乌鳢和斑鳢EST序列微卫星信息分析
2016-05-15分类号:S917.4
【部门】杭州市农业科学研究院
【摘要】乌鳢(Channa argus,♂)、斑鳢(Channa maCulatus,♀)是杂交鳢"杭鳢1号"的亲本。利用高通量测序技术对乌鳢和斑鳢的肝脏进行转录组测序获得大量Est序列后,利用mIsa软件进行微卫星信息分析,结果表明,通过转录组测序获得乌鳢Est序列59 959条,长度45 mb,发现15 428个ssr,出现频率为25.73%;获得斑鳢Est序列44 337条,长度27 mb,发现8 439个ssr,出现频率为19.03%。在乌鳢和斑鳢Est-ssr中,重复单元以1~2碱基重复为最多,并以长度小于16 bp的短重复序列为主,间隔ssr和复合ssr的Est序列rpKm均值要低于单纯型...
【关键词】乌鳢(Channa argus) 斑鳢(Channa maculatus) EST序列 微卫星
【基金】浙江省水产农业新品种选育重大科技专项(2012C12907-7)
【所属期刊栏目】淡水渔业
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