半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)sox基因家族生物信息学分析
2016-04-25分类号:S917.4
【部门】南京农业大学无锡渔业学院 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 中国海洋大学水产学院
【摘要】Sox(SRY-Related HMG-box)基因家族是在动物体内发现的一类编码转录因子的基因家族,广泛参与了动物生长发育、理化反应,特别是性别决定和分化等过程。本研究采用生物信息学方法,利用Sox基因高度保守的HMG-box区序列作为种子序列,检索半滑舌鳎(CYnoGloSSuS SeMilaeviS)基因组注释的蛋白数据库,共鉴定分离出23个Sox基因。并在全基因组水平对半滑舌鳎Sox基因家族进行了保守结构域序列、进化、基因结构、染色体定位及基因表达模式的系统分析。结果显示,通过保守结构域分析发现了半滑舌鳎Sox基因家族除CSe Sox32外,皆存在一段9个氨基酸残基(RPMnaFMvW...
【关键词】Sox基因 HMG结构域 半滑舌鳎 生物信息学
【基金】国家自然科学基金项目(31130057); 山东省自然科学基金(ZR2014CP011); 山东省农业良种工程重大课题; 泰山学者攀登计划专项共同资助
【所属期刊栏目】渔业科学进展
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