基于RNA-seq技术对不同品种猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释
2016-05-03分类号：S828
【部门】安徽农业大学动物科技学院 安徽省农业科学院畜牧兽医研究所
【摘要】【目的】筛选皖南花猪和大约克猪背最长肌组织差异表达基因。【方法】采集皖南花猪和大约克猪背最长肌（各３头），测定其肉质性状指标，并提取其ＲＮＡ，采用高通量转录组测序（ＲＮＡ－ｓｅｑ）技术进行测序，对所获序列进行ＧＯ和ＰＡｔｈｗＡｙ显著性富集分析。【结果】测序后皖南花猪３个样本得到的总序列数分别为６５ ５８４ １２６，６４ ３２７ ７３８和５９ ２４４ ５０２，其中有效序列达到９４．４％，９４．３％和９４．２％；大约克猪３个样本得到的总序列数分别为５７ ９６９ １３４，６８ ２５４ １６８和７２ ２９８ １４２，其中有效序列达到９３．８％，９３．７％和９３．８％。测序饱和度良好，证明测序数据真实可．．．
【关键词】RNA-seq 皖南花猪 大约克猪 差异表达基因 背最长肌
【基金】安徽省生猪产业技术体系项目(AHCYTX-06-10); 安徽省生猪现代农业项目(13000101); 安徽省农业科学院科技创新团队建设项目(13C0405)
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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