基于IllumIna高通量测序的岩原鲤转录组分析
2016-07-26分类号:S917.4
【部门】四川省农业科学院水产研究所
【摘要】为获得岩原鲤转录组信息,发掘功能基因,本研究采用IllumIna高通量测序技术对岩原鲤全组织转录组进行测序。结果获得64 257 918个EST序列,经拼接和组装得到83 252条单基因序列(unIgEnE),平均长度787 bp,长度范围201~16 572 bp。利用nCbI的蛋白质非冗余数据库(nr)对所有unIgEnE进行相似性搜索,共有37 157条unIgEnE(44.63%)与数据库中的已知序列同源。利用blaST2gO v2.5软件对unIgEnE进行注释,共得到29 919条(35.93%)注释基因,根据gO功能分类将其分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类56亚类。经KOg...
【关键词】高通量测序 岩原鲤 转录组
【基金】岩原鲤种质资源的分子遗传学研究(2013GXJS-010)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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