鳀科(EngraulidaE)鱼类dna条形码电子芯片研究
2016-11-29分类号：S917.4
【部门】农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 大连海洋大学水产与生命学院 上海海洋大学水产与生命学院 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室
【摘要】本研究将基于线粒体ＣＯＩ部分序列的ＤＮＡ条形码和ＤＮＡ芯片技术相结合，以缇科１１属３０种鱼类为研究对象，在比对分析其ＤＮＡ条形码序列的基础上，利用软件ＯｌＩｇＯ ＡｒｒＡｙ ２．１筛选探针，经ＯｌＩｇＯＣＡｌＣ优化探针，去除易形成发夹（ＨＡＩｒｐＩＮ）、茎环（ＳｔｅｒＮ－ｌＯＯｐ）及自身二聚体结构（ＨＯｍＯＤＩｍｅｒＳ）的探针，再利用ＯｌＩｇＯ ＨｅＡｔ ｍＡｐ对探针与靶标序列进行虚拟杂交，共有１４个物种的２４条探针能与靶标序列特异性结合。利用ＤＮＡ条形码芯片技术能将１４个物种鉴定到种，虽然物种识别能力仅占总物种数的４６．７％，但鉴定准确率可达１００％。因此，基于ＣＯＩ基因的ＤＮＡ芯片技术对缇．．．
【关键词】鳀科 DNA条形码 探针 DNA芯片 电子杂交
【基金】山东省科技发展计划项目(2012GHY11531); 科技基础性工作专项(2013FY110700); 泰山学者建设工程专项经费共同资助
【所属期刊栏目】渔业科学进展
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