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海带3个着丝粒蛋白编码序列的克隆及特征分析

2016-07-15分类号:S917.3

【作者】徐梅  周志刚  
【部门】上海海洋大学水产与生命学院  
【摘要】本研究根据海带基因组及糖海带转录组数据库中获得的编码着丝粒相关蛋白CENH3、Nuf2和NdC80的CoNtig序列设计特异性引物,利用PCR技术自海带中克隆得到它们的开放阅读框(oRf)序列,分别命名为Sj CENH3、Sj Nuf2和Sj NdC80,大小分别为432、1365和2172 bP,相应地编码由143、454和723个氨基酸组成的蛋白。同源序列比对表明,Sj CENH3由氨基端尾巴和羧基端的组蛋白折叠域组成,后者包括4个α螺旋(αN、α1、α2和α3)和2个环(LooP1和LooP2);但与组蛋白H3相比,Sj CENH3的氨基端略长且序列不相似,同时组蛋白折叠域的α1、α2螺...
【关键词】海带  CENH3  动粒蛋白  基因克隆  生物信息学
【基金】国家高技术研究发展计划(2012AA10A406); 国家自然科学基金(41376136)~~
【所属期刊栏目】水产学报
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