虾虎鱼科(Gobiidae)基因组微卫星dNa的分布特征
2016-09-28分类号：S917.4
【部门】农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 山东农业大学
【摘要】为了解虾虎鱼科（Ｇｏｂｉｉｄａｅ）鱼类基因组遗传结构特征，本研究自主开发矛尾复虾虎鱼（ＳｙｎｅｃｈｏＧｏｂｉｕＳ ｈａＳｔａ）微卫星序列１５３条，结合从Ｇｅｎ ｂａｎｋ中筛选出的虾虎鱼科微卫星序列５３５条，合计６８６条微卫星序列，隶属于１９种虾虎鱼，序列总长度为２９５０６２ ｂｐ，包含４７３个微卫星位点，微卫星位点累计长度为３３３７０ ｂｐ。统计微卫星重复类型，发现在所有微卫星重复类型中以二碱基重复出现次数最多，位点数为３６１个，占总微卫星的７６．３２％，其中，重复拷贝类别最多的是ａｃ（３４０个），占全部微卫星的７１．８８％，占二碱基重复微卫星的９４．１８％，在二碱基重复类型中没有发现ａｔ和Ｇ．．．
【关键词】虾虎鱼科 微卫星 基因组
【基金】国家自然科学基金项目(31172411); 国际科技合作专项(2013DFA31410); 泰山学者建设工程专项共同资助
【所属期刊栏目】渔业科学进展
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