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[期刊] 实验技术与管理
[作者]
程红 严定策 宋武林 孔翦 曾艳
圆二色(CD)光谱是一种广泛使用的测量蛋白质结构和构象变化的方法,可以提供除其他生物物理、化学和结构生物学技术以外的辅助结构信息。为了评价各实验室间CD测量结果的准确性,由教育部高等学校科学研究发展中心、国家计量认证高校评审组组织,华中科技大学分析测试中心承担并负责实施了2022年度高校实验室间比对项目“α-螺旋主导蛋白质的圆二色光谱测定”,项目以一种α-螺旋为主导的蛋白质(细胞色素C)在波长222 nm处的圆二色值作为考核参数,共有来自12个国内高校测试平台和科研院所的实验室参加了此次比对活动。通过基于经典统计法对比对数据的统计分析,表明各参加实验室测量结果偏差均在可接受范围之内,有效验证了不同实验室间进行CD光谱测量的可比性和可靠性。
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
王一然 丁瑞雪 耿丽娟 刘显琦 毛晋春 杨梅 陈旭 武俊瑞
巴氏杀菌乳因最大限度地保留了乳的营养物质和风味,深受国内外消费者的普遍青睐,然而,因其杀菌温度低、货架期很短,大大限制了大规模生产、远距离销售。其中,在贮运期间发生的蛋白质腐败性变质,是导致巴氏杀菌乳在贮运期间品质劣变的主要原因之一。在前期研究的基础上,结合蛋白质含量与氨基酸含量的分析,利用傅里叶变换红外光谱技术(FT-IR)分别对采集的不同贮藏温度和时间条件下的巴氏杀菌乳样品的蛋白质二级结构进行测定,并对不同巴氏杀菌乳样品的蛋白及其酰胺Ⅰ带及酰胺Ⅲ带进行了拟合,对不同贮藏温度和时间条件下的巴氏杀菌乳的蛋白质二级结构的变化规律进行进一步研究。结果表明:贮藏温度和时间对巴氏杀菌乳中蛋白质二级结构具有显著的影响,其中,在0℃和4℃贮藏条件下,巴氏杀菌乳乳清蛋白中的α-螺旋结构所占比例显著降低,无规卷曲结构所占比例显著上升,β-折叠、β-转角结构所占比例趋于稳定。而在15℃和25℃贮藏条件下α-螺旋结构的比例先下降后上升,总体来看,乳清蛋白二级结构随着贮藏时间的增加,由有序向无序转变。该结果表明了在不同贮藏条件下巴氏杀菌乳中蛋白质二级结构由有序向无序变化,二级结构的变化降低了巴氏杀菌乳在贮藏期间的营养价值。从蛋白质二级结构的角度来看,4℃的贮藏条件能更好保持巴氏杀菌乳的营养品质。
关键词:
FT-IR 蛋白质二级结构 巴氏杀菌乳
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘海静 孙素琴 李安 哈益明
【目的】利用红外光谱技术分析天然螺旋藻、螺旋藻粉和螺旋藻片的主要成分,为螺旋藻相关产品品质检测和真伪鉴别提供一种快速、准确和有效的方法。【方法】采集2种天然螺旋藻、4种螺旋藻粉和4种螺旋藻片的红外光谱(FTIR),解析样品的红外光谱、二阶导数光谱和二维相关光谱确定出主要吸收官能团,主体成分以及不同样品之间的差异。通过扫描电镜图像(SEM)、样品蛋白质含量和氨基酸组成的测定结果对红外光谱中的差异进行说明。【结果】天然螺旋藻的红外光谱在1 154/1 156 cm-1、1 079 cm-1和1 039/1 035 cm-1出现3个糖类特征吸收峰;二维相关红外光谱在1 161、1 138、1 083...
关键词:
螺旋藻 FTIR 糖 蛋白质
[期刊] 中国农业科学
[作者]
魏良明 严衍禄 戴景瑞
以128份常用普通玉米自交系及杂交种的混合籽粒样品为材料,采用偏最小二乘(PLS)回归法,对近红外反射光谱(NIRS)测定玉米完整籽粒蛋白质、淀粉含量的可行性和方法进行了研究。结果表明,采用一阶导数+多元散射校正预处理、谱区为10000~4000cm-1和一阶导数+直线扣减预处理、谱区为9000~4000cm-1,分别建立的蛋白质、淀粉含量的校正模型,其校正和预测效果最佳。其校正决定系数(R2cal)均大于0.97,交叉验证和外部验证决定系数(R2cv、R2val)为0.92~0.95,各项误差(RMSEE、RMSECV和RMSEP)均小于1(0.3~0.7之间)。在玉米品质改良实践中,利用近...
[期刊] 实验技术与管理
[作者]
刘吕丹 白玉霞 丁延伟
热分析技术在矿物、金属、石油、食品、医药、化工等与材料相关的领域中应用日益广泛。由于热分析技术的影响因素众多,因此缺乏统一的标准物质对仪器进行校准,造成实验室难以建立测量结果的溯源机制,无法把握结果的准确度。通过实验室间比对可以有效确定实验室的检测能力,保证实验数据准确。该文以中国科学院实验室间比对项目“热重法测定未知物的热分解百分比”的实施为例,通过分析比对数据的统计结果,发现比对结果一致性良好,各参比实验室测量结果偏差均在可接受范围内,验证了实验室间比对方法在热分析技术中应用的适用性和可靠性。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李栓明 郭银巧 王克如 谢瑞芝 戴建国 肖春华 李静 李少昆
【目的】筛选整粒小麦籽粒蛋白质的近红外特征光谱波段并建立优化模型,可实现快速、无损测定整粒小麦籽粒蛋白质含量,为田间便携式小麦籽粒蛋白质含量速测仪设计提供依据。【方法】2012—2013年以蛋白质含量有明显差异的8个冬小麦品种为试验品种,设置3个施氮量和2个灌溉量共6个处理,建立丰富的样本类型,共采集176个小麦籽粒光谱数据;将ASD Field Spec Pro光谱仪采集到的基于全反射下垫面的整粒小麦籽粒反射光谱通过公式A=log(1/R)转换为吸收光谱,对吸收光谱采用S-G平滑、多元散射校正和基线校正等方法进行预处理,以消除背景噪声,然后采用交叉验证偏最小二乘回归方法进行特征波段压缩;分析...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
周桂 邹成林 丘立杭 黄丽萍 杨丽涛 李杨瑞
以甘蔗品种ROC22为材料,采用含100 g/L聚乙二醇(PEG)6000的Hoagland营养液模拟干旱胁迫处理,SDS-PAGE电泳技术分析干旱胁迫对甘蔗幼苗根系蛋白质的影响。结果表明:与对照相比,24 h胁迫过程中稳定存在的新增蛋白条带为44.5 ku,可能是应答干旱胁迫的主要新增调节蛋白;57.1和29.0 ku蛋白条带在24 h处理期间相对表达量变化活跃,胁迫初期57.1 ku蛋白条带显著增加,29.0 ku蛋白条带显著下降,胁迫过程中出现起伏变化;而62.7、40.4与48.2 ku蛋白条带在PEG胁迫早期相当长时间保持稳定,后期才出现显著增加与下降;PEG胁迫14 h处理蛋白质条...
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
张新玉 王颖杰 刘若西 申兵辉 王皎月 严衍禄 康定明
为探索应用近红外光谱技术检测玉米单籽粒蛋白质含量,本研究采用JDSU近红外光谱检测仪采集了205份不同基因型玉米材料的单籽粒光谱值,用常规化学法测定玉米单籽粒蛋白质含量化学值,以117个样本为建模集,拟合了玉米单籽粒近红外光谱仪扫描得到的光谱图与玉米单籽粒蛋白质含量化学值之间的相互关系,用88个样本作预测集,比较了偏最小二乘回归法(PLSR)和支持向量机回归法(SVR)2种预测模型的效果。结果表明,玉米单籽粒种子的蛋白质含量在样本中变异范围为3.48%18.15%,平均值为10.17%。偏最小二乘回归法(
关键词:
玉米单籽粒 蛋白质含量 近红外 定量分析
[期刊] 淡水渔业
[作者]
陈孝宇 陈鑫 王津津 范引光 曾宪东 郑剑
鲤浮肿病(carp edema virus disease,CEVD)是在锦鲤中发现的一种传染性病毒病,近年来在全球传播迅速,对鲤养殖业造成严重损害。本研究设计CEV环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)引物,进行特异性实验;选取套式PCR、荧光PCR和LAMP三种检测方法,组织10家实验室进行室间比对测试:制备含CEV病毒核酸的测试样品,评价其均匀性和稳定性,通过测试结果分析方法检出限。结果显示,套式PCR的核酸样品检测限可达6.8×10~(-10) g。
[期刊] 统计与决策
[作者]
黎莎
统计局甄局长给贾县长送来了《全县农业经济指标年报》。贾县长看罢,疑惑地问道;"哎,老甄,这些数字恐怕有出入吧?""都是计算机计算汇总。"贾县长说:"也不能迷信计算机嘛。比如粮食产量这个数字,我看就有问题。去年还是两亿出头,今年怎么连一亿还不到呢?""因为今?..
[期刊] 实验技术与管理
[作者]
雷敏 刘斌 阮梅林 罗云
分子量是蛋白质的重要特征参数,准确测定蛋白质分子量对研究蛋白质结构与功能具有重要意义。该文以牛血清蛋白(BSA)和人血清免疫球蛋白(IgG)为研究对象,采用分析超速离心-沉降速率法(AUC-SV)测定2种蛋白的分子量,并系统研究了样品初始浓度、离心转速、离心时间、离心温度、样品上样体积和缓冲液体系等实验条件对测定结果的影响。结果表明:离心转速为20 000~40 000 r/min时,影响不明显,样品初始浓度、离心时间、离心温度、缓冲液体系的适宜范围较宽,样品上样体积对测定结果的影响显著。在优化的实验条件下,测得未知蛋白的分子量为39.9 kDa,与质谱法测定结果(40.0 kDa)一致。该方法具有适宜条件范围宽、非破坏性、无需标准品和普适性高等优点,适用于未知蛋白分子量的测定。此外,相关研究结论还可供AUC-SV初学者学习借鉴。
关键词:
分析超速离心 沉降速率 蛋白质分子量
[期刊] 中国农业科学
[作者]
周桂盈 杨晓敏 滕子文 孙丽娟 郑长英
【目的】前期研究发现,螺虫乙酯处理西花蓟马(Frankliniella occidentalis)0 h卵24 h后,造成卵壳破裂从而抑制卵孵化出若虫。本研究旨在探究螺虫乙酯处理西花蓟马0 h卵24 h后引起卵形态结构发生变化的原因,寻找螺虫乙酯抑制西花蓟马0 h卵孵化的关键蛋白,揭示螺虫乙酯抑制西花蓟马卵孵化的分子机制。【方法】以西花蓟马0 h卵为研究对象,使用浓度为14.42 mg·L~(-1)的螺虫乙酯处理24 h后,采用无标记定量(Label-free)蛋白质组学技术分析螺虫乙酯处理组与对照组之间的差异表达蛋白。利用Gene Ontology(GO)富集分析和KEGG通路分析对筛选出的差异表达蛋白进行功能注释和通路分析等生物信息学分析,并通过平行反应监测(PRM)技术验证差异蛋白的表达量。【结果】螺虫乙酯处理后共有204个蛋白差异表达,其中124个蛋白表达量上调,80个蛋白表达量下调。生物信息学分析表明,上调的差异表达蛋白主要参与物质合成和代谢通路,下调的差异表达蛋白主要参与对外界刺激的防御反应通路。此外,利用PRM技术对差异表达蛋白进行鉴定,结果表明螺虫乙酯处理西花蓟马0 h卵24 h后,三磷酸鸟苷环水解酶1-1、三磷酸鸟苷环水解酶1-2、类谷胱甘肽硫-转移酶、脂酰辅酶A还原酶蛋白表达量显著上调,西花蓟马卵的类内表皮结构糖蛋白SgAbd-2、类铜/锌-超氧化物歧化酶、O-乙酰基转移酶蛋白表达量显著下调,且类内表皮结构糖蛋白SgAbd-2表达量下调最为明显。PRM技术验证结果与蛋白质组学的结果一致。【结论】上述蛋白可能在西花蓟马卵孵化过程中发挥多种功能,其中类内表皮结构糖蛋白SgAbd-2与昆虫表皮分化等生命活动相关,推测螺虫乙酯抑制了类内表皮结构糖蛋白SgAbd-2的表达,从而造成西花蓟马0 h卵出现卵壳破裂的现象,类内表皮结构糖蛋白SgAbd-2可能在西花蓟马0 h卵孵化的过程中发挥重要作用。
关键词:
西花蓟马 螺虫乙酯 卵 蛋白质组学 孵化
[期刊] 实验技术与管理
[作者]
尹燕霞 佟丽 李小蒙 向本琼
对分子筛层析实验进行改革,优化分子筛层析分离标准蛋白的实验条件、建立良好的标准曲线。以分子筛Sephacryl S-200 HR作为层析填料,对蛋白、蛋白浓度、样品上样量、上样顺序、流速等关键因素和环节进行了摸索,通过实验条件的筛选和优化获得了线性关系较好的标准曲线和洗脱峰图谱。该方法具有较高的分辨率和重复性,为进一步研究层析技术奠定了基础,在本科生的实验教学中取得了良好教学效果。
关键词:
分子筛层析 标准曲线 实验教学
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
彭卫民 商树田 傅友兰 刘国琴
采用羟基磷灰石柱层析法对钝顶螺旋藻藻胆蛋白粗提液进行纯化,得到藻蓝蛋白(PC)和别藻蓝蛋白(APC)纯化液。用紫外-可见分光光度计测得 PC 和 APC 的最大可见吸收峰分别在620nm 和650nm 处;用荧光分光光度计测得它们的室温荧光发射峰分别在645nm 和656nm 处。经12%SDS-PAGE 法分析,PC由α和β两个亚基组成,其分子量分别为16.3kD 和18.9kD;APC 也由α和β两个亚基组成,其分子量分别为15.0kD 和16.9kD。用高效液相色谱仪(HPLC)对 PC 和 APC 的氨基酸组成作了测定,发现二者的氨基酸组成比较相似。
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
李湘河 徐静雯 赵勇
本研究旨在利用4种提取方法[振荡提取(OE)、高速匀浆提取(HHE)、超声提取(UE)和反复冻融提取(RFE)]从螺旋藻中提取C-藻蓝蛋白并对其结构、理化性质、功能特性和抗氧化活性进行研究 。研究表明,4种提取方法所得C-藻蓝蛋白纯度都达到了试剂级标准,其中反复冻融和高速匀浆方法提取得到的C-藻蓝蛋白具有较高的纯度分别达到了2.68和2.37。红外光谱分析显示,反复冻融得到的C-藻蓝蛋白α-螺旋含量最高,说明其二级结构最稳定。C-藻蓝蛋白的功能特性研究表明,其溶解度、乳化能力、起泡能力、持水性、持油性、最低凝胶浓度和表面疏水性,均表现为反复冻融提取>高速匀浆提取>超声提取>振荡提取(P≤0.05)。由SDS-PAGE图谱可知,所有提取方法得到的C-藻蓝蛋白均包含α和β两个螺旋亚基。抗氧化实验结果显示,C-藻蓝蛋白具有较强的抗氧化特性,4种提取方式所得C-藻蓝蛋白清除DPPH和ABTS自由基能力表现为反复冻融提取>高速匀浆提取>超声提取>振荡提取。综上所述,反复冻融提取的C-藻蓝蛋白纯度最高,二级结构最稳定,具有最佳的功能特性包括了溶解度、乳化能力、起泡能力、持水性、持油性、最低凝胶浓度和表面疏水性,同时具有较强的抗氧化性,这些研究结果对拓展C-藻蓝蛋白在食品、医药和化妆品等应用提供理论和研究基础。
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