【摘要】本文基于我国六大育种地区的面板数据,运用个体固定效应模型实证分析了我国公共科研部门育种创新与R&D投入的问题。结果表明,公共科研部门育种科研经费R&D投入对育种创新的作用在滞后期为2年后几乎消失,育种回报周期短;公共科研部门育种科研经费R&D投入比例失调,基础研究对育种创新的消极性影响将显现,应用研究投入当期及试验发展投入滞后二期对育种创新产出见效快。本文还发现,以山东、河南、四川为代表的农业大省由于自身农业资源优势,育种科研经费R&D投入对育种创新的产出作用不如江苏、吉林等经济发达地区;扩大育种经费R&D投入的规模将对全国育种创新水平的提高有积极作用。