2013年中国典型对虾养殖区白斑综合征病毒流行株高变异区序列的分析比较
2016-05-15分类号：S945.4
【部门】农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所 上海海洋大学 青岛海洋科学与技术国家实验室
【摘要】为了解中国不同地区白斑综合征病毒的流行变异情况，本研究取用２０１３年３—１２月从７个省市发病地区采集到的６４份ＷＳＳＶ阳性样本，以特异的引物扩增目的片段，通过测序分析不同样本的缺失及变异差异。结果显示，在开放阅读框ＯＲＦ１４／１５的扩增中，分别有６５３０ ｂｐ、６５３３ ｂｐ和５１３８ ｂｐ的片段缺失，而在ＯＲＦ２３／２４扩增中有１２０７０ｂｐ大片段的缺失，不同地区样本中未能成功扩增ＯＲＦ７５，而ＯＲＦ９４的重复单元数目分别为０、３、４、１２不等，ＯＲＦ１２５的重复单元数目为０、７。ＳＮｐ分析表明，含有３个重复单元的ＯＲＦ９４在４８位的碱基为Ｔ、Ｔ、Ｔ，重复单元数为４的在４８位的碱基为Ｔ、Ｔ、．．．
【关键词】WSSV ORF 缺失 变异 PCR
【基金】国家重点基础研究发展计划项目(2012CB114401); 山东省“泰山学者”建设工程专项经费; 农业部科研杰出人才和创新团队专项
【所属期刊栏目】中国水产科学
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