刀鲚类Tc1转座子的分子特征及拷贝数变化的意义
2016-01-05分类号：S917.4
【部门】上海海洋大学鱼类研究室上海市海洋动物系统分类与进化重点实验室
【摘要】为了探讨刀鲚２种不同生活史种群的遗传结构差异以及成因，本研究利用分子克隆及转座子展示技术，从刀鲚基因组中分离、鉴定出一类新的、命名为Ｃｎ－ＴＣ１的转座子。该转座子全长１８９６ ｂｐ，为鳀科鱼类第一类被挖掘的ＴＣ１转座子。Ｃｎ－ＴＣ１自身包含另一个长度为１０４０ ｂｐ的类ＴＣ１，表明Ｃｎ－ＴＣ１在基因组内的转座经历过多次迸发。Ｃｎ－ＴＣ１的５’和３’末端反向重复序列长度分别为６４和８３ ｂｐ，转座插入位点具有＂ＴＡＴＡ＂基序。预测的Ｃｎ－ＴＣ１转座酶具有与ＤｎＡ结合的保守结构，提示其仍具有转座潜能。Ｃｎ－ＴＣ１插入位点侧翼序列的ＧＣ含量呈不均匀分布，均值低于ＡＴ含量。运用荧光定量ｐＣＲ方法，估算．．．
【关键词】刀鲚 转座子 类Tc1 拷贝数 种群
【基金】公益性行业(农业)科研专项(201203065); 国家自然科学基金(31172407,31472280); 高等学校博士学科点科研专项(20123104110006); 上海高校水产学高峰学科~~
【所属期刊栏目】水产学报
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