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[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
杜晓华 王得元 巩振辉
为了避开基于限制性酶切位点分子标记技术的DNA酶切环节,简化其复杂的程序,试验以辣椒为材料,建立了一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP),并对其反应体系进行了优化,对RSAP适用性、重复性进行了检验。结果显示,RSAP技术的引物为2条长度均为18 bp的引物,引物的3′端为4~6个碱基的限制性酶切位点序列,接着是12~14个碱基的随机序列,2条引物的限制性位点和随机序列不同;PCR扩增的前5个循环采用35℃的退火温度,随后的35个循环采用48℃的退火温度;在25μL反应体系中,模板DNA用量为20 ng,M g2+浓度为2.5 mm o l/L,dNTP s浓度为0.2 m...
[期刊] 林业科学
[作者]
魏令波 唐谦 郑先武 顾万春 李小兵
马尾松随机扩增多态性ＤＮＡ标记的分离研究魏令波，唐谦，郑先武，顾万春（中国林业科学研究院林业研究所北京１０００９１）李小兵（中国科学院遗传研究所植物生物技术开放实验室北京１０００１２）关键词马尾松，ＲＡＰＤ，Ｍｅｎｄｅｌｉａｎ分离随机扩增多态性ＤＮＡ...
关键词：
马尾松,RAPD,Mendelian分离
[期刊] 中国水产科学
[作者]
汪登强 危起伟 罗晓松 方耀林
使用长PCR技术扩增鲟形目(Acipenseriformes)15个种的核糖体DNA(rDNA)18S rRNA基因与28S rRNA基因之间约2.5 kb的片段,并用7个限制性内切酶对该片段进行限制性位点分析。结果显示,使用LATaqDNA聚合酶及GCBuffer结合长PCR技术能够很好地扩增鲟形目鱼类的rDNA。根据酶切图谱可确定93个限制性位点,其中21个为保守位点,72个多态信息位点。HhaⅠ酶切的带型在所有个体中完全一致,提示这些位点对保持rDNA的功能有重要作用。一些酶的酶切产物长度之和大于扩增产物的长度,暗示鲟形目鱼类个体内存在多个rDNA等位基因。对种间遗传距离进行计算,并构建...
关键词：
鲟形目 rDNA PCR 限制性位点
[期刊] 华北农学报
[作者]
胡秀荣 方良俊 陈晓 朱志凯 张鑫 詹聘芳
在盐胁迫下,经不同药物处理的水稻R6幼苗,提取RNA并反转录为cDNA后,对水稻P450基因cDNA序列扩增多态性进行分析。结果表明,不同药物处理的水稻R6幼苗形态特征明显;药物环孢素(CsA)处理的水稻细胞色素P450基因CYP709(NM-001066006)缺失430 bp条带,可能是NM-001066006基因与NM-001066009基因的外显子选择性剪接所致,从而表现出功能基因扩增多态性。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
伍玲 李平 刘熔山
以小麦、玉米、小米、高粱、狼尾草五个不同属的材料为外源ＤＮＡ供体，经减压渗透转导受体紫稻，从获得的变异材料中各选一份进行了随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分析。共用２０个随机引物，其中６个引物扩增出了有差异的多态性ＤＮＡ片段，１个引物可以区分受体材料与变异材料及变异材料间的差异。在以材料两两间的相似率进行的聚类分析中，发现聚类结果与材料变异性状一致，变异材料与受体材料间相似率高达９０．７％，认为变异材料为受体材料在“减压渗透”处理后的真实变异；ＲＡＰＤｓ是检测材料间差异的有效方法。
[期刊] 华北农学报
[作者]
蒋建平 杨懋勋 黄永芳
本研究选择了中国广东省7个有代表性的山区作为野百合(Lilium brownii F.E.Brown ex Miellez)天然居群的采样点,对采集到的199份样品进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,以建立野百合天然居群RAPD分析方法体系以便后续研究,并了解广东省野百合天然居群多态性情况和居群内外个体及野百合及变种百合样品的聚类情况。以新鲜叶片、硅胶干燥叶片及鳞片为材料分别提取DNA,从273条10聚寡核苷酸随机引物中筛选出20条随机引物,对7个居群共199个野百合及百合样品进行RAPD扩增。共检测到433条RAPD谱带,其中多态性条带为430条,所有个体的多态性条带百分率(PPB)...
[期刊] 水产学报
[作者]
李晓静 孔杰 王伟继 孟宪红 田燚 孟鹏 毛连菊
为评估DNA随机扩增多态性标记在中国对虾遗传连锁图谱构建中的应用前景,利用中国对虾单对交配亲本及其子二代材料,对RAPD标记及其遗传规律进行了研究。22条RAPD随机引物扩增结果的统计分析表明,标记在中国对虾F2的遗传规律可归为不分离标记和分离标记:不分离标记,指在亲本和后代中均不分离的标记,占总位点的54.1%;分离标记占总位点的45.9%。其中,分离标记又包括符合孟德尔遗传分离的标记、偏离孟德尔遗传分离标记和异常分离标记。符合孟德尔分离的标记中,分离比例为3∶1的标记占分离标记的14.7%;总的1∶1标记占分离标记的64.7%;偏离孟德尔分离和异常分离的标记分别占分离标记的11.7%和8....
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
郭晓令 姜志华 刘红林 黄月英
采用纯种大约克和纯种二花脸猪血样提取基因组ＤＮＡ，分别用１１种限制性内切酶消化，以非放射性狄高辛试剂盒标记４．８ｋｂ２１－羟化酶（ＣＹＰ２１）基因为探针，经Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交对猪的ＣＹＰ２１基因位点的限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰｓ）进行了研究。结果在ＢａｎⅠ、ＨｉｎｄⅢ、ＫｐｎⅠ、ＰｓｔⅠ和ＴａｑⅠ５种限制性内切酶位点检测出了ＲＦＬＰｓ，且ＢａｎⅠ和ＫｐｎⅠ酶切位点的多态性为首次发现；而在其他６种酶切位点（ＡｐａⅠ、ＢａｍＨⅠ、ＤｒａⅠ、ＥｃｏＲⅠ、ＳｃａⅠ、ＸｂａⅠ）没有发现ＲＦＬＰｓ。用上述５种发现ＲＦＬＰｓ的限制酶对无亲缘关系的１２头大约克和１２头二花脸猪进行ＲＦＬＰｓ分析，各限制酶...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
郝家胜 周开亚
用 40个 10 寡核苷酸随机引物对中国鹅的 5个品种———狮头鹅、皖西白鹅、太湖鹅、浙东白鹅和四川白鹅进行了随机扩增多态DNA (RAPD)分析。结果表明 ,用筛选出的 14个引物共扩增出 174个DNA片段 ,其中的 48个 (占2 8 2 % )在 5个品种间表现为多态性。根据扩增DNA片段的异同 ,计算了各品种和个体间的遗传多样性指数和遗传距离指数。同时 ,用分子进化遗传分析软件 (MEGA)以UPGMA法和NJ法对遗传距离指数进行了聚类分析。结果显示 ,中国鹅 5品种间的遗传分化可能与人工选择密切相关 ,而和地理分布没有明显的关联。
[期刊] 水产学报
[作者]
张锡元 张德春 杨代淑 邓凤姣 余来宁 方耀林
运用４０个１０碱基随机引物对长江中游鲢的遗传多样性进行了随机扩增多态ＤＮＡ （ＲＡＰＤ）分析。所用引物中，能在鲢不同个体基因组中扩增出多态ＤＮＡ带的有１０个，占总引物数 的 ２５％．据ＲＡＰＤ带型分析，所取长江鲢自然群体的 １８条样品中，每两个体相比较的遗 传相似度在０．９２８５至０．９７８８之间，平均值为０．９５４３；遗传变异度则在０．０２１２至０．０７１５之 间，平均值为０．０４７２５；群体Ｓｈａｎｎｏｎ表型多样性指数（Ｈｏ）为８．８６１５，Ｓｈａｎｎｏｎ多样性值（Ｈ）为０．０６２４。 讨论了这些数据所反映的长江鲢遗传多样性和鱼类种质资源评价问题。
关键词：
鲢 随机扩增多态DNA 遗传多样性 长江
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
曹少先 杨利国 赵文魁 张兆柏 姜勋平 茆达干
应用 19个波尔山羊个体间多态性较强、重复性好的随机引物对 2 0只 5～ 6月龄波尔山羊公羊组织样DNA进行扩增 ,共得到 15 6个标记 ,其中可变标记 47个。t检验表明 ,OPE 15 .1阳性组腰角宽显著高于阴性组 ,OPH 15 .8、OPE 15 .4阳性组臀端宽显著高于阴性组 ;而OPH 13 .6、OPH 13.8等标记阴性组多个体尺、体重性状显著高于阳性组。这说明这些标记与特定性状可能存在相关 ,其遗传基础可能是该标记与控制性状的QTL或主基因连锁。
[期刊] 林业科学
[作者]
程东升 梁惠燕 薛煜 潘学仁 李武汉
用ＲＡＰＤ手段分析了我国３种松干锈菌Ｃｒｏｎａｒｔｉｕｍｒｉｂｉｃｏｌａ、Ｃ．ｆｌａｃｃｉｄｕｍ及Ｃ．ｑｕｅｒｃｕｕｍ在ＤＮＡ水平上的遗传分化。用５个随机引物从１０个菌株（含１个不同属参照菌株）中检测出５１个多态ＤＮＡ片段进行聚类分析，３种锈菌清晰地显示为不同类群，此结果为传统分类的成立提供了分子遗传学证据。３种锈菌中Ｃ．ｒｉｂｉｃｏｌａ和Ｃ．ｆｌａｃｉｄｕｍ的亲缘关系较近，这同由症状和冬孢子寄主反映出的相似关系一致。种内菌株间存在遗传差异，但其程度小于种间差异。锈孢子及冬孢子寄主都不同的Ｃ．ｆｌａｃｉｄｕｍ菌株间差异明显，可能反映着专化型分化的遗传学基础。不同松树寄主的Ｃ．ｑｕｅｒｃｕｕｍ菌...
[期刊] 浙江林学院学报
[作者]
沈俊岭 倪慧群 陈晓阳 黄少伟
采用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记对中国6省(区)及印度尼西亚共8个麻疯树Jatropha curcas种源样本进行研究,旨在阐明麻疯树种源间的遗传关系和遗传多样性。结果表明:麻疯树相关序列扩增多态性-聚合酶链式反应(SRAP-PCR)最佳反应体系为:10×PCR buffer2μL,DNA模板20ng,Taq酶16.67nkat,Mg2+2.50mmol·L-1,三磷酸脱氧核苷酸(dNTP)120.00μmol·L-1,引物0.15μmol·L-1,总体积为20μL;并从274对引物中选出具有多态性的45对引物,共检测出500条清晰的条带,其中多态性条带141条,占总条带数的28.2...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
苟本富
采用单酶切和双酶切AFLP技术分别对5种不同蔷薇品种基因组DNA的遗传多态性进行了检测,比较了2种方法的多态性比率。单酶切采用10条人工设计的与接头序列相识别的AFLP选择性引物,用PstⅠ酶切,共获得108个AFLP标记,片段大小在100~2000 bp,得到33个多态位点,多态性位点百分率为30.56%;双酶切采用25对双酶切AFLP引物,在50~600 bp扩增出清晰条带658条,得到182个多态位点,占总扩增带的27.6%。对多态性片段进行统计,计算出不同品种间的相似系数和遗传距离。结果表明:硕苞蔷薇同其它4种蔷薇的遗传距离偏远,且其它四种蔷薇的遗传距离均较近,这与蔷薇品种来源和培育史...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
于晓英 吴铁明 彭尽晖 吕长平 张宏志 丁江南
为了获得萱草清晰的 AFL P指纹图谱并进一步进行萱草种质资源的鉴别与分类研究 ,以大花萱草为试材 ,用改进后的 SDS法和 CTAB法 ,从萱草的幼叶、成熟叶、新根等部位提取 DNA.结果表明 ,用这两种方法均可从萱草的幼叶、成熟叶、新根中获得高分子量基因组 DNA和 AFL P指纹图谱 ,其中以幼叶的 DNA产量和品质最好 ,CTAB法提取的 DNA纯度较高且程序简单
关键词：
萱草 扩增片段长度多态性 脱氧核糖核酸
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