槐猪和杜洛克猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释
2016-03-18分类号:S828
【部门】福建农林大学动物科学学院 福建省农业科学院畜牧兽医研究所
【摘要】为了筛选槐猪和杜洛克猪背最长肌中的差异表达基因,对槐猪和杜洛克猪背最长肌进行转录组测序,并进行生物信息学分析.结果表明,槐猪和杜洛克猪分别获得36 177 844和34 496 450条可用读段,且与猪参考基因组的比对率分别为78.71%和80.09%.槐猪和杜洛克猪间共有953个差异表达基因,以杜洛克猪为对照组,槐猪与之相比,有589个上调基因和364个下调基因.槐猪和杜洛克猪的差异表达基因共分类到48个基因本体(GO)条目中,其中,细胞组分13个、分子功能12个和生物学过程23个.显著富集的KEGG通路共计6个,其中,PPAR信号通路是与调节脂类代谢显著相关的通路.
【关键词】槐猪 杜洛克猪 背最长肌 差异表达 转录组测序
【基金】科技部科技基础性工作专项(2014FY120800); 福建省省属公益类科研院所专项(2014R1023-12)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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