低盐胁迫下坛紫菜叶状体的转录组分析
2016-12-15分类号:S917.3
【部门】上海海洋大学水产与生命学院 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室
【摘要】为探索坛紫菜叶状体响应低盐胁迫的分子生理学机制,本研究采用第二代高通量测序技术,分析比较在正常盐度(26,对照组)和低盐度(3,胁迫组)下培养不同时间(3、6和9 h)的坛紫菜叶状体转录组数据。结果显示,测序数据经de novo组装,获得了33 872条unigenes,平均长度为612 bp;与对照组相比,3个胁迫组分别产生了1108、1638和1881条差异性表达基因。go功能富集分析显示,一些可能与低盐胁迫相关的重要生物过程得到了显著富集,如单分子有机物代谢过程,单糖的合成代谢和分解过程,糖质新生,有机物分解代谢过程等。Kegg代谢通路富集分析发现,低盐胁迫不同时间富集到的代谢通路存在很...
【关键词】坛紫菜 低盐胁迫 转录组 荧光定量PCR(qRT-PCR) 差异性表达基因
【基金】国家“八六三”高技术研究发展计划(2012AA10A411); 国家自然科学基金(31072208); 国家农业科技成果转化资金(2013GB2C220537); 福建省省长专项基金(2014S1477-10)~~
【所属期刊栏目】水产学报
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