【摘要】利用2006—2012年中国65所教育部直属高校的面板数据,在考虑高校科研经费投入强度差异的情况下,利用门槛面板模型对高校科研经费配置结构与科研绩效的关系进行了实证研究。研究结果显示:科研经费配置结构与科研绩效之间会因高校科研经费投入强度的不同而呈现出显著的区间效应,表现为投入强度较低时科研经费配置结构与科研绩效正相关但不显著,投入强度中等和较高时两者显著正相关。最后从整体与个体、纵向与横向、监管与激励3个关系层面提出了相关政策建议。