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[期刊] 华北农学报
[作者]
李楠 张海英 陈年来 王永健 许勇 宫国义 郭绍贵
利用940对SSR引物,对甜瓜、黄瓜和西瓜三套重组自交系群体的作图亲本DNA进行PCR扩增,分析SSR引物在不同瓜类作物间的通用性与多态性。结果表明,上述SSR引物在甜瓜、黄瓜和西瓜等不同瓜类作物间具有一定的通用性,最小通用率超过24%,说明不同瓜类作物基因组间存在一定的相似性。但瓜类SSR引物的种属特异性很强,能够检测的多态率很低,三套作图亲本之间能够共用的多态性SSR引物比例甚至不足1%。
关键词：
瓜类作物 SSR 通用性 多态性
[期刊] 西南农业学报
[作者]
杨维泽 许宗亮 杨绍兵 杨美权 左应梅 杨天梅 张金渝
为了筛选适合用于滇重楼种质资源整理、评价和遗传研究的SSR标记,首次利用百合(35对)、延龄草(10对)、薯蓣(5对)的EST-SSR标记对5份滇重楼材料进行PCR扩增,分析3种植物引物在滇重楼中的通用性。结果显示,40对引物在滇重楼中能有效扩增,占引物总数的80.0%,其中32对引物具有多态性,占引物总数的64.0%,引物通用率较高;利用15对具有多态性的引物对35份滇重楼材料进行多态性检测,等位基因数(A)、有效等位基因数(Ae)、Nei’s基因多样性(H)、Shannon指数(I)及多态位点百分比(PPB%)分别为1.9955、1.2634、0.1811、0.3075和99.5%,滇重楼...
关键词：
EST-SSR 滇重楼 通用性
[期刊] 华北农学报
[作者]
胡秀荣 方良俊 陈晓 朱志凯 张鑫 詹聘芳
在盐胁迫下,经不同药物处理的水稻R6幼苗,提取RNA并反转录为cDNA后,对水稻P450基因cDNA序列扩增多态性进行分析。结果表明,不同药物处理的水稻R6幼苗形态特征明显;药物环孢素(CsA)处理的水稻细胞色素P450基因CYP709(NM-001066006)缺失430 bp条带,可能是NM-001066006基因与NM-001066009基因的外显子选择性剪接所致,从而表现出功能基因扩增多态性。
[期刊] 浙江林学院学报
[作者]
沈俊岭 倪慧群 陈晓阳 黄少伟
采用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记对中国6省(区)及印度尼西亚共8个麻疯树Jatropha curcas种源样本进行研究,旨在阐明麻疯树种源间的遗传关系和遗传多样性。结果表明:麻疯树相关序列扩增多态性-聚合酶链式反应(SRAP-PCR)最佳反应体系为:10×PCR buffer2μL,DNA模板20ng,Taq酶16.67nkat,Mg2+2.50mmol·L-1,三磷酸脱氧核苷酸(dNTP)120.00μmol·L-1,引物0.15μmol·L-1,总体积为20μL;并从274对引物中选出具有多态性的45对引物,共检测出500条清晰的条带,其中多态性条带141条,占总条带数的28.2...
[期刊] 华北农学报
[作者]
蒋建平 杨懋勋 黄永芳
本研究选择了中国广东省7个有代表性的山区作为野百合(Lilium brownii F.E.Brown ex Miellez)天然居群的采样点,对采集到的199份样品进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,以建立野百合天然居群RAPD分析方法体系以便后续研究,并了解广东省野百合天然居群多态性情况和居群内外个体及野百合及变种百合样品的聚类情况。以新鲜叶片、硅胶干燥叶片及鳞片为材料分别提取DNA,从273条10聚寡核苷酸随机引物中筛选出20条随机引物,对7个居群共199个野百合及百合样品进行RAPD扩增。共检测到433条RAPD谱带,其中多态性条带为430条,所有个体的多态性条带百分率(PPB)...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
伍玲 李平 刘熔山
以小麦、玉米、小米、高粱、狼尾草五个不同属的材料为外源ＤＮＡ供体，经减压渗透转导受体紫稻，从获得的变异材料中各选一份进行了随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分析。共用２０个随机引物，其中６个引物扩增出了有差异的多态性ＤＮＡ片段，１个引物可以区分受体材料与变异材料及变异材料间的差异。在以材料两两间的相似率进行的聚类分析中，发现聚类结果与材料变异性状一致，变异材料与受体材料间相似率高达９０．７％，认为变异材料为受体材料在“减压渗透”处理后的真实变异；ＲＡＰＤｓ是检测材料间差异的有效方法。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
徐建堂 祁建民 林培清 张高阳 陶爱芬 方平平
为研究红麻叶片叶绿体DNA(cpDNA)非编码区的序列特征,采用改良CTAB方法提取红麻总DNA,以8份红麻光钝感突变体及其4份近缘种基因组DNA为模板,应用8对植物cpDNA通用引物对红麻cpDNA非编码区序列进行PCR扩增,优化cpDNA非编码序列PCR的扩增条件,应用4种限制性内切酶(EcoRⅠ、HindⅢ、TaqⅠ、AulⅠ)酶切扩增片段.结果表明:所筛选的通用引物适用于红麻cpDNA非编码序列扩增,扩增产物经1.5%琼脂糖电泳检测,片段大小为400-2000 bp,共扩增cpDNA片段大小约13000 bp.将PCR扩增产物进行酶切,每个片段均有相同的酶切位点,只有cp4引物对cpD...
[期刊] 水产学报
[作者]
李晓静 孔杰 王伟继 孟宪红 田燚 孟鹏 毛连菊
为评估DNA随机扩增多态性标记在中国对虾遗传连锁图谱构建中的应用前景,利用中国对虾单对交配亲本及其子二代材料,对RAPD标记及其遗传规律进行了研究。22条RAPD随机引物扩增结果的统计分析表明,标记在中国对虾F2的遗传规律可归为不分离标记和分离标记:不分离标记,指在亲本和后代中均不分离的标记,占总位点的54.1%;分离标记占总位点的45.9%。其中,分离标记又包括符合孟德尔遗传分离的标记、偏离孟德尔遗传分离标记和异常分离标记。符合孟德尔分离的标记中,分离比例为3∶1的标记占分离标记的14.7%;总的1∶1标记占分离标记的64.7%;偏离孟德尔分离和异常分离的标记分别占分离标记的11.7%和8....
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
刘霞 郭玉华 王松文 李传友 刘芳 张欣 施利利
选用分布于水稻12条染色体上的249对SSR引物,对9个不同类型水稻品种进行DNA扩增,筛选到具有3条以上特异扩增条带的SSR引物39对,其中能揭示籼粳多态性的引物有6对。用筛选到的引物在9个不同水稻品种间的扩增结果,初步分析了SSR标记的多态性及用于水稻指纹分析、籼粳分化分析和聚类分析的潜力。
[期刊] 林业科学
[作者]
魏令波 唐谦 郑先武 顾万春 李小兵
马尾松随机扩增多态性ＤＮＡ标记的分离研究魏令波，唐谦，郑先武，顾万春（中国林业科学研究院林业研究所北京１０００９１）李小兵（中国科学院遗传研究所植物生物技术开放实验室北京１０００１２）关键词马尾松，ＲＡＰＤ，Ｍｅｎｄｅｌｉａｎ分离随机扩增多态性ＤＮＡ...
关键词：
马尾松,RAPD,Mendelian分离
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
于晓英 张秋明 易干军 霍合强 谭卫萍 李典范
为了建立一个准确、完善、统一的香蕉鉴别分类标准 ,促进香蕉种质资源的合理利用及新品种的选育与推广 ,于 2 0 0 0年 2至 12月在广东省农科院果树研究所对广州国家种质香蕉圃的 35份香蕉种质材料进行了AFLP分子标记 .结果表明 :1)引物EcoRⅠACC +MseⅠCAT和EcoRⅠACC +MseⅠCAG对 35个香蕉材料进行选择性扩增后 ,共得到扩增位点 10 7个 ,其中多态性位点 84个 ,多态性位点比例达到 78.5 % ,对 35个材料的区分率达到10 0 % .2 )在引物对EcoRⅠACC +MseⅠCAT和EcoRⅠACC +MseⅠCAG构建的香蕉AFLP指纹图谱中...
关键词：
香蕉 种质资源 鉴别 扩增片段长度多态性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
杜晓华 王得元 巩振辉
为了避开基于限制性酶切位点分子标记技术的DNA酶切环节,简化其复杂的程序,试验以辣椒为材料,建立了一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP),并对其反应体系进行了优化,对RSAP适用性、重复性进行了检验。结果显示,RSAP技术的引物为2条长度均为18 bp的引物,引物的3′端为4~6个碱基的限制性酶切位点序列,接着是12~14个碱基的随机序列,2条引物的限制性位点和随机序列不同;PCR扩增的前5个循环采用35℃的退火温度,随后的35个循环采用48℃的退火温度;在25μL反应体系中,模板DNA用量为20 ng,M g2+浓度为2.5 mm o l/L,dNTP s浓度为0.2 m...
[期刊] 林业科学
[作者]
程东升 梁惠燕 薛煜 潘学仁 李武汉
用ＲＡＰＤ手段分析了我国３种松干锈菌Ｃｒｏｎａｒｔｉｕｍｒｉｂｉｃｏｌａ、Ｃ．ｆｌａｃｃｉｄｕｍ及Ｃ．ｑｕｅｒｃｕｕｍ在ＤＮＡ水平上的遗传分化。用５个随机引物从１０个菌株（含１个不同属参照菌株）中检测出５１个多态ＤＮＡ片段进行聚类分析，３种锈菌清晰地显示为不同类群，此结果为传统分类的成立提供了分子遗传学证据。３种锈菌中Ｃ．ｒｉｂｉｃｏｌａ和Ｃ．ｆｌａｃｉｄｕｍ的亲缘关系较近，这同由症状和冬孢子寄主反映出的相似关系一致。种内菌株间存在遗传差异，但其程度小于种间差异。锈孢子及冬孢子寄主都不同的Ｃ．ｆｌａｃｉｄｕｍ菌株间差异明显，可能反映着专化型分化的遗传学基础。不同松树寄主的Ｃ．ｑｕｅｒｃｕｕｍ菌...
[期刊] 华北农学报
[作者]
乔燕春 林锦英 谢伟平 张华 郑岩松 谢丽芳 李莲芳 黄红弟
利用9个表型性状和20对SRAP标记分析了13份华南地区主要瓜类作物的遗传进化关系,9个表型性状差异显著,20对SRAP分子标记分析供试的13份材料,共产生328条差异谱带,仅有2条共同带,多态性比率为99%,遗传相似系数为0.140~0.993。进一步分析了表型性状与SRAP分子标记的相关性,P=0.05时,相关系数为0.576;说明表型性状和分子标记结果存在一定的显著相关,通过分子标记研究和表型性状的相关性分析,确定华南地区主要葫芦科植物的遗传关系,可为今后在分子水平进行葫芦科瓜类种质资源的育种及亲缘关系分析等研究提供科学依据。
关键词：
华南地区 瓜类蔬菜 SRAP 遗传相关性
[期刊] 西南农业学报
[作者]
苟本富
采用单酶切和双酶切AFLP技术分别对5种不同蔷薇品种基因组DNA的遗传多态性进行了检测,比较了2种方法的多态性比率。单酶切采用10条人工设计的与接头序列相识别的AFLP选择性引物,用PstⅠ酶切,共获得108个AFLP标记,片段大小在100~2000 bp,得到33个多态位点,多态性位点百分率为30.56%;双酶切采用25对双酶切AFLP引物,在50~600 bp扩增出清晰条带658条,得到182个多态位点,占总扩增带的27.6%。对多态性片段进行统计,计算出不同品种间的相似系数和遗传距离。结果表明:硕苞蔷薇同其它4种蔷薇的遗传距离偏远,且其它四种蔷薇的遗传距离均较近,这与蔷薇品种来源和培育史...
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