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[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
杨坤梅 杨璧嘉 胡梦露 任书娴 李宗艳
[目的]探究西南牡丹品种群与不同种源牡丹品种的亲缘关系,为其栽培起源研究提供基础资料。[方法]以50个中原牡丹品种、20个西南牡丹品种、18个西北牡丹品种、6个国外牡丹品种、1个江南牡丹品种和2个野生种共计9 6份不同地理种源牡丹为材料,利用36个目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism,SCoT)引物进行PCR扩增,筛选多态性比率好的条带,利用NTSYS-pc软件计算品种间的遗传相似性系数,在此基础上,采用UPGMA聚类分析个体间的亲缘关系。[结果]多态性好的引物共有18个,用其对96个牡丹样本进行扩增,共获得182条扩增条带,其中多态性条带172个,多态性比率为94.50%;96个样本间的遗传相似性系数在0.5523~0.868 1,品种间遗传差异较大,其中遗传相似性系数最大的是西北牡丹品种2与品种3,而紫斑牡丹与豆绿和中甸紫2的遗传相似性系数最小。在遗传相似性系数为0.693 1时,96个牡丹样本聚为8支,第1支由15个中原牡丹品种、4个西南牡丹品种和1个江南品种组成;第2支由2个西南牡丹品种丽江紫3和昭通粉1组成;第3支由35个中原传统牡丹品种聚成;第4支包括3个日本品种、1个法国品种和14个西南品种;第5支由17个紫斑牡丹杂交品种聚成;第6支仅有紫斑牡丹1个样本;第7支仅有黄牡丹1个样本;第8支由美国品种海黄和法国品种金晃聚成。[结论]西南牡丹品种与日本牡丹关系最近,与中原牡丹也有着近缘关系,而与其他种源的品种群关系较远。产地对西南牡丹品种的亲缘关系影响较大。
关键词:
牡丹 遗传多样性 SCoT标记 亲缘关系
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
侯小改 尹伟伦 李嘉珏 王华芳
利用荧光标记AFLP技术,采用8对M+3和P+3引物组合对4个牡丹野生种和26个矮化及高大品种间的亲缘关系进行了分析.共获得1 133条可统计的条带,其中948条呈多态性,多态性带百分率达84%,揭示了牡丹组植物丰富的遗传多样性.聚类结果表明:在受试的4个牡丹野生种中,与栽培牡丹亲缘关系从近到远依次为:杨山牡丹、矮牡丹、紫斑牡丹和卵叶牡丹;矮牡丹和卵叶牡丹有较近的亲缘关系.牡丹品种间的聚类结果表明,部分矮化品种、高大品种分别相聚,而一些矮化与高大品种也相聚.不同相似系数的遗传聚类划分与株高间并没有完全一致的关系,但在其他性状相差不大时,株高相近的品种间亲缘关系相对较近.
关键词:
牡丹 AFLP 亲缘关系
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘殿林 杨瑞环 哈玉洁 陈德富 陈喜文 夏立新
用RAPD技术对黄瓜基因组DNA进行多态性研究,分析了39份黄瓜材料的遗传差异。结果表明,所采用的172条随机引物中,有49条引物扩增谱带清晰且重复性较好,扩增总片段数达378个,单个引物的扩增片段数在4-12之间,片段大小在0.2-3.5 kb之间。不同材料间的遗传距离(D)在0.064-0.592之间,并根据遗传距离,按UWPGA法进行了聚类分析。
关键词:
黄瓜 RAPD 遗传多样性 聚类分析
[期刊] 林业科学
[作者]
阿地力·沙塔尔 张伟 程晓甜 朱银飞 骆有庆 陈梦
枣实蝇是一种高度危险性外来有害生物。对吐鲁番市、KSS、HSX和HMS4个不同地区采集的枣实蝇mtDNACOI基因片段测序,并进行序列比较和系统发育分析。结果表明:采自吐鲁番市、HSX、HMS的枣实蝇遗传距离最近,为0.002,其相似性高达99.8%。吐鲁番市枣实蝇和HMS枣实蝇分别与KSS枣实蝇的遗传距离最远,为0.062,其相似性为94.1%。对以上几个地点采集的枣实蝇基因序列与已公开报道的外群蔷薇咔实蝇Carpomya schineriR248FJ571365.1、蔷薇咔实蝇Carpomya schineriR141FJ571364.1、樱桃绕实蝇Rhagoletis cerasiGQ1...
关键词:
枣实蝇 COI基因 PCR 线粒体DNA
[期刊] 海洋渔业
[作者]
王超 陈爱华 曹奕 吴杨平 张雨 姚国兴 蔡永祥
为探究中国辽东半岛海域(辽宁群体)、长江口及其两翼海域(江苏群体)、台湾海峡西部海域(福建群体)、珠江口及其两翼海域(广东群体)、北部湾海域(广西群体)以及日本伊势湾海域(三重群体)6个不同海域文蛤(Meretrix Meretrix)地理群体的亲缘关系,采用18S rrNA基因、线粒体细胞色素氧化酶c亚基Ⅰ(cOⅠ)及16S rrNA基因3种分子标记进行序列测定与分析。测序结果显示,3种基因序列长度分别在1 854、658、596 bp左右;18S rrNA基因碱基组成无偏异,序列较为保守;cOⅠ与16S rrNA基因A+t平均含量明显大于G+c含量,符合线粒体基因组成特征。通过MeG Al...
[期刊] 林业科学
[作者]
孟丽 郑国生
利用RAPD技术对芍药属牡丹组的 11个野生牡丹类群和 12个栽培牡丹品种间的亲缘关系进行了研究。筛选出的 17个单引物和 1个组合引物共扩增出 191条谱带 ,其中 15 3条表现多态性 (占 80 1% ) ,揭示了牡丹组植物丰富的遗传多样性。对扩增结果进行UPGMA聚类分析表明 :革质花盘亚组的野生类群与栽培品种聚为一类 ,革质花盘亚组各野生种与栽培品种间的亲缘关系都比较近。 5个野生种与受试牡丹品种间的平均遗传距离值为 0 4 8~ 0 5 7,与栽培牡丹间亲缘关系从近到远依次为 :杨山牡丹、四川牡丹、卵叶牡丹、紫斑牡丹和矮牡丹。另外 ,本次RAPD试验扩增出的 2 5个特异标记...
关键词:
牡丹 亲缘关系 RAPD
[期刊] 中国农业科学
[作者]
唐裕杰 王刘豪 李凯 李继莲
【目的】探明熊蜂肠道寄生虫——短膜虫(Crithidia bombi)的流行规律以及不同蜂种、不同地区间寄生的熊蜂短膜虫的亲缘关系。【方法】调查内蒙古、甘肃、青海、四川4个省(自治区)的25种1 007只熊蜂的短膜虫感染情况,对不同蜂种、不同地区间熊蜂短膜虫的感染率进行卡方检验(SPSS 22.0),并对熊蜂短膜虫的内转录间隔区ITS序列进行PCR扩增、克隆、测序。利用特异的ITS引物扩增待检测的熊蜂肠道总DNA,之后进行凝胶电泳检测,通过是否扩增出675 bp的熊蜂短膜虫ITS基因片段来判断待检测的蜂群是否感染了熊蜂短膜虫,再进一步测序,分析不同蜂种、不同地区寄生的熊蜂短膜虫之间的亲缘关系。【结果】在调查的所有样品中,有20种262只熊蜂被短膜虫感染,感染率为26.0%。感染率最高的两种熊蜂是白背熊蜂(Bombus festivus)和火红熊蜂(B. pyrosoma),而西伯熊蜂(B. sibiricus)的短膜虫感染率最低;青海省熊蜂的短膜虫感染率最高,而内蒙古熊蜂的短膜虫感染率最低;雄蜂的感染率极显著高于工蜂和蜂王。另外,除了甘肃省的黑尾熊蜂(B.melanurus)和猛熊蜂(B. difficillimus),四川省的疏熊蜂(B. remotus)、兴熊蜂(B. impetuosus)和弗里熊蜂(B. friseanus)所感染的短膜虫与其他短膜虫亲缘关系较远之外,其余大部分的熊蜂短膜虫的亲缘关系较近。【结论】熊蜂短膜虫对我国熊蜂的感染广泛,且不同蜂种、不同地理环境和不同级型间熊蜂短膜虫的感染率均有差别。熊蜂经过长期群体进化演变,不同地区形成相对固定的优势种类,因此各地区所捕捉到的熊蜂种类不同。对我国不同地区熊蜂短膜虫感染情况的统计分析侧重于样本量≥30的种类,这些种类是各地区的优势种类,另外一些熊蜂虽未能采集足够的样本,但根据已采集的样本量分析得出的感染率较高。熊蜂短膜虫存在寄主专一性,且对熊蜂宿主的感染具有适应性。我国部分地区熊蜂感染的短膜虫的亲缘关系总体来说较强,但也受到地理位置及其寄主熊蜂蜂种的影响。
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
张旻桓 姚奕平 黄宇 金晓玲 叶烨 邢文 雍玉冰 张雨朦 黄承前
【目的】揭示江南牡丹可能的起源,为江南牡丹种质资源的遗传背景明晰和种质创新利用提供依据。【方法】利用筛选的 14 对 SSR 引物对 47 份资源 376 份样品进行遗传多样性和亲缘关系分析。【结果】14 对引物共检测平均等位基因的变化区间为 1.500 ~ 2.786,总体的平均等位基因为 1.797,观测杂合度(H_o)变化区间为 0.371 ~ 0.786,期望杂合度(H_e)的变化区间为 0.250 ~ 0.510,平均值分别为 0.320 和 0.560,观测杂合度(H_o)的平均值大于期望杂合度(H_e)。固定指数(F)的变化区间为 -1.000 ~ 0.011,平均值为 -0.805。等位基因丰富度(A_r)的最大值为 2.79(‘香丹’),最小值为 1.5,平均值为 1.769,基本上为江南牡丹的传统品种。江南牡丹品种中来源于湖南牡丹的品种相对其他来源的品种具有较高的遗传多样性。江南牡丹大部分传统品种与卵叶牡丹显示了较近的关缘关系,其中‘四旋’‘玫红’‘轻罗’‘川红’有很近的遗传距离,整体来讲是一个较为独立的群体。‘凤丹’‘香丹’与杨山牡丹和紫斑牡丹显示了较近的亲缘关系。‘雪源红’和‘香玉’与大部分中原牡丹聚为一类,推测为早年引种至江南地区的中原牡丹品种。【结论】肉质花盘亚组可能没有参与江南栽培牡丹的起源,江南牡丹大部分传统品种有杨山牡丹、卵叶牡丹、紫斑牡丹、矮牡丹和四川牡丹的基因,这些种共同形成了江南牡丹品种群。
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
张丽娜 易军 本间香贵 高继平 张文忠
稻米是我国人民的主食,在口粮安全中占有重要地位,关系着人们的生活质量和健康水平。辽宁省地处高纬度冷凉地区,水稻成熟过程中昼夜温差较大,灌浆速度较快,病虫害较轻,有利于水稻优质、高产、稳产目标的实现。为了探究辽宁省稻米品质现状和地域特性,助力辽宁水稻种植结构调整,推进水稻供给侧结构性改革,试验于2014年和2015年在辽宁省东南部沿海平原稻区、辽东山地丘陵稻区、辽河平原稻区和辽西山地丘陵稻区采集生产上主栽品种的当季稻谷,研究各稻区主栽品种在当地栽培条件下的品质特性。结果表明:在外观品质上,沿海平原稻区垩白粒率和垩白度明显高于其他稻区,总体上有沿海平原稻区高于内陆平原或山地丘陵稻区的趋势;在营养品质上,沿海平原稻区水稻蛋白质含量明显高于其他稻区,而直链淀粉含量则明显低于其他稻区,但在食味值和米饭综合评分上,却没有明显的优势,在不同年份表现出一定的波动性;中部平原亚区米饭外观和口感明显低于东北部山地丘陵亚区。在稻谷的宽度、厚度、千粒重及糙米率、精米率和整精米率上,沿海平原稻区优势比较明显,谷粒明显偏大,千粒重和出米率较高。进一步对辽宁省种植的水稻品种品质进行主成分分析,发现3个影响稻米品质的主因子:精米外观因子、米饭食味和加工相结合因子及营养品质因子。3个主因子对稻米品质的累积贡献率为93.7%。沿海平原稻区稻米改良方向应该是降低垩白粒率和垩白度,适当减少氮肥施用量,降低蛋白质含量。内陆平原或山地丘陵稻区稻米改良方向应该是增加长宽比,加强灌浆结实期管理,增加籽粒饱满度,提高加工品质。
关键词:
辽宁省 水稻 品质 稻作区域 主成分分析
[期刊] 华北农学报
[作者]
王惠哲 李淑菊 孙霞 管炜
用AFLP分子标记对4种不同类型黄瓜种质资源进行了多态性分析。利用NTSYS软件分析遗传相似系数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图。从50对AFLP引物中筛选出24对多态性高、扩增稳定、重复性好的引物。结果表明:24对引物组合共产生1 367条扩增带,平均每对引物组合产生56.96条;共产生多态性位点297个,多态性比率为21.7%。28份材料两两间的遗传相似系数在0.841 3~0.994 9之间,聚类分析结果显示,28份材料被聚成7小组,各组内生态类型基本一致。其中,华北有刺类型黄瓜在DNA水平上的同源性极高,遗传变异度较小,多样性水平较低,不如其他3个类型黄瓜多样性丰富。试验结果表...
关键词:
黄瓜 AFLP 聚类分析 亲缘关系
[期刊] 中国水产科学
[作者]
张鹏 张源 王铁杆 严兴洪
利用SSR标记对9个坛紫菜(Porphyra haitanensis)品系(2个野生品系,2个优良品系,2个杂交品系,3个色素突变品系)的丝状体进行了亲缘关系分析。结果表明:从52对微卫星引物中筛选出7对引物,它们的反应稳定并且其PCR产物具有多态性。9个品系的平均有效等位基因数(Ne)为1.7166,平均期望杂合度(He)为0.4074,平均多态信息含量(PIC)为0.3308,Shannon多样性指数(I)为0.6239。用Nei氏法计算出这9个品系的遗传距离和遗传相似性系数,再用UPMGA和Neighbor-joining2种方法所获得的系统学关系图,其结果均基本上反映了各品系间的亲缘关...
[期刊] 图书情报知识
[作者]
楼雯 陈雨晨
[目的/意义]了解全球iSchools的师资流动特性,尤其是亲缘因素和地域因素的影响。[研究设计/方法]分析了56所iSchools的1123位教师的最高学历毕业院校和现任职院校的定向流动情况。[结论/发现]发现iSchools已形成规模,师资流动的频繁程度由北美地区到亚太地区再到欧洲地区逐渐减弱;从整体上看iSchools内部凝聚严重,对青年教师的选用既想避免亲缘因素的影响又想加入更多学科的力量;不同阶段的iSchools师资结构呈现出两极分化的现象。[创新/价值]从毕业最高院校就职到现任学校的就职流动视角,考察了全球不同地区iSchools之间和之内的师资流动情况。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
王明明 陈化榜 王建华 宋振巧 李圣波
【目的】探讨木瓜属品种的种源、亲缘关系以及遗传多样性,旨在为木瓜属品种的分类提供科学依据。【方法】利用22个SRAP(sequence-related amplified polymorphism)引物组合对27份品种和5份野生种进行聚类分析、主坐标分析及遗传多样性的评价。【结果】共检测到152个多态性位点,平均每个引物组合6.91个多态性位点,多态性位点百分数为73.08%。聚类分析显示,32份材料可划分为毛叶木瓜种系、西藏木瓜、皱皮木瓜种系、日本木瓜种系4个类群。西藏木瓜与毛叶木瓜种系聚为一支,亲缘关系密切;日本木瓜种系和皱皮木瓜种系聚为另一支,日本木瓜种系与毛叶木瓜种系亲缘关系最远,皱皮...
关键词:
木瓜属 品种 SRAP 遗传多样性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
徐曼 李厚华 郭亦博 赵冰 王亚杰 高艳
【目的】在分子水平上探究苹果属海棠野生种、栽培种及相近属植物之间的亲缘关系,为分类学研究、海棠育种提供参考。【方法】选用4对AFLP引物(M-CTC/E-AGC,M-CTA/E-ACG,M-CAT/E-ACT和MCAA/E-ACG),分析苹果属海棠9个野生种、8个栽培种以及4个山楂属植物和2个梨属植物的遗传多样性。【结果】(1)共扩增出条带114条,其中多态性条带108条,多态位点百分率达94.7%,供试材料表现出丰富的遗传多样性。(2)供试材料在相似系数为0.73时被分为3组,分别为苹果属组、山楂属组和梨属组,因此AFLP分子标记的方法可以将苹果属与梨属、山楂属完全区分开。(3)秦巴山区野生...
关键词:
海棠 AFLP 分子标记 亲缘关系 分类
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