利用IllumIna mISeq测序平台分析肉鸡盲肠微生物多样性
2016-12-15分类号:S831
【部门】四川农业大学动物医学院/动物微生态研究中心/动物疫病与人类健康四川省重点实验室
【摘要】为对肉鸡盲肠微生物的多样性进行探索,选取15只饲养在相同条件下的科宝-500肉鸡,利用IllumIna mISeq测序平台与qIIme等16Srrna序列分析工具在22日龄时采集盲肠内容物进行研究。结果显示:1)测序共获得359 158条有效序列与3 210个OTu,并且由稀释曲线可以证明此次测序结果比较全面的覆盖了肉鸡盲肠微生物群落。2)各样品菌群之间存在差异,得到序列的数量以及菌群多样性差别较大。3)通过核心菌群分析可知,4个共享菌群在门水平上分别为:拟杆菌门BacTerOIdeTeS(70.0%±12.1%)、厚壁菌门FIrmIcuTeS(25.4%±11.2%)、变形菌门PrOTeOB...
【关键词】肉鸡 盲肠 微生物 核心菌群 Illumina MiSeq测序 PICRUSt分析
【基金】四川省科技厅国际合作项目(2013HH0055)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
文献传递