为了研究不同农地整治措施对土壤细菌的影响,通过高通量测序技术,对不同农地整治措施下土壤细菌多样性与种群结构进行对比分析。结果表明:(1)从细菌多样性来看,实施农地整治的样点土壤细菌多样性显著提高;(2)从细菌种群结构来看,实施田块归并、平整土地、筑造沟渠以及土壤培肥等措施有效提高了甲基暖菌属(Methylocaldum)、亚硝化单胞菌(Nitrosomonas)、脱硫线菌属(Desulfonema)等有益菌属的丰度;(3)通过与土壤环境因子的相关性分析,酸碱度、铜和铅含量是影响农地整治区土壤细菌多样性与结构的重要因素。该研究证实了农地整治对提高土壤细菌多样性和改善土壤质量的重要作用,也为农地整治工作的开展提供了科学依据。

【目的】砂铁矿区的核心问题是土壤环境的恶化，故修复砂铁矿时，要兼顾恢复植被、土壤及土壤环境的重要组成部分的土壤微生物。【方法】为明晰砂铁矿区最适宜的植被修复措施，本研究采用高通量测序技术，以准噶尔荒漠东北部青河县砂铁矿为研究对象，分析不同修复措施下土壤养分差异及土壤细菌多样性和群落结构特征，探讨最适宜砂铁矿区修复措施。【结果】不同处理下土壤养分含量有显著差异，其中D处理土壤有机质含量最高，> B> E> C> A；在土壤细菌门水平，放线菌门、变形菌门和绿弯菌门是其主要类群，相对丰度均超过75%，但细菌多样性及群落结构在处理间存在显著差异，均表现为D处理土壤细菌多样性最高，>E> C> A> B；冗余分析结果表明，土壤有机碳和土壤全钾主要影响D处理土壤细菌多样性及群落结构，土壤全氮主要影响B处理土壤细菌多样性及群落结构，土壤全磷主要影响E处理土壤细菌群落结构及多样性。【结论】综合得出半灌木+灌木+多年生草本+一年生草本混播(D)以及围栏封育(E)是最有效的砂铁矿区生态修复措施。为加快修复进程可以为D处理添加有机质和钾肥，E处理添加磷肥。

利用Ion S5~(TM) XL测序平台,通过未施肥(R1)、常规施肥(R2)和化肥减量(R4)等不同施肥方式对木薯华南205种植地土壤进行16S rRNA高通量测序分析,结果表明,在相似水平为97%下聚类分析得到的R1、R2、R4的OTUs数分别为1 003、989、864个;不同施肥方式下木薯根际土壤中优势菌门为酸杆菌门、绿弯菌门、变形菌门、放线菌门、厚壁菌门和拟杆菌门.化肥施用增加了绿弯菌门、变形菌门、放线菌门、厚壁菌门等的相对丰度,降低了酸杆菌门和拟杆菌门的相对丰度.施肥方式改变土壤细菌的多样性和丰度,其物种多样性表现为R1>R2>R4.基于土壤细菌群落的PCoA和聚类分析,R1和R2群落组成多样性较为相似,与R4不同.表明施肥方式不仅改变木薯根际土壤细菌的多样性与相对丰度,也在一定程度上改变了木薯根际土壤群落结构,尤其增加了木薯根际土壤有益细菌的数量,提高了木薯产量.

【目的】通过对华北地区一年两熟种植模式下冬小麦生长季不同施肥和灌溉处理下土壤细菌群落的研究,揭示长期不同施肥和灌溉制度下土壤细菌数量、多样性和群落结构的变化规律。为科学施肥和灌溉,提高农田地力和维持土壤微生物多样性等提供依据。【方法】依托中国农业大学吴桥实验站,选取长期施肥和灌溉定位试验的6个处理冬小麦收获后耕层土壤为研究对象,分别为化肥+不灌溉(CI0)、化肥+拔节期灌溉(CI1)、化肥+拔节期灌溉+灌浆期灌溉(CI2)、有机肥+不灌溉(MI0)、有机肥+拔节期灌溉(MI1)和有机肥+拔节期灌溉+灌浆期

【目的】本文研究了不同苎麻品种根际土壤细菌群落组成和多样性的变化。【方法】利用Illumina平台Miseq高通量测序技术结合相关生物信息学对深根型、中根型、浅根型苎麻根际土壤细菌进行高通量测序及分析。【结果】测序共获得230 664个OTUs,257 100条读数,平均读长420 bp。Venn图表明不同处理之间共有的细菌OTU数目为459个,深根型苎麻与中根型苎麻共有的细菌类群最多。深根型苎麻Chao指数显著高于浅根型苎麻13.86%,与中根型苎麻差异不显著。深根型苎麻Shannon指数显著高于中根型

【目的】根区土壤微生物是影响根系环境的重要因素，炭化苹果枝是废弃果树枝条低氧高温热解产物，研究施用炭化苹果枝对苹果根区土壤细菌和真菌的群落结构及其多样性的影响，为炭化苹果枝的合理应用以及改善果园土壤生物学性状提供理论依据。【方法】在春季，将长势一致的２年生‘富士’苹果幼树（砧木为平邑甜茶）移栽到含有不同质量比（０—４％）炭化苹果枝的盆栽土壤中，于移栽１２０ ｄ后采集土样，提取基因组ｄＮＡ，通过ＰＣＲ扩增建立文库，利用Ｍｉｓｅｑ平台ｉｌｌｕＭｉＮＡ第二代高通量测序技术并结合相关生物信息学分析土壤细菌１６ｓ Ｒ ＲＮＡ基因Ｖ３＋Ｖ４区域和真菌ｉＴｓ１区域的丰富度和多样性指数以及群落结构。【结果】从．．．

[目的]研究镉(Cd)污染对浙江省山区水库消落带湿地土壤细菌群落结构及多样性的影响，探求有利于Cd污染湿地土壤修复的耐Cd细菌菌落。[方法]采用Illumina Miseq高通量测序技术，分析Cd浓度分别为0、100和400 mg/kg时对消落带湿地建群种植物落羽杉根际土壤细菌群落结构和多样性指数的影响。[结果]研究区所有样品共有34门、96纲、202目、313科、502属土壤细菌。低浓度Cd污染时，消落带湿地植物落羽杉根际土壤细菌Chaol指数和Shannon指数与对照相比大幅升高，而高浓度Cd污染时，其Chaol指数和Shannon指数大幅下降。各处理特有的细菌OTUs也呈同样的趋势。不同程度Cd污染条件下，消落带湿地落羽杉根际土壤细菌群落结构在门和属水平上发生明显变化。随着Cd污染程度的加剧，消落带湿地土壤放线菌门和浮霉菌门相对丰度呈持续下降趋势，拟杆菌门和芽单胞菌门相对丰度呈持续升高趋势。土壤变形菌门和髌骨菌门相对丰度呈先下降后上升趋势，而土壤酸杆菌门、棒状杆菌门、疣微菌门、硝化螺旋菌门和厚壁菌门相对丰度呈先上升后下降趋势。变形菌门、拟杆菌门、髌骨菌门、芽单胞菌门在高浓度Cd污染下为湿地土壤细菌群落的主体。土壤罗思河小杆菌属相对丰度在低浓度Cd污染时呈下降趋势，而在高浓度Cd污染时呈升高趋势，土壤鞘氨醇单胞菌属的相对丰度在低浓度Cd污染时呈上升趋势，在高浓度Cd污染时呈下降趋势。土壤假节杆菌属、黏液杆菌属以及红假单胞菌属的相对丰度随着Cd浓度的增加一直呈下降趋势。土壤黄杆菌属的相对丰度随着Cd污染程度的加剧呈持续升高趋势。[结论]细菌罗思河小杆菌属、Gemmatimonadaceae-unclassified、马赛菌属、Candidate-Adlerbacteria-unclassified、Chitinophagaceae-unclassified、Alphaproteobacteria-unclassified、黄杆菌属、杜擀氏菌属可以被认为是消落带湿地土壤高抗Cd污染的细菌菌属。研究结果可为我国南方山地水库消落带湿地生态恢复采用微生物技术提供依据。

【目的】比较并探究根际土壤生物学性状及细菌多样性能否作为筛选具有促生效果作物组合的生物学指标,为筛选促生的间套种作物组合及对土壤连作障碍的生态防控提供理论依据和技术支撑。【方法】选取葫芦科、豆科及旋花科作物根际土壤作为研究对象,比较不同作物根际土壤生物学性状及细菌群落结构的差异。【结果】同为葫芦科的根际土壤中涉及土壤碳、氮和磷循环相关的酶活性之间无显著差异水平,缺乏互补性;而葫芦科作物与豆科的豇豆和旋花科的红薯根际土壤相应的酶活性之间均呈现显著的差异水平,表现出良好的互补效果;细菌多样性分析结果表明葫芦科

【目的】研究冀北山区不同植被恢复类型对根际土壤细菌群落结构特征和多样性影响,探索自然和人工恢复对土壤微生物的作用机制,为该区域植被恢复与管理提供理论依据。【方法】以自然恢复的灌草丛、灌木林、次生林以及人工恢复的人工林根面、根际和非根际土为研究对象,通过Illumina Miseq平台对细菌16S rRNA的V3—V4片段进行高通量测序,分析土壤细菌α、β和功能多样性、群落结构组成以及与环境因子的关系。【结果】1)各恢复类型细菌α多样性差异显著(P0.05),整体表现为根面和根际土高于非根际土。2)次生林和人工林土壤细菌群落结构有一定相似性;次生林与灌草丛、灌木林土壤细菌群落结构差异较大。根际土与非根际土细菌群落结构有一定相似性,根面土与根际、非根际土细菌结构差异较大。3)变形菌门、放线菌门、拟杆菌门、酸杆菌门、芽单胞菌门和厚壁菌门为优势类群。各样地有机质分解菌群(变形菌门、放线菌门和拟杆菌门)丰度差异显著,灌草丛和次生林显著高于其他样地,根面和根际土显著高于非根际土。固碳和固氮菌群(芽单胞菌门和厚壁菌门)分布较均匀。4)土壤田间持水量、有机质和全磷、植被分布均匀度、Simpson多样性指数和丰富度指数是影响土壤细菌群落的主要因素。土壤因子(田间持水量、有机质和全磷)对灌木林和灌草丛非根际土细菌影响极显著,对根面和根际土细菌作用较小;植被因子(植被分布均匀度、Simpson多样性指数和丰富度指数)对乔木林(次生林和人工林)不同根际范围土壤细菌群落影响均达到极显著水平。5)新陈代谢功能在KEGG上的编码基因数量最多,是土壤细菌的优势功能。各土样细菌群落KEGG功能基因序列数量和多样性差异显著,说明各植被恢复类型根际土壤中有许多具有各自独特功能的菌种,但土壤和植被不能决定土壤细菌功能多样性。【结论】恢复方式、植被类型和根系对冀北山区土壤细菌群落结构和多样性均有影响,其中恢复方式对土壤细菌多样性作用更明显,植被类型对土壤细菌群落结构影响更显著。距离根系越近,土壤细菌多样性越高,土壤细菌群落结构与非根际土差异越大。此外,环境因子如土壤养分、水分含量及植被分布状况等均与土壤细菌群落结构及多样性有关。

【目的】探究热带森林不同海拔下土壤细菌群落特征的分布模式及其环境驱动因素，为微生物生物地理学的理论研究提供数据支撑。【方法】以海南热带雨林国家公园吊罗山片区为研究区域，通过16S rDNA高通量测序技术分析土壤细菌群落组成、多样性及其功能沿海拔梯度的变化规律，并基于相关性分析来探究其环境驱动因素。【结果】土壤细菌群落多样性随海拔升高而单调下降。α-变形菌纲、γ-变形菌纲和放线菌纲以及黄色杆菌科是优势细菌类群，其相对丰度随海拔升高分别呈单调上升、先上升后下降、先下降后上升趋势。相关性分析表明，细菌群落组成与土壤pH、有机质、全钾、铵态氮、有效磷和有效钾存在显著相关性。PICRUSt功能预测表明，氨基酸运输和代谢、能源生产和转换、翻译/核糖体结构、生物转化以及细胞壁/膜/包膜生物合成等四大类COG功能以及glnA/ GLUL，gltD，cynT/can，gltB，ncd2/npd五种氮循环基因占据优势。nirK、arcC、cah、norB、nirS和nrfH 6种氮循环基因在中海拔的相对丰度显著较高，而GLU/gltS和nrtD/cynD在低海拔的相对丰度较高。【结论】土壤pH和全钾是驱动细菌群落特征沿海拔分布的关键因子，这为热带森林土壤微生物资源的科学保护与合理利用提供数据支撑和理论依据。

【目的】明确不同地膜覆盖对白及生长及根际土壤可培养细菌遗传多样性的影响，为生物质膜覆盖在白及种植上的应用提供理论支撑。【方法】采用大田试验种植白及，设置不覆膜（CK）、覆盖生物基质膜（BM）、覆盖塑料地膜（PM）3个处理，分别测定田间杂草去除率、白及农艺性状、白及根际土壤理化性质和根际土壤可培养细菌遗传多样性。【结果】覆膜处理（PM、BM）可有效抑制杂草生长，以BM抑制杂草效果最好，杂草去除率达99.74%。生物质膜覆盖可有效促进白及生长，与CK和PM相比，BM处理的白及叶片长宽比分别显著提高26.55%和22.03%，SPAD值显著增加21.68%和18.98%（P＜0.05）；BM处理可显著提高土壤肥力，土壤有机质、速效氮、速效磷、速效钾含量分别比CK处理上升26.58%、35.34%、49.80%、47.43%（P＜0.05）。本实验从CK、PM和BM处理土壤分别获得26、23和29株细菌，BOXA1R形成42个遗传群，代表菌株的16S rRNA基因系统发育分析表明，供试菌株分布于8个属，较好地揭示了菌株间的遗传多样性。同时，不同处理土壤优势类群也存在差异，CK处理的优势细菌为粘着剑菌，占比15.4%，BM为假蕈状芽孢杆菌，占比13.8%，PM为花椒芽孢杆菌，占比17.4%。单独从BM处理白及根际土壤分离得到枯草芽孢杆菌、暹罗芽孢杆菌等9个具有促生功能的细菌种群。【结论】生物质膜覆盖种植白及在去除杂草、促进白及生长、有效提升土壤养分方面表现出优良的效果，具有良好的应用前景。

[目的 ]探讨我国南亚热带地区不同树种人工林对土壤细菌群落多样性的影响,为该地区实施人工林生态系统适应性经营策略的树种选择提供土壤微生物生态学方面的科学依据。[方法 ]采用PCR-DGGE技术,比较分析位于广西凭祥市中国林业科学研究院热带林业实验中心的4个乡土树种(马尾松、红锥、米老排和火力楠)人工林和外来树种尾巨桉人工林土壤(0～20 cm)细菌群落的丰富度、多样性和均匀度,并探讨了土壤细菌群落多样性与土壤理化性质因子之间的相互关系。[结果 ]5种不同树种人工林土壤细菌群落多样性之间无显著差异(p> 0.05),其土壤细菌群落多样性与土壤全氮和全磷呈显著正相关(p

【目的】土壤细菌对土壤生态系统功能和健康维持起着重要作用。在了解核桃林土壤细菌群落随林龄的变化规律的基础上，结合土壤因子进一步探究土壤微生物群落与土壤理化性质及土壤酶活性之间的关系。阐明土壤微生物群落变化的驱动因素，为该地区核桃林的高效可持续经营管理提供科学依据。【方法】以不同种植年限（平均年龄8年、50年和100年以上）西藏核桃林为研究对象，基于高通量测序技术，研究不同树龄下土壤微生物组成及多样性的变化，并结合土壤理化因子进一步探究种植年限对土壤微生物群落的影响。【结果】（1）核桃种植年限没有显著影响细菌丰富度，但是古核桃林（100年以上）显著降低了细菌香农指数、优势度指数和均匀度指数。（2）变形菌门、酸杆菌门、厚壁菌门、芽单胞菌门、黏球菌门、放线菌门、拟杆菌门和绿弯菌门是土壤细菌优势菌门。不同树龄下部分微生物类群的相对丰度差异显著，随着种植年限的增长，土壤放线菌门的相对丰度增加，绿弯菌门的相对丰度降低，此外拟杆菌门的相对丰度呈现先增加后降低的趋势。（3）非度量多维尺度分析结果显示，不同种植年限核桃林土壤细菌群落组成之间存在显著差异。同时，冗余分析表明，土壤硝态氮含量对细菌群落组成影响显著。（4）相关性分析也显示土壤酶和土壤理化性质与微生物多样性以及优势菌门之间存在显著相关关系。【结论】核桃定植年限通过改变土壤理化性质和酶活性，改变了土壤微生物群落的多样性和群落结构，其中古核桃林细菌群落多样性显著降低，加剧了土壤微生态失衡。研究结果为明确不同龄林核桃林土壤微生物群落特征研究提供重要补充。在实际生产中除更新核桃树外，可合理使用无机和有机肥或者微生物菌肥，从而维护核桃林土壤生态系统的稳定。

【目的】为了解施用不同梯度氮磷钾推荐用量下对烟田土壤细菌群落的物种多样性的影响。【方法】从云南省澄江县烟区采集不同推荐施肥用量处理中的土壤样品，提取土壤总DNA并利用16S rRNA高通量测序技术及生物信息学分析法进行统计分析。【结果】在烟田中不同施肥处理条件下土壤细菌域有7个优势种群，依次为变形菌门(Proteobacteria)，酸杆菌门(Acidobacteria)，放线菌门(Actinobacteria)，拟杆菌门（Bacteroidetes），芽单胞菌门（Gemmatimonadetes），绿弯菌门(Chloroflexi)，厚壁菌门（Firmicutes），这些优势群落占所有有效序列的90%以上。相对于不同氮、钾梯度施用量，不同磷梯度的养分用量对烟田土壤细菌群落的多样性具有显著影响。在磷施用量为67.5 kg/hm~(2)处理条件下，土壤微生物3个α多样性指数最低即OUT=1494（P=0.067），Shannon=5.98（P=0.016)和Simpson=0.9891（P=0.043）。通过不同养分互作条件下优势种群变形菌门α多样性的比较发现，在N=90 kg/hm~(2)的处理中，磷钾不同养分梯度组合可显著改变土壤优势种群变形菌门的多样性，其中当磷的施用量为45 kg/hm~(2)，钾的施用量为405 kg/hm~(2)时，变形菌门的Shannon指数和Simpson指数最低，分别为4.640（P=0.049）和0.967（P=0.053），其中当磷的施用量为22.5 kg/hm~(2)，钾的施用量为270 kg/hm~(2)时，变形菌门的Shannon指数和Simpson指数最高，分别为4.87（P=0.049）和0.976（P=0.053）。在P=45 kg/hm~(2)的处理中，不同氮、钾组合梯度下，未发现显著改变土壤优势种群变形菌门的α多样性指数的效应，但是当氮和钾（N_(2)K_(3)）施用量分别为90 kg/hm~(2)和405 kg/hm~(2)时，变形菌门的Shannon指数和Simpson指数分别为4.640（P=0.370）和0.967（P=0.444），相对低于其他处理组。【结论】不同施肥制度能够通过改变土壤性质影响土壤微生物群落的结构和功能特征。

为了解野生羊肚菌的生境,研究其菌塘土壤细菌群落的结构与多样性,运用PCR–DGGE技术,对采集于凉山州冕宁县野生羊肚菌发生地的8个羊肚菌菌塘土样和2个非菌塘土样进行分析。结果表明:羊肚菌菌塘土壤与非菌塘土壤细菌群落的结构差异和多样性差异较大;菌塘土壤的多样性指数(H)和丰度(S)比非菌塘土壤的高;菌塘土壤中Thermosporotrichaceae、Myxococcaceae和Rhodospirillaceae等3科细菌在羊肚菌菌塘土壤中占据优势地位;羊肚菌菌塘土壤细菌多样性程度总体优于非菌塘土壤。