 王运华 李建春
采用土培方法，研究了２个甘蓝型油菜硼低效品种和４个甘蓝型油菜硼高效品种对缺硼反应的差异。结果表明：高效品种叶色浅、生育期短、抽苔早，低效品种叶色深、生育期长、抽苔晚，生育期和抽苔日数与硼效率系数间的相关性达到极显著水平，可作为早期筛选甘蓝型油菜不同品种硼效率高低的参考指标；在轻度缺硼条件下，低效品种苗期长势较弱，硼含量较高，经济系数小，而高效品种长势较好，经济系数大；轻度缺硼时，不同硼效率品种茎中硼的相对含量均高于硼正常水平，其中，高效品种又比低效品种高，有利于硼的运转和再利用，提高硼的利用效率；缺硼对低效品种株高、单株总果数、千粒重影响大，而高效品种受影响较小；不同硼效率品种的生育进程不受硼...
关键词：
甘蓝型油菜 硼效率 缺硼反应 遗传差异
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
段海燕 王运华 徐芳森 刘慧
采用两步筛选法 (即苗期干物质筛选和全生育期产量筛选 )在酸性黄棕壤上对 194个甘蓝型油菜品种进行了磷效率的筛选。本研究以磷效率系数来反映品种间的差异 ,将其定义为缺磷和加磷条件下的干物质量及产量等指标的比值 (-P/ +P) ,在苗期筛选时 ,设置两个处理 (-P :0 .0 10g/kg ,+P :0 .10 0g/kg ,以纯养分计 ,下同 ) ,32d后收获 ,根据干物质量得到苗期磷效率系数 ,其变幅在 0 .0 5 0～ 0 .6 15之间 ,呈正态分布。根据苗期长势长相从其中选出 12个具有代表性的品种进入全生育期筛选 ,设置两个处理 (-P :0 .0 2 0g/kg ,+P ...
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甘蓝型油菜 品种 磷效率
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