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不同光周期条件下日本牙鲆尾部神经分泌系统转录组分析

2016-06-15分类号:S917.4

【作者】陈阿琴  张影  陈松林  吕为群  
【部门】上海海洋大学水产与生命学院  中国水产科学研究院黄海水产研究所  
【摘要】为发掘日本牙鲆响应光周期变化的重要功能基因,采用新一代高通量测序RNA-seq技术分析8L∶16D、12L∶12D和16L∶8D等3个光周期条件下日本牙鲆尾部神经分泌系统(cAuDAL NeuRosecRetoRy system,cNss)的基因表达变化。转录组测序结果显示,3个样品分别产生了5 807 622、6 147 140和6 116 872个cLeAN ReADs。分别对8L∶16D、12L∶12D和16L∶8D条件下的文库进行两两比较,共获得200个差异表达基因。Go分类分析表明,差异表达基因属于生物学过程、细胞定位和分子功能的42个类别。KeGG PAthwAy显著性富集分析差异...
【关键词】日本牙鲆  尾部神经分泌系统  光周期  转录组
【基金】国家自然科学基金(31072228,41376134); 上海高校水产学高峰学科建设和知识服务平台项目; 上海市自然科学基金(14ZR1419900)~~
【所属期刊栏目】水产学报
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