【摘要】以莆田黑鸭为材料，对其主要组织相容性复合体（ＭＨＣ）Ⅰ基因外显子２进行ＰＣＲ扩增和ＤＮＡ测序，分析其遗传多态性及变异特征，为进一步寻求抗病分子提供依据．结果表明，莆田黑鸭ＭＨＣⅠ基因外显子２处有丰富的遗传多态性，核苷酸变异以颠换为主，同义替换率大于非同义替换率，总ＧＣ含量较高，为５９％，其中，密码子第３位的ＧＣ含量最高，为８２．７％．莆田黑鸭ＭＨＣⅠ基因外显子２编码的氨基酸有明显的疏水性，对维持ＭＨＣ分子的结构和功能具有重要作用．聚类分析结果表明，禽类分支中，莆田黑鸭与家鹅的亲缘关系较近，与鸡的亲缘关系较远．