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建鲤基因组中一个ty3-gypsy反转录转座子的发现与分析

2016-03-15分类号:S917.4

【作者】丁炜东  曹丽萍  曹哲明  邴旭文  
【部门】农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室  中国水产科学研究院淡水渔业研究中心  
【摘要】转座子是动植物基因组的重要组成部分,在前期研究中发现建鲤(Cyprinus Carpio var.jian)基因组中存在一个ty3-gypsy反转录转座子类型的转座子,并将其命名为jrE转座子(jian Carp rEtrotransposon,jrE)。为了研究jrE反转录转座子在建鲤基因组中的功能,采用pCr扩增、荧光定量pCr和原位杂交等方法对jrE转座子的特性进行了研究。jrE反转录转座子全长5126 bp,具有5?端470 bp和3?端453 bp长末端重复片段(long tErminal rEpEat End,ltr),中间的开放阅读框(orF)包括核心蛋白基因(gag)和酶基因区...
【关键词】建鲤  反转录转座子  拷贝数  原位杂交
【基金】国家自然科学基金项目(31200918); 江苏省自然科学基金项目(BK2011184); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2015JBFM06)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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