葡萄牙牡蛎外套膜转录组测序及壳色基因挖掘
2016-08-25分类号：S917.4
【部门】湖南农业大学动物科学技术学院 水产高效健康生产湖南省协同创新中心 福建省水产研究所
【摘要】采用ＩｌｌｕｍＩｎａ高通量测序平台对黑壳与金壳葡萄牙牡蛎（Ｃｒａｓｓｏｓｔｒｅａ ａｎｇｕｌａｔａ）外套膜组织开展转录组测序研究，其中黑壳组总计产出５ ８５７ ７１８ ０９２ ｎｔ数据，筛选后的干净阅读子５８ ００４ ５６０个；金壳组产出６ ７２７ ４４７ ３２６ ｎｔ数据，干净阅读子６６ ６１４ ８５４个。将发掘的新基因与Ｃｏｇ、ｇｏ、Ｋｅｇｇ、ｓｗＩｓｓ－Ｐｒｏｔ、ｎｒ数据库进行序列比对，最终得到各数据库注释的新基因数量分别为１４７、３９７、２０３、５６７、１ ３４７个。通过对差异表达基因的序列进行生物学功能注释和聚类分析以及利用已知贝壳基质蛋白序列进行搜索，鉴定出１４条可能与壳色表达有关．．．
【关键词】葡萄牙牡蛎 壳色 转录组
【基金】现代农业产业技术体系建设专项(CARS–48); 福建省种业工程项目(201451477–9); 福建省属公益类科研院所基本科研专项(2015R1003–8)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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