鱼类环境DNA研究中通用引物的筛选验证
2016-01-15分类号：S917.4
【部门】上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室
【摘要】为了筛选一个通用性和适用性良好的能够运用于环境ＤＮＡ（ｅＤＮＡ）研究的鱼类引物，从相关文献中选取了鱼类线粒体基因组部分片段的５对引物，分别对线粒体Ｄ－ｌｏｏｐ区、１６Ｓ ｒｒＮＡ基因、ＣｏＩ基因以及Ｃｙｔｂ基因部分片段进行扩增。对千岛湖４８种鱼类基因组ＤＮＡ进行扩增后比较发现，引物１６Ｓ和ＣｏＩ均可以取得良好的扩增效果，通用性优于其他几对引物。引物１６Ｓ的扩增产物经凝胶电泳检测均出现明亮的目的条带，引物ＣｏＩ则有３种鱼的条带经凝胶电泳检测亮度较暗。利用上述引物对环境样品ｅＤＮＡ扩增时发现，只有１６Ｓ和ＣｏＩ的引物具有良好的扩增效果，能够得到明显单一的亮带。对该两种引物的ｐＣｒ产物克隆后测序比对．．．
【关键词】引物筛选 线粒体标记 环境DNA 千岛湖
【基金】公益性行业(农业)专项“湖泊水库养殖容量及生态增养殖技术研究与示范”(201303056); 教育部博士点基金项目(20123104110002); 上海市高校知识服务平台项目(ZF1206)
【所属期刊栏目】淡水渔业
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