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[期刊] 水产学报
[作者]
颜玲 钟婧妍 袁永斌 张瑶 胡宏辉 陆婷婷 白志毅
为了阐明谷胱甘肽硫转移酶Pi类基因(HcGSTP1)在三角帆蚌类胡萝卜素转运中的作用，并探讨该基因表达与三角帆蚌壳色的相关性。本实验克隆并鉴定了三角帆蚌HcGSTP1基因，对其进行了序列特征和进化分析，通过实时荧光定量PCR (qRT-PCR)和原位杂交(ISH)技术检测了HcGSTP1基因在三角帆蚌中的表达及定位情况，利用RNAi技术对其功能及作用机制进行了初步分析。结果显示，HcGSTP1基因的全长cDNA序列为1 317bp，其中开放阅读框(ORF)区为618 bp，编码205个氨基酸，包含一个GST-N-pi结构域和GST-C-Pi结构域。qRT-PCR结果显示，HcGSTP1基因在紫蚌肝胰腺和斧足中表达量极显著高于白蚌，且在紫蚌边缘膜和中央膜中表达量显著高于白蚌。原位杂交结果显示，HcGSTP1基因在外套膜的外褶、背膜区、腹膜区、部分中褶以及外褶与中褶连接处出现明显的阳性信号。RNAi技术结果显示，HcGSTP1基因在边缘膜中表达的干扰率达83.74%，同时发现边缘膜中总类胡萝卜素含量(TCC)降低了30.12%。上述实验结果初步证实HcGSTP1基因参与三角帆蚌类胡萝卜素的转运，进而可能会影响贝壳及珍珠呈色，为深入理解三角帆蚌类胡萝卜素转运及贝壳和珍珠颜色形成机制补充了分子依据。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
范玉洁 林飞鹏 安泽伟 唐朝荣
【目的】从橡胶树中克隆Glutathione-S-transferase(GST)基因的cDNA和基因组DNA,进行序列、结构和系统进化分析,研究胁迫条件和激素处理下的表达谱。【方法】利用产排胶机理课题组构建的胶乳EST数据库,通过PCR技术克隆橡胶树GST基因的cDNA和基因组DNA;在线预测蛋白质保守功能域和亚细胞定位,构建系统进化树,利用实时荧光定量PCR分析割胶、伤害、低温、激素和死皮病等因素对该基因表达的影响。【结果】从橡胶树胶乳中克隆到1个GST基因的全长cDNA(793 bp),编码25.4 kD(219aa)蛋白,命名为HbGSTU1;克隆了HbGSTU1的基因组DNA(1 3...
[期刊] 水产学报
[作者]
周向红 易乐飞 李信书 王萍 阎斌伦
谷胱甘肽S-转移酶(glutathione S-transferase,GST)是一类多功能蛋白家族,主要参与解毒和抗氧化防御过程。为了研究GST在条斑紫菜叶状体解毒过程中的作用,克隆并分析了条斑紫菜一个可溶性谷胱甘肽S-转移酶基因(命名为PyGST)的基因组DNA序列和cDNA序列,采用实时荧光定量PCR研究了其在铅胁迫下的表达规律。PyGST包含一个长624 bp的完整开放阅读框,编码区内含有一个长248 bp的内含子。PyGST具有GST蛋白家族的保守碱基和保守结构域。PyGST与藻类GST的亲缘关系最近,与动物Sigma型GST的亲缘关系次之;在进化树上PyGST等大多数藻类GST与动...
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
李西雷 李卿青 朱庭耀 白志毅 李家乐
三角帆蚌贝壳珍珠质颜色与体内总类胡萝卜素含量(total carotenoids content,TCC)密切相关。为研究养殖中添加β-胡萝卜素对三角帆蚌总类胡萝卜素含量(TCC)及贝壳珍珠质颜色的影响,选用不同颜色选育系(紫色选育系和白色选育系)的三角帆蚌进行了为期40 d的养殖实验。通过设置4种浓度梯度(5、10、20、40 mg/L)分别进行添加实验。结果显示,随着类胡萝卜素添加量的增加,三角帆蚌肝胰腺和外套膜组织中TCC也相应增加,但不同颜色选育系三角帆蚌对类胡萝卜素的累积效果差异显著(P0.05)。白色选育系三角帆蚌各实验组贝壳珍珠质的颜色参数值之间差异均不显著(P>0.05)。综上,紫色选育系三角帆蚌体内能够富集更高含量的类胡萝卜素,而白色选育系三角帆蚌对类胡萝卜素的富集能力较弱。
关键词：
三角帆蚌 类胡萝卜素 壳色 组织 累积
[期刊] 水产学报
[作者]
张瑶 刘瀚璐 陆婷婷 颜玲 吕雪峰 王昊 王志炎 白志毅
类胡萝卜素代谢是影响三角帆蚌贝壳颜色和珍珠颜色的重要功能物质。本实验从已有的全基因组库中获得的HcSR-B1基因序列进行生物信息学分析，其开放阅读框长1 626 bp (GenBank：OR296620)，编码541个氨基酸，包括一个典型的CD36结构域及2个跨膜结构域。系统进化树及氨基酸比对分析证实，HcSR-B1基因进化较为保守，与文蛤相似性最高。以具有高、中、低类胡萝卜素代谢能力的三角帆蚌品系金蚌、紫蚌和白蚌为研究对象，实时荧光定量PCR (qRT-PCR)分析结果显示，HcSR-B1基因在肝胰腺、边缘膜、中央膜、斧足及闭壳肌中表达量均为金蚌最高、白蚌最低，且在肝胰腺及外套膜两个组织中均呈现显著性差异；原位杂交实验发现该基因在外套膜边缘均具有阳性信号，并且在外褶（OF）、中褶（MF）、中褶与内褶连接处及腹膜区（VM）中出现的阳性信号较其余部分更强；RNA干扰沉默基因表达72 h后，最佳干扰组基因表达量显著降低71.72%，该组外套膜组织总类胡萝卜素含量 (TCC) 相应降低50.5%。研究表明，HcSR-B1基因能够影响三角帆蚌类胡萝卜素的吸收转运过程，进而通过生物矿化过程影响贝壳或珍珠颜色。本研究可以深化对三角帆蚌壳色和珍珠颜色形成分子机制的理解。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘晓丛 曾丽 刘国锋 彭勇政 陶懿伟 张邀月 王梦茹
【目的】克隆万寿菊(Tagetes erecta L.‘Scarletade’)类胡萝卜素裂解双加氧酶基因CCD1(TeCCD1),分析其序列特征和表达特性,为阐明其在类胡萝卜素降解途径中生物学功能及进一步探讨万寿菊花色形成机理提供理论基础。【方法】依据万寿菊花蕾转录组数据,利用同源序列比对结果设计引物,结合RT-PCR技术克隆获得万寿菊CCD1 cDNA全长,分析其序列特征;利用Real-time PCR分析舌状花未开花蕾、半开花蕾、开放的头状花序和完全开放的头状花序4个不同发育时期的基因表达特性。【结
[期刊] 华北农学报
[作者]
张蕾 于永昂 杨天佑
为了进一步研究小麦谷胱甘肽－Ｓ－转移酶基因（ＴａＧＳＴ）的功能，采用ＲＴ－ＰＣＲ方法分离了小麦谷胱甘肽－Ｓ－转移酶基因（ＴａＧＳＴ）的ＯＲＦ全长Ｃ ＤＮａ，并进行了生物信息学分析。结果表明：小麦ＴａＧＳＴ基因的ＯＲＦ全长６９０ ｂＰ，编码２２９个氨基酸；ＴａＧＳＴ蛋白分子质量为２５．８１ ｋ Ｄａ，Ｐ Ｉ为５．２９。系统进化分析表明，该基因编码蛋白与水稻ＯＳＧＳＴ蛋白的氨基酸同源性最高，与已知植物ＧＳＴ家族成员的氨基酸序列聚类分析将ＴａＧＳＴ聚为ＰｈＩ类ＧＳＴ。构建原核表达载体Ｐ ＥＴ３２－ＴａＧＳＴ，对ＴａＧＳＴ基因进行原核表达，ＳＤＳ－ＰａＧＥ结果表明，其所表达蛋白与预期蛋白大小一致。为进．．．
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
马俊宁 代鲁鲁 张然然 陈辉
【目的】克隆华山松大小蠹谷胱甘肽S-转移酶基因的全长序列,并对其序列特征及不同发育时期的表达规律进行研究,以揭示谷胱甘肽S-转移酶在华山松大小蠹克服寄主抗性及物质转运过程中的分子调控机制。【方法】采用RT-PCR和RACE克隆华山松大小蠹谷胱甘肽S-转酶基因全长cDNA序列,用实时荧光定量PCR检测该基因在华山松大小蠹幼虫、蛹和雌雄成虫中的表达情况。【结果】获得cDNA全长为973bp的华山松大小蠹谷胱甘肽S-转移酶基因,并命名为DaGSTe1(GenBank登录号:KJ637332),其编码一个由218个氨基酸组成的多肽,分子质量约为23.567ku,理论等电点为7.90。华山松大小蠹DaG...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
罗梅 董章勇 宾淑英 廖泓之 林进添
【目的】扶桑绵粉蚧是我国重要的入侵生物,其繁殖能力强,能危害棉花、扶桑、向日葵、南瓜、番茄等多种我国重要的经济作物。克隆扶桑绵粉蚧谷胱甘肽S-转移酶(GSTs)基因,可为揭示扶桑绵粉蚧GSTs的生理功能提供参考。【方法】利用RT-PCR和RACE技术克隆扶桑绵粉蚧谷胱甘肽S-转移酶基因全长,并采用生物信息学方法分析其结构特征,用实时荧光定量PCR的方法研究其各个虫态的表达谱。【结果】克隆了扶桑绵粉蚧谷胱甘肽S-转移酶基因全长序列,该基因的开放阅读框包含651bp的片段,编码217个氨基酸。DNA编码区由4个内含子和5个外显子组成,内含子的长度分别为90,123,67和70bp;分隔的5个外显子...
[期刊] 水产学报
[作者]
罗红瑞 白志毅 刘晓军 李清清 董绍建 曾仕梅 李家乐
为寻找珍珠层颜色形成相关基因,以转录组文库中标注的序列为模板,利用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)方法,获得了三角帆蚌HcCUBDC基因的全长cDNA序列,共5 158 bp,开放阅读框(ORF)1 920 bp,编码639个氨基酸,5'端非编码区576 bp,3'端非编码区2 662 bp,Gen Bank登录号为KP067952。生物信息学分析表明,三角帆蚌HcCUBDC蛋白含有一个由19个氨基酸组成的信号肽和4个CUB结构域,但未能比对上已知的蛋白。经荧光定量PCR检测,HcCUBDC基因在紫色和白色蚌前端缘膜、后端缘膜、...
[期刊] 水产学报
[作者]
罗红瑞 白志毅 刘晓军 李清清 董绍建 曾仕梅 李家乐
为寻找珍珠层颜色形成相关基因，以转录组文库中标注的序列为模板，利用ｃＤＮＡ末端快速扩增（ｒＡｐｉＤ ＡｍｐｌｉｆｉｃＡｔｉｏＮ ｏｆ ｃＤＮＡ ｅＮＤｓ，ｒＡｃｅ）方法，获得了三角帆蚌ＨｃｃＵＢＤｃ基因的全长ｃＤＮＡ序列，共５ １５８ Ｂｐ，开放阅读框（ｏｒｆ）１ ９２０ Ｂｐ，编码６３９个氨基酸，５＇端非编码区５７６ Ｂｐ，３＇端非编码区２ ６６２ Ｂｐ，ＧｅＮ ＢＡＮｋ登录号为ｋｐ０６７９５２。生物信息学分析表明，三角帆蚌ＨｃｃＵＢＤｃ蛋白含有一个由１９个氨基酸组成的信号肽和４个ｃＵＢ结构域，但未能比对上已知的蛋白。经荧光定量ｐｃｒ检测，ＨｃｃＵＢＤｃ基因在紫色和白色蚌前端缘膜、后端缘膜、．．．
[期刊] 水产学报
[作者]
袁一鸣 李西雷 白志毅 汪桂玲 李家乐
采用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)首次克隆了三角帆蚌过氧化氢酶(CAT)基因的cDNA全长序列,为2 804 bp,包含112 bp的5'非翻译区(untranslated region,UTR),1 303 bp的3'UTR和1 388 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF)。ORF区共编码462个氨基酸,推算的分子量约为52.7 ku,理论等电点为6.35。多序列比对结果显示,有一段CAT氨基酸高度保守的催化位点序列FDRERIPERVVHAKGAG。三角帆蚌CAT基因有12个与...
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
刘斐斐 崔晓羽 董赛赛 段胜华 汪桂玲 李家乐
为进一步了解WNT4在三角帆蚌性别决定过程中的作用，通过RACE（Rapid-amplification of cDNA ends）技术克隆获得了三角帆蚌WNT4基因的全长cDNA，共1560 bp，其中5’-UTR 396 bp、3’-UTR 24 bp，开放阅读框（ORF）为1140 bp，可以编码379个氨基酸，且该序列含有Wnt家族特有结构域。对WNT4的氨基酸序列进行同源性分析后，发现该基因在物种间的进化关系和结构功能具保守性。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析发现WNT4基因在三角帆蚌雌雄多个组织中(外套膜、闭壳肌、鳃、性腺、斧足和肝)均有表达，表明其参与了多样的生物学过程，在腮、斧足、肝中表达量较高，在性腺、闭壳肌、斧足中雌雄间有显著性差异，且雌性三角帆蚌的性腺、闭壳肌表达量显著高于雄性。原位杂交结果显示，WNT4在雌性三角帆蚌的卵母细胞上有明显的杂交信号，推测WNT4基因与性别决定相关。
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
瞿春梅 梁旭方 张进 何珊 沈丹
利用简并引物从日本沼虾肝脏克隆mu型sGST基因cDNA核心片段获得其sGST氨基酸序列。序列分析表明日本沼虾肝脏mu型sGST基因cDNA核心序列长299bp,编码99个氨基酸。日本沼虾sGST与南美白对虾(Litopenaeus vannamei)、小鼠(Mus musculus)、大鼠(Rattus norvegicus)、肩突硬蜱(Ixodes scapu-laris)、扇头蜱(Rhipicephalus appendiculatus)、热带爪蟾(Xenopus tropicalis)、微小牛蜱(Rhipicephalus micro-plus)和太平洋牡蛎(Crassostrea g...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
黄颖 王晓东 遇文婧
【目的】本研究旨在通过分析山新杨谷胱甘肽S-转移酶编码基因PdbGSTU的抗病功能，为林木抗性育种提供基因资源与抗性种质。【方法】克隆PdbGSTU基因序列并对其进行生物信息学分析，利用荧光定量PCR技术分析该基因的组织特异性表达及植物激素诱导下的表达模式。利用转基因技术获得山新杨的过/抑制表达PdbGSTU基因植株，通过观察比较接种细链格孢菌后各植株叶片的表型和病斑面积，验证该基因的抗病功能；同时测定接种病原菌前后，野生型和转基因山新杨植株内过氧化氢含量和抗氧化相关酶活性。【结果】（1）山新杨PdbGSTU基因开放阅读框全长753 bp，编码氨基酸250个，对应的蛋白质相对分子质量为29.01 kDa，为稳定的酸性亲水蛋白，定位于细胞质中；系统进化分析显示，PdbGSTU蛋白与银中杨的蛋白KAJ6918316亲缘关系最近；启动子序列分析显示，PdbGSTU基因启动子序列含多种响应植物激素和逆境胁迫的顺式作用元件。（2）RT-qPCR结果显示，PdbGSTU基因在山新杨顶芽表达量最高，在其根部表达量最低，且该基因受茉莉酸甲酯、水杨酸和1-氨基环丙基-1-羧酸3种植物激素诱导，均上调表达。（3）接种细链格孢菌后，野生型和抑制表达PdbGSTU基因植株的叶片上，病斑面积分别为6.42和16.46 mm2，而过表达PdbGSTU基因的植株叶片上，少部分接种点出现明显病斑，其余接种部分仅出现褪色。【结论】PdbGSTU正向参与山新杨对细链格孢菌侵染的抵御过程，可通过清除活性氧提高杨树对病原菌的抗性。
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