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[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
李国宏 王伟 赵同海
以萧氏松茎象7个地理种群的基因组DNA为材料,对其进行随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,从80个引物中筛选出39个稳定性好、多态性高的引物。7个地理种群共扩增出489条扩增条带,每条引物平均可以得到12.5条扩增条带,其长度从250～2 000 bp不等,其中443条(90.6%)扩增条带为多态性条带,平均每条引物可得到11.4条多态性条带。通过公式计算多态性位点、遗传距离、及Nei's遗传距离,结果表明:萧氏松茎7个地理种群之间的遗传距离指数的变异范围为0.403 7～0.484 4,遗传相似性指数为0.515 6～0.596 3,平均遗传距离指数为0.444 1;其Shannon's信...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
易乐飞 刘楚吾 吕立强
约氏笛鲷 (Lutjanusjohni)样品 10尾 ,取自湛江近海自然种群。从 12 0个随机引物中筛选出 16个引物 ,采用RAPD技术对其进行分析。结果表明 ,16个引物共检测到 2 15个位点 ,其中多态位点比例 (P)为 78.6 0 % ,遗传相似系数 (S)为 0 .72 70 ,遗传距离 (D)为 0 .2 730 ,遗传多样性指数 (H)为 0 .2 0 85。目前湛江近海约氏笛鲷自然群体种质资源仍然维持在良好水平 ,捕捞尚未对其造成明显影响
关键词：
约氏笛鲷 自然群体 RAPD 遗传多样性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
宛涛 蔡萍 张辰波 伊卫东 李方祯 张洪波
【目的】阐明内蒙古冷蒿居群亲缘关系与地理分布的关系。【方法】采用居群遗传学方法及RAPD技术,对内蒙古不同生态地区具有代表性的14个冷蒿居群的遗传多样性进行了研究。【结果】11个引物对14个冷蒿居群总DNA共扩增出93条带,其中77条表现出多态性,多态性标记所占的比例为82.8%,冷蒿居群表现出丰富的RAPD多态性。构建的14个冷蒿居群的遗传关系聚类图显示,扎尼河冷蒿居群与扎兰屯冷蒿居群的遗传距离最小,其次为卓伦高勒冷蒿居群与蔡木山冷蒿居群,贺兰山和吉兰泰冷蒿居群与其他冷蒿居群间的遗传距离均较大。【结论】RAPD技术适用于冷蒿居群遗传多样性的分析,冷蒿居群的亲缘关系与其地理分布有着密切关系。
关键词：
冷蒿 RAPD 遗传多样性 内蒙古
[期刊] 西南农业学报
[作者]
陈德西 封传红 何忠全 向运佳 胡荣平
采用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术，研究了四川省甘孜州地区蝗虫的遗传结构。用筛选出的１２条随机引物对９个种群９１个个体进行扩增。结果表明，１２条引物共检测到９５个位点，其中多态位点共计７２个。ＳｈＡＮＮｏＮ信息指数（Ｉ）和ＮｅＩ＇Ｓ遗传多样性（ｈ）估计的９个种群的遗传多样性水平分别是０．４１６１和０．２８１０。利用ＮｅＩ＇Ｓ基因多样性指数进行群体内遗传多样性评价，ＳｈＡＮＮｏＮ多样性指数（Ｉ）具有相同的结果，来自四川甘孜雅县雅江（ＹＪＧＬ）种群值最高，为０．１６７４，白玉县金沙乡（ＢＹＪＳ）种群最低为０．０４０５；居群内基因多样度ｈＳ为０．０７７７，表明遗传变异主要存在于居群间。基因分化．．．
关键词：
蝗虫 种群 RAPD 遗传多样性
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
张鲜艳 陈发棣 张飞 陈素梅 房伟民
利用ISSR和SRAP分子标记对11份不同地理居群野生菊的遗传多样性进行了分析。结果发现:25个ISSR引物共扩增到203条扩增带,其中有187条呈多态性,多态性比率平均为91.9%;29对SRAP引物组合共扩增到446条扩增带,其中有435条呈多态性,多态性比率平均为97.5%;11个居群间的Ne′is遗传距离分布在0.088 7~0.615 5之间。聚类分析表明,紫花野菊、野路菊及其变种能很好地区分开来,但是野生菊资源的遗传变异与地理分布相关性似乎并不明显。
[期刊] 淡水渔业
[作者]
程慧涛 戴远棠 阮炘贺 李育森 李丽华 段旭琢 单金红 贾弦泽 徐斌 王庆 赵会宏
为了解国内广东省湛江市、广东省佛山市、广东省惠州市、广西自治区南宁市、浙江省湖州市5个地区红螯螯虾养殖群体的遗传结构，我们鉴定了红螯螯虾8个微卫星位点。利用8个微卫星标记对5个地区的红螯螯虾养殖群体进行了遗传分析，8对引物在150个样本个体中共检测出237个等位基因。所有8个微卫星的等位基因数范围为2～10,平均为6.05。H_o和H_e平均值分别为0.490和0.614。每组的等位基因数在6.000(广西南宁GXNN)到6.625(广东佛山GDFS)之间。所有群体中平均H_e在0.593(广东惠州GDHZ)到0.646(广东湛江GDZJ)之间。由此可以看出种群的遗传多样性并未显著降低。F_(is)、F_(st)值、分子方差分析(AMOVA)结果显示，这些红螯螯虾群体大部分的遗传变异来源于种群内部，并且各个群体都保持着较高水平的遗传距离，其中GDZJ和ZJHZ群体之间遗传距离最大(0.107 7)。推测导致这些差异的产生可能是随机遗传漂变和人工选择。
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
魏松红 宋宇 田永恒 王奕鸣 丁英
稻瘟病是制约水稻高产稳产的主要因素。为明确东北地区稻瘟病菌群体遗传多样性，以2021年分离自东北地区的96株稻瘟病菌为试材，利用简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)分子标记技术，对供试稻瘟病菌进行PCR检测，研究供试稻瘟病菌群体遗传结构、遗传多样性水平等。结果表明：16对SSR引物均能在100～500 bp内扩增出清晰条带。供试96株稻瘟病菌可划分为13个遗传宗谱，其中宗谱DQL02和DQL01为优势宗谱，分别包含37株和22株菌株，分别占总菌株数的38.54%和22.92%；宗谱DQL04、DQL06和DQL08为次要宗谱，分别包含9株、6株和6株菌株，分别占总菌株数的9.38%、6.25%和6.25%；其他8个宗谱为小宗谱，包含菌株数为1～4株。在群体水平上，东北地区稻瘟病菌群体间的遗传多样性水平比群体内的遗传多样性水平高，且存在于群体内的遗传变异占群体总遗传变异的83.37%。群体间平均Nei基因多样性指数变化范围为0.083 6～0.457 1，平均为0.204 1；平均多态百分率变化范围为6.25%～100%，平均为45.67%，说明有一定遗传多样性差异存在于东北地区稻瘟病菌群体中；聚类分析结果表明东北13个地区稻瘟病菌群体间的遗传距离为0.011 0～0.187 9，存在较大差异。按遗传距离远近可将东北13个地区稻瘟病菌群体划分为4个类群，第2类群全部由辽宁省种群组成；第3类群全部由吉林省种群组成，反映出东北地区稻瘟病菌群体遗传谱系与其地理分布有一定联系。研究结果可为了解东北地区稻瘟病菌群体遗传结构和群体演化提供理论基础。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
张鲜艳 张飞 陈发棣 郭慧敏 陈素梅
结合形态学性状和分子标记对12份不同地理居群野菊进行了遗传多样性研究。结果表明:不同地理居群野菊各形态性状存在不同程度的变异(14.06%～67.50%),叶柄长、叶长/叶柄长、花序径、舌状花长、舌状花宽和舌状花长/舌状花宽可能是造成野菊不同地理居群间表型差异的主要因素。25个ISSR引物共扩增到246条扩增带,其中229条呈多态性,多态性带比率平均为92.5%;29对SRAP引物组合共产生651条扩增带,其中638条呈多态性,多态性带比率平均为98.0%,从分子水平揭示了野菊丰富的遗传多样性。12个居群间的Nei's遗传距离分布在0.211 7～0.494 9之间;聚类分析表明,南京野菊和四...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
李义良 赵奋成 胡燕菲 蔡坚 吴惠姗 张应中 郭文冰
应用SRAP分子标记技术,对来自非洲的5个不同地理群体非洲桃花心木的遗传多样性和遗传分化进行了分析。结果表明:筛选出28对SRAP引物组合用于群体遗传分析,共扩增出条带77条,其中多态性条带59条,多态性水平为76.62%;5个群体遗传距离在0.036 1~0.131 7之间,总的Nei’s基因多样性指数为0.209 3,总的Shannon’s信息指数分别为0.330 0,遗传变异主要来自群体内个体间(70.04%),群体基因流(Nm)为1.1858。
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
刘坤 刘福利 王飞久 孙修涛 汪文俊 丁昌玲 梁洲瑞 马兴宇
应用RAPD技术,对自然分布于山东半岛莱州湾、小石岛、俚岛、楮岛和汇泉湾的5个大叶藻种群的遗传多样性和遗传结构进行了分析,并基于研究结果对山东半岛大叶藻种群保护和移植修复提出了建议。实验用10条RAPD引物共扩增出42条条带,多态条带39条,多态性位点比率为92.86%。研究结果表明山东半岛大叶藻种群具有较高的遗传多样性和较高的遗传分化;AMOVA分析显示5个种群99.68%的变异来源于种群内部,而0.32%的变异来源于种群间;Mantel测试表明5种群遗传距离与地理距离之间没有相关性;遗传多样性最低的是莱州湾种群,应该得到优先保护;遗传多样性较高的是俚岛种群和汇泉湾种群,可以作为山东半岛海草...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
季祥彪 王国鼎 乔光 康冀川 宋常美 文晓鹏
采用RAPD标记对贵州及周边分布的野生春兰遗传多样性进行分析。结果表明:筛选的48个引物共扩增了324条600~2000bp带,其中201条(62.0%)显示多态性,RAPD标记可以有效地用于春兰野生资源遗传多样性评价;原产于贵州不同居群间样品的遗传差异性较大,多态性百分率为36.8%(荔波样品)~69.8%(黎平样品),高于60%的样品占全部贵州样品的1/3,分布于全省5个地州市;聚类分析显示,样品的聚类具有很强的地域性,特别是贵州样品表现更为明显,来自川西的样品和黔北、黔东北的样品具有很高的同源性。
关键词：
春兰 野生资源 遗传多样性 RAPD
[期刊] 林业科学研究
[作者]
杨华 尹光天 甘四明 白嘉雨 李荣生 杨锦昌 陈和明
利用RAPD标记从DNA水平对收集的4个天然黄藤种群进行遗传多样性分析。15条引物扩增得到154条片段,整个种的多态性位点比率为75.97%,Ne i’s指数为0.258 4,Shannon信息指数为0.388 8。黄藤种的遗传多样性为0.257 8,种群间的Ne i遗传分化系数为0.141 2,各种群间的遗传变异非常小。4个种群间的遗传相似性分析结果显示:毛感乡和尖峰岭种群间的遗传相似度最高,吊罗山和坝王岭种群间的遗传相似度最低。AMOVA分析结果表明:种群间基因分化系数为0.026 2,大部分遗传变异(97.38%)来源于群体内。研究结果揭示:收集的天然黄藤种群具有较高的遗传多样性,有良好...
关键词：
黄藤 RAPD 遗传多样性 遗传分化
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
王庆恒 杜晓东 李康
采用12个随机引物对北海、三亚、厦门地区的光裸星虫进行RAPD分析,结果表明,光裸星虫北海、厦门、三亚种群平均多态位点比例分别为73·39%、84·20%和87·00%,平均遗传多样性指数分别为0·2450、0·2958和0·2670。北海种群和三亚种群遗传距离(Dbs)为0·1225;北海种群与厦门种群的遗传距离(Dbx)为0·2947;三亚种群与厦门种群的遗传距离(Dsx)为0·2193。在聚类分析树上,厦门种群最先从聚类树上分支出来。OPH-02-880和OPO-09-510为厦门种群的特征性片段,可作为种群鉴别的依据。
关键词：
光裸星虫 遗传多样性 RAPD
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
林碧英 林珲 陈莹莹
从200个随机引物中筛选出10个引物,对11份笋子芥材料进行RAPD分析,并对笋子芥遗传多样性和分类进行研究.结果表明:10个引物共扩增出93个位点,其中多态性谱带65条,多态性程度为69.9%;平均每个引物产生9.3条多态性谱带,每个引物可扩增出7-13条,谱带大小为100-2000 bp.聚类分析结果表明,遗传距离为0.38时,11份笋子芥可聚成四大类群.
关键词：
笋子芥 RAPD 遗传多样性 聚类分析
[期刊] 淡水渔业
[作者]
王朝明 邹桂伟 郑蓓蓓 罗相忠 潘光碧
从40个10bp随机引物中筛选出22个用于大口鲇、鲇及其杂交F1代三个群体多样性分析,共检测到217个位点,在群体之间和个体之间都存在差异。群体内的遗传相似度分别为0.986、0.878、0.961,群体内平均遗传变异是0.112;大口鲇与杂交F1代、鲇与杂交F1代、大口鲇与鲇群体间的遗传相似度为0.731、0.615、0.423,群体间的平均遗传变异为0.888。鲇群体的遗传变异度和多态位点比例均高于大口鲇、杂交F1代。UPGMA系统树清晰反映个体间和群体间的相互关系。
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