【摘要】就新型农村合作医疗基金管理而言,存在基金安全问题及其不合理使用问题。对内部控制理论应用于新型农村合作医疗基金管理进行分析,认为二者目标一致,并且目前开展的基金管理工作体现了内部控制的内容,可以尝试将内部控制理论应用于新型农村合作医疗基金管理工作中,以保障新型农村合作医疗基金安全、促进基金合理使用并改善参合农民受益程度。