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[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
张楠 温彬 金仕容 高建忠 陈再忠
以七彩神仙鱼(Symphysodon aequifasciatus)为研究材料,克隆了sox9基因cDNA序列,全长为1348 bp,开放性阅读框长990 bp,编码334个氨基酸,且预测的氨基酸序列具有SOX家族的HMG高保守区域。在构建的系统进化树中,七彩神仙鱼与奥利亚罗非鱼的sox9氨基酸序列同源性达89%,表明sox9基因在进化地位中具有保守性。RT-PCR结果显示:sox9 mRNA在精巢、脑、肠、胃以及皮肤中均有表达,尤以精巢中的表达量最高,而在卵巢中未见表达。sox9基因在仔鱼出膜后第45天表达量最高,而在第50天的表达量最低。原位杂交结果显示:sox9出现在成熟精巢的支持细胞内,而在卵巢中未检测到。综上所述,sox9基因参与七彩神仙鱼精巢的发育过程,可能对其性腺功能的维持起作用。
关键词：
七彩神仙鱼 sox9 时空表达 原位杂交
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
林睿涓 高建忠 金仕容 赵玉明 陈再忠
源自DEAD-box家族的Vasa基因是生殖细胞的分子标记之一。本研究克隆了七彩神仙鱼(Symphysodon haraldi)Vasa基因的全长序列,并进行了不同组织的表达分析。结果表明:七彩神仙鱼Vasa基因c DNA序列共2 370 bp,其中5'UTR占123 bp,3'UTR为279 bp,ORF编码655个氨基酸,长1 968 bp。氨基酸序列同源性分析表明七彩神仙鱼的Vasa基因与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)的同源性最高。半定量分析表明,Vasa基因在成熟七彩神仙
关键词：
七彩神仙鱼 Vasa基因 克隆 表达分析
[期刊] 淡水渔业
[作者]
彭啸 温彬 陈再忠 高建忠
为了探究胸腺素基因在七彩神仙鱼(Symphysodon aquifasciatus)中的特征、进化和功能，基于转录组序列比对及生物信息学的方法对七彩神仙鱼的胸腺素进行了鉴定、基因与蛋白结构分析、系统发生分析，通过RACE技术克隆获得了七彩神仙鱼胸腺素基因全长，利用qRT-PCR技术研究其在各组织中的表达规律，通过病原感染实验，研究了七彩神仙鱼β-胸腺素基因在病原胁迫下的表达规律。结果显示，七彩神仙鱼的胸腺素基因鉴定为胸腺素β1型，命名为dfTβ。克隆结果显示，dfTβ的全长为779 bp, ORF区序列长度为303 bp,编码100个氨基酸，其5′-UTR为43 bp, 3′-UTR为433 bp,含有22个poly-A。系统发育进化分析结果显示，七彩神仙鱼β-胸腺素同尼加拉瓜湖始丽鱼β-胸腺素聚为一簇。qPCR结果显示，β-胸腺素在七彩神仙鱼各组织中均有表达，其中在肠、皮肤、鳃中表达最高，在头肾和脾中表达最低。嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染后，七彩神仙鱼皮肤、头肾、脾和肠中dfTβ均在短时间内显著上调，并随着时间出现先上升后下降的趋势，但各组织中上调倍数最高峰的时间不同。研究结果表明，dfTβ基因参与了七彩神仙鱼受病原刺激后的免疫应答，且表达模式不同，表明其可能在不同组织、免疫的不同阶段发挥不同的作用。
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
张诚仪 陈再忠
运用聚丙烯酰胺垂直板凝胶电泳法,对七彩神仙鱼的8种组织(脑、皮肤、肌肉、肝脏、胰脏、鳃、眼球晶状体、心脏)中的9种酶类[酯酶(EST)、醇脱氢酶(ADH)、乳酸脱氢酶(LDH)、山梨醇脱氢酶(SDH)、过氧化物酶(POD)、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G-6-PD)和酪氨酸酶(COX)]进行了研究,并对其各组织中的同工酶位点及其酶谱表型进行了分析。试验中共检测到29个基因座位,分别由相应的等位基因决定。试验结果表明,七彩神仙鱼的9种同工酶系在各组织都显示出清晰稳定的酶谱,除CAT在七彩神仙鱼各组织和个体中表现一致以外,其它8种同工酶都存在明显的组织差...
关键词：
七彩神仙鱼 同工酶 组织差异
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
周建桥 欧阳明艳 温彬 陈再忠 高建忠
为了探究七彩神仙鱼体表黏液在繁殖周期中组分的变化规律，测定了七彩神仙鱼体表黏液中皮质醇、免疫球蛋白M、总蛋白、乳酸、葡萄糖的含量变化。结果表明，七彩神仙鱼体表黏液中皮质醇、免疫球蛋白M、总蛋白、乳酸、葡萄糖的含量均受亲鱼性别和繁殖时期显著影响（P<0.05），且繁殖时期与性别之间存在显著交互作用（P<0.05）。在幼鱼平游期，5种组分含量在雌雄亲鱼之间存在显著差异（P<0.05）。七彩神仙鱼开始“喂奶”后其体表黏液成份发生显著变化，尤其是雄鱼会分泌更多的营养与免疫组分来满足幼鱼需求。
关键词：
七彩神仙鱼 体表黏液 繁殖期 繁殖间期
[期刊] 水产学报
[作者]
宋雪璐 李小勤 陈再忠 王磊 还殿宇 冷向军
为研究叶黄素对七彩神仙鱼体色和生长的影响,在"牛心汉堡"饲料中分别添加0、50、100、200、300和400 mg/kg叶黄素,饲喂初始平均体质量(10.3±0.3)g的七彩神仙鱼8周。结果显示,添加叶黄素50200 mg/kg,对鱼体增重率无显著影响,但添加量达200 mg/kg后,饲料系数显著增大,添加量达300 mg/kg后,增重率显著降低。在养殖4周、8周时,鱼体皮肤亮度(L*)无显著变化,皮肤黄度(b*)和叶黄素含量随叶黄素添加量增加而显著升高;8周时,各叶黄素添加组的皮肤b*值和叶黄素含量显
关键词：
七彩神仙鱼 叶黄素 体色 生长
[期刊] 水产学报
[作者]
冯晓飒 温彬 刘君恒 张源 高建忠 陈再忠
为探讨微塑料和多环芳烃菲对七彩神仙鱼生长、能量存储、稳定同位素及生态化学计量学特征的影响，本研究设置了3个微塑料浓度（0、100、1000 μg/L）和2个菲水平（0、50μg/L），共6个暴露条件，进行8周的养殖实验。结果显示：1）幼鱼末体重未受微塑料和菲影响，但菲会降低肥满度，且二者对肝体指数有交互影响：50μg/L菲下100μg/L微塑料增加肝体指数，100μg/L微塑料下菲可提高肝体指数。2）幼鱼蛋白质含量随菲浓度升高而增加，粗脂肪和碳水化合物均受微塑料和菲交互影响：0μg/L菲下微塑料增加会提高粗脂肪水平，但会降低碳水化合物含量；1000μg/L微塑料下菲增加会降低粗脂肪含量，但会提高碳水化合物水平。3）幼鱼δ~(13)C随微塑料增加而降低，δ~(15)N受二者交互影响，但不同条件下无显著差异。4）微塑料会增加幼鱼C含量，菲则增加N水平，而P含量还受二者交互影响：0μg/L菲下100μg/L微塑料降低P水平，而50μg/L菲下1000μg/L微塑料降低P含量；100μg/L微塑料下菲增加会提高P水平，但1000μg/L微塑料下菲增加会降低P含量；幼鱼C/N受微塑料和菲单一暴露影响，而N/P和C/P还受二者交互影响。研究显示，微塑料和菲复合胁迫对七彩神仙鱼幼鱼生长和存活未造成显著影响，但可能会通过改变鱼体组织能量存储，导致其稳定同位素和生态化学计量学特征发生变化。该研究结果可为渔业水域微塑料和菲的生态风险评价提供科学依据。
[期刊] 上海水产大学学报
[作者]
刘晓东 陈再忠
观察了黄白、红点绿和红盖子七彩神仙鱼皮肤色素细胞的分布情况,并通过光谱、色谱和类胡萝卜素显色反应等方法分析了其皮肤类胡萝卜素的组成成分。黄白七彩神仙鱼体侧皮肤以黄色素细胞为主并有少量黑色素细胞,皮肤类胡萝卜素主要为黄体素;红盖子七彩神仙鱼体侧皮肤以红色素细胞和黄色素细胞为主,也有一定量的黑色素细胞和虹彩细胞;红点绿七彩神仙鱼在皮肤红色区又大量的红色素细胞、黄色素细胞和黑色素细胞,而在蓝条纹区有大量虹彩细胞和黑色素细胞。红点绿和红盖子七彩神仙鱼皮肤色素组成均为虾青素及其酯、角黄素、玉米黄素的酯及α-胡萝卜素。
[期刊] 水产学报
[作者]
朱建国 温彬 成果 高建忠 陈再忠
为探讨丁酸梭菌(Clostridium butyricum)对七彩神仙鱼(Symphysodon haraldi)生长、形体指标、营养利用和肠道结构功能的影响，在基础饵料中分别添加0(对照)、1×10~(4)、1×10~(5)、1×10~(6)、1×10~(7)、1×10~(8) cfu/g丁酸梭菌饲养幼鱼8周。结果显示，与对照组相比，丁酸梭菌对七彩神仙鱼生长和形体指标无显著影响。1×10~(5) cfu/g添加组鱼体粗蛋白含量增加，对蛋白质的消化率显著提高。丁酸梭菌显著提高了中肠肠道绒毛高度和宽度，且1×10~(5) cfu/g添加组肠道酸性黏多糖分泌量显著增加。对于肠道消化酶和抗氧化能力，1×10~(5) cfu/g添加组胰蛋白酶活性显著提高，1×10~(6) cfu/g添加组丙二醛含量显著降低。肠道内容物短链脂肪酸分析显示，1×10~(5) cfu/g添加组的乙酸和丙酸含量显著高于对照组，且总酸含量在该添加组达到最大显著高于其他组。研究表明，在本试验条件下，七彩神仙鱼饵料中添加1×10~(5) cfu/g丁酸梭菌可以改善肠道结构，提高肠道消化和抗氧化能力，增加肠道短链脂肪酸的分泌和营养利用率。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
陈段芬 彭镇华 高健
A new gene,named as NTZDS1(GenBank accession number:EU138882),was cloned from the alabastrum of Narcissus tazetta var.chinensis through RT-PCR.The sequence consists of 1 899 bp,has an open reading frame of 1 725 bp encoding a polypeptide of 574 amino acids.Homology analysis showed that the deduced N...
关键词：
中国水仙 ZDS基因 序列分析 组织表达
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
高志民 陈段芬 彭镇华
MADS-box基因在植物花发育中具有重要作用。采用RT-PCR和RACE技术,从中国水仙幼嫩花蕾中分离到了一个MADS-box同源基因,命名为NtMADS3(GenBank登记号:EU081900)。该基因cDNA全长980 bp;编码区编码241个氨基酸,具有典型的植物MADS-box基因结构。序列分析表明,NtMADS3编码的蛋白与其他植物的MADS-box蛋白有着较高的一致性,其中与石刁柏的AOM3一致性高达89.2%,与拟南芥的AGL6一致性为60.0%。系统进化树分析表明NtMADS3基因属于E类功能基因。组织表达模式分析显示,NtMADS3基因在中国水仙的开花期各器官及花的各部位...
[期刊] 水产学报
[作者]
唐宇飞 刘晓红 常馨月 吴海珍 张元兴
为了研究白三烯Ｂ＿４受体在斑马鱼发育和免疫中的功能，本实验利用ＲＡＣＥ技术克隆得到了斑马鱼白三烯Ｂ＿４受体样（ＢＬＴ１－ＬｉｋＥ）基因ＢＬＴ１－ＬｉｋＥ１和ＢＬＴ１－ＬｉｋＥ２的全长ＣＤＮＡ序列，其分别编码３３９和３５６个氨基酸。序列和结构分析发现，其编码的２个蛋白均属于Ｇ蛋白偶联受体家族视紫红质蛋白亚族，并具有典型的Ｇ蛋白偶联受体的特征，与人的ＢＬＴ１同源度达３１％以上。进一步将２个基因与绿色荧光蛋白融合表达，发现其具有较好的细胞膜定位功能；ＷＥｓＴＥＲＮ印迹检测也证实，重组表达细胞的全细胞蛋白可与人源ＢＬＴ１的多克隆抗体发生特异性相互作用。此外，荧光定量ＰＣＲ分析结果显示，在斑马鱼幼鱼发育．．．
关键词：
斑马鱼 BLT1 基因克隆 基因表达
[期刊] 中国水产科学
[作者]
陈玥 李家乐 沈玉帮
为了研究C1qC基因在草鱼(Ctenopharyngodon idella)免疫过程中所起的作用,利用RT-PCR和RACE方法克隆获得了C1qC基因cDNA全长序列,经序列分析表明,所克隆的C1qC cDNA全长为916 bp,包括开放阅读框(open reading frame,ORF)735 bp,5′端非编码区(untranslated region,UTR)89 bp和3′端非编码区(UTR)92 bp。735 bp的ORF共编码244个氨基酸,相对分子量为26 162.5 U。同源性分析表明,草鱼与斑马鱼(Danio rerio)的相似度最高,达到71%。经草鱼呼肠孤病毒(gras...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
苏建明 肖调义 张学文 陈韬 章怀云
采用快速扩增cDNA末端方法,获得1007bp草鱼MHCⅡα基因全长cDNA片段,序列包括717bp的开放阅读框、34bp的5′端非编码区以及256bp的3′端非编码区.氨基酸序列比对和同源性比较分析结果表明,草鱼MHCⅡα与鲤鱼MHCⅡα相似性最高,为79%,与斑马鱼的相似性为75%,与人的相似性最低,为34%.RT-PCR组织表达分析,MHCⅡα基因在正常草鱼组织中除了肌肉中没有扩增出MHCⅡα基因转录本外,在所检测的其他组织中都有不同程度的表达,其中脾脏、头肾有较强的表达,血液有中等程度的表达,肝脏、眼与肌肉相对表达较弱.
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
刘金梦 秦贝贝 黎航航 肖调义 苏建明
采用RT–PCR和cDNA末端快速扩增技术克隆草鱼(Ctenopharyngodon idellus) II型小肽转运载体(PepT2)基因全长cDNA序列，对其进行生物信息学和共线性分析，并采用实时荧光定量PCR技术检测分析健康草鱼PepT2基因在不同组织中的表达情况。结果表明：草鱼PepT2基因的cDNA序列全长为2733 bp，包括开放阅读框2169 bp(编码722个氨基酸残基)，5′非编码区82 bp和3′非编码区482 bp；草鱼PepT2基因结构含有20个外显子和19个内含子；预测蛋白相对分子质量为8.032×10~(4)，等电点为6.01，该蛋白具有与哺乳动物同源蛋白类似的12个螺旋跨膜结构，并且在跨膜区9和10之间有1个大的外环，跨膜区氨基酸高度保守，含有6个蛋白激酶C磷酸化位点和3个N–糖基化位点；预测的PepT2蛋白三级结构包含有18个α–螺旋和21个β–折叠；氨基酸序列同源性分析结果显示，草鱼PepT2氨基酸序列与斑马鱼(Danio rerio)的同源性最高，为86.65%，与其他所比较的物种的同源性则为52.83%～68.15%；系统进化树分析表明，草鱼与斑马鱼的亲缘关系最近；与斑马鱼相比，草鱼PepT2所在的染色体保留着大多数基因，具有保守的基因块；实时荧光定量表达分析表明，草鱼PepT2在肠道中表达量最高，其次是肾脏。
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