细粒棘球蚴RTN4基因的克隆及序列分析
2016-02-02分类号：S852.734
【部门】石河子大学动物科技学院 中国农业科学院兰州兽医研究所
【摘要】【目的】克隆细粒棘球蚴（Ｅｇ）内质网膜蛋白４（ＲＥｔｉｃｕｌｏｎ－４，Ｒｔｎ４）抗原基因，对其序列进行生物信息学分析。【方法】采集感染Ｅｇ的绵羊肝脏和肺脏，提取Ｅｇ头节总ＲｎＡ为模板，对Ｒｔｎ４基因进行Ｒｔ－ＰｃＲ扩增，将ＰｃＲ产物克隆到ＰＭＤ１９－ｔ载体后测序，对其核苷酸序列及氨基酸序列进行生物信息学分析。【结果】Ｅｇ Ｒｔｎ４ｃＤｎＡ全长６５４ｂＰ，编码２１７个氨基酸，蛋白质分子质量为２５．３ｋｕ，等电点为８．８３。编码氨基酸序列中含有１个ｎ端酰基化位点、２个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和４个蛋白激酶ｃ磷酸化位点。经生物信息学软件预测，Ｒｔｎ４蛋白的抗原表位区主要集中在第１－４７位、第７１－１４．．．
【关键词】细粒棘球蚴 抗原基因 基因克隆 生物信息学分析
【基金】国家公益性(农业)行业专项(201303037); 国家国际科技合作项目(2014DFR31310); 新疆自治区研究生科研创新项目(XJGRI2014059)
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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