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[期刊] 淡水渔业
[作者]
刘军 赵良杰 刘其根 张宏
为了解银鯝（Ｘｅｎｏｃｙｐｒｉｓ ａｒｇｅｎｔｅａ）的遗传资源状况，利用线粒体ｃｏｉ基因序列比较分析长江、钱塘江和黑龙江水系中银鲴群体的遗传多样性和种群分化情况。结果显示，在１１０条５２８ ｂｐ的ｃｏｉ序列中，碱基ｔ、ｃ、ａ、ｇ的平均含量分布为２７．１３％、１８．５６％、２８．７０％、２５．６１％，检测出变异位点１５个。多样性分析显示，各地理种群单倍型多样性均较高，核苷酸多样性均较低，长江群体单倍型多样性（０．７４２±０．０５３～０．９１１±０．０３３）高于黑龙江（０．７３１±０．０８７）和钱塘江（０．５５２±０．１３７）群体，推测与不同地理群体所处生境多样性有关。单倍型网络结构显示出明显的地．．．
[期刊] 淡水渔业
[作者]
乔德亮 何晓梅 韦传宝 杨露 胡利
应用线粒体COⅡ基因序列分析了细鳞斜颌鲴(Plagiognathops microlepis)三个群体(梁子湖群体、龙窝湖群体和淮河群体)的遗传变异关系。结果显示:测序得到细鳞斜颌鲴线粒体COⅡ基因大小为681 bp,A+T含量(56%左右)明显高于G+C含量。三个群体18个个体共测出5种单倍型,42个核苷酸变异位点,多态位点百分率为6.17%。梁子湖群体含4种单倍型、6个变异位点,核苷酸多样性指数为0.004036,核苷酸多样性较丰富;龙窝湖群体和淮河群体各自只有1种单倍型,无变异位点。梁子湖-龙窝湖、淮河-梁子湖、淮河-龙窝湖群体间的遗传距离分别是0.002707、0.058901和0.0...
[期刊] 华北农学报
[作者]
胡鹏飞 李晓东 戴伟 王茜 王晓梅
对中国大陆6水系10个地区中华绒鳌蟹和合浦绒螯蟹自然群体及1个俄罗斯地区日本绒鳌蟹群体中共289个个体的线粒体细胞色素氧化酶亚基I进行了RFLP分析。选用8种能识别4碱基的限制性内切酶AluI,DpnII,HaeIII,MspI,MseI,RsaI,TaqI和TasI及3种能识别6碱基的限制性内切酶ApaI,NdeI和VspI对该基因片段酶切后,在11个群体中共检测到15种复合单倍型,其中复合单倍型1为除合浦绒鳌蟹以外的群体所共有,并均以该复合单倍型为主(46.4%~96.7%),复合单倍型4在合浦绒鳌蟹群体中占有很大比例(91.7%);合浦绒螯蟹与中华绒螯蟹北方水系(黄河、海河、辽河)的遗传...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
梁宏伟 孟彦 罗相忠 李忠 邹桂伟
为研究我国主要养殖区域黄鳝(Monopterus albus)的遗传多样性,利用线粒体细胞色素c氧化酶亚基I(cytochrome C oxidase subunit I,COI)基因对来源于湖北、江西、安徽、湖南、重庆和山东的6个黄鳝群体共187个样本进行遗传多样性分析。结果表明长度为646 bp的COI基因序列在6个群体的碱基含量基本相同,碱基T、C、A和G的平均含量分别为27.7%,30.7%,24.5%和17.1%,包括61个变异位点,其中单位点突变16个,简约信息位点45个,变异位点以C/T间的转换为主。6个群体中共检测到38种单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.886,核苷酸多样性(π)为0.01094,群体整体遗传多样性高,湖北和山东群体遗传多样性都较高(Hd>0.8),湖南群体和江西群体的遗传多样性次之(Hd>0.5),而安徽和重庆两个群体的遗传多样性都较低(Hd<0.5)。6个群体间有显著的遗传分化,基因交流贫乏(Nm<1)。群体分子变异分析(AMOVA)显示,6个黄鳝地理种群群体内的遗传变异高于群体间的遗传变异,其遗传变异主要发生在群体内部。遗传结构和系统发育树显示湖南群体与其他5个群体的遗传关系较远。重庆群体可能由单一或很少几个群体进化而来的,起源比较单一。就目前而言,黄鳝野生种质资源遗传多样性丰富,苗种频繁流动和人工养殖尚未对其种群结构造成较大影响,仍有较强的环境适应能力和良好的育种潜力。
[期刊] 淡水渔业
[作者]
谢佳燕 颜渊 杨钰慧 林少卿
采用线粒体COI基因序列对长江流域湖北段和江苏段蒙古鲌(Chanodichthys mongolicus)不同自然群体的遗传组成和结构进行了分析。结果显示,蒙古鲌种群的遗传多样性水平中等,群体的平均基因多态性为0.664,核苷酸多态性为0.002,不同种群间遗传多样性存在一定的差异。COI基因序列共检测了10种单倍型,其中4种单倍型在蒙古鲌不同种群间共享,其余单倍型为单个种群所特有。分子变异分析表明79.7%的变异发生在种群内。NJ聚类树和单倍型网络图分析均表明蒙古鲌不同种群未形成明显的谱系地理结构。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
葛家春 许志强 李晓晖 李跃华 柏如发 朱清顺 潘建林
研究了长江、辽河、瓯江水系野生中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)及其莱茵河水系F1共4个群体71个个体的线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)基因序列,比对长度包括628个位点,其中变异位点112个,简约信息位点36个。基因序列G+C(%)含量较低,表现出较为明显的碱基组成偏倚性。71个个体共含17种单倍型,单倍型H13出现次数最多,为莱茵河水系F1、长江以及瓯江群体共享;单倍型H15、H16和H17为瓯江群体特有。样本总体遗传多样性指数较高,其单倍型多样性指数(H)为0.862,核苷酸多样性指数(π)为0.016 9。各水系野生群体遗传多样性分析表明,长江群体单倍型多样性指数最...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
唐首杰 李思发 蔡完其
通过对线粒体DNA控制区和CO I基因序列的联合分析,研究了团头鲂(Megalobrama amblycephala)3类遗传生态群体(包含4个野生群体、2个驯养群体、1个选育良种"浦江1号"群体)的遗传多样性和遗传分化情况。结果表明:(1)在所分析的7个群体中,共确定了64种单倍型,群体间无共享单倍型。(2)4个野生群体内线粒体DNA的单倍型多样度(Hd)在0.857～0.943之间,核苷酸变异位点数在31～40之间,核苷酸多样性指数(π)在0.275%～0.461%之间,平均核苷酸差异数(K)的范围为4.043～6.800;2个驯养群体的相应参数变化范围分别为0.714～0.800、18～...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
冯梦霞 汤永涛 刘如垚 闫雪朦 胡博 聂国兴 周传江
日本沼虾(Macrobrachium nipponense)是一种经济价值较高的淡水虾类,广泛分布于我国各淡水水体,其在河南境内各水系均有分布。随着水产养殖业的发展、水域生态环境的变化及人为因素的影响,日本沼虾的种质资源也逐渐受到影响。为评估河南境内水系日本沼虾的种质资源现状及其遗传多样性,本研究利用线粒体COI基因对河南境内18个地理群体135尾日本沼虾开展种群遗传学研究,样品覆盖河南境内的长江、黄河、淮河和海河4个水系。结果显示,河南境内日本沼虾18个地理群体共包含27个单倍型,群体平均单倍型多样性(Hd)为0.78574,平均核苷酸多样性(π)为0.01059,其中淮河水系日本沼虾群体平均遗传多样性最低,长江水系日本沼虾群体平均遗传多样性最高,且各水系群体均显示出高Hd低π的特点。AMOVA分析显示,日本沼虾遗传变异主要来源于日本沼虾群体内(66.03%),群体间遗传变异为40.22%。系统发育树和单倍型网络均未显示出明显的水系分化。中性检验、错配分布及贝叶斯天际线分析表明,日本沼虾群体近期没有发生种群扩张,群体相对稳定。本研究可为河南境内日本沼虾种质资源的保护和合理开发利用提供参考。
[期刊] 淡水渔业
[作者]
杨天燕 孟玮 马燕武 蔡林钢 郭焱
采用线粒体COI和Cyt b基因序列分析相结合的方法,对伊犁河和塔里木河水系6个斑重唇鱼(Diptychus maculates)群体遗传差异和分化水平进行了比较研究。AMOVA分析结果显示,斑重唇鱼群体间遗传差异显著大于群体内,群体平均遗传分化指数ΦST分别为0.980 2(COI)和0.886 3(Cyt b),除伊犁河水系两群体差异不显著外(P>0.05),其他两两群体间遗传差异均显著。基于Kimura双参数法计算群体间平均遗传距离发现,不仅两水系间群体存在差异,塔里木河水系内部群体也产生了较大的遗传分化。单倍型网络图和系统关系树显示库玛拉克河群体存在两组不同单倍型类群,分别与伊犁河和塔...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
蔡凤环 赵惠燕
以8个不同地区的麦长管蚜(Macrosiphumavenae)种群为虫源,每种群10个个体用6种随机引物进行RAPD分析。结果表明,引物在8个种群间共产生272个RAPD标记,种群内的相似度比种群间的高得多。利用Nei氏相似系数,对8个种群的RAPD-PCR结果进行分析可知,北京与山东试虫采集地种群遗传距离为0.0239,在8个地区中最小,山西试虫采集地种群与其他7个地区差异最大,这说明不同地区的麦长管蚜(M.ave-nae)种群的确存在着遗传变异。用UPGMA法构建的聚类图发现,麦长管蚜聚成3个群体:山东和北京群体,安徽、四川和陕西群体,新疆群体,呈梯度分布,单纯以地理隔离不能解释麦长管蚜...
关键词：
麦长管蚜 RAPD分析 种群遗传变异
[期刊] 中国水产科学
[作者]
赵明 宋炜 马春艳 张凤英 蒋科技 宋志明 马凌波
利用线粒体CO I序列为遗传标记分析了棘头梅童鱼(Collichthys lucidus Richardson)7个地理群体(江苏连云港、江苏大丰、上海崇明、浙江舟山、浙江温州、福建宁德和福建厦门)的遗传结构特征。在7个群体209个样本的线粒体CO I序列中共检测到44种单倍型。7个群体单倍型多样性为(0.416±0.112)~(0.720±0.076),核苷酸多样性为(0.001 10±0.000 35)~(0.004 44±0.001 64)。两个组群的AMOVA分析显示,南北两个组群分析组群间的变异为40.10%(P0.05),群体内为60...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
朱丹丽 王晓清 曾志南 秦溱 熊钢 曾丹 严璐琪
采用ＰＣＲ产物直接测序法对来自福建东山、广东湛江和广西北海的３个群体方斑东风螺（ＢａＢｙｌｏｎｉａ ａＲｅｏｌａｔａ）的Ｃｏｉ基因进行比较分析。结果表明：Ｃｏｉ基因片段长度为６８０ ＢＰ，碱基组成显示ａ＋ｔ比例较高，约为６２．４２％；种群间多态位点数为３２，单倍型多样性指数为０．７０７±０．０９２，核苷酸多态性指数为０．００１ ８５±０．０００ ３９，平均核苷酸差异数为１．２５２。以泥东风螺（ＢａＢｙｌｏｎｉａ ｌｕｔｏｓａ）和织纹螺（ｎａｓｓａＲｉｕｓ）为外群，构建了ｎＪ系统发育树，其拓扑结构显示，３个群体的方斑东风螺首先聚类到一起，然后与泥东风螺聚为一支，与织纹螺形成不同的分支。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
马朋 刘萍 李健 李吉涛 陈萍
采用PCR扩增技术对脊尾白虾的莱州湾、海洲湾、象山湾的3个野生群体共计62个个体的线粒体COI基因片段进行扩增和测序,获得长度为658bp核苷酸序列。62条序列T、C、A、G和A+T的平均含量分别为31.53%、22.63%、27.30%、18.53%和58.83%,A+T含量显著高于G+C含量,这一结果与甲壳类、双壳贝类等的COI线粒体基因片段中的观察结果相似。通过统计变异位点、核苷酸多样性指数和平均核苷酸差异数进行基因序列变异分析。AMOVA分析表明,3群体间总遗传分化系数Fst=0.3611(P<0.01),群体间存在较高的遗传分化,其中象山湾群体与莱州湾群体之间的遗传分化系数最高,莱州...
[期刊] 上海水产大学学报
[作者]
杨学明 郭亚芬 蒋钦杨 陈福艳 梁万文 蒋和生
运用PCR方法,扩增罗氏沼虾缅甸原种F1代、广西选育群体和江苏养殖群体的线粒体DNA上的细胞色素氧化酶(Cytochrome oxidase subunit I,COI)基因,在此基础上选用10种限制性内切酶对扩增产物进行限制性片段长度多态(RFLP)分析。三个群体共发现2个多态位点,11种酶切图谱,3种基因型。三群体的多态座位比例、平均杂合度和基因型多样性指数分别为:缅甸原种F122.2%、0.0556、0.0472,广西选育群体22.2%、0.0400、0.0398,江苏养殖群体11.1%、0.0106和0.0083,群体间遗传差异未见显著。根据群体间遗传距离构建UPGMA聚类关系图,显示...
[期刊] 水产学报
[作者]
吴宙 周丽青 迟长凤 吴彪 孙秀俊 刘志鸿 赵丹 于涛 郑言鑫
为探讨近三十年来我国皱纹盘鲍养殖模式对群体遗传结构产生的影响，利用线粒体细胞色素C氧化酶亚基（COI）基因和细胞色素b（Cytb）基因分析了定植漳州的群体、大连培育蓬莱越冬群体、荣成培育福建越冬群体及长山列岛（砣矶岛、大钦岛、南隍城岛）皱纹盘鲍群体的遗传多样性与群体遗传结构。结果显示，在259个个体730bp的COI序列片段中检测到48个变异位点和30个单倍型，6个群体的单倍型多样性为0.586-0.897，核苷酸多样性为0.0056-0.0081；259个个体730bp的Cytb序列片段中检测到59个变异位点和32个单倍型，6个群体的单倍型多样性为0.605-0.909，核苷酸多样性为0.0077-0.0120。基于COI和Cytb基因的群体间Fst值以及AMOVA结果表明，绝大部分群体之间存在显著的遗传分化，并且遗传变异主要来源于群体内。现行的皱纹盘鲍北鲍南养模式加强了不同群体之间的基因交流，使不同遗传背景的种群二次接触导致了皱纹盘鲍6个群体均具有较高的单倍型多样性和核苷酸多样性；而各养殖群体中的不同选育条件则可能是造成显著遗传分化的重要原因。本文对分属南北沿海的6个皱纹盘鲍群体的遗传评估将为我国皱纹盘鲍资源的合理利用以及养殖模式对遗传结构的影响提供科学依据。
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