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[期刊] 淡水渔业
[作者]
彭啸 温彬 陈再忠 高建忠
为了探究胸腺素基因在七彩神仙鱼(Symphysodon aquifasciatus)中的特征、进化和功能，基于转录组序列比对及生物信息学的方法对七彩神仙鱼的胸腺素进行了鉴定、基因与蛋白结构分析、系统发生分析，通过RACE技术克隆获得了七彩神仙鱼胸腺素基因全长，利用qRT-PCR技术研究其在各组织中的表达规律，通过病原感染实验，研究了七彩神仙鱼β-胸腺素基因在病原胁迫下的表达规律。结果显示，七彩神仙鱼的胸腺素基因鉴定为胸腺素β1型，命名为dfTβ。克隆结果显示，dfTβ的全长为779 bp, ORF区序列长度为303 bp,编码100个氨基酸，其5′-UTR为43 bp, 3′-UTR为433 bp,含有22个poly-A。系统发育进化分析结果显示，七彩神仙鱼β-胸腺素同尼加拉瓜湖始丽鱼β-胸腺素聚为一簇。qPCR结果显示，β-胸腺素在七彩神仙鱼各组织中均有表达，其中在肠、皮肤、鳃中表达最高，在头肾和脾中表达最低。嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染后，七彩神仙鱼皮肤、头肾、脾和肠中dfTβ均在短时间内显著上调，并随着时间出现先上升后下降的趋势，但各组织中上调倍数最高峰的时间不同。研究结果表明，dfTβ基因参与了七彩神仙鱼受病原刺激后的免疫应答，且表达模式不同，表明其可能在不同组织、免疫的不同阶段发挥不同的作用。
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
林睿涓 高建忠 金仕容 赵玉明 陈再忠
源自DEAD-box家族的Vasa基因是生殖细胞的分子标记之一。本研究克隆了七彩神仙鱼(Symphysodon haraldi)Vasa基因的全长序列,并进行了不同组织的表达分析。结果表明:七彩神仙鱼Vasa基因c DNA序列共2 370 bp,其中5'UTR占123 bp,3'UTR为279 bp,ORF编码655个氨基酸,长1 968 bp。氨基酸序列同源性分析表明七彩神仙鱼的Vasa基因与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)的同源性最高。半定量分析表明,Vasa基因在成熟七彩神仙
关键词：
七彩神仙鱼 Vasa基因 克隆 表达分析
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
张楠 温彬 金仕容 高建忠 陈再忠
以七彩神仙鱼(Symphysodon aequifasciatus)为研究材料,克隆了sox9基因cDNA序列,全长为1348 bp,开放性阅读框长990 bp,编码334个氨基酸,且预测的氨基酸序列具有SOX家族的HMG高保守区域。在构建的系统进化树中,七彩神仙鱼与奥利亚罗非鱼的sox9氨基酸序列同源性达89%,表明sox9基因在进化地位中具有保守性。RT-PCR结果显示:sox9 mRNA在精巢、脑、肠、胃以及皮肤中均有表达,尤以精巢中的表达量最高,而在卵巢中未见表达。sox9基因在仔鱼出膜后第45天表达量最高,而在第50天的表达量最低。原位杂交结果显示:sox9出现在成熟精巢的支持细胞内,而在卵巢中未检测到。综上所述,sox9基因参与七彩神仙鱼精巢的发育过程,可能对其性腺功能的维持起作用。
关键词：
七彩神仙鱼 sox9 时空表达 原位杂交
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
张诚仪 陈再忠
运用聚丙烯酰胺垂直板凝胶电泳法,对七彩神仙鱼的8种组织(脑、皮肤、肌肉、肝脏、胰脏、鳃、眼球晶状体、心脏)中的9种酶类[酯酶(EST)、醇脱氢酶(ADH)、乳酸脱氢酶(LDH)、山梨醇脱氢酶(SDH)、过氧化物酶(POD)、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G-6-PD)和酪氨酸酶(COX)]进行了研究,并对其各组织中的同工酶位点及其酶谱表型进行了分析。试验中共检测到29个基因座位,分别由相应的等位基因决定。试验结果表明,七彩神仙鱼的9种同工酶系在各组织都显示出清晰稳定的酶谱,除CAT在七彩神仙鱼各组织和个体中表现一致以外,其它8种同工酶都存在明显的组织差...
关键词：
七彩神仙鱼 同工酶 组织差异
[期刊] 中国水产科学
[作者]
陈鸣 赵超 范嗣刚 王鹏飞 闫路路 王芳 邱丽华
β-胸腺素(β-thymosin)是一类高度保守的功能多肽,在伤口愈合、血管生成、抗菌和抗病毒免疫等生理活动中起重要的调控作用。本研究从斑节对虾(Penaeus monodon)中成功克隆了一种β-thymosin cDNA序列(β-thymosin 5),其全长为1495 bp,开放阅读框(open reading frame, ORF)为615 bp,编码204个氨基酸。多重序列比对和系统进化树分析结果表明Pmβ5与对虾属的日本囊对虾(Penaeus japonicus)和凡纳滨对虾(Penaeus vannamei)的胸腺素β5聚为一支,其中与日本囊对虾的胸腺素β5同源性最高,相似性高达77%。组织分布研究显示Pmβ5mRNA在肝胰腺和淋巴等免疫相关组织中的表达量明显高于其他组织。在灭活的副溶血弧菌(Vibrio parahemolyticus)刺激下, Pmβ5基因的表达量显著升高(P
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
周建桥 欧阳明艳 温彬 陈再忠 高建忠
为了探究七彩神仙鱼体表黏液在繁殖周期中组分的变化规律，测定了七彩神仙鱼体表黏液中皮质醇、免疫球蛋白M、总蛋白、乳酸、葡萄糖的含量变化。结果表明，七彩神仙鱼体表黏液中皮质醇、免疫球蛋白M、总蛋白、乳酸、葡萄糖的含量均受亲鱼性别和繁殖时期显著影响（P<0.05），且繁殖时期与性别之间存在显著交互作用（P<0.05）。在幼鱼平游期，5种组分含量在雌雄亲鱼之间存在显著差异（P<0.05）。七彩神仙鱼开始“喂奶”后其体表黏液成份发生显著变化，尤其是雄鱼会分泌更多的营养与免疫组分来满足幼鱼需求。
关键词：
七彩神仙鱼 体表黏液 繁殖期 繁殖间期
[期刊] 水产学报
[作者]
丰培金 王文东 李伟 何江帅 张俊辉 杨振国 卢强
应用荧光DDRT-PCR从鲤外周血白细胞克隆了鲤胸腺素β(thymosinβ,Tβ)基因cDNA全序列。序列分析表明,TβcDNA全长528bp,其完整的读码框架位于40～178bp,编码46个氨基酸,5'非编码区长39bp,3'非编码区长为348bp,且具有Poly(A)加尾信号(AATAAA),将该基因序列递呈GenBank,注册序列号为AY457946。氨基酸序列同源性分析显示,鲤Tβ氨基酸序列与鲤Tβa、斑马鱼Tβa及斑马鱼Tβ-2同源性均为84%。在系统发生树上,鲤Tβ与鲤、斑马鱼、白斑狗鱼和鲑Tβa及斑马鱼Tβ2聚类。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
陈段芬 彭镇华 高健
A new gene,named as NTZDS1(GenBank accession number:EU138882),was cloned from the alabastrum of Narcissus tazetta var.chinensis through RT-PCR.The sequence consists of 1 899 bp,has an open reading frame of 1 725 bp encoding a polypeptide of 574 amino acids.Homology analysis showed that the deduced N...
关键词：
中国水仙 ZDS基因 序列分析 组织表达
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
高志民 陈段芬 彭镇华
MADS-box基因在植物花发育中具有重要作用。采用RT-PCR和RACE技术,从中国水仙幼嫩花蕾中分离到了一个MADS-box同源基因,命名为NtMADS3(GenBank登记号:EU081900)。该基因cDNA全长980 bp;编码区编码241个氨基酸,具有典型的植物MADS-box基因结构。序列分析表明,NtMADS3编码的蛋白与其他植物的MADS-box蛋白有着较高的一致性,其中与石刁柏的AOM3一致性高达89.2%,与拟南芥的AGL6一致性为60.0%。系统进化树分析表明NtMADS3基因属于E类功能基因。组织表达模式分析显示,NtMADS3基因在中国水仙的开花期各器官及花的各部位...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
艾闽 杨辉 胡伟 李锋刚 刘小林 王立新
【目的】对大鲵胸腺素β-4基因进行生物信息学分析和原核表达载体构建,为大鲵胸腺素β-4蛋白生理活性的深入研究奠定基础。【方法】从大鲵皮肤cDNA文库中分离获得了大鲵胸腺素β-4基因全长序列,采用多种生物软件对其进行生物信息学分析,用定量PCR研究胸腺素β-4基因在不同组织的表达情况,并以pET32a为载体构建该基因原核表达载体。【结果】胸腺素β-4基因全长共699bp,其中开放阅读框135bp,5′-UTR 87bp,3′-UTR为474bp,该基因编码45个氨基酸,表达蛋白的理论分子质量为5 141.59u,等电点为5.34;结构分析发现,大鲵胸腺素β-4蛋白氨基酸序列的第7～43位处有"T...
关键词：
大鲵 胸腺素β-4基因 分离与表达
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
王磊 陈再忠 冷向军 高建忠 孙培英 曲恒超 张晓晓 宋雪璐
对野生七彩神仙鱼、牛心汉堡养殖七彩神仙鱼和配合饲料养殖七彩神仙鱼的肌肉成分进行了分析比较。结果表明：野生七彩神仙鱼肌肉中粗蛋白最高，配合饲料养殖的七彩神仙鱼次之，牛心汉堡养殖的七彩神仙鱼最低（Ｐ＜０．０５）；野生七彩神仙鱼粗脂肪含量低于２种养殖七彩神仙鱼（Ｐ０．０５）；３种不同摄食模式的七彩神仙鱼肌肉水分含量和灰分之间没有显著差异（Ｐ＞０．０５）。３种不同摄食模式七彩神仙鱼的氨基酸组成基本一致，均含有１７种氨基酸，含量最高的为谷氨酸（Ｇｌｕ），９种必需氨基酸中含量最高的为赖氨酸（ｌｙｓ）。３种不同摄食模式的七彩神仙鱼肌肉中主要含有１．．．
[期刊] 上海水产大学学报
[作者]
刘晓东 陈再忠
观察了黄白、红点绿和红盖子七彩神仙鱼皮肤色素细胞的分布情况,并通过光谱、色谱和类胡萝卜素显色反应等方法分析了其皮肤类胡萝卜素的组成成分。黄白七彩神仙鱼体侧皮肤以黄色素细胞为主并有少量黑色素细胞,皮肤类胡萝卜素主要为黄体素;红盖子七彩神仙鱼体侧皮肤以红色素细胞和黄色素细胞为主,也有一定量的黑色素细胞和虹彩细胞;红点绿七彩神仙鱼在皮肤红色区又大量的红色素细胞、黄色素细胞和黑色素细胞,而在蓝条纹区有大量虹彩细胞和黑色素细胞。红点绿和红盖子七彩神仙鱼皮肤色素组成均为虾青素及其酯、角黄素、玉米黄素的酯及α-胡萝卜素。
[期刊] 水产学报
[作者]
张逛 王武 段征宇 桂朗 苏冒亮 牟幸江 张俊彬
为了解金钱鱼促性腺激素受体基因(GtHRs)在金钱鱼性腺发育中的作用,采用反转录PCR(Rt-PCR)与cDNA末端快速克隆(RACE)首次克隆了金钱鱼卵泡刺激素受体(FSHR)和促黄体生成素受体(LHR)的cDNA序列全长。FSHR的cDNA全长2538 bp,编码702个氨基酸,LHR的cDNA全长3315 bp,编码722个氨基酸,它们都含有属于糖蛋白激素受体(GHR)家族的典型跨膜螺旋结构区域(TM helix)。同源性分析显示金钱鱼GtHRs与欧洲鲈的相似性最高,且GtHRs在进化中具有一定的保
[期刊] 中国水产科学
[作者]
陈玥 李家乐 沈玉帮
为了研究C1qC基因在草鱼(Ctenopharyngodon idella)免疫过程中所起的作用,利用RT-PCR和RACE方法克隆获得了C1qC基因cDNA全长序列,经序列分析表明,所克隆的C1qC cDNA全长为916 bp,包括开放阅读框(open reading frame,ORF)735 bp,5′端非编码区(untranslated region,UTR)89 bp和3′端非编码区(UTR)92 bp。735 bp的ORF共编码244个氨基酸,相对分子量为26 162.5 U。同源性分析表明,草鱼与斑马鱼(Danio rerio)的相似度最高,达到71%。经草鱼呼肠孤病毒(gras...
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