嗜水气单胞菌AH10(CCTCC AB2014155)的全基因组测序及比较分析
2016-09-15分类号：S941.4
【部门】国家水生动物病原库农业部淡水水产种质资源利用重点实验室上海海洋大学水产与生命学院 淡水水产健康养殖湖北省协同创新中心
【摘要】为了解嗜水气单胞菌全基因组信息的结构和功能，对嗜水气单胞菌（ＡｅｒｏｍｏｎＡｓ ｈｙｄｒｏｐｈｉｌＡ）Ａｈ１０（ＣＣＴＣＣ保藏号：ＡＢ２０１４１５５）进行了全基因组测序。将提取的Ａｈ１０全基因组ｄｎＡ进行片段化、构建文库后上机测序；将基因组组装后进行注释和比较分析。结果显示：Ａｈ１０全基因组序列总长度为４．９１ ｍＢ，ＧＣ含量为６１．１％，共预测到４５７０个基因，３３５１个基因具有明确的生物学功能。共找到２５９２个基因具有直系同源族（ＣｌｕｓＴｅｒ ｏｆ ｏｒＴｈｏｌｏＧｏｕｓ Ｇｒｏｕｐｓ，ＣｏＧ）分类，１２８１个与代谢通路有关的基因，基因组岛３１个。比较基因组学研究发现：Ａｈ１０比对到ｓｎ．．．
【关键词】嗜水气单胞菌 基因组测序 基因 比较分析
【基金】现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-46-12)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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