林麝粪便细菌多样性研究
2016-02-15分类号:S858.94
【部门】四川农业大学动物营养研究所/动物抗病营养教育部重点实验室 四川省养麝研究所
【摘要】为研究林麝粪便细菌的结构与组成,选取6只2~3岁的圈养条件相同且健康的公林麝,饲喂精粗比为2∶8的饲粮,收集其新鲜粪便,提取其总DNA,然后用16SrrNA细菌通用引物进行PCr扩增,并用IllumINA mISeq250Pe测序平台,对扩增子进行mISeq双端测序。结果显示:1)借助IllumINA mISeq250Pe测序平台对样品进行测序,共获得85 091条有效序列,5 133个有效OTu。2)所得OTu经物种注释被归类为23个门,其中厚壁菌门(FIrmICuTeS)(51.1%±19.9%)、拟杆菌门(BACTerOIDeTeS)(35.6%±15.5%)、变形菌门(PrOTeOBA...
【关键词】林麝 菌群结构 OTU稀释曲线 共享菌群
【基金】四川省科技厅国际合作项目(2013HH0043)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
文献传递